Heatmap: Cluster_232 (HCCA cluster)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
Root (elongation zone)
Root (meristematic zone)
Root (stele)
Root (tip)
Root
Leaf (3rd leaf of seedling)
Leaf (3rd leaf)
Leaf (apex)
Leaf (bundle sheath)
Leaf (mesophyll)
Leaf (Seedling)
Leaf
Internode
Stalks
Shoot
Shoot (apex)
Tassels (primordia)
Tassels
Anther
Pollen
Ear (immature)
Ear (inflorescence)
Ear (leaf)
Ear (primordia)
Ear
Silks
Kernels (germinating)
Kernels
Maternal transfer zone
Nucellus
Embryo
Endosperm (transfer layer)
Endosperm
Seeds
Coleoptyle (5 day)
Seedling
Whole Plant
Zm00001d002020 (GRMZM2G059740)
0.82 0.03 3.11 0.96 11.84 5.55 2.55 2.02 0.83 0.58 7.31 10.36 0.0 1.49 8.56 0.85 0.1 0.96 0.44 0.01 0.04 0.0 28.15 0.0 1.63 21.66 3.34 1.85 2.05 0.57 0.57 0.19 0.14 1.2 8.31 5.83 3.83
Zm00001d002085 (GRMZM2G023163)
11.52 16.82 23.51 40.08 50.38 14.64 12.56 14.85 10.98 11.68 23.52 21.18 15.02 20.65 23.29 17.66 20.98 45.0 36.92 7.44 12.72 12.6 98.55 21.25 15.05 39.72 17.09 13.11 9.98 17.57 28.92 1.43 2.81 17.94 69.87 25.59 21.62
Zm00001d002168 (GRMZM2G115705)
0.03 0.44 0.0 7.44 5.74 2.53 2.67 1.12 0.51 1.15 3.67 3.43 0.0 0.0 0.61 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 20.4 0.0 0.22 0.0 0.03 0.01 0.68 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.05 1.01 0.5
Zm00001d003365 (GRMZM2G022699)
0.04 0.0 0.0 0.48 8.7 1.07 1.61 0.0 0.49 0.75 6.97 2.37 0.11 0.05 1.73 0.32 0.04 0.09 0.03 0.0 0.12 0.0 0.62 0.16 0.18 0.06 0.43 0.42 2.74 0.24 0.0 1.1 0.0 0.19 0.27 1.04 0.96
Zm00001d003434 (GRMZM2G041356)
123.81 17.62 17.8 52.06 62.81 28.94 19.14 31.42 6.35 6.25 23.61 31.05 2.1 3.59 16.41 9.18 0.7 2.57 1.8 0.06 3.06 4.12 243.98 1.96 7.67 9.7 21.95 9.26 4.92 0.0 8.25 0.59 1.55 5.43 24.39 13.03 16.8
Zm00001d004072 (GRMZM2G052386)
0.93 0.0 0.32 0.61 1.84 0.09 0.08 0.0 0.0 0.0 0.32 0.47 0.0 0.0 0.12 0.02 0.0 0.08 0.09 0.15 0.03 0.0 8.03 0.0 0.12 0.0 0.0 0.07 0.0 0.58 0.06 0.0 0.0 0.03 0.03 0.19 0.17
Zm00001d006531 (GRMZM2G365282)
0.0 0.0 0.02 0.96 0.88 0.02 0.0 0.19 0.0 0.0 0.34 0.35 0.0 0.0 0.06 0.14 0.42 1.59 0.04 0.05 0.05 0.0 5.76 1.37 0.64 0.0 0.0 0.01 0.0 2.06 0.19 0.0 0.0 0.02 0.01 0.17 0.05
Zm00001d006755 (GRMZM2G079082)
