Heatmap: Cluster_255 (HCCA cluster)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Root (elongation zone)
Root (meristematic zone)
Root (stele)
Root (tip)
Root
Leaf (3rd leaf of seedling)
Leaf (3rd leaf)
Leaf (apex)
Leaf (bundle sheath)
Leaf (mesophyll)
Leaf (Seedling)
Leaf
Internode
Stalks
Shoot
Shoot (apex)
Tassels (primordia)
Tassels
Anther
Pollen
Ear (immature)
Ear (inflorescence)
Ear (leaf)
Ear (primordia)
Ear
Silks
Kernels (germinating)
Kernels
Maternal transfer zone
Nucellus
Embryo
Endosperm (transfer layer)
Endosperm
Seeds
Coleoptyle (5 day)
Seedling
Whole Plant
Zm00001d002462 (GRMZM2G101675)
0.23 0.3 0.71 0.21 0.3 0.14 0.09 0.14 0.11 0.18 0.25 0.15 0.08 0.21 0.13 0.31 0.33 0.31 0.23 0.0 0.16 0.22 0.2 0.37 0.19 0.25 0.4 0.24 0.07 0.44 1.0 0.16 0.17 0.99 0.15 0.25 0.14
0.33 0.29 0.83 0.0 0.3 0.09 0.02 0.24 0.19 0.2 0.06 0.16 0.1 0.11 0.18 0.28 0.15 0.56 0.12 0.0 0.47 0.25 0.12 0.57 0.49 0.01 0.38 0.36 0.12 0.0 1.0 0.15 0.12 0.9 0.45 0.23 0.04
Zm00001d003191 (GRMZM2G052175)
0.0 0.0 0.0 0.03 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.02 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.03 0.0 0.01 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.28 0.01 0.0 0.01 1.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.02
Zm00001d003282 (GRMZM2G057637)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.09 0.01 0.0 1.0 0.04 0.06 0.38 0.0 0.0 0.0
Zm00001d005159 (GRMZM2G064163)
0.68 1.0 0.79 0.31 0.41 0.26 0.23 0.37 0.46 0.23 0.17 0.31 0.63 0.27 0.25 0.54 0.41 0.41 0.89 0.04 0.27 0.41 0.37 0.44 0.4 0.37 0.99 0.25 0.28 0.38 0.79 0.03 0.11 0.87 0.58 0.25 0.25
Zm00001d006364 (GRMZM2G146745)
0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.05 0.07 0.02 0.1 1.0 0.08 0.08 0.24 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.02 0.0 0.01 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.02 0.02 0.0 0.05 0.04 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.1 0.0 0.5 0.09 0.0 0.0 1.0 0.0 0.04 0.37 0.0 0.01 0.0
0.14 0.17 0.22 0.13 0.21 0.09 0.06 0.09 0.06 0.04 0.08 0.08 0.14 0.24 0.1 0.2 0.13 0.13 0.09 0.0 0.11 0.1 0.62 0.15 0.12 0.07 0.12 0.12 0.1 0.24 1.0 0.08 0.06 0.18 0.4 0.16 0.16
0.01 0.01 0.01 0.0 0.04 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.01 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.2 0.0 0.03 0.02 0.03 0.02 0.0 0.0 1.0 0.0 0.01 0.05 0.01 0.14 0.03
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.03 0.13 0.16 0.0 0.29 0.02 0.0 0.06 0.1 0.0 0.1 0.26 0.0 0.0 0.59 0.13 0.24 1.0 0.0 0.0 0.0
Zm00001d013229 (GRMZM2G394688)
0.0 0.02 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.06 0.13 0.0 0.64 0.02 0.44 0.11 0.09 0.0 0.23 0.32 0.4 0.02 0.68 0.31 0.18 1.0 0.0 0.01 0.0
Zm00001d014325 (GRMZM2G048549)
0.03 0.06 0.07 0.03 0.13 0.2 0.11 0.33 0.11 0.26 0.26 0.28 0.02 0.01 0.2 0.18 0.01 0.06 0.03 0.0 0.06 0.04 0.13 0.04 0.15 0.11 0.27 0.14 0.01 0.0 1.0 0.14 0.35 0.39 0.09 0.37 0.15
Zm00001d016098 (GRMZM2G165726)
0.11 0.02 0.15 0.03 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.16 0.03 0.0 0.0 1.0 0.01 0.03 0.09 0.0 0.0 0.0
Zm00001d016255 (GRMZM2G105348)
0.02 0.06 0.17 0.51 0.13 0.1 0.1 0.05 0.01 0.01 0.05 0.04 0.0 0.23 0.02 0.15 0.0 0.01 0.04 0.0 0.04 0.0 0.11 0.02 0.02 0.01 0.14 0.02 0.02 0.0 1.0 0.02 0.01 0.09 0.01 0.19 0.25
Zm00001d017140 (GRMZM2G137399)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.21 0.07 0.0 0.0 1.0 0.01 0.03 0.5 0.0 0.0 0.0
Zm00001d019446 (GRMZM2G042692)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.04 0.0 0.0 1.0 0.05 0.09 0.49 0.01 0.01 0.0
