Heatmap: Cluster_67 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Archegonia (mature)
Antheridia (9 DAI)
Antheridia (small, 11 DAI)
Antheridia (mature, 14-15 DAI)
Antheridia (japan)
Antheridia
Antheridia Reute
Antheridia Gransden
Sperm cell packages
Gametophore
Gametophore (dehydrated)
Gametophore (rehydrated)
Gametophore (hydroponic)
Gametophore+auxin (hydroponic)
Leaflets
Paraphysis
Sporophyte (9 DAF)
Sporophyte (16 DAF)
Sporophyte S1
Sporophyte S2
Sporophyte S3
Sporophyte S4
Sporophyte (10 DPC)
Spore capsule (green)
Spore capsule (green, reute)
Spore capsule (mature)
Spore capsule (mature, reute)
Spores (germinating, continous light)
Protoplast
Protonema
Protonema (liquid culture)
Protonema+aba
Protonema+gametophore
Protonema+gametophore (continous light)
Protonema+gametophore (heat stress)
Protonema+gametophore (high light)
Protonema+gametophore (low light)
Protonema+gametophore+acetone
Protonema+gametophore+gib.acid (continous light)
Protonema+gametophore+glucose (blue light)
Protonema+gametophore+glucose (darkness)
Protonema+gametophore+glucose (far red light)
Protonema+gametophore+glucose (red light)
Protonema+gametophore+glucose (uv-b light)
Protonema+gametophore+jasmonate
Protonema+gametophore+stringolactone
Protonema+glucose (continous light)
Chloronema
Pp3c10_14730V3.1 (Pp3c10_14730)
-0.04 -2.37 0.23 -5.12 0.52 -1.09 -0.63 -0.19 -1.99 -2.56 -6.27 -7.49 -1.61 -2.05 -3.58 -0.01 2.98 -3.3 0.37 0.87 3.01 2.33 3.73 - -0.58 -3.95 -5.01 - -5.66 -2.41 -3.75 -4.08 -4.94 - - -5.77 -5.54 -1.41 -4.77 -1.97 -6.25 -5.77 -1.81 -3.19 -5.41 -1.96 -3.0 -7.31
Pp3c10_21590V3.1 (Pp3c10_21590)
- - - - - - - - - - - - - - - - 5.58 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 1.6 - - - - - - - - - - - - - 4.48 2.93 - - - - - 3.38 - 2.2 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Pp3c11_12660V3.1 (Pp3c11_12660)
- - - - - - - - - - - - - - - - 5.58 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Pp3c11_5490V3.1 (Pp3c11_5490)
-1.34 0.69 0.9 - -2.6 -1.7 0.09 -3.17 - -5.1 - - -4.16 -1.95 -6.53 -0.33 4.09 -2.63 3.82 2.94 -2.32 -3.3 0.14 - -2.27 -2.92 - -3.22 - -4.82 -4.5 - -6.5 - -3.83 -4.43 - -2.92 - -4.73 - - - -3.7 - -3.37 - -5.33
Pp3c12_11370V3.1 (Pp3c12_11370)
- - 0.24 - 0.37 - - - - -0.12 - - - - - - 4.63 - 3.19 2.12 - - - - 2.17 0.67 - - - -1.82 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Pp3c12_12960V3.1 (Pp3c12_12960)
- - - - - 4.49 - - - - - - - - - - 4.67 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Pp3c12_13340V3.1 (Pp3c12_13340)
0.58 -1.18 -2.55 -7.75 0.0 1.63 0.83 0.8 -0.44 -1.62 -4.05 -4.03 -1.1 -1.24 -1.65 1.84 3.08 - 1.88 0.67 -1.55 -0.69 2.11 - -5.47 -6.34 - - -6.52 -1.61 -3.02 -2.13 -2.08 -4.33 - - -5.02 -0.38 -3.44 0.32 - 0.97 2.52 -0.14 -1.59 -0.1 -1.67 -8.53
Pp3c12_1990V3.1 (Pp3c12_1990)
- - - - 2.6 - - - - - - - - - - - 4.87 - - - - - - - - 3.66 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Pp3c12_20120V3.1 (Pp3c12_20120)
- - 0.71 - 2.65 - - - - - - - - - - 2.02 4.37 1.72 - - - - - - 0.92 2.62 - - - -1.1 - - - - - 1.87 - - - - - - - - - - - -
Pp3c12_21720V3.1 (Pp3c12_21720)
- - - - - - - - - - - - - - - - 5.58 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Pp3c12_7470V3.1 (Pp3c12_7470)
- 2.44 1.58 1.74 1.18 - - - - - - - - - - - 4.88 - - - - - - - - 2.18 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Pp3c13_16410V3.1 (Pp3c13_16410)
- - - - - - - - - - - - - - -0.54 - 5.12 - - - - - - - - 3.65 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Pp3c13_20800V3.1 (Pp3c13_20800)
- - - - - - - - - - - - - - - - 5.58 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Pp3c14_18770V3.1 (Pp3c14_18770)
