Heatmap: Cluster_44 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log₂ transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene	Aerial Stem	Mature Aerial Stem	Syangia	Rhizome
Pnu_g00348	0.0	0.21	-1.53	0.58
Pnu_g00389	0.19	0.46	-4.65	0.52
Pnu_g00413	-0.17	0.61	-	0.66
Pnu_g00505	-0.15	0.24	-0.3	0.15
Pnu_g01169	0.11	0.41	-4.36	0.62
Pnu_g01249	0.01	0.41	-1.04	0.23
Pnu_g01453	0.17	0.47	-5.65	0.55
Pnu_g01974 (MEE67)	0.07	0.11	-0.73	0.34
Pnu_g02433 (TCP14)	-0.02	0.39	-1.59	0.46
Pnu_g03079	-0.23	0.36	-0.78	0.36
Pnu_g03155 (CRR22)	-0.21	0.4	-0.58	0.2
Pnu_g03158	0.06	0.15	-0.52	0.21
Pnu_g03379	0.03	0.61	-6.03	0.52
Pnu_g03513	0.28	0.34	-	0.61
Pnu_g03574	0.07	0.3	-3.19	0.69
Pnu_g03675	-0.23	0.52	-5.62	0.76
Pnu_g03844	0.15	0.43	-2.72	0.47
Pnu_g03988	-0.06	0.23	-0.66	0.31
Pnu_g04347	0.26	0.49	-7.77	0.48
Pnu_g04788	-0.15	0.2	-1.11	0.57
Pnu_g04851	0.11	0.17	-3.6	0.78
Pnu_g04887 (ACT7)	-0.19	0.35	-0.56	0.23
Pnu_g05021	0.11	0.04	-1.02	0.48
Pnu_g05260	-0.07	0.73	-2.14	0.22
Pnu_g05305	-0.13	0.28	-0.48	0.21
Pnu_g05843	0.13	0.15	-1.64	0.56
Pnu_g06110	0.06	0.37	-1.24	0.31
Pnu_g06215	0.11	0.26	-2.29	0.6
Pnu_g06464 (ATCTH)	0.06	0.48	-2.02	0.4
Pnu_g07002	0.17	0.56	-3.93	0.41
Pnu_g07174	-0.03	0.26	-0.62	0.23
Pnu_g07216	0.27	0.53	-7.47	0.43
Pnu_g07308 (UBP1B)	-0.26	0.29	-0.38	0.23
Pnu_g07334	0.04	0.04	-0.28	0.17
Pnu_g07635	-0.01	0.61	-3.25	0.46
Pnu_g07645 (PHB1)	-0.08	0.22	-0.43	0.2
Pnu_g07711	-0.11	0.31	-0.51	0.18
Pnu_g07770	-0.21	0.88	-4.16	0.31
Pnu_g08023 (CKB1)	-0.06	0.21	-0.48	0.23
Pnu_g08035	0.08	0.19	-0.59	0.19
Pnu_g08155	0.04	0.59	-4.08	0.5
Pnu_g08399	-0.2	0.49	-1.17	0.36
Pnu_g08513	-0.21	0.39	-0.5	0.16
Pnu_g08816	-0.09	0.24	-0.31	0.1
Pnu_g08867	-0.03	0.2	-0.26	0.05
Pnu_g08877	0.36	0.37	-5.45	0.49
Pnu_g08950	0.01	0.21	-0.44	0.14
Pnu_g09028 (SYTF)	0.15	0.17	-0.65	0.17
Pnu_g09261 (VHP2;2)	0.08	0.27	-1.28	0.41
Pnu_g09274	0.1	0.38	-1.88	0.44
Pnu_g09969	-0.15	0.35	-0.7	0.27
Pnu_g09996	0.05	0.31	-1.62	0.48
Pnu_g10041 (THA2)	0.09	0.24	-1.14	0.38