0.15 0.0 0.05 2.86 2.22 0.66 0.22 0.0 0.0 0.0 1.05 0.45 0.0 0.05 0.17 0.24 0.0 0.02 0.01 0.0 0.0 0.27 5.48 0.0 0.68 1.56 0.06 0.06 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.05 0.31 0.47 0.31
Zm00001d008201 (GRMZM5G853479)
0.32 0.16 1.19 0.0 12.5 4.29 0.87 4.13 1.12 1.46 1.27 6.24 0.28 0.0 1.33 2.41 0.0 2.68 0.24 0.0 0.42 0.22 24.13 0.17 0.84 0.0 0.0 1.32 3.01 0.0 0.02 1.42 0.25 0.62 5.12 2.51 7.6
Zm00001d008457 (GRMZM2G079219)
0.22 0.47 3.48 3.62 5.45 1.43 0.91 1.3 0.58 0.25 7.06 5.99 0.34 1.98 3.19 1.99 0.27 0.53 0.54 0.01 0.48 1.11 8.1 0.09 2.71 4.22 5.97 0.92 0.68 1.15 0.16 2.4 0.1 0.79 15.77 3.09 5.72
Zm00001d010463 (GRMZM2G029756)
4.33 1.31 1.12 19.27 13.26 3.43 2.8 0.76 0.89 1.3 2.29 7.24 0.45 2.85 3.31 1.88 0.68 0.6 0.15 0.07 0.95 0.74 28.63 3.49 1.17 13.46 4.79 0.52 1.5 1.15 2.97 2.72 0.1 0.86 0.82 3.77 6.1
Zm00001d011157 (GRMZM2G338161)
0.0 0.0 0.03 0.0 3.73 0.51 0.12 0.0 0.03 0.02 0.49 0.76 0.0 0.0 0.11 0.01 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 4.37 0.0 0.07 0.0 0.03 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.41 0.16
Zm00001d014056 (GRMZM2G386952)
0.0 0.0 0.02 0.0 0.38 0.1 0.05 0.01 0.0 0.0 0.11 0.18 0.0 0.0 0.03 0.08 0.0 0.51 0.77 0.0 0.0 0.04 0.1 0.0 0.05 0.0 0.03 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.02 0.18 0.24 0.08
Zm00001d016219 (GRMZM2G135862)
0.06 0.09 1.44 4.23 3.32 1.99 2.04 0.59 0.36 0.57 2.1 2.62 0.57 1.64 1.41 0.75 0.07 0.3 0.45 0.0 0.34 0.47 8.15 1.1 1.43 4.12 0.73 0.3 0.0 1.37 0.3 0.0 0.02 0.24 2.67 2.08 0.88
Zm00001d017365 (GRMZM2G139773)
0.23 0.07 1.31 0.96 3.26 0.09 0.09 0.03 0.14 0.03 1.85 0.6 0.11 0.26 0.3 0.2 0.03 2.01 1.96 0.06 0.02 0.05 3.78 0.17 0.45 1.0 0.25 0.66 0.0 0.45 0.03 0.54 0.12 0.35 0.5 0.34 0.35
Zm00001d017671 (GRMZM2G168980)
7.93 1.48 0.68 3.1 4.32 12.05 2.87 1.76 0.87 0.49 6.83 1.68 0.0 0.0 0.91 0.02 0.0 0.59 0.01 0.92 0.0 0.0 8.08 0.11 0.23 0.93 0.44 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.66 2.31 2.84
Zm00001d019256 (GRMZM2G117878)
3.41 4.43 6.43 3.59 7.55 1.09 7.62 0.26 0.99 1.03 6.48 5.33 0.68 12.86 2.71 1.57 0.0 2.42 2.77 0.01 0.16 0.0 35.14 0.0 1.01 0.0 12.28 1.24 1.5 0.0 1.52 0.85 0.08 0.99 4.54 2.17 4.27
Zm00001d020057 (GRMZM2G473001)