- - - - - - - - - - - - - - - - 5.13 2.18 - - - - - - - 3.08 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Pp3c14_25400V3.1 (Pp3c14_25400)
- - - - - - - - - - - - - - -1.02 - 5.57 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Pp3c14_2890V3.1 (Pp3c14_2890)
- - 3.31 - - - - - - - - - - - - - 5.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Pp3c14_4460V3.1 (Pp3c14_4460)
2.0 0.81 1.01 1.03 -4.06 1.74 1.48 1.14 1.68 -2.23 -2.2 -1.24 -3.46 -2.89 -2.54 0.87 3.31 0.23 -0.14 -1.8 -2.33 -4.38 -2.43 0.8 -2.54 -0.47 -2.24 -0.73 -1.91 -0.24 -1.21 -1.65 -1.2 -0.69 -2.45 -1.96 -1.49 -1.71 -2.17 -1.39 -2.43 -2.15 -1.54 -2.22 -0.5 -2.05 -2.17 -0.72
Pp3c14_530V3.1 (Pp3c14_530)
- - - - - - - - - - - - - - - - 5.58 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Pp3c14_7370V3.1 (Pp3c14_7370)
- - - - - - - - - - - - - - - - 5.14 - - - - - - - - 3.68 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Pp3c14_8060V3.1 (Pp3c14_8060)
- - 2.94 - - - - - - - - - - - -0.98 - 5.32 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Pp3c15_1040V3.1 (Pp3c15_1040)
- 2.65 2.4 - -21.94 -3.99 - - - - - - - - - - 4.85 0.01 - - - -0.7 - - - 2.08 - - - - - - - -16.57 - - - -14.88 - - - - -7.43 0.81 - - -25.19 -
Pp3c15_17270V3.1 (Pp3c15_17270)
- - - - - - - - - - - - - - - - 5.58 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Pp3c15_21459V3.1 (Pp3c15_21459)
-1.34 - -3.19 - -1.11 -1.02 -3.11 0.02 - -2.66 -0.56 -0.47 -1.79 -1.68 -1.45 - 3.34 -4.18 3.51 1.49 -2.0 -4.79 3.49 - -0.47 1.7 0.81 -4.65 - -7.79 - -1.43 - - - - - -3.27 - -3.0 - -4.76 -1.35 -3.21 -4.36 -3.92 - -
Pp3c16_7680V3.1 (Pp3c16_7680)
- - - - 2.8 - - - - - - - - - - - 5.36 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Pp3c17_14290V3.1 (Pp3c17_14290)
- - - - - - - - - - - - - - - - 5.58 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Pp3c17_19910V3.1 (Pp3c17_19910)
- - - - - - - - - - - - - - - - 5.58 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Pp3c17_4900V3.1 (Pp3c17_4900)
- - - - - - - - - - - - - - - - 5.58 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Pp3c18_10320V3.1 (Pp3c18_10320)
- - - - - - - - - - - - - - - - 5.58 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Pp3c18_10480V3.1 (Pp3c18_10480)
- - - - - - - - - - - - - - - - 5.58 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Pp3c18_13850V3.1 (Pp3c18_13850)
- - - - - - - - - - - - - - - - 4.49 - - - - - - - - 3.12 - - - - - - - - - - - - - 3.31 - - 2.8 - - - - -
Pp3c18_3150V3.1 (Pp3c18_3150)
- - - - - - - - - - - - - - - - 5.58 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - -4.48 -0.2 1.3 2.79 2.05 2.7 1.76 -4.49 - - - - -5.57 - 4.31 -3.88 -1.63 -1.83 - -3.76 -0.85 - -2.59 - - - -3.11 -3.38 -1.34 -2.98 -3.21 -3.54 - - - -1.01 -3.22 -2.65 -3.38 -2.72 -2.89 -4.17 - -3.91 -2.54 -5.51
Pp3c19_23020V3.1 (Pp3c19_23020)
- - - - - - - - - - - - - - - - 5.58 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Pp3c19_6120V3.1 (Pp3c19_6120)
- - - - 3.69 - - - - - - - - - - - 5.13 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Pp3c1_283V3.1 (NRPD5)
- - 1.61 - - - - - - - - - - - - 3.26 5.14 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Pp3c1_29490V3.1 (Pp3c1_29490)
- - - - - - - - - - - - - - - - 4.87 - - - - - - 2.57 - - - 2.72 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.64 -
Pp3c1_34920V3.1 (Pp3c1_34920)
- - 2.33 2.77 - - - - - - - - - - - - 5.18 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Pp3c20_22860V3.1 (Pp3c20_22860)
- - - - - - - - - - - - - - - - 5.58 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-2.18 -4.1 -1.83 -8.86 0.12 -0.08 0.64 -1.15 -4.57 -1.57 -7.64 -9.86 -1.44 -0.35 -2.41 -5.35 4.46 -5.87 2.97 2.38 -0.56 -3.01 0.35 -7.68 -1.96 -5.95 - -7.43 -3.28 -3.46 -5.31 -6.04 -4.99 -7.24 -8.88 -5.33 -5.47 -2.61 -8.03 -0.49 -2.63 -0.6 -0.66 0.33 -4.13 -2.9 -2.46 -6.49
