1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_32 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

 Transpose table  Download table
Gene
Aerial Stem
Mature Aerial Stem
Syangia
Rhizome
34.29 33.69 33.06 33.49
Pnu_g00474 (RABH1e)
 29.56 23.08 26.04 24.27
37.86 40.12 35.75 37.14
Pnu_g00517 (DSPTP1)
 33.45 33.21 31.31 27.6
Pnu_g00911 (FUC1)
 38.36 32.94 30.08 30.91
1.58 3.11 1.21 0.09
6.73 4.84 4.58 5.12
Pnu_g01108 (TIL)
 118.68 125.9 97.77 103.83
Pnu_g01244 (AGT2)
 15.22 13.79 11.75 13.27
Pnu_g01279 (LCB2)
 28.58 29.22 27.22 28.74
Pnu_g01285 (ALDH4)
 10.07 10.17 8.55 10.5
10.96 12.33 8.41 7.42
4.4 5.65 3.24 4.27
Pnu_g01887 (GLTP1)
 30.54 28.5 28.26 28.12
8.47 7.39 7.2 8.69
5.49 4.67 3.48 3.9
3.56 4.07 3.12 3.72
22.45 21.68 20.3 22.5
12.07 13.51 7.32 10.94
Pnu_g03403 (ETFBETA)
 11.66 12.61 10.76 12.72
20.77 24.18 8.64 14.79
Pnu_g03824 (GONST1)
 8.32 7.3 6.51 7.31
Pnu_g03869 (C4H)
 15.09 15.41 10.78 12.93
Pnu_g04159 (CINV2)
 5.79 5.92 4.41 5.78
7.64 6.65 5.12 6.66
11.42 11.26 6.12 9.28
5.12 5.59 2.56 0.49
27.09 21.68 19.31 21.17
36.49 35.73 34.67 31.85
34.49 33.08 32.69 32.1
2.53 2.43 2.32 2.02
11.74 11.98 10.29 12.0
Pnu_g06527 (PK1B)
 32.79 29.29 29.84 30.35
27.49 30.03 23.96 27.11
Pnu_g06715 (MBD5)
 7.94 7.29 6.48 8.37
15.68 15.92 13.29 17.25
15.9 12.81 14.03 11.06
15.74 15.29 13.77 13.7
21.09 21.59 11.05 8.8
2.77 3.29 2.29 2.87
3.83 4.07 0.85 0.13
Pnu_g07920 (ACX1)
 8.57 8.99 7.34 8.72
47.79 45.22 41.66 40.61
12.4 13.6 9.95 10.89
3.95 3.97 3.46 3.72
8.44 7.25 6.31 6.21
1.89 3.52 1.38 0.2
14.25 14.03 5.52 8.26
7.31 7.0 5.6 5.53
28.45 28.48 25.0 25.31
1.55 2.58 0.27 1.44
Pnu_g10466 (ARI2)
 5.92 7.39 6.24 6.85
3.77 3.0 2.18 2.35
31.48 31.94 25.9 34.59
13.34 15.31 12.25 12.42
5.87 5.58 3.57 4.63
Pnu_g12156 (AVP1)
 3.84 5.26 2.12 0.65
7.77 9.51 4.45 4.6
12.56 12.08 10.5 9.58
52.08 49.2 49.64 47.68
Pnu_g12922 (CSY2)
 46.0 45.44 43.47 42.61
Pnu_g13084 (ROPGEF7)
 5.79 5.56 4.23 4.1
4.48 5.18 3.56 4.52
24.09 23.69 14.91 15.66
4.21 4.25 1.9 1.24
2557.5 2640.72 1219.03 1130.61
74.64 58.44 45.7 46.88
29.25 33.37 22.06 25.71
7.99 7.81 7.14 7.44
14.41 17.5 8.92 15.48
Pnu_g17253 (XBAT35)
 21.71 22.44 21.58 21.37
3.83 4.05 1.83 2.02
35.9 35.04 32.35 30.39
10.07 8.31 8.42 7.85
Pnu_g17785 (HCT)
 40.34 33.93 30.89 32.77
9.39 8.63 6.73 8.19
Pnu_g17952 (MMZ3)
 14.97 16.1 11.58 13.85
19.09 20.04 13.89 18.89
10.73 14.83 3.72 8.65
2.85 2.97 2.21 3.21
Pnu_g19199 (NHX6)
 2.95 4.66 2.38 2.82
3445.94 3377.94 1968.84 1540.8
9.62 10.54 8.03 8.74
Pnu_g19667 (KIN10)
 14.39 14.19 14.1 14.35
Pnu_g19682 (KT1)
 9.4 11.1 4.67 7.44
Pnu_g20203 (HGO)
 20.95 20.6 18.67 22.32
Pnu_g20245 (TCP3)
 15.13 12.21 9.62 10.32
16.46 17.16 15.58 15.18
Pnu_g20995 (CTS)
 20.36 19.32 19.22 18.98
13.39 15.12 9.73 14.8
2.91 3.58 1.3 3.03
35.03 28.72 25.99 28.46
37.27 40.79 29.12 17.29
17.53 15.21 13.45 12.58
10.22 9.37 6.72 9.96
13.79 12.97 12.24 12.39
11.82 11.99 7.46 9.36
9.6 9.59 6.81 11.62
11.39 17.84 9.09 9.47
Pnu_g23988 (XIC)
 5.7 5.79 4.33 3.92
1038.65 1113.17 624.21 536.8
10.15 10.77 9.64 10.39
5.05 4.98 3.88 4.84
7.65 8.43 6.69 7.83
22.65 22.88 22.45 20.32
3.18 3.55 1.16 0.66
Pnu_g25512 (APRL4)
 16.68 17.08 16.75 17.49
3.99 3.51 2.17 3.36
2.66 2.89 1.64 2.17
4.29 4.48 4.07 4.32
Pnu_g26386 (IDD7)
 6.31 6.53 3.63 3.82
2.9 3.25 1.42 1.59
4.65 5.06 2.36 3.09
3.29 2.83 2.17 2.98
3.29 3.67 2.81 3.59
6.36 5.1 4.01 3.87
6.84 6.97 4.88 7.04
1.98 2.73 1.41 0.0
3.34 3.86 2.92 2.65
Pnu_g29528 (B5 #4)
 26.87 23.01 16.36 21.15
3.01 3.02 2.71 2.13
Pnu_g30176 (HSP83)
 2.9 2.46 0.29 0.12
Pnu_g30527 (GDH1)
 9.1 8.88 7.55 7.1
521.58 487.22 292.8 237.47
3.76 5.24 1.52 2.03
39.46 49.99 35.2 44.05
8.45 6.9 5.72 6.49
1348.06 1492.27 690.67 709.38
12.63 11.14 10.19 11.1
Pnu_g32182 (OMT1)
 7.07 5.32 4.14 5.83
6.22 4.53 4.93 5.0
Pnu_g32662 (COL4)
 7.24 10.07 6.23 5.45
2.14 3.2 0.5 1.76
3.28 3.29 2.34 1.69
3.2 2.86 2.16 2.48
9.65 10.62 9.24 10.17
84.43 86.6 77.34 84.73
Pnu_g34061 (SUM3)
 21.92 21.07 18.09 19.68

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)