49.66 106.71 229.21 140.33 182.62 96.45 124.76 48.01 120.9 69.57 53.22 108.03 74.76 88.35 75.3 99.06 71.54 81.92 75.04 0.29 78.72 89.93 37.49 73.87 77.24 144.09 143.27 92.83 64.68 87.14 67.14 13.33 30.96 74.32 47.71 90.72 73.84
Zm00001d021737 (GRMZM2G309025)
8.35 1.58 19.5 16.35 14.22 7.99 7.36 4.77 3.11 4.4 19.6 12.07 6.97 10.81 7.34 12.59 7.72 9.15 5.47 0.26 3.02 3.79 33.16 4.92 6.22 28.02 12.49 5.86 12.58 8.48 4.43 2.77 2.01 7.11 10.43 11.61 8.1
Zm00001d023843 (GRMZM2G176472)
9.43 3.26 1.28 7.28 17.17 3.86 1.73 1.04 0.27 0.43 17.32 8.46 0.11 2.07 2.63 1.62 0.71 0.74 2.14 0.18 0.74 0.15 21.44 0.86 2.55 0.22 4.5 8.55 5.88 18.99 0.74 3.04 0.3 4.46 4.5 6.34 3.12
Zm00001d024200 (GRMZM2G092363)
5.37 2.08 9.93 17.07 13.33 31.52 29.89 14.49 3.53 3.4 7.16 8.88 0.74 7.44 5.81 5.35 0.21 0.93 0.31 0.01 5.18 1.15 55.82 0.04 2.83 0.28 1.67 1.2 0.0 0.33 1.1 0.0 0.65 0.3 0.77 8.68 18.27
Zm00001d024352 (GRMZM2G481531)
0.0 0.0 0.08 0.12 1.01 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.28 0.0 0.0 0.07 0.03 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 2.84 0.0 0.01 0.0 0.06 0.03 0.0 0.0 0.01 2.37 0.0 0.0 0.04 0.02 0.18
Zm00001d024412 (GRMZM2G144407)
0.07 0.0 0.33 4.95 3.7 1.0 0.34 0.14 0.64 0.14 0.19 0.4 0.0 0.07 0.4 0.25 0.82 0.35 1.9 0.01 0.13 0.13 13.36 0.01 0.23 0.0 2.39 0.18 0.0 2.98 0.07 0.0 0.02 0.32 1.29 1.15 1.25
Zm00001d024866 (GRMZM2G089721)
2.35 0.03 0.58 4.08 1.44 2.49 2.76 0.41 0.76 0.87 1.77 1.33 0.23 0.62 1.37 0.73 0.01 1.04 1.41 0.01 0.03 0.05 4.56 0.03 0.1 0.65 0.04 0.61 1.5 0.0 0.0 0.74 0.6 0.31 0.29 1.27 1.4
Zm00001d024961 (GRMZM2G436448)
0.01 0.0 2.18 0.0 6.61 1.3 2.97 0.04 0.86 1.54 7.4 4.32 0.11 0.22 2.98 1.33 0.0 0.07 0.36 0.01 0.03 0.15 6.12 0.0 1.45 0.0 7.13 1.07 8.21 0.0 0.0 0.0 0.02 0.74 6.98 1.81 1.02
Zm00001d025035 (GRMZM2G017164)
0.76 1.98 3.3 7.88 10.81 3.64 2.23 2.46 1.73 2.65 7.49 8.06 3.97 5.66 5.63 4.55 4.9 3.08 4.26 0.01 1.73 3.03 23.27 4.2 4.36 13.72 1.7 4.62 2.05 10.66 0.76 0.0 1.1 3.72 8.3 5.29 3.68
0.51 6.16 0.4 13.57 11.58 2.06 0.81 1.07 0.07 0.18 5.3 5.57 0.06 0.05 1.43 0.33 1.39 1.43 1.02 0.01 0.72 0.38 36.41 1.82 1.7 0.37 9.92 1.41 1.37 8.94 3.99 0.12 0.32 3.72 1.84 2.7 2.0
Zm00001d025390 (GRMZM2G042811)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.21 0.0 0.0 0.0 0.06 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Zm00001d025401 (GRMZM2G052100)