Pnu_g10253 (ENOC)	-0.16	0.22	-0.31	0.18
Pnu_g10335 (CXE17)	0.03	0.29	-0.45	0.03
Pnu_g10378 (CGS)	0.0	0.26	-0.54	0.16
Pnu_g10448 (GATA27)	0.0	0.33	-0.94	0.28
Pnu_g10469 (ATB BETA)	-0.07	0.24	-0.61	0.28
Pnu_g10473	0.05	0.16	-0.52	0.21
Pnu_g10475	0.11	0.34	-0.8	0.12
Pnu_g10506	0.22	0.36	-3.35	0.54
Pnu_g10595 (UXS5)	0.11	0.19	-1.41	0.49
Pnu_g10789 (CCR2)	-0.38	0.59	-1.12	0.34
Pnu_g10820	-0.42	0.9	-7.49	0.47
Pnu_g10882	-0.02	0.18	-0.45	0.2
Pnu_g10898	0.12	0.42	-1.88	0.38
Pnu_g10913	-0.02	0.39	-1.36	0.4
Pnu_g11059	0.0	0.2	-1.54	0.59
Pnu_g11245 (PEX5)	-0.09	0.21	-0.23	0.06
Pnu_g11253	-0.11	0.36	-0.71	0.24
Pnu_g11254	-0.03	0.36	-0.79	0.21
Pnu_g11281	-0.25	0.77	-	0.55
Pnu_g11328	0.09	0.22	-0.67	0.19
Pnu_g11334	-0.15	0.37	-0.6	0.19
Pnu_g11451 (PRR7)	-0.05	0.57	-1.98	0.37
Pnu_g11523 (BIM1)	0.13	0.14	-0.59	0.19
Pnu_g11667	-0.12	0.87	-2.71	0.13
Pnu_g11949	0.05	0.15	-0.46	0.17
Pnu_g12031	-0.02	0.33	-0.55	0.11
Pnu_g12050	0.03	0.25	-1.35	0.48
Pnu_g12104 (ERD13)	0.06	0.02	-0.42	0.26
Pnu_g12117 (EIF5A)	0.04	0.25	-0.54	0.13
Pnu_g12166 (OTP82)	-0.1	0.11	-0.79	0.49
Pnu_g12233	0.31	0.31	-1.78	0.29
Pnu_g12257 (HRB1)	-0.03	0.44	-0.79	0.12
Pnu_g12700	-0.01	0.26	-0.64	0.23
Pnu_g12728	0.12	0.46	-3.65	0.54
Pnu_g13470	0.04	0.17	-0.51	0.19
Pnu_g13494 (NINJA)	-0.01	0.11	-0.42	0.24
Pnu_g13528 (ASP1)	0.0	0.13	-0.51	0.27
Pnu_g13609	-0.19	0.43	-0.98	0.35
Pnu_g13700 (DES1)	0.06	0.2	-1.43	0.52
Pnu_g13985	0.07	0.22	-0.44	0.07
Pnu_g13996 (SIR)	-0.02	0.27	-0.73	0.27
Pnu_g14568 (MGT4)	0.01	0.32	-0.59	0.11
Pnu_g15479 (PYRD)	-0.01	0.21	-0.53	0.21
Pnu_g15806	0.2	0.53	-5.51	0.48
Pnu_g15959	-0.21	0.36	-0.76	0.34
Pnu_g16078	-0.01	0.35	-0.86	0.24
Pnu_g16425 (CCR2)	-0.23	0.36	-0.69	0.31
Pnu_g16607	0.0	0.19	-0.42	0.15
Pnu_g16651	0.1	0.23	-0.93	0.3
Pnu_g17107	0.14	0.37	-1.93	0.42
Pnu_g17300	0.08	0.07	-0.54	0.27
Pnu_g17825	-0.2	0.83	-9.62	0.44
Pnu_g17987	0.05	0.12	-0.48	0.21
Pnu_g18449 (ACA4)	0.17	0.28	-1.64	0.42
Pnu_g18549	0.05	0.06	-0.32	0.17
Pnu_g18556	0.09	0.17	-0.56	0.18
