1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_103 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

 Transpose table  Download table
Gene
Aerial Stem
Mature Aerial Stem
Syangia
Rhizome
-0.61 0.51 -3.86 0.89
0.02 -0.05 -1.32 0.7
0.17 0.28 -1.52 0.39
0.25 -0.05 -0.86 0.37
0.54 0.11 -4.02 0.49
-0.1 0.09 -0.66 0.46
0.04 0.08 -3.39 0.86
0.3 0.28 -0.92 0.03
0.29 0.17 -0.81 0.12
0.39 0.2 -1.85 0.34
0.31 -0.48 -1.84 0.82
0.5 -0.11 -0.55 -0.03
0.51 0.09 -1.88 0.31
0.51 -0.01 -0.97 0.1
0.57 0.2 -3.29 0.33
0.14 0.23 -0.74 0.17
0.67 0.1 -1.84 0.07
0.71 0.02 -3.79 0.35
0.26 0.11 -0.55 0.06
Pnu_g02668 (AZG1)
 0.81 -0.28 -2.47 0.31
0.55 -0.01 -1.15 0.12
0.44 0.23 -1.35 0.11
0.53 0.31 -6.47 0.38
0.17 0.05 -0.54 0.2
0.56 0.22 -5.07 0.41
Pnu_g03449 (OMT1)
 0.35 -0.05 -0.99 0.32
0.26 0.05 -2.91 0.71
0.01 0.1 -0.51 0.28
0.37 -0.14 -0.88 0.32
0.34 0.16 -0.78 0.05
0.39 0.16 -1.47 0.28
0.67 -0.09 -2.43 0.37
-0.06 0.21 -0.95 0.45
Pnu_g04446 (UPL1)
 0.15 -0.02 -0.26 0.1
0.43 0.07 -0.71 -0.01
0.29 0.04 -0.72 0.19
0.6 0.38 -5.68 0.22
0.64 0.02 -4.91 0.48
Pnu_g05007 (CRR22)
 0.49 0.21 -1.52 0.12
0.61 -0.29 -3.11 0.62
Pnu_g05947 (UGT85A1)
 0.5 0.25 -2.65 0.31
0.19 0.05 -0.44 0.12
Pnu_g06206 (STO)
 0.22 0.2 -0.64 0.07
0.4 0.1 -2.3 0.49
0.2 0.22 -0.82 0.17
0.37 0.33 -1.73 0.21
Pnu_g06393 (BGLU42)
 0.25 0.14 -1.21 0.36
Pnu_g06470 (IBO1)
 0.22 0.13 -0.65 0.14
Pnu_g06873 (ERD5)
 0.27 0.22 -1.39 0.32
0.17 -0.03 -0.3 0.11
0.25 0.24 -2.11 0.48
0.84 0.09 -3.4 0.06
0.28 0.06 -3.29 0.71
Pnu_g08452 (IXR1)
 0.47 0.23 -1.95 0.25
Pnu_g08818 (CHS)
 0.39 0.12 -2.64 0.53
Pnu_g09154 (ADH)
 0.11 0.09 -0.97 0.43
Pnu_g09188 (PDF2)
 0.56 -0.02 -2.86 0.49
Pnu_g09403 (EDF4)
 0.33 0.07 -1.35 0.38
0.58 -0.02 -3.94 0.54
0.28 0.21 -1.81 0.42
Pnu_g10066 (LOX1)
 0.39 0.11 -4.2 0.64
0.14 0.13 -0.4 0.06
Pnu_g10710 (DiT1)
 0.2 0.14 -0.76 0.22
Pnu_g10754 (TOR2)
 0.04 0.33 -1.51 0.45
0.34 0.18 -3.37 0.59
Pnu_g11256 (MYB16)
 0.49 0.12 -3.94 0.53
Pnu_g11464 (PI4K GAMMA 4)
 0.24 0.13 -0.8 0.2
0.35 0.12 -1.53 0.37
0.38 -0.08 -3.5 0.73
0.41 0.51 -3.49 0.22
0.22 -0.04 -0.79 0.36
0.43 0.38 -4.74 0.39
Pnu_g12261 (DCR)
 0.59 0.13 -1.68 0.12
Pnu_g12528 (HSP21)
 0.71 -0.05 -1.12 -0.09
Pnu_g12683 (ROT3)
 0.65 0.05 -3.1 0.36
0.08 0.11 -1.09 0.48
Pnu_g12879 (NRT1.5)
 0.52 -0.06 -2.97 0.56
0.13 0.14 -1.03 0.4