Zm00001d019704 (GRMZM2G407223)
0.03 0.04 0.06 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.03 0.0 0.04 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.03 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.16 0.0 0.06 0.01
0.0 0.01 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.02 0.02 0.0 0.0 1.0 0.0 0.02 0.2 0.01 0.06 0.02
Zm00001d021901 (GRMZM2G374971)
0.0 0.0 0.0 0.03 0.12 0.02 0.01 0.06 0.0 0.0 0.02 0.07 0.01 0.03 0.05 0.02 0.0 0.02 0.13 0.0 0.0 0.0 0.3 0.01 0.01 0.05 0.43 0.18 0.01 0.0 0.2 0.04 0.1 1.0 0.01 0.09 0.08
Zm00001d022303 (GRMZM2G006119)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.05 0.0 0.0 1.0 0.0 0.03 0.32 0.0 0.0 0.0
Zm00001d023985 (GRMZM2G350919)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.48 0.0 0.0 0.01 0.8 0.61 1.0 0.0 0.0 0.01
Zm00001d024302 (GRMZM2G368861)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.1 0.0 0.0 1.0 0.0 0.12 0.75 0.0 0.0 0.0
Zm00001d027258 (GRMZM2G333069)
0.0 0.01 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.03 0.0 0.04 0.01 0.01 0.01 0.0 0.02 0.0 0.0 0.02 0.01 0.02 0.03 0.05 0.0 0.01 1.0 0.03 0.04 0.2 0.0 0.01 0.01
Zm00001d028647 (GRMZM2G172574)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.02 0.0 0.0 1.0 0.01 0.05 0.24 0.0 0.0 0.0
Zm00001d029025 (GRMZM2G050077)
0.0 0.0 0.09 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.04 0.01 0.01 0.04 0.01 0.01 0.04 0.16 0.02 0.03 0.01 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.06 0.0 0.04 0.02 0.01 0.01 1.0 0.0 0.01 0.08 0.03 0.08 0.03
Zm00001d029778 (GRMZM2G402564)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.04 0.01 0.0 1.0 0.04 0.05 0.13 0.0 0.01 0.0
Zm00001d030172 (GRMZM2G179528)
0.0 0.0 0.0 0.02 0.15 0.09 0.04 0.06 0.03 0.03 0.59 0.32 0.0 0.0 0.07 0.01 0.0 0.01 0.02 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.02 0.0 0.86 0.37 0.99 0.0 0.49 0.03 0.13 0.29 0.04 0.12 0.09
Zm00001d030262 (GRMZM2G466982)
0.0 0.0 0.0 0.05 0.03 0.03 0.06 0.06 0.0 0.0 0.07 0.05 0.0 0.0 0.02 0.03 0.1 0.0 0.06 0.0 0.08 0.07 0.0 0.0 0.01 0.1 0.0 0.08 0.0 0.0 0.12 1.0 0.04 0.01 0.11 0.02 0.97
Zm00001d030464 (GRMZM2G063824)
0.13 0.05 0.01 0.05 0.14 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.02 0.01 0.06 0.14 0.01 0.13 0.0 0.65 0.01 0.0 0.2 0.1 0.0 0.08 0.18 0.14 0.55 0.12 0.13 0.03 1.0 0.02 0.05 0.71 0.01 0.02 0.07
0.0 0.0 0.1 0.0 0.01 0.0 0.05 0.0 1.0 0.91 0.0 0.04 0.0 0.0 0.13 0.02 0.0 0.02 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.09 0.0 0.03 0.21 0.08 0.16 0.0
Zm00001d031228 (GRMZM2G169535)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.35 0.0 0.01 0.0
Zm00001d031785 (GRMZM2G117250)
0.03 0.04 0.03 0.0 0.15 0.03 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.03 0.03 0.16 0.01 0.01 0.12 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.02 0.02 0.0 0.06 0.08 0.0 0.02 1.0 0.06 0.06 0.22 0.01 0.04 0.06
Zm00001d032130 (GRMZM2G055143)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.11 0.0 0.01 0.0 0.04 0.23 0.0 0.02 0.03 0.02 0.0 0.02 0.06 0.02 0.07 0.15 0.39 1.0 0.19 0.05 0.34 0.0 0.0 0.01
Zm00001d033064 (GRMZM2G461548)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.01 0.29 0.0 0.0 0.02
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.23 0.0 0.0 0.08 0.0 0.04 0.18 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.0 0.0 1.0 0.0 0.12 0.41 0.0 0.0 0.3
Zm00001d034848 (GRMZM2G159353)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.12 0.01 0.0 0.01 0.02 0.0 0.07 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.03 0.04 0.0 0.0 1.0 0.0 0.02 0.44 0.0 0.01 0.01
