1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_46 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

 Transpose table  Download table
Gene
Aerial Stem
Mature Aerial Stem
Syangia
Rhizome
3.91 3.71 1.2 0.0
23.18 21.25 31.93 23.38
7.03 6.77 5.07 0.47
Pnu_g00854 (OTP51)
 6.3 4.17 6.33 3.04
4.12 2.4 2.32 0.13
5.35 5.95 6.91 0.83
19.34 17.19 19.84 14.46
5.19 3.2 4.47 2.39
6.21 3.51 7.33 3.87
12.89 10.98 11.83 7.37
Pnu_g01470 (CAM3)
 305.69 247.78 284.76 228.2
67.85 57.25 80.12 54.32
Pnu_g01634 (ATSMO2)
 31.06 21.71 32.84 21.26
23.48 22.11 24.68 19.67
5.97 5.23 5.47 5.62
5.25 4.47 5.88 5.52
3.8 1.47 3.34 2.46
4.21 3.8 5.41 2.84
5.17 3.82 5.78 3.61
7.9 5.53 11.48 3.36
4.43 3.91 3.93 3.03
Pnu_g02714 (PEX11D)
 34.93 28.53 35.66 25.91
9.9 11.4 7.6 2.34
5.56 4.3 4.91 0.43
3.94 3.75 2.18 0.48
Pnu_g03493 (TMS1)
 11.6 10.35 13.7 7.96
6.3 6.38 6.7 0.15
34.91 25.0 29.77 23.02
3.16 4.44 3.77 1.29
10.85 8.35 10.15 9.97
39.66 32.51 36.35 30.8
4.99 3.42 3.94 1.48
3.56 3.23 3.67 2.48
8.57 7.91 5.29 3.78
3.29 1.19 2.95 2.49
15.28 22.48 17.61 0.97
2.73 2.55 3.53 1.8
10.08 13.88 8.76 0.88
Pnu_g05364 (KAK)
 44.42 36.79 37.65 30.86
19.56 13.87 18.99 21.58
3.41 0.95 3.65 0.49
7.76 11.79 9.26 0.82
4.92 4.39 3.75 0.18
1.98 1.25 2.71 2.29
7.91 5.65 5.94 4.45
3.41 1.84 1.55 0.04
4.04 2.06 2.85 2.16
5.1 4.27 5.24 3.86
10.04 9.0 8.86 7.5
66.88 59.39 56.36 41.81
14.75 12.87 13.22 10.63
8.58 8.47 8.62 8.13
Pnu_g07826 (STP7)
 20.71 15.43 20.29 16.01
2.99 1.5 2.19 1.0
Pnu_g08205 (EMB64)
 38.63 36.7 40.53 33.51
14.57 13.67 11.5 10.85
10.86 8.01 9.04 6.09
5.58 2.52 5.53 1.58
11.3 11.26 7.91 9.1
172.5 150.81 202.81 130.8
6.65 6.28 4.06 4.39
Pnu_g09699 (emb1129)
 170.6 158.13 175.75 148.59
2.73 2.29 1.78 1.43
5.78 4.61 4.03 3.89
8.47 6.78 8.19 6.17
11.75 11.4 10.69 10.32
Pnu_g10105 (EHD1)
 2.87 3.29 3.95 2.28
92.55 70.54 74.26 45.9
20.92 22.51 24.63 20.57
26.24 21.47 23.34 18.96
6.08 6.77 2.56 0.0
5.03 4.22 1.71 1.61
Pnu_g11960 (SGS3)
 4.64 4.0 5.48 3.75
7.5 6.41 8.62 5.68
Pnu_g13259 (SUVR4)
 3.35 3.26 3.58 2.8
6.15 5.52 6.1 4.69
Pnu_g13298 (emb1441)
 9.46 9.39 10.12 9.07
2.91 2.09 3.91 1.98
Pnu_g13480 (IPT2)
 2.45 2.37 2.93 1.76
19.6 17.56 18.59 14.25
Pnu_g13688 (PTR1)
 29.66 24.92 29.43 23.75
6.44 4.78 5.31 3.71
7.85 8.07 9.78 6.66
30.35 20.36 33.1 24.29
Pnu_g14066 (HST)
 6.88 4.38 5.91 3.92
111.48 116.89 134.44 101.72
