1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_81 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

 Transpose table  Download table
Gene
Aerial Stem
Mature Aerial Stem
Syangia
Rhizome
3.11 2.42 2.24 0.77
Pnu_g00715 (HDH)
 13.37 12.62 13.8 9.33
Pnu_g00796 (MKK3)
 12.71 10.38 12.83 7.82
Pnu_g00856 (ESP3)
 22.01 18.82 24.02 18.39
34.44 25.97 32.71 17.6
33.99 26.89 31.67 18.66
Pnu_g01710 (SKB1)
 12.65 10.47 13.07 10.32
Pnu_g01948 (EBS)
 30.37 27.81 31.61 22.74
29.78 27.11 31.34 25.13
8.3 5.77 7.0 1.79
40.98 30.04 36.27 22.82
41.24 38.93 43.52 29.28
9.44 6.16 7.74 1.19
Pnu_g02724 (RPAC43)
 54.95 47.36 54.29 40.22
Pnu_g02775 (PHT3;3)
 8.46 7.2 9.58 3.3
7.88 6.14 9.08 5.16
9.21 8.18 5.25 2.2
Pnu_g03367 (MAG1)
 59.5 53.66 51.6 40.05
Pnu_g03764 (P44)
 28.01 20.3 26.38 13.51
8.96 7.67 7.75 5.22
53.58 25.65 37.7 3.11
Pnu_g04221 (ARABIDILLO2)
 4.13 3.24 3.85 2.23
Pnu_g04525 (SUN2)
 4.98 4.13 5.17 2.02
55.16 46.87 50.83 32.24
Pnu_g05794 (WIN2)
 25.57 22.89 29.82 19.38
66.44 56.24 53.64 36.94
6.95 5.82 7.22 4.48
4.74 4.62 5.23 3.31
Pnu_g06157 (FSD1)
 41.47 33.51 33.16 22.15
Pnu_g06175 (PAC1)
 49.73 39.81 50.7 37.96
Pnu_g06319 (NIP6)
 26.19 21.9 30.94 6.3
Pnu_g06330 (SIRB)
 36.31 26.96 31.87 18.82
Pnu_g06516 (ARIA)
 29.3 26.9 27.91 23.65
11.9 10.5 10.92 5.73
18.4 16.09 19.56 13.91
Pnu_g07018 (PKR1)
 7.59 6.84 8.22 6.21
11.42 8.93 10.14 7.06
Pnu_g07063 (FC2)
 42.9 37.74 38.7 28.2
Pnu_g07238 (PIF3)
 26.73 22.26 31.18 16.21
6.31 5.41 5.73 3.88
Pnu_g07348 (BBD1)
 10.79 10.77 12.19 6.71
Pnu_g07508 (MSH3)
 8.42 7.37 7.9 5.45
Pnu_g07654 (SDIR1)
 26.42 25.23 23.31 19.81
7.43 6.26 8.46 5.57
5.01 3.69 4.75 2.7
Pnu_g08088 (HY2)
 13.23 10.51 16.7 6.56
Pnu_g08126 (ORP1B)
 4.61 3.2 4.32 2.0
3.53 3.38 3.96 2.69
Pnu_g08522 (MURE)
 4.2 3.23 4.1 2.51
Pnu_g08542 (CLO)
 17.09 15.85 18.9 13.25
10.3 10.32 8.47 5.74
12.62 11.71 15.29 9.24
3.85 2.46 3.03 0.09
Pnu_g09657 (CLC-C)
 8.79 7.19 6.4 2.67
4.64 3.73 6.13 3.02
23.87 24.05 27.73 21.02
4.91 3.31 4.83 2.26
32.17 27.53 33.42 18.91
40.69 44.8 53.9 25.0
4.77 4.09 5.14 2.43
24.28 21.97 24.22 18.75
Pnu_g10500 (TMK1)
 9.11 7.04 9.11 3.25
Pnu_g10676 (Erv1)
 6.49 5.64 6.05 3.58
85.39 74.36 64.59 47.8
42.83 34.22 38.97 26.75
3.65 2.13 2.7 0.78
26.57 25.93 28.6 19.9
Pnu_g11101 (P5CS2)
 14.07 12.44 12.6 11.17
23.33 21.09 24.61 16.77
Pnu_g11172 (DIS1)
 37.54 31.86 44.02 27.21
Pnu_g11249 (PTAC10)
 18.03 15.52 15.05 12.0
15.02 14.61 15.0 12.66
15.36 14.1 16.21 11.28
5.3 3.92 4.04 1.95
548.28 385.86 674.35 347.86
29.16 24.24 32.88 21.84
76.87 65.39 78.86 50.2
Pnu_g12103 (ERD13)
 626.38 488.1 699.66 419.67
10.16 9.2 10.79 8.65
47.48 35.88 58.9 19.97
Pnu_g12885 (APO2)
 13.17 11.62 11.52 7.51
10.54 6.51 8.41 4.07
12.07 9.6 12.4 7.33
Pnu_g13100 (MCCB)
 6.04 4.34 5.96 2.72
188.2 179.18 173.09 136.22
84.37 84.25 77.57 64.04
Pnu_g13653 (NUDX1)
 15.32 13.91 14.02 10.52
Pnu_g13810 (BIO1)
 4.63 3.25 5.17 1.93
17.57 13.41 16.0 10.57
Pnu_g13861 (SWP)
 7.05 6.25 8.08 5.94
