1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_29 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

 Transpose table  Download table
Gene
Aerial Stem
Mature Aerial Stem
Syangia
Rhizome
-0.46 0.04 0.09 0.24
-2.56 0.41 0.36 0.29
-0.54 0.09 0.15 0.19
Pnu_g00703 (emb1075)
 -0.45 0.15 0.09 0.13
Pnu_g00777 (APC7)
 -0.48 0.12 0.1 0.17
-0.3 0.12 0.05 0.09
-0.26 0.1 0.01 0.12
Pnu_g00855 (RPB2)
 -0.31 0.02 0.11 0.14
-0.49 -0.07 0.21 0.24
Pnu_g01261 (ABF2)
 -0.47 -0.09 0.2 0.25
Pnu_g01373 (SAD1)
 -0.64 -0.02 0.15 0.33
-0.6 0.09 0.26 0.11
-0.92 -0.08 0.33 0.34
-0.44 0.0 0.24 0.11
-0.61 -0.0 0.25 0.21
-0.35 -0.01 0.14 0.17
Pnu_g02813 (APP1)
 -0.53 -0.07 0.21 0.26
-0.46 0.11 0.11 0.16
-0.95 0.01 0.26 0.36
Pnu_g04229 (TUB1)
 -0.85 -0.22 0.46 0.28
Pnu_g04461 (U2AF35B)
 -0.29 -0.06 0.18 0.12
-0.57 -0.11 0.3 0.23
Pnu_g05836 (PTB3)
 -0.18 0.05 -0.02 0.14
-0.57 -0.01 0.34 0.09
-0.68 -0.06 0.4 0.13
-0.45 0.17 -0.08 0.26
-0.49 0.02 0.29 0.06
-0.56 0.07 0.21 0.16
-0.75 0.01 0.33 0.19
Pnu_g06834 (U2A')
 -0.55 -0.03 0.21 0.23
-0.45 0.06 0.2 0.11
Pnu_g06923 (EMB1691)
 -0.25 0.09 -0.02 0.14
-0.21 0.08 -0.05 0.15
-0.25 0.1 0.09 0.03
Pnu_g07173 (ATRBP45C)
 -0.35 -0.0 0.29 -0.0
-0.49 0.08 0.09 0.21
-0.56 0.14 0.1 0.2
-0.56 -0.12 0.29 0.24
-0.46 0.01 0.18 0.18
Pnu_g07387 (APRL4)
 -0.33 0.13 -0.04 0.19
-0.21 0.08 0.1 0.01
-0.39 0.09 0.05 0.19
Pnu_g07888 (scpl50)
 -0.97 -0.13 0.25 0.48
-0.83 -0.07 0.32 0.31
-0.3 -0.06 0.2 0.11
-0.44 -0.09 0.29 0.14
-0.44 -0.09 0.22 0.21
-0.31 0.07 0.11 0.09
-0.36 0.11 0.12 0.07
-0.42 -0.05 0.2 0.18
-0.39 0.12 0.06 0.15
Pnu_g08908 (TDT)
 -0.33 0.0 0.24 0.03
-0.31 0.01 0.11 0.15
-0.48 -0.03 0.11 0.29
-0.41 -0.08 0.3 0.1
Pnu_g09501 (CDC20.2)
 -1.79 -0.34 0.37 0.7
-0.62 0.14 0.13 0.21
-0.43 0.13 0.02 0.21
-0.36 0.04 0.18 0.09
-0.29 0.08 -0.02 0.2
-0.74 -0.02 0.43 0.1
Pnu_g09703 (STA1)
 -0.72 -0.02 0.27 0.26
Pnu_g09745 (ATL43)
 -0.24 0.04 0.13 0.04
Pnu_g09804 (EIF2)
 -0.56 0.15 0.0 0.28
-0.44 -0.01 0.3 0.06
-0.7 -0.05 0.43 0.1
-0.63 0.05 0.08 0.33
-0.51 -0.05 0.23 0.21
-0.49 0.15 -0.1 0.33
-0.31 0.13 -0.08 0.2
-0.4 -0.01 0.13 0.21
Pnu_g11040 (FLK)
 -0.43 0.03 0.08 0.24
-0.27 0.03 0.11 0.1
-0.48 0.06 0.0 0.31
-0.52 0.01 0.27 0.13
Pnu_g11227 (UBDK GAMMA 7)
 -0.98 -0.16 0.49 0.25
-0.52 0.24 -0.1 0.25
Pnu_g11290 (GCN1)
 -0.69 0.13 -0.01 0.36
-0.3 0.07 0.14 0.05
-0.47 0.11 -0.06 0.32
-0.74 -0.07 0.22 0.36
-0.41 0.09 0.01 0.24
Pnu_g11740 (HDA3)
 -0.21 0.07 -0.02 0.14
-0.19 0.03 0.03 0.11
-0.43 0.23 -0.12 0.23
Pnu_g12337 (PP2A-4)
 -0.56 0.16 -0.01 0.27
Pnu_g12353 (PPX1)
 -0.37 0.06 0.16 0.09
-0.68 -0.18 0.46 0.16
-0.29 -0.01 0.2 0.06
-0.55 0.09 -0.01 0.33
-1.12 -0.11 0.49 0.27
-0.48 -0.01 0.16 0.24
-0.34 0.06 0.13 0.1
Pnu_g12858 (SR45)
 -0.41 0.1 0.14 0.1
Pnu_g12927 (ALS)
 -0.79 -0.06 0.29 0.31
-0.4 0.03 0.21 0.09