Pp3c20_5220V3.1 (Pp3c20_5220)
- - - - - - - - - - - - - - -0.69 - 5.57 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Pp3c21_14160V3.1 (Pp3c21_14160)
- - - - - - - - - - - - - - - - 5.58 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Pp3c21_19360V3.1 (Pp3c21_19360)
- - - - -5.92 -3.02 -0.68 -1.6 -0.04 0.55 -0.22 -0.35 -0.11 -0.59 1.27 - 4.4 -3.74 -0.19 -1.45 -2.2 -2.88 2.53 -7.14 2.41 -0.1 1.04 - - -7.53 -7.74 -0.52 -7.95 - - -7.06 - -2.2 - -3.05 - -3.35 -1.69 -3.43 - -2.49 -6.77 -2.68
Pp3c22_20150V3.1 (Pp3c22_20150)
- - - - - - - - - - - - - - -1.69 - 5.24 - - - - - - - - 3.26 - - - -1.72 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Pp3c22_280V3.1 (Pp3c22_280)
- - - 2.12 - - - 2.64 - - - - - - - - 4.74 - - - - - - 2.53 - 2.29 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Pp3c22_8290V3.1 (Pp3c22_8290)
- - - - - - - - - - - - - - - - 5.58 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Pp3c22_9020V3.1 (Pp3c22_9020)
- - - - - - - - - - - - - - - - 5.58 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Pp3c23_13720V3.1 (Pp3c23_13720)
- - 3.22 - - - - - - - - - - - - - 5.27 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Pp3c23_3850V3.1 (Pp3c23_3850)
- - - - - - - - - - - - - - - - 5.58 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Pp3c23_7660V3.1 (Pp3c23_7660)
- - - - - - - - - - - - - - - - 5.58 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Pp3c24_5030V3.1 (Pp3c24_5030)
- - 1.71 - -0.38 - - - - - - - - - - - 4.09 0.72 - - - - - 4.23 - 2.72 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Pp3c26_10060V3.1 (Pp3c26_10060)
- - - - - - - - - - - - - - - - 5.58 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Pp3c2_15650V3.1 (Pp3c2_15650)
- - - - - - - - - - - - - - - - 5.58 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Pp3c2_17180V3.1 (Pp3c2_17180)
- - 2.16 - - - - - - - - - - - - - 5.4 - - - - - - - - 0.53 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - 2.56 - - - - - - - - - - - - 3.57 4.92 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Pp3c3_30870V3.1 (Pp3c3_30870)
- - - - - - - - - - - - - - - - 5.58 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Pp3c3_36860V3.1 (Pp3c3_36860)
- - - - - - - - - - - - - - - - 5.58 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Pp3c4_15113V3.1 (Pp3c4_15113)
- - - - - - - - - - - - - - - - 5.58 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - -5.04 -0.86 -3.84 -2.01 - 0.62 - - -1.01 -4.77 -0.76 - 4.38 -0.61 0.26 1.15 2.12 -0.48 3.15 -0.96 0.37 -2.2 -3.58 - - -1.34 -1.77 -5.23 -5.6 - - - - -0.55 - -3.82 - - -0.86 -2.34 - -0.59 -0.98 -
Pp3c4_30930V3.1 (Pp3c4_30930)
- - - - - - - - - - - - - - - - 5.31 3.04 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Pp3c5_17240V3.1 (Pp3c5_17240)
- - - - - - - - - - - - - - - - 5.58 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Pp3c6_9590V3.1 (Pp3c6_9590)
- - - - - - - - - - - - - - - - 5.14 - - - - - - - - 3.68 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Pp3c7_11770V3.1 (Pp3c7_11770)
- - - - - - - - - - - - - - - - 5.58 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Pp3c7_16169V3.1 (Pp3c7_16169)
- - - - - - - - - - - - - - - - 5.58 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Pp3c7_22620V3.1 (Pp3c7_22620)
- - - - - - - - - - - - - - - - 5.58 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Pp3c8_1400V3.1 (Pp3c8_1400)
- - - - - - - - - - - - - - - - 5.58 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.