1.34 0.25 39.19 60.37 839.14 332.55 686.71 132.3 142.3 138.16 865.59 706.52 0.0 100.6 536.62 64.15 0.23 234.64 49.8 3.14 2.32 0.0 5815.42 4.2 151.44 72.57 20.11 161.37 415.86 202.33 120.14 78.69 20.77 158.29 198.12 285.33 214.62
Zm00001d027921 (GRMZM2G115105)
3.12 2.88 1.56 7.44 5.46 5.44 3.44 3.51 1.95 4.39 9.83 4.47 0.0 0.15 2.16 1.18 0.35 3.6 10.82 0.11 0.22 0.0 4.03 0.18 1.02 1.05 1.01 0.27 13.95 0.67 0.49 4.75 0.53 0.38 0.44 2.97 2.17
Zm00001d027995 (GRMZM2G397055)
6.61 0.83 0.37 2.29 13.99 8.77 17.25 2.69 3.53 6.82 7.34 8.71 0.0 0.0 3.11 0.33 0.42 7.35 0.45 0.01 0.04 0.04 32.71 0.0 0.93 0.33 1.75 0.31 0.0 0.0 0.2 0.0 0.0 0.22 0.28 5.09 6.97
0.21 0.42 0.47 0.48 1.35 0.96 0.64 0.31 0.19 0.25 3.35 2.05 0.51 0.0 0.99 0.6 0.28 1.1 0.65 0.03 0.23 0.2 4.07 0.4 1.02 0.03 0.37 0.29 1.37 2.53 0.51 0.5 0.16 0.29 0.15 1.23 1.12
Zm00001d029590 (GRMZM2G074138)
74.4 9.73 63.92 51.75 70.53 50.31 36.43 19.4 16.13 20.44 26.49 57.45 5.89 19.9 42.38 19.41 20.94 19.74 19.49 0.09 33.68 24.65 26.26 17.35 20.24 15.02 38.06 13.41 40.61 20.33 6.5 1.45 2.16 7.23 10.3 44.74 50.88
Zm00001d030555 (GRMZM2G303909)
0.04 0.04 0.05 3.0 2.83 0.37 0.16 0.0 0.02 0.04 1.26 0.73 0.0 0.02 0.19 0.27 0.0 0.21 0.07 0.0 0.0 0.0 12.3 0.05 0.53 0.0 0.42 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.65 0.46 0.36
Zm00001d031345 (GRMZM2G017629)
0.06 0.0 0.11 8.8 9.58 0.0 2.67 0.0 0.1 0.02 18.25 2.86 0.06 0.02 0.42 0.05 0.0 4.86 10.94 0.05 0.1 0.0 257.72 0.12 2.59 0.13 0.0 0.89 0.0 0.0 0.04 0.0 0.03 4.57 0.36 0.5 1.15
Zm00001d037949 (GRMZM2G069713)
39.78 13.01 30.18 15.28 50.46 39.09 58.2 30.04 27.32 17.0 42.27 39.35 11.96 0.98 28.21 20.26 16.21 13.27 18.44 0.02 17.65 5.94 49.61 23.89 15.99 2.28 29.32 19.23 47.31 22.34 25.5 20.59 2.79 5.94 3.69 28.09 17.26
Zm00001d038115 (GRMZM2G332107)
0.0 0.0 0.01 0.0 2.61 0.49 0.05 0.09 0.33 0.26 0.69 1.75 0.0 0.09 1.89 0.06 0.0 0.32 0.58 0.01 0.0 0.0 7.57 0.0 0.09 0.0 0.0 0.19 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.22 0.16 0.75 0.7
Zm00001d038494 (GRMZM2G089461)
7.37 0.59 10.61 3.0 5.52 2.13 1.34 0.47 3.29 3.78 3.24 4.47 0.57 1.23 1.59 2.55 0.91 1.21 1.56 0.0 0.27 0.14 5.84 0.59 1.92 3.6 2.67 1.74 1.5 2.64 0.53 0.0 0.41 1.71 0.7 4.48 2.66