24.61 21.83 24.16 19.23
3.57 3.09 3.62 2.7
8.81 7.55 9.96 6.93
15.51 12.86 16.65 3.77
Pnu_g14728 (CMT3)
 4.67 3.78 4.43 3.31
7.35 6.46 8.82 3.78
Pnu_g15018 (IQD3)
 12.42 11.08 11.31 7.5
Pnu_g15324 (PAPS1)
 14.67 14.88 16.74 12.63
94.02 90.51 100.3 77.72
5.77 5.1 6.16 3.37
13.12 9.21 12.92 6.67
4.68 4.06 5.49 2.54
Pnu_g16857 (HAC1)
 10.58 9.78 11.48 7.75
Pnu_g16927 (RUS3)
 3.24 2.99 3.49 2.37
40.03 36.67 37.45 22.16
8.07 4.56 9.42 1.94
14.92 13.88 17.37 11.04
Pnu_g17386 (SERAT3;2)
 8.88 8.06 9.2 5.66
18.52 15.44 20.44 14.52
12.71 12.27 15.96 8.79
Pnu_g17818 (TUA3)
 30.11 27.27 33.48 21.42
Pnu_g17923 (TTL1)
 11.61 7.34 14.72 4.6
15.77 14.78 18.05 10.7
Pnu_g18261 (UPF3)
 8.52 7.99 8.82 7.6
Pnu_g18502 (NF-YA7)
 6.91 5.02 6.57 3.21
9.29 5.85 9.72 3.34
138.58 111.1 125.28 90.66
40.22 34.0 36.26 13.02
Pnu_g18988 (emb1688)
 7.97 6.84 6.75 4.26
24.12 22.27 25.98 16.92
13.54 11.06 14.72 6.35
Pnu_g19779 (PAP10)
 7.83 5.77 7.77 3.78
Pnu_g20302 (MOR1)
 15.86 14.3 15.98 11.35
3.01 2.81 4.66 1.8
Pnu_g20584 (PIP5K9)
 11.69 10.0 10.27 7.14
9.06 6.22 8.53 4.69
9.08 9.11 11.54 5.83
27.31 23.99 31.59 18.58
137.01 124.19 132.5 94.43
5.44 4.56 5.3 3.69
9.07 6.53 11.54 5.01
Pnu_g24116 (BGAL8)
 17.93 15.31 14.39 8.51
Pnu_g24148 (CTF2A)
 10.35 8.54 10.3 4.12
19.53 17.5 22.92 12.89
8.39 6.68 8.7 6.09
11.41 8.62 9.0 7.0
9.35 6.71 11.18 4.9
Pnu_g24688 (ACD31.2)
 50.02 38.86 53.69 31.05
Pnu_g24698 (IVD)
 13.87 10.78 12.65 7.96
Pnu_g24769 (SEU)
 12.46 9.52 10.81 5.67
10.13 7.7 9.63 5.42
28.85 22.79 29.82 15.0
Pnu_g25064 (CRR22)
 2.27 1.83 2.58 1.39
12.95 11.4 14.17 10.01
36.38 34.28 41.09 27.65
35.89 32.83 39.77 25.26
39.57 31.67 40.71 29.08
Pnu_g26048 (NF-YA7)
 6.04 4.36 7.47 1.6
7.35 6.58 8.01 5.01
18.0 15.7 21.08 12.99
1522.29 1073.5 1501.69 821.9
Pnu_g26225 (GCN2)
 25.63 22.3 23.42 20.83
7.18 5.98 7.74 5.2
5.97 4.75 7.15 4.22
7.67 5.87 7.39 4.28
22.92 19.91 22.53 17.41
13.59 11.62 13.54 9.68
43.61 29.95 56.49 20.42
16.85 13.32 18.23 9.37
9.3 7.61 8.96 5.9
1.76 2.54 3.32 1.17
Pnu_g27506 (MIRO1)
 6.63 6.04 5.83 4.3
12.22 10.23 15.66 7.8
Pnu_g27624 (CLPX)
 15.43 13.37 18.11 11.39
18.9 10.53 15.7 4.52
7.03 5.74 7.51 4.53
Pnu_g27816 (NRPA1)
 9.02 8.07 8.35 6.87
30.3 22.88 44.52 10.23
Pnu_g28721 (MOR1)
 16.09 12.51 15.74 10.26
25.74 21.07 28.22 15.15
3.74 1.65 6.07 0.32
69.49 56.02 72.03 23.21
4.75 3.28 4.11 2.12
Pnu_g31057 (EIN3)
 21.5 19.28 18.53 15.12
18.72 12.83 18.02 6.0
16.43 8.78 20.24 6.0
74.85 69.87 84.43 59.78
4.52 4.72 6.73 2.01
Pnu_g31717 (emb1381)
 2.97 2.46 2.97 1.71
2.73 1.9 3.48 0.7
2.79 1.25 3.88 0.16
Pnu_g32445 (HUA1)
 25.67 25.0 26.43 20.6
Pnu_g32631 (TRFL9)
 10.6 7.14 12.98 3.37
Pnu_g32780 (DWF7)
 33.09 26.0 30.62 17.21
19.6 19.67 22.4 16.94
Pnu_g32971 (BE1)
 4.34 3.05 4.66 2.56
3.46 2.87 3.28 2.31
2.23 1.73 2.35 1.38
Pnu_g33225 (PTB2)
 13.09 12.88 14.63 10.18
3.66 2.83 4.24 0.59
3.12 2.02 3.3 0.95
9.47 5.48 12.07 3.27
19.02 16.62 17.7 13.88

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)