Heatmap: Cluster_3 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Aerial Stem
Mature Aerial Stem
Syangia
Rhizome
0.36 1.0 0.4 0.04
0.6 1.0 0.08 0.0
0.37 1.0 0.09 0.0
0.0 1.0 0.0 0.0
0.0 1.0 0.02 0.0
0.18 1.0 0.06 0.0
0.55 1.0 0.03 0.02
0.12 1.0 0.27 0.05
0.79 1.0 0.44 0.62
0.66 1.0 0.27 0.0
0.29 1.0 0.02 0.01
0.55 1.0 0.05 0.01
0.55 1.0 0.02 0.03
0.11 1.0 0.0 0.0
0.0 1.0 0.0 0.0
0.54 1.0 0.38 0.06
0.97 1.0 0.44 0.25
0.44 1.0 0.1 0.06
Pnu_g01340 (ECA3)
0.55 1.0 0.1 0.03
0.05 1.0 0.0 0.0
0.13 1.0 0.0 0.15
0.89 1.0 0.83 0.76
0.84 1.0 0.15 0.01
0.43 1.0 0.0 0.0
0.63 1.0 0.2 0.03
0.51 1.0 0.49 0.03
0.55 1.0 0.2 0.02
1.0 0.75 0.2 0.07
Pnu_g01909 (LOS1)
0.48 1.0 0.84 0.04
0.0 1.0 0.0 0.0
0.75 1.0 0.24 0.01
0.49 1.0 0.55 0.04
0.51 1.0 0.01 0.04
0.51 1.0 0.31 0.05
0.58 1.0 0.01 0.02
0.8 1.0 0.3 0.0
0.69 1.0 0.8 0.02
0.8 1.0 0.45 0.02
0.63 1.0 0.12 0.03
0.42 1.0 0.06 0.0
0.57 1.0 0.04 0.05
0.33 1.0 0.29 0.02
0.79 1.0 0.13 0.05
0.42 1.0 0.28 0.05
0.52 1.0 0.14 0.01
0.56 1.0 0.5 0.05
0.65 1.0 0.3 0.04
0.72 1.0 0.47 0.49
0.69 1.0 0.18 0.07
Pnu_g03357 (CAB4)
0.86 1.0 0.6 0.0
0.57 1.0 0.39 0.03
Pnu_g03686 (AGT)
0.61 1.0 0.46 0.3
0.64 1.0 0.51 0.02
0.65 1.0 0.39 0.04
0.48 1.0 0.26 0.05
0.37 1.0 0.07 0.03
0.74 1.0 0.4 0.01
0.57 1.0 0.69 0.05
0.55 1.0 0.55 0.03
0.71 1.0 0.55 0.1
0.77 1.0 0.45 0.17
0.62 1.0 0.34 0.12
0.85 1.0 0.11 0.06
0.48 1.0 0.01 0.05
0.03 1.0 0.12 0.25
0.66 1.0 0.62 0.07
0.53 1.0 0.27 0.03
0.0 1.0 0.0 0.0
0.51 1.0 0.0 0.0
0.58 1.0 0.08 0.0
0.58 1.0 0.24 0.06
0.39 1.0 0.02 0.26
0.17 1.0 0.03 0.0
1.0 0.88 0.05 0.02
0.31 1.0 0.0 0.17
0.43 1.0 0.0 0.29
0.8 1.0 0.64 0.0
0.45 1.0 0.2 0.04
0.9 1.0 0.63 0.65
0.0 1.0 0.0 0.0
0.19 1.0 0.0 0.0
0.42 1.0 0.24 0.05
0.82 1.0 0.04 0.09
0.75 1.0 0.05 0.07
0.0 1.0 0.0 0.0
0.33 1.0 0.1 0.03
0.37 1.0 0.68 0.11
Pnu_g08345 (CAC3)
0.9 1.0 0.6 0.78
0.71 1.0 0.58 0.35
0.46 1.0 0.11 0.01
0.43 1.0 0.0 0.0
0.7 1.0 0.17 0.0
