1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_57 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

 Transpose table  Download table
Gene
Aerial Stem
Mature Aerial Stem
Syangia
Rhizome
Pnu_g00455 (DUT1)
 10.0 10.15 21.78 5.27
Pnu_g00709 (JR3)
 26.73 25.71 39.7 23.0
Pnu_g00760 (CDC48B)
 9.5 9.77 16.28 9.33
93.85 100.98 136.28 95.43
Pnu_g01288 (RUS2)
 18.36 20.81 26.91 18.17
7.4 8.17 22.67 9.98
16.01 17.51 22.2 13.97
48.33 52.64 85.75 51.01
12.57 12.94 22.46 10.71
5.5 7.55 34.19 7.56
Pnu_g01722 (NDA1)
 15.16 13.84 20.98 12.4
7.78 7.05 28.33 8.32
Pnu_g01984 (RS41)
 64.64 67.72 96.1 63.46
29.56 26.18 41.23 23.95
Pnu_g02348 (PHB3)
 55.02 47.91 88.88 39.92
18.23 20.11 44.89 21.03
26.84 24.07 53.77 20.08
Pnu_g03104 (CRR22)
 5.33 4.93 8.01 4.05
Pnu_g03806 (ORP4B)
 3.12 3.78 9.13 3.94
63.9 68.52 94.68 69.65
3.49 4.13 11.83 3.35
16.21 17.31 29.37 17.8
10.15 10.53 15.75 10.62
Pnu_g06998 (CAD1)
 30.52 32.74 57.68 33.09
4.7 4.54 7.94 3.75
Pnu_g07121 (RS41)
 50.61 54.8 80.54 56.25
9.21 9.33 15.9 10.19
6.83 7.47 15.02 7.25
17.46 16.4 40.26 15.97
Pnu_g07634 (FLK)
 96.07 111.71 147.61 101.18
Pnu_g07689 (PIMT2)
 29.61 39.82 79.46 40.86
5.92 6.98 12.87 5.69
2.75 3.65 8.26 3.92
24.47 25.73 31.14 23.49
4.4 7.37 21.01 4.27
Pnu_g08535 (ECA3)
 9.93 10.62 21.67 10.19
39.75 34.5 70.18 31.46
2.16 2.79 5.83 2.52
2.15 2.78 10.94 3.31
Pnu_g09645 (TPS1)
 17.51 20.1 33.17 20.76
Pnu_g10083 (HAK5)
 9.55 9.43 22.5 7.11
11.71 12.56 20.97 12.34
Pnu_g10522 (ABI1)
 19.46 14.0 36.23 11.44
4.48 5.63 7.46 3.92
Pnu_g10647 (EMB2271)
 6.81 6.56 10.06 5.17
36.99 32.93 51.89 32.27
7.3 9.4 14.17 8.78
Pnu_g11066 (GPCR)
 13.38 13.33 29.53 14.16
4.14 3.38 6.37 2.84
Pnu_g11184 (GAMMAVPE)
 90.16 102.99 209.51 102.12
6.63 7.08 15.02 5.75
3.52 3.63 7.59 3.18
7.67 7.94 12.22 6.59
Pnu_g11772 (RBL1)
 23.9 20.01 53.19 18.88
Pnu_g11977 (NFB1)
 1.86 1.56 3.88 1.2
Pnu_g12069 (PSAT1)
 1.12 1.73 3.31 1.55
10.25 9.66 16.73 9.77
Pnu_g12389 (ABF1)
 2.62 2.32 7.36 1.39
Pnu_g12564 (emb2191)
 7.43 7.95 14.83 6.93
31.65 32.44 44.77 34.02
Pnu_g13420 (TON1B)
 36.2 36.65 48.05 33.11
19.62 21.15 39.93 20.64
33.77 33.34 71.38 33.76
55.43 61.06 99.0 52.69
22.68 24.38 36.22 24.87
11.91 9.73 28.26 7.48
141.95 154.82 175.05 144.2
110.56 135.69 357.37 149.7
1.12 2.46 7.3 1.41
Pnu_g16808 (SHM3)
 22.15 19.72 43.1 16.66
8.47 8.03 33.19 9.74
5.86 7.38 15.41 6.1
3.12 2.65 5.56 2.66
10.67 9.77 19.76 9.43
34.96 37.96 82.01 36.91
4.2 3.56 8.8 3.64
22.41 24.54 33.66 21.88
4.69 5.63 24.82 5.08
Pnu_g18497 (QWRF8)
 2.5 3.17 6.09 3.3
67.59 71.65 93.36 61.64
Pnu_g19018 (TGA2)
 22.62 21.64 38.09 21.29
35.16 34.76 74.31 41.7
8.59 4.79 20.24 3.66
Pnu_g19671 (CSTF77)
 7.7 8.72 12.38 8.54
Pnu_g19873 (mMDH1)
 83.85 87.34 128.15 79.17
14.77 17.71 28.67 17.62
Pnu_g20505 (PPOX)
 27.43 23.31 42.56 22.03
Pnu_g20543 (ADG1)
 3.18 2.37 7.69 2.23
Pnu_g20828 (CYCB2;2)
 1.46 1.53 4.43 1.27
1.77 2.79 7.08 2.29
0.07 0.47 4.18 0.24
Pnu_g23582 (VSR3)
 4.99 8.64 29.43 7.89
0.25 0.78 3.48 0.0
15.8 15.84 25.43 15.23
13.46 14.09 34.58 15.38
5.27 5.53 13.45 4.14
Pnu_g24758 (HSP18.2)
 1.39 1.04 14.15 1.43
Pnu_g24919 (DXR)
 11.07 9.11 20.02 6.77
5.95 9.91 17.96 9.46
Pnu_g25109 (bZIP16)
 16.51 16.0 27.21 17.26
Pnu_g25395 (DREB2)
 2.71 3.33 7.08 3.34
Pnu_g25458 (ATX4)
 4.77 5.64 11.03 4.57
63.53 73.59 141.24 70.99
17.86 21.23 39.24 20.68
0.77 1.02 4.09 0.41
Pnu_g25850 (LRL3)
 12.59 13.32 28.49 13.04
26.67 31.43 45.04 31.73
Pnu_g25870 (ATU2AF65A)
 12.48 12.72 21.04 11.27
Pnu_g25961 (CGS)
 16.75 15.64 30.89 12.55
91.45 111.58 145.74 88.2
102.77 104.41 209.05 93.93
Pnu_g27234 (DPBF3)
 7.01 7.77 15.27 7.35
15.19 16.65 35.86 13.48
0.86 1.33 3.87 0.9
Pnu_g27691 (EMB3012)
 5.62 6.7 11.93 7.15
3.42 2.13 8.59 2.34
Pnu_g28273 (GAMMAVPE)
 27.52 34.13 111.75 39.17
0.23 0.57 3.89 0.0
52.08 49.91 153.78 61.42
2.2 5.15 14.3 0.72
39.96 37.38 71.93 29.08
87.29 95.21 189.59 87.81
8.8 11.68 44.21 13.61
Pnu_g30250 (AHG3)
 31.11 24.53 68.35 20.01
3.48 3.56 4.95 3.25
39.0 39.33 84.63 36.18
6.22 5.49 10.25 5.46
124.31 139.25 207.43 126.42
25.48 22.25 46.66 16.31
116.67 123.44 183.83 118.92
Pnu_g33724 (BPM2)
 37.01 36.75 58.37 40.25
35.13 39.06 53.38 30.4

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)