13.27 10.84 19.17 9.66
35.27 28.42 24.1 17.83
10.13 8.1 9.48 8.32
69.77 59.89 58.69 53.89
Pnu_g14986 (VEL1)
 6.5 5.32 11.58 3.63
42.99 24.6 38.13 8.5
21.26 19.52 16.53 15.01
6.04 7.03 8.27 5.27
12.62 10.35 14.13 7.42
7.8 3.89 8.59 2.31
4.09 3.85 2.93 1.06
9.26 7.86 9.4 7.39
Pnu_g17773 (AGT2)
 7.5 6.12 8.54 6.61
14.67 12.64 15.99 9.94
4.51 5.31 6.81 4.54
16.59 14.21 17.75 14.12
Pnu_g18183 (SCY2)
 4.49 3.43 4.79 3.1
9.86 7.96 10.99 8.11
6.83 3.03 10.15 2.25
277.23 207.95 211.71 136.77
46.15 31.35 48.16 15.72
9.63 5.78 5.9 2.73
6.83 4.02 8.14 3.25
21.72 19.68 23.06 19.25
3.95 3.72 4.85 1.89
3.92 2.84 3.73 2.28
13.98 9.92 15.26 7.86
6.34 4.51 7.29 3.54
Pnu_g20466 (UVR3)
 12.23 4.62 9.29 2.15
9.85 9.19 8.98 6.33
Pnu_g20653 (LPA19)
 6.11 5.29 5.16 5.94
2.34 1.44 2.35 2.02
Pnu_g20751 (RIN13)
 5.86 5.44 6.97 5.62
13.4 9.68 9.0 0.62
5.11 6.34 7.97 3.88
2.38 0.92 3.58 1.08
7.06 4.69 6.61 2.87
2.73 2.39 4.5 1.74
3.3 3.18 2.93 1.71
2.2 3.17 2.89 1.23
3.01 1.73 2.32 1.09
4.65 3.6 6.08 3.0
2.94 1.43 2.94 1.73
8.79 8.73 12.01 9.1
4.35 4.4 6.17 4.78
1.72 1.27 2.6 1.08
19.23 16.61 14.36 1.85
1.74 1.51 2.9 1.09
Pnu_g23335 (MUB6)
 18.33 16.49 16.16 9.84
Pnu_g23573 (CRCK2)
 5.21 1.56 5.43 0.5
2.98 2.67 2.99 0.0
10.29 8.64 11.25 7.23
4.3 1.56 8.18 1.88
12.09 10.71 9.55 8.19
3.78 3.65 3.49 2.87
41.16 31.3 37.32 25.83
22.92 19.44 16.46 13.69
5.91 2.74 7.59 0.24
9.46 6.62 7.71 4.77
Pnu_g25506 (ABC1)
 9.47 7.76 9.79 6.55
27.3 22.26 23.23 20.45
10.56 9.47 11.46 8.5
Pnu_g25875 (GYRB1)
 4.8 4.17 4.07 4.37
19.19 19.27 20.45 15.1
6.42 1.8 9.52 1.8
99.18 103.62 120.32 96.79
Pnu_g27695 (SNL3)
 8.7 9.03 9.45 7.76
52.28 50.66 33.86 2.57
8.6 10.02 9.73 1.12
3.12 1.69 2.51 1.0
1.63 1.03 2.94 0.59
9.5 7.89 2.93 0.3
9.33 9.56 13.04 10.39
2.85 1.6 3.07 1.61
3.41 2.44 2.71 1.8
12.57 15.69 18.62 8.88
5.79 4.09 3.48 4.47
3.83 2.63 3.67 1.42
6.71 4.85 6.3 4.54
3.6 2.06 5.3 1.42
4.48 4.48 4.58 5.16
5.07 3.34 5.99 6.26
3.43 1.3 2.14 0.85
15.3 8.47 16.06 10.31
5.84 4.53 4.04 3.52
Pnu_g31997 (ORG1)
 9.22 6.16 6.78 3.9
28.06 24.61 36.39 22.94
21.81 16.77 19.71 15.0
12.51 10.19 10.04 3.77
Pnu_g32859 (EIN5)
 28.17 24.89 24.08 21.47
5.72 3.0 4.87 1.4
7.26 5.63 6.37 4.57
Pnu_g33922 (UVR2)
 12.09 5.95 11.35 2.96
5.22 4.01 5.03 0.31
13.49 11.88 11.41 1.38
15.42 16.39 16.99 3.75

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)