Zm00001d036911 (GRMZM2G423378)
0.02 0.14 0.05 0.03 0.03 0.0 0.0 0.03 0.07 0.04 0.0 0.01 0.01 0.04 0.02 0.04 0.01 0.13 0.07 0.01 0.01 0.07 0.0 0.0 0.04 0.0 0.05 0.02 0.11 0.0 0.44 0.0 0.08 1.0 0.02 0.11 0.0
Zm00001d037915 (GRMZM5G826767)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.02 0.08 0.0 0.0 1.0 0.12 0.07 0.14 0.0 0.0 0.0
Zm00001d037918 (GRMZM2G055699)
0.0 0.02 0.03 0.07 0.1 0.29 0.25 0.09 0.04 0.06 0.33 0.19 0.0 0.02 0.06 0.05 0.29 0.1 0.05 0.0 0.02 0.01 0.82 0.01 0.06 0.0 0.61 0.21 1.0 0.0 0.34 0.05 0.17 0.71 0.03 0.16 0.13
Zm00001d038099 (GRMZM2G061143)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.68 0.59 0.0 0.0 0.0
Zm00001d038974 (GRMZM2G085641)
0.0 0.0 0.01 0.0 0.02 0.07 0.04 0.02 0.02 0.03 0.13 0.1 0.0 0.05 0.06 0.02 0.02 0.15 0.05 0.07 0.03 0.0 0.08 0.02 0.06 0.02 0.05 0.01 0.0 0.19 1.0 0.02 0.01 0.27 0.04 0.07 0.13
0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.39 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.5 0.0 0.0 0.04 1.0 0.39 0.75 0.0 0.0 0.0
Zm00001d043302 (GRMZM2G039166)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.06 0.0 0.0 1.0 0.0 0.06 0.15 0.0 0.0 0.0
Zm00001d044078 (GRMZM2G067600)
0.03 0.06 0.13 0.03 0.11 0.01 0.02 0.06 0.02 0.01 0.01 0.04 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.16 0.07 0.03 0.0 0.0 1.0 0.01 0.02 0.23 0.0 0.19 0.06
Zm00001d044351 (GRMZM2G019578)
0.0 0.0 0.23 0.05 0.4 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.08 0.01 0.02 0.1 0.05 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.02 0.28 0.01 0.03 0.27 0.0 1.0 0.22 0.09 0.38 0.08 0.05 0.03
Zm00001d044352 (GRMZM2G023631)
0.0 0.0 0.01 0.0 0.08 0.05 0.0 0.01 0.01 0.0 0.01 0.17 0.0 0.08 0.02 0.01 0.0 0.12 0.05 0.02 0.01 0.0 0.31 0.0 0.08 0.63 0.07 0.02 0.0 0.0 1.0 0.0 0.05 0.46 0.54 0.2 0.07
Zm00001d045321 (GRMZM2G098750)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.06 0.03 0.0 1.0 0.01 0.06 0.44 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.2 0.0 0.0 0.0 1.0 0.23 0.41 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.28 0.0 0.0 0.0 0.0 0.73 1.0 0.0 0.0 0.0
Zm00001d047259 (GRMZM2G125813)
0.0 0.01 0.01 0.01 0.03 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.01 0.03 0.29 0.0 0.28 0.02 0.01 0.0 0.0 0.11 0.21 0.0 0.01 0.13 0.07 0.04 0.13 0.11 0.17 1.0 0.08 0.03 0.04 0.0 0.01 0.02
Zm00001d047710 (GRMZM2G083186)
0.03 0.06 0.36 0.01 0.13 0.03 0.08 0.08 0.1 0.28 0.09 0.18 0.05 0.21 0.03 0.17 0.04 0.15 0.4 0.02 0.08 0.04 0.31 0.07 0.06 0.0 0.45 0.32 0.18 0.0 1.0 0.24 0.11 0.95 0.03 0.18 0.02
0.04 0.5 0.07 0.0 0.11 0.0 0.0 1.0 0.0 0.18 0.22 0.01 0.0 0.3 0.21 0.25 0.0 0.41 0.27 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.11 0.0 0.23 0.11 0.0 0.0 0.47 0.0 0.26 0.11 0.1 0.05 0.0
Zm00001d048629 (GRMZM2G107286)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.02 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.02 0.47 0.0 0.0 0.0
Zm00001d048948 (GRMZM2G419675)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.02 0.69 0.23 0.0 0.0 0.23 0.0 0.09 1.0 0.01 0.01 0.01
Zm00001d049813 (GRMZM2G047533)
0.0 0.0 0.03 0.07 0.03 0.01 0.0 0.01 0.01 0.0 0.01 0.02 0.02 0.58 0.01 0.13 0.01 0.01 0.08 0.0 0.03 0.01 0.05 0.01 0.01 0.0 0.32 0.14 0.03 0.0 1.0 0.02 0.24 0.18 0.01 0.02 0.03
Zm00001d050984 (GRMZM2G453494)
0.0 0.0 0.0 1.0 0.01 0.12 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.16 0.0 0.0 0.52 0.0 0.03 0.0
Zm00001d051459 (GRMZM2G044627)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.06 0.0 0.0 1.0 0.01 0.06 0.14 0.0 0.0 0.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)