0.37 0.02 -0.74 0.13
0.18 -0.13 -4.32 0.93
Pnu_g13852 (XIF)
 0.18 0.26 -0.49 -0.07
0.19 -0.06 -0.68 0.36
0.57 0.12 -3.55 0.43
0.21 0.09 -0.37 0.01
0.23 0.1 -0.69 0.19
0.51 0.05 -1.37 0.21
0.23 0.06 -2.23 0.65
0.26 0.44 -3.7 0.46
0.17 0.18 -1.78 0.53
0.19 0.07 -0.33 0.02
Pnu_g15748 (PDV2)
 0.49 0.23 -1.99 0.22
0.13 -0.0 -0.15 0.01
0.57 0.07 -2.0 0.28
0.51 0.15 -0.85 -0.13
0.61 -0.11 -6.13 0.61
0.47 -0.23 -1.23 0.42
0.62 -0.35 -4.45 0.71
0.3 -0.31 -0.63 0.39
0.27 0.36 -1.18 0.1
Pnu_g18294 (PAL4)
 0.89 -0.44 -5.78 0.47
0.26 0.19 -1.39 0.36
0.62 -0.25 -2.16 0.49
0.79 -0.34 -5.79 0.55
Pnu_g19043 (RKF3)
 0.13 0.14 -0.47 0.12
0.59 -0.05 - 0.62
0.36 0.21 -1.13 0.14
0.33 0.38 -1.25 0.04
0.15 0.19 -0.51 0.06
0.28 -0.15 -0.58 0.28
0.57 0.04 -1.61 0.22
0.41 0.47 -4.0 0.29
0.01 0.07 -0.29 0.17
0.2 0.04 -3.65 0.8
0.47 0.07 -3.49 0.56
0.01 0.2 -0.86 0.37
0.31 0.42 -2.46 0.32
0.53 0.04 -1.71 0.28
0.13 0.42 -2.17 0.43
0.23 0.35 -1.28 0.18
Pnu_g23052 (MRP14)
 0.28 -0.01 -2.6 0.7
Pnu_g23098 (ALDH2)
 0.42 0.14 -1.54 0.28
0.12 0.3 -1.36 0.38
0.24 0.21 -1.96 0.49
0.1 0.03 -0.3 0.14
0.16 -0.01 -0.82 0.4
Pnu_g24959 (EXS)
 0.31 0.13 -1.2 0.3
0.17 0.11 -0.78 0.27
0.2 0.2 -0.84 0.19
0.27 0.24 -0.76 0.03
0.39 0.01 -1.99 0.51
0.28 0.17 -2.05 0.5
0.73 0.0 -2.75 0.25
0.34 0.4 -1.93 0.2
0.52 0.48 -4.27 0.17
0.55 -0.21 -1.28 0.34
0.06 0.15 -0.48 0.18
0.53 0.17 -1.35 0.06
Pnu_g29411 (TIM9)
 0.17 0.07 -0.22 -0.05
0.77 -0.58 -2.13 0.48
0.25 0.01 -1.44 0.51
Pnu_g29933 (UBC20)
 0.18 0.05 -0.93 0.39
0.44 -0.1 -0.61 0.07
0.3 -0.1 -0.49 0.17
0.9 -0.8 -2.07 0.41
0.62 -0.06 -1.22 0.11
Pnu_g30297 (AZG1)
 0.97 -0.33 -3.04 0.17
0.24 0.15 -0.59 0.06
0.21 0.24 -1.02 0.22
0.28 0.22 -1.42 0.32
Pnu_g30586 (ZFN1)
 0.09 0.35 -1.75 0.44
0.64 0.17 -2.09 0.12
Pnu_g30625 (UPL1)
 0.06 -0.01 -0.33 0.23
0.39 0.16 -2.16 0.44
Pnu_g31509 (IXR1)
 0.36 0.12 -1.52 0.36
0.52 -0.31 -3.23 0.73
0.36 0.16 -1.17 0.21
Pnu_g31969 (FATB)
 0.52 -0.17 -1.18 0.3
0.52 0.22 -2.06 0.22
0.48 0.28 -1.52 0.05
0.53 0.02 -4.22 0.57
0.27 0.07 -0.49 0.06
0.63 0.13 -2.24 0.2
0.74 0.25 -5.74 0.16
0.32 -0.14 -3.36 0.8
0.55 0.12 - 0.53
Pnu_g33334 (OPT7)
 0.36 0.1 -0.6 -0.03
0.24 -0.36 - 1.03
0.14 -0.05 -0.44 0.25
Pnu_g33775 (RD21)
 0.4 0.15 -0.82 0.01
0.32 -0.1 -0.62 0.23

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.