Heatmap: Cluster_5 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Sterile Leaflet
Fertile Leaflet with Sori
Primary Rachis
Petiole
Root
1.29 1.13 -1.74 -4.44 -5.85
1.32 0.92 -1.19 -2.76 -4.99
Pir_g00411 (TLP18.3)
1.29 0.95 -1.22 -2.65 -4.54
1.14 1.0 -1.04 -2.09 -3.84
Pir_g00419 (ATPD)
1.16 0.99 -0.93 -2.26 -4.55
Pir_g00575 (STN8)
1.1 0.95 -0.98 -1.86 -2.88
Pir_g00993 (STM)
1.38 0.91 -1.65 -3.16 -3.59
1.4 0.93 -1.75 -3.14 -4.5
Pir_g01350 (STN7)
1.28 0.84 -1.09 -2.01 -4.33
Pir_g01921 (HPR)
1.23 1.02 -1.14 -3.05 -4.69
1.29 0.96 -1.45 -2.41 -4.08
1.01 0.71 -0.61 -1.25 -1.85
1.15 0.79 -0.83 -1.6 -2.64
Pir_g02783 (ATAB2)
1.2 0.95 -1.1 -2.24 -3.43
Pir_g03114 (FUG1)
1.14 0.88 -0.96 -1.68 -2.9
Pir_g04306 (OSA1)
1.13 0.87 -0.68 -1.88 -3.46
1.19 0.91 -1.09 -1.95 -3.22
Pir_g04871 (NDF1)
1.28 1.04 -1.62 -2.94 -3.99
1.28 0.95 -1.36 -2.36 -4.05
1.05 0.88 -0.9 -1.74 -1.97
Pir_g05862 (PPH1)
1.1 0.8 -0.65 -1.48 -3.12
Pir_g06182 (RPE)
1.25 1.0 -1.19 -2.79 -4.86
Pir_g06296 (PSBW)
1.14 0.96 -0.91 -2.0 -4.13
Pir_g06429 (RPL12)
1.07 0.98 -0.81 -1.91 -3.44
1.25 0.84 -1.18 -1.88 -3.02
1.29 0.94 -1.24 -2.46 -4.99
1.17 0.8 -0.88 -1.64 -2.82
1.09 0.8 -0.59 -1.55 -3.03
1.17 0.81 -0.96 -1.65 -2.56
Pir_g07718 (PTAC16)
1.24 0.97 -1.01 -2.6 -6.02
1.24 0.75 -1.13 -1.73 -2.39
1.35 0.79 -1.23 -2.16 -3.69
Pir_g08787 (GAPA-2)
1.32 1.05 -1.45 -3.84 -8.85
1.28 1.04 -1.17 -4.57 -5.63
Pir_g09257 (PSB27)
1.18 1.04 -1.18 -2.51 -4.03
1.02 0.84 -0.71 -1.44 -2.31
Pir_g09728 (GCN5)
1.16 1.04 -1.34 -2.17 -3.38
1.34 0.95 -1.66 -2.83 -3.83
Pir_g10112 (ATHM2)
1.24 0.92 -1.11 -2.3 -3.78
Pir_g10142 (MIND)
0.99 0.89 -0.83 -1.5 -2.07
Pir_g10266 (RPS1)
1.09 0.77 -0.75 -1.29 -2.52
1.32 0.95 -1.47 -2.74 -4.01
Pir_g10350 (ZEP)
1.2 0.95 -1.16 -2.32 -3.02
Pir_g10443 (NADK2)
1.19 0.93 -1.09 -1.91 -3.88
1.24 1.01 -1.05 -2.93 -5.55
Pir_g10851 (GCH)
0.99 0.72 -0.73 -1.2 -1.61
1.18 0.98 -1.01 -2.58 -3.5
1.36 1.1 -2.17 -4.49 -6.06
Pir_g11258 (AGT)
1.34 0.92 -1.3 -2.89 -5.64
Pir_g11419 (GLU1)
1.31 0.83 -1.41 -2.14 -2.74
Pir_g11582 (YLMG2)
1.27 0.97 -1.36 -2.93 -3.11
1.47 0.85 -1.97 -3.22 -3.99
Pir_g11763 (FTSH1)
1.21 0.85 -0.98 -1.98 -2.94
Pir_g12090 (PMDH1)
1.43 1.04 -2.61 -4.27 -4.79
Pir_g12246 (GLDP2)
1.44 0.94 -1.83 -4.11 -5.47
Pir_g12400 (LHCB3)
1.16 1.02 -0.98 -2.39 -4.68
Pir_g12483 (HCEF1)
1.36 1.04 -1.77 -3.82 -6.09
1.34 1.0 -1.54 -3.54 -4.46
Pir_g12781 (CCB3)
1.26 0.91 -1.26 -2.4 -3.1
Pir_g12908 (ATS1)
1.3 0.92 -1.27 -2.53 -4.06
Pir_g13293 (TRX P)
1.05 0.8 -0.8 -1.36 -2.18
1.27 1.05 -1.61 -3.12 -4.01
1.36 0.89 -1.37 -2.56 -5.0