Zm00001d038548 (GRMZM2G116335)
0.05 0.03 0.66 1.56 1.47 0.5 0.14 0.02 0.06 0.07 1.01 0.32 0.0 0.0 0.13 0.28 0.66 0.17 0.29 0.01 0.01 0.0 2.17 0.2 0.15 0.04 0.62 0.1 0.0 0.12 0.3 0.0 0.03 0.34 0.17 0.29 0.24
Zm00001d039527 (GRMZM2G308910)
0.0 0.0 0.0 0.0 1.51 0.82 1.05 1.51 0.53 0.42 0.25 0.86 0.0 0.0 0.87 0.06 0.0 0.02 0.14 0.0 0.02 0.0 6.31 0.0 0.06 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.24 0.0 0.01 0.34 0.86 0.27
Zm00001d039822 (GRMZM2G463574)
0.52 0.79 1.2 3.69 1.91 0.49 2.25 1.22 0.67 1.24 4.31 3.33 1.08 0.12 1.48 1.42 0.98 1.32 1.99 0.16 1.67 2.16 7.29 1.09 1.87 1.88 2.44 1.49 0.68 2.19 1.01 0.0 0.61 2.27 1.8 3.05 0.91
Zm00001d041476 (GRMZM2G412885)
1.36 0.64 8.12 3.13 12.25 6.79 9.48 2.47 2.46 2.53 5.85 7.72 0.11 0.05 9.48 0.84 3.94 1.37 0.63 0.11 3.03 1.94 10.17 1.84 1.45 0.06 2.78 1.62 0.68 0.0 1.23 0.0 0.08 2.41 4.51 5.77 6.27
Zm00001d041772 (GRMZM2G019090)
0.03 0.53 16.05 28.4 66.52 19.42 19.82 1.02 0.08 0.15 77.04 14.42 0.0 16.42 5.79 9.45 28.0 0.51 10.4 0.2 5.72 18.12 114.51 0.02 19.77 51.69 90.41 12.18 0.68 63.59 8.91 0.0 1.7 1.97 2.04 32.62 14.84
Zm00001d042135 (GRMZM2G116554)
0.04 0.07 0.06 0.84 11.28 3.04 0.28 1.11 0.15 0.02 8.19 3.85 0.0 0.34 1.98 0.82 0.0 0.15 0.05 0.01 0.0 0.0 8.36 0.0 1.06 0.0 4.57 7.82 1.37 0.0 3.53 0.0 0.47 0.19 0.01 1.64 3.7
Zm00001d042731 (GRMZM2G053284)
0.01 0.87 0.36 4.28 27.14 2.09 8.9 0.82 0.66 1.17 13.82 8.32 0.23 1.79 3.6 0.33 0.61 0.8 2.19 0.01 0.6 0.82 15.12 0.29 3.55 2.87 2.04 0.63 2.05 0.0 0.32 0.0 0.05 2.03 0.67 5.23 10.69
Zm00001d043199 (GRMZM2G178704)
0.04 0.0 0.6 1.08 2.49 2.11 0.46 1.69 0.91 0.93 3.0 3.51 0.0 0.3 1.51 0.77 0.34 0.23 0.2 0.0 0.26 0.19 5.18 0.02 0.34 0.11 1.38 0.45 0.68 0.44 0.19 0.0 0.03 0.37 1.31 3.03 0.92
0.11 0.03 0.54 1.56 1.38 1.68 1.12 0.15 0.55 0.92 0.39 1.79 0.0 0.33 1.23 0.78 0.89 0.45 0.29 0.0 0.16 0.14 4.73 0.23 0.24 0.11 0.4 0.25 0.0 0.12 0.08 0.19 0.0 0.31 1.08 1.11 1.49
2.72 2.91 0.9 6.93 10.79 3.08 0.97 1.51 0.38 0.61 2.19 4.41 0.45 2.07 1.36 0.98 1.96 5.97 2.65 13.95 2.31 0.95 15.0 1.47 2.73 0.9 5.2 1.12 7.52 4.93 15.95 0.97 0.32 1.64 1.34 2.28 2.1
Zm00001d044654 (GRMZM2G079303)