Pnu_g18672	-0.02	0.27	-2.38	0.69
Pnu_g18963 (HA4)	0.29	0.26	-2.6	0.5
Pnu_g19101	0.14	0.41	-3.04	0.53
Pnu_g19193	-0.14	0.84	-	0.37
Pnu_g19284	-0.05	0.32	-0.66	0.22
Pnu_g19791	0.25	0.26	-2.23	0.48
Pnu_g20102 (SHM7)	-0.02	0.21	-0.61	0.26
Pnu_g20107 (CUL4)	0.0	0.18	-0.38	0.13
Pnu_g20322	0.09	0.54	-3.08	0.45
Pnu_g20510 (PIMT1)	0.12	0.32	-1.12	0.26
Pnu_g20517	0.12	0.52	-	0.57
Pnu_g20631	-0.15	0.24	-0.46	0.25
Pnu_g21170	-0.01	0.12	-0.25	0.11
Pnu_g21209	0.1	0.14	-2.07	0.66
Pnu_g21435	0.3	0.12	-2.9	0.63
Pnu_g21735	0.25	0.31	-2.01	0.4
Pnu_g21948	-0.07	0.19	-0.41	0.2
Pnu_g22186	0.18	0.34	-1.13	0.2
Pnu_g22786	0.08	0.33	-2.41	0.59
Pnu_g22820	-0.04	0.26	-0.41	0.11
Pnu_g22916	-0.14	0.31	-0.42	0.14
Pnu_g22931	-0.19	0.27	-1.34	0.61
Pnu_g23605	0.11	0.21	-0.94	0.31
Pnu_g24327	0.1	0.17	-0.64	0.21
Pnu_g24532 (ECH2)	-0.13	0.22	-0.3	0.15
Pnu_g24745	0.04	0.2	-0.6	0.22
Pnu_g24971 (CPK13)	0.04	0.2	-0.41	0.09
Pnu_g25828	-0.1	0.6	-1.95	0.38
Pnu_g26652 (CCR2)	-0.05	0.48	-1.87	0.45
Pnu_g26853	0.04	0.5	-1.25	0.18
Pnu_g26950 (UBC16)	-0.05	0.23	-0.29	0.06
Pnu_g27328 (UPF1)	-0.13	0.23	-0.72	0.39
Pnu_g27464	0.11	0.38	-1.01	0.17
Pnu_g28002	0.02	0.2	-0.57	0.22
Pnu_g28336	0.08	0.37	-1.26	0.31
Pnu_g28475 (CKB1)	-0.02	0.2	-0.49	0.21
Pnu_g28613 (SCE1)	-0.13	0.3	-0.42	0.15
Pnu_g28794	0.13	0.51	-4.38	0.52
Pnu_g29602	0.12	0.29	-2.02	0.54
Pnu_g30044	-0.22	0.29	-0.64	0.36
Pnu_g30137	0.04	0.2	-0.86	0.35
Pnu_g30201	0.15	0.27	-1.2	0.32
Pnu_g30209	-0.42	0.61	-2.8	0.67
Pnu_g31050	-0.15	0.23	-0.5	0.28
Pnu_g31533	0.05	0.56	-1.83	0.27
Pnu_g31712	0.27	0.32	-2.96	0.51
Pnu_g31880 (emb2734)	-0.1	0.3	-0.8	0.33
Pnu_g32479	-0.07	0.48	-2.39	0.55
Pnu_g32569	-0.37	0.35	-0.96	0.53
Pnu_g32797 (WOL)	0.22	0.3	-2.49	0.52
Pnu_g32889	-0.01	0.23	-0.65	0.26
Pnu_g32961	0.3	0.19	-3.01	0.59
Pnu_g33233	0.1	0.19	-0.51	0.11
Pnu_g33249 (CPK17)	-0.11	0.24	-0.32	0.13
Pnu_g33606	0.07	0.34	-0.85	0.18
Pnu_g33657	0.05	0.21	-0.5	0.14
Pnu_g34046	0.02	0.24	-0.45	0.1

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.