Pir_g14125 (CRB)
1.26 1.1 -1.48 -3.53 -7.19
1.38 0.92 -1.46 -2.99 -5.61
1.2 0.72 -0.9 -1.63 -2.28
1.39 0.79 -1.21 -2.41 -5.3
Pir_g14704 (COR413IM1)
1.44 0.99 -2.04 -4.21 -6.45
1.5 0.9 -2.32 -3.94 -5.28
Pir_g14932 (CP12)
1.27 0.99 -1.32 -2.59 -4.47
Pir_g15215 (RPL15)
1.25 0.93 -1.46 -2.52 -2.57
Pir_g15460 (LHCB4.1)
1.34 1.01 -1.42 -3.88 -6.71
1.34 1.05 -2.07 -3.29 -4.13
Pir_g15580 (FTRA2)
1.11 1.05 -1.2 -2.12 -3.26
Pir_g15644 (CCB1)
1.22 0.93 -1.36 -2.05 -2.88
1.26 0.97 -1.04 -2.87 -5.37
1.49 1.01 -3.33 -5.68 -4.2
Pir_g16813 (CYP38)
1.15 0.96 -1.03 -2.12 -3.11
Pir_g16996 (OHP2)
1.11 0.95 -0.8 -2.01 -3.39
Pir_g17030 (GC1)
1.37 0.94 -1.67 -3.05 -3.76
1.38 0.9 -1.84 -3.09 -2.94
1.23 0.76 -1.11 -1.49 -2.88
1.28 0.7 -1.05 -1.66 -2.78
Pir_g17404 (SBPASE)
1.37 0.95 -1.36 -3.81 -6.49
Pir_g17500 (MRL1)
1.1 1.03 -1.01 -2.06 -3.62
1.35 0.94 -2.02 -2.91 -2.73
Pir_g17695 (PGK1)
1.36 1.02 -1.85 -3.52 -4.63
1.57 0.95 -4.35 -5.9 -4.73
1.12 0.81 -0.85 -1.53 -2.46
1.09 0.86 -0.95 -1.48 -2.51
Pir_g18424 (FNR1)
1.25 0.93 -1.09 -2.23 -4.57
1.42 0.98 -2.17 -3.65 -4.12
Pir_g19480 (SIG5)
1.17 1.08 -1.0 -3.03 -6.58
Pir_g19526 (LHCA5)
1.1 0.84 -1.0 -1.38 -2.46
1.38 0.96 -1.59 -3.39 -5.48
Pir_g19768 (CAB4)
1.23 1.08 -1.19 -3.4 -6.59
Pir_g19829 (LUT2)
1.15 1.02 -0.95 -3.02 -3.23
Pir_g19912 (LHCB5)
1.21 1.07 -1.09 -3.24 -6.51
1.3 0.92 -1.27 -2.5 -4.05
Pir_g20062 (FZL)
1.16 1.03 -1.01 -2.84 -3.48
1.19 0.85 -1.0 -1.86 -2.89
1.46 1.06 -3.19 -4.83 -5.73
1.29 1.11 -1.59 -3.86 -9.34
1.41 0.97 -1.76 -4.19 -5.36
1.16 0.84 -0.98 -1.76 -2.53
Pir_g26099 (ZKT)
1.13 0.95 -0.85 -1.99 -3.73
1.17 1.03 -1.11 -2.39 -4.22
1.15 0.8 -0.96 -1.78 -2.06
Pir_g36190 (FNR1)
1.23 1.05 -1.4 -2.65 -4.49
1.16 0.85 -1.14 -1.97 -1.94
1.28 0.95 -1.26 -2.95 -3.56
Pir_g48365 (PSBX)
1.34 0.94 -1.41 -2.84 -5.1
1.25 0.73 -1.04 -1.7 -2.54
Pir_g54622 (RBCS1A)
1.31 1.04 -1.31 -4.5 -7.04
Pir_g56029 (PRK)
1.25 1.01 -0.96 -3.31 -8.25
Pir_g56449 (PDS)
1.54 0.83 -1.96 -4.8 -6.32
1.36 0.9 -1.31 -3.38 -3.71
1.24 0.81 -1.22 -1.88 -2.48
1.21 0.83 -1.19 -1.83 -2.44
1.47 0.98 -2.37 -4.94 -4.54
1.27 0.97 -1.25 -2.85 -3.71
Pir_g59187 (GSR 1)
1.29 0.84 -1.51 -2.07 -2.51
Pir_g59747 (CAT2)
1.49 1.06 -3.52 -7.7 -8.1
1.2 1.0 -0.96 -2.57 -5.47
1.52 0.99 -3.42 -5.4 -5.34
1.21 0.92 -1.22 -1.96 -3.22
Pir_g60607 (OHP)
1.12 0.88 -0.92 -1.46 -3.51
1.34 0.98 -1.61 -2.83 -5.59
1.39 0.9 -1.48 -2.97 -4.82
1.5 0.86 -1.75 -4.46 -6.51
1.18 0.78 -1.05 -1.38 -2.74
1.18 0.81 -0.78 -1.68 -3.63
1.36 1.04 -1.69 -4.53 -5.72

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.