-0.25 -0.06 0.15 0.12
-0.39 0.0 0.21 0.11
-0.27 -0.0 0.07 0.17
-0.97 0.11 -0.03 0.52
-0.38 0.14 -0.05 0.23
-0.27 -0.02 0.15 0.1
Pnu_g13928 (RPN1A)
 -0.4 0.07 0.01 0.25
Pnu_g14029 (ACBP2)
 -0.42 0.16 -0.11 0.27
Pnu_g14060 (FIP1)
 -0.41 -0.06 0.25 0.13
Pnu_g14546 (RPL10B)
 -0.33 0.06 0.1 0.12
-0.88 0.01 0.1 0.47
-0.51 0.02 0.23 0.15
-0.7 -0.07 0.21 0.35
-0.37 -0.02 0.2 0.12
Pnu_g15687 (MPPBETA)
 -0.55 -0.04 0.21 0.25
-0.82 0.16 -0.16 0.5
-1.12 0.07 0.48 0.14
-0.37 0.16 -0.1 0.23
-0.52 -0.06 0.11 0.33
-0.37 0.16 0.04 0.12
Pnu_g17119 (BET11)
 -0.41 0.16 0.05 0.13
Pnu_g17169 (VSR3)
 -0.43 0.02 0.08 0.25
-0.58 0.06 0.19 0.2
-0.33 0.07 0.14 0.08
Pnu_g17556 (PTB2)
 -0.5 -0.1 0.31 0.16
-0.68 -0.13 0.37 0.22
-0.67 -0.04 0.18 0.34
Pnu_g18337 (UBC11)
 -0.47 0.13 -0.05 0.28
-0.13 0.04 0.07 0.01
Pnu_g18527 (PAB2)
 -0.18 0.06 0.11 -0.0
Pnu_g18694 (MTO3)
 -0.96 -0.03 0.31 0.34
-0.52 0.02 0.09 0.29
Pnu_g18782 (PP2A-4)
 -0.58 0.17 -0.1 0.35
Pnu_g18835 (UBA1)
 -0.49 -0.05 0.24 0.19
-0.34 0.06 0.07 0.17
-0.37 0.04 0.1 0.17
-0.66 -0.01 0.29 0.2
-0.56 -0.07 0.34 0.15
-0.24 -0.0 0.08 0.14
Pnu_g19711 (CPL4)
 -0.32 0.03 0.17 0.07
-0.61 0.08 0.2 0.18
-0.79 -0.02 0.31 0.25
Pnu_g20028 (CKA1)
 -0.33 -0.03 0.12 0.18
-0.8 -0.0 0.33 0.23
Pnu_g20129 (bZIP23)
 -0.67 0.01 0.26 0.22
-0.81 0.12 0.25 0.21
-0.35 0.11 -0.09 0.26
-0.97 -0.16 0.23 0.5
-0.46 0.02 0.24 0.11
Pnu_g22365 (TGD1)
 -0.76 -0.13 0.46 0.17
-0.32 -0.0 0.09 0.19
Pnu_g23107 (TOC132)
 -0.59 0.15 -0.17 0.42
Pnu_g23465 (TOC132)
 -0.65 0.26 -0.07 0.27
-0.81 0.06 0.32 0.19
Pnu_g24304 (RBP-DR1)
 -0.23 0.09 0.1 0.01
-0.92 0.15 0.03 0.42
Pnu_g25053 (MKK9)
 -0.76 -0.3 0.42 0.33
-0.84 -0.17 0.23 0.46
-0.38 -0.02 0.26 0.07
-0.42 0.11 -0.12 0.32
Pnu_g25939 (MTM1)
 -0.31 0.09 0.04 0.14
-0.44 0.05 0.03 0.28
-0.74 0.02 0.18 0.33
-0.19 0.07 0.04 0.06
Pnu_g26058 (EIF3C)
 -0.72 -0.08 0.4 0.17
-0.72 -0.18 0.43 0.22
-0.91 -0.04 0.31 0.33
-0.63 0.06 0.15 0.26
-0.95 -0.16 0.58 0.13
-0.64 -0.02 0.4 0.08
-0.75 0.03 0.12 0.38
-0.65 -0.03 0.3 0.2
Pnu_g27006 (ARFA1F)
 -0.38 0.15 -0.07 0.22
-0.86 -0.19 0.53 0.17
-0.33 0.12 0.01 0.15
Pnu_g27602 (ARA7)
 -0.58 0.04 0.16 0.24
-0.57 0.06 -0.0 0.37
-0.61 0.1 0.19 0.18
-0.44 0.12 0.06 0.18
-0.55 0.07 0.2 0.15
-0.44 0.09 0.11 0.16
-0.73 -0.03 0.24 0.31
-0.54 -0.04 0.21 0.24
-1.14 -0.19 0.36 0.47
-0.52 -0.04 0.31 0.12
-0.53 0.04 0.3 0.07
-0.31 0.05 0.2 0.02
-0.42 -0.01 0.3 0.05
-0.54 0.07 0.12 0.23
Pnu_g32072 (MED34)
 -0.59 0.09 0.17 0.2
Pnu_g32274 (NTF2A)
 -0.56 0.01 0.36 0.05
-0.8 -0.05 0.3 0.3
-0.46 0.03 0.19 0.15
-0.51 0.18 0.01 0.2
Pnu_g33114 (TUB6)
 -1.21 -0.04 0.34 0.41
-0.46 0.2 -0.01 0.17
-0.69 0.08 0.16 0.26
-1.42 0.18 0.51 0.1
Pnu_g33699 (PRP40A)
 -0.21 -0.06 0.14 0.1
Pnu_g33776 (TIM44-2)
 -0.68 0.01 0.26 0.22

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.