Heatmap: Cluster_134 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Aerial Stem
Mature Aerial Stem
Syangia
Rhizome
Pnu_g00521 (APFI)
0.14 0.23 -0.52 0.03
0.21 0.58 -1.72 0.06
0.36 0.54 -2.36 0.1
0.33 0.89 -4.19 -0.27
Pnu_g01300 (OWL1)
0.21 0.25 -0.6 -0.01
0.35 0.55 -4.1 0.26
0.26 0.24 -0.81 0.07
0.33 0.5 -1.98 0.11
Pnu_g04456 (XIE)
0.1 0.24 -0.4 -0.02
0.17 0.62 -1.56 -0.0
0.17 0.26 -0.45 -0.08
0.17 0.26 -0.51 -0.04
0.44 0.56 -3.66 0.12
0.19 0.3 -0.77 0.05
Pnu_g06903 (TPS5)
0.12 0.24 -0.46 0.0
0.26 0.24 -0.79 0.07
0.23 0.32 -0.82 0.02
Pnu_g07225 (CHI)
0.26 0.7 -1.88 -0.15
Pnu_g07351 (ZIP11)
0.39 0.71 -2.54 -0.18
0.27 0.49 -1.77 0.14
0.06 0.47 -1.37 0.25
0.18 0.48 -1.58 0.19
0.16 0.2 -0.45 0.0
Pnu_g08394 (HIR1)
0.25 0.35 -0.93 0.02
Pnu_g08398 (GR-RBP3)
0.08 0.15 -0.22 -0.03
Pnu_g08511 (ADL2)
0.17 0.23 -0.51 0.0
Pnu_g08521 (MSS1)
0.33 0.54 -1.68 -0.04
0.07 0.29 -0.55 0.07
Pnu_g09219 (MC1)
0.3 0.43 -1.41 0.07
Pnu_g09267 (SBP1)
0.4 0.5 -1.84 -0.02
0.43 0.69 -2.32 -0.25
Pnu_g09704 (LIG1)
0.2 0.32 -0.59 -0.1
0.12 0.32 -0.76 0.1
Pnu_g10291 (PRD1)
0.28 0.61 -2.35 0.08
0.32 0.41 -2.21 0.27
0.12 0.29 -0.45 -0.05
Pnu_g10977 (MPB2C)
0.33 0.3 -1.16 0.09
0.26 0.94 -5.44 -0.2
0.5 0.55 -5.52 0.14
0.21 0.24 -0.69 0.06
0.32 0.6 -1.73 -0.09
Pnu_g12701 (NLA)
0.16 0.34 -0.66 -0.02
0.18 0.45 -1.12 0.05
0.1 0.23 -0.38 -0.01
Pnu_g12994 (HSS)
0.24 0.22 -1.16 0.27
0.25 0.33 -0.99 0.07
0.09 0.28 -0.48 0.01
Pnu_g13229 (NAP6)
0.09 0.4 -0.69 0.0
Pnu_g13279 (ftsh4)
0.26 0.33 -0.85 -0.01
Pnu_g13521 (NAP7)
0.18 0.28 -0.61 -0.01
Pnu_g13603 (LEW3)
0.1 0.22 -0.32 -0.04
0.1 0.35 -0.56 -0.03
0.2 0.24 -0.91 0.19
Pnu_g15481 (EIL1)
0.13 0.66 -1.86 0.06
0.23 0.27 -0.68 0.0
Pnu_g17826 (KNAT3)
0.3 0.53 -2.66 0.23
0.09 0.43 -1.54 0.32
0.46 0.26 -2.12 0.26
Pnu_g18814 (PIP5K9)
0.3 0.41 -1.36 0.07
0.42 0.45 -1.3 -0.17
Pnu_g19509 (GST8)
0.29 0.38 -1.72 0.22
0.28 0.48 -1.21 -0.06
Pnu_g19752 (OBP4)
0.38 0.68 -3.68 0.03
0.4 0.68 -3.74 0.01
Pnu_g20581 (PKP1)
0.24 0.19 -0.76 0.13
0.2 0.27 -0.73 0.05
Pnu_g20969 (COI1)
0.23 0.25 -0.79 0.08
0.19 0.53 -1.71 0.15
0.38 0.3 -1.82 0.24
Pnu_g24046 (CAC3)
0.1 0.24 -0.44 0.01
0.03 0.32 -0.44 -0.0
Pnu_g24729 (ZIP4)
0.14 0.26 -0.5 -0.01
0.21 0.75 -1.35 -0.39
Pnu_g26193 (NAP3)
0.06 0.23 -0.28 -0.06
0.12 0.39 -0.7 -0.03
0.18 0.38 -0.86 0.03
0.39 0.62 -8.56 0.21
0.18 0.26 -0.84 0.15
-0.03 0.75 -1.4 -0.07
Pnu_g33071 (FAB1B)
0.22 0.34 -1.25 0.2
0.14 0.39 -0.91 0.07

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.