0.32 0.52 0.61 1.22 1.09 0.34 0.32 0.21 0.02 0.02 0.8 0.85 0.06 0.19 0.28 0.28 0.37 0.88 1.33 0.13 0.36 0.53 0.89 1.59 0.65 0.2 0.62 0.16 0.0 0.0 0.42 0.19 0.27 1.12 1.61 0.65 0.16
Zm00001d045845 (GRMZM2G070603)
47.61 10.03 0.1 24.84 19.13 22.34 8.94 6.93 3.31 2.75 5.93 20.29 0.0 0.0 4.31 0.92 0.0 0.09 0.01 0.39 0.09 0.04 35.08 0.11 2.57 4.71 4.42 0.57 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.24 0.48 6.66 4.75
Zm00001d046801 (GRMZM2G452896)
4.75 3.37 1.95 10.29 18.93 6.25 3.9 3.13 1.56 1.6 11.38 8.77 0.57 5.96 3.92 3.91 0.1 0.87 0.7 0.0 0.59 0.23 27.28 0.17 2.34 0.56 2.65 1.43 7.52 1.02 0.16 0.93 0.32 0.69 4.11 5.66 7.92
Zm00001d046919 (GRMZM2G057616)
41.95 7.0 6.55 37.19 32.19 48.26 44.51 15.81 21.32 23.45 18.28 38.57 8.05 38.58 40.42 9.96 0.45 4.14 2.56 0.02 0.85 0.42 16.11 1.07 8.28 14.08 9.0 0.3 0.68 7.42 4.4 0.93 0.07 0.52 18.72 24.65 64.26
Zm00001d047358 (GRMZM2G149273)
29.6 0.01 0.2 7.05 14.52 14.97 3.29 0.19 7.04 4.9 12.89 17.26 0.0 0.0 2.05 0.01 0.0 0.02 0.04 0.01 0.0 0.0 76.92 0.0 0.03 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 3.65 4.99
Zm00001d047952 (GRMZM2G081458)
0.14 0.02 0.24 0.0 4.86 0.54 0.14 0.03 0.06 0.07 1.3 1.69 0.06 0.02 0.98 0.6 0.0 0.06 0.35 0.0 0.03 0.0 4.25 0.0 0.78 1.46 2.46 0.81 0.68 0.0 0.0 0.12 0.02 0.64 1.09 1.3 1.15
Zm00001d050803 (GRMZM2G107021)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.43 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.04 0.25 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.13
Zm00001d050834 (GRMZM2G047715)
0.06 0.31 0.23 7.76 2.64 0.0 0.15 0.41 0.06 0.14 0.32 0.17 0.0 0.1 0.3 0.15 0.55 0.17 0.44 0.1 0.44 0.33 10.79 0.57 0.69 0.0 0.28 0.31 0.0 0.24 0.54 0.0 0.17 0.35 0.96 1.24 0.75
Zm00001d051015 (GRMZM2G138624)
2.64 10.79 15.25 11.41 28.44 6.32 8.76 17.96 6.1 5.68 15.07 23.18 9.58 20.62 6.5 15.23 19.73 23.19 23.63 40.53 14.31 27.55 34.62 12.12 25.23 9.08 24.6 20.02 21.6 36.68 35.84 18.87 9.72 19.72 25.49 14.4 7.98
Zm00001d051799 (GRMZM2G063276)
16.79 0.5 0.45 18.68 23.81 21.64 21.44 13.64 12.6 11.81 17.67 17.58 13.26 6.23 14.45 8.07 2.71 6.01 1.26 0.0 9.99 3.79 60.52 6.97 11.46 23.61 2.62 3.0 0.0 4.8 4.17 2.2 0.59 2.32 1.7 15.03 21.41

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)