Pnu_g09040 (BGLU40)
0.39 1.0 0.01 0.3
0.41 1.0 0.52 0.03
1.0 0.82 0.37 0.29
0.89 1.0 0.59 0.71
0.19 1.0 0.0 0.0
1.0 0.71 0.1 0.16
0.44 1.0 0.11 0.01
0.7 1.0 0.37 0.08
0.59 1.0 0.1 0.0
0.63 1.0 0.0 0.02
0.92 1.0 0.2 0.07
0.39 1.0 0.63 0.08
0.55 1.0 0.7 0.08
0.6 1.0 0.0 0.06
0.73 1.0 0.6 0.08
0.29 1.0 0.13 0.04
0.7 1.0 0.32 0.11
0.71 1.0 0.23 0.54
0.25 1.0 0.22 0.1
0.68 1.0 0.25 0.06
0.0 1.0 0.0 0.0
0.66 1.0 0.43 0.03
0.71 1.0 0.35 0.42
0.0 1.0 0.03 0.03
0.49 1.0 0.0 0.0
Pnu_g13396 (VPS33)
0.94 1.0 0.91 0.91
0.58 1.0 0.62 0.12
0.38 1.0 0.54 0.09
0.72 1.0 0.02 0.02
0.45 1.0 0.08 0.02
0.21 1.0 0.01 0.0
0.79 1.0 0.48 0.37
0.35 1.0 0.3 0.07
0.11 1.0 0.05 0.08
0.44 1.0 0.05 0.03
0.77 1.0 0.42 0.23
Pnu_g17865 (REME1)
0.98 1.0 0.72 0.77
Pnu_g18783 (BAT1)
0.95 1.0 0.64 0.35
0.57 1.0 0.68 0.4
0.82 1.0 0.86 0.79
0.93 1.0 0.52 0.48
0.87 1.0 0.97 0.11
0.54 1.0 0.27 0.16
0.49 1.0 0.1 0.02
0.53 1.0 0.32 0.03
0.7 1.0 0.14 0.01
0.7 1.0 0.53 0.0
0.52 1.0 0.81 0.09
0.66 1.0 0.56 0.64
0.65 1.0 0.2 0.02
0.82 1.0 0.29 0.16
0.1 1.0 0.46 0.13
1.0 0.66 0.36 0.0
1.0 0.94 0.05 0.0
0.77 1.0 0.15 0.01
0.48 1.0 0.0 0.0
0.23 1.0 0.0 0.06
0.71 1.0 0.05 0.0
0.56 1.0 0.07 0.0
0.6 1.0 0.04 0.06
0.52 1.0 0.03 0.03
0.65 1.0 0.06 0.03
0.75 1.0 0.36 0.02
0.83 1.0 0.34 0.14
0.6 1.0 0.55 0.02
0.93 1.0 0.14 0.33
0.56 1.0 0.23 0.07
Pnu_g29936 (HSP83)
1.0 0.84 0.53 0.15
0.83 1.0 0.34 0.0
Pnu_g30080 (SBPASE)
0.97 1.0 0.32 0.03
0.76 1.0 0.23 0.42
0.83 1.0 0.55 0.62
0.5 1.0 0.24 0.07
0.32 1.0 0.3 0.04
0.21 1.0 0.05 0.0
0.87 1.0 0.81 0.79
0.88 1.0 0.11 0.09
0.79 1.0 0.11 0.04
0.64 1.0 0.5 0.02
0.42 1.0 0.16 0.02
Pnu_g31905 (MPK10)
0.76 1.0 0.57 0.61
0.65 1.0 0.62 0.09
0.87 1.0 0.6 0.03
0.75 1.0 0.03 0.06
0.78 1.0 0.65 0.55
0.63 1.0 0.6 0.09
0.55 1.0 0.16 0.01
0.83 1.0 0.54 0.3
1.0 0.75 0.41 0.17
0.42 1.0 0.15 0.03
0.21 1.0 0.02 0.06
0.39 1.0 0.2 0.08

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)