Heatmap: Cluster_255 (HCCA cluster)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
Root (elongation zone)
Root (meristematic zone)
Root (stele)
Root (tip)
Root
Leaf (3rd leaf of seedling)
Leaf (3rd leaf)
Leaf (apex)
Leaf (bundle sheath)
Leaf (mesophyll)
Leaf (Seedling)
Leaf
Internode
Stalks
Shoot
Shoot (apex)
Tassels (primordia)
Tassels
Anther
Pollen
Ear (immature)
Ear (inflorescence)
Ear (leaf)
Ear (primordia)
Ear
Silks
Kernels (germinating)
Kernels
Maternal transfer zone
Nucellus
Embryo
Endosperm (transfer layer)
Endosperm
Seeds
Coleoptyle (5 day)
Seedling
Whole Plant
Zm00001d002462 (GRMZM2G101675)
15.13 19.36 46.54 13.69 19.6 9.33 6.19 9.16 6.88 11.77 16.5 9.82 5.1 13.96 8.41 20.54 21.87 20.21 14.88 0.15 10.51 14.38 12.88 24.13 12.28 16.16 26.36 16.01 4.38 29.08 65.41 10.78 11.31 65.01 9.9 16.2 8.88
25.42 22.43 63.39 0.12 23.16 7.18 1.17 18.06 14.6 15.63 4.39 12.33 7.71 8.35 13.76 21.13 11.82 42.81 9.3 0.02 36.33 19.2 9.07 43.8 37.43 0.43 29.35 27.6 9.02 0.23 76.77 11.28 9.0 68.84 34.55 17.77 3.15
Zm00001d003191 (GRMZM2G052175)
0.0 0.0 0.0 2.39 0.74 0.29 0.0 0.0 0.0 0.0 0.94 1.57 0.0 0.0 0.05 0.88 0.0 2.17 0.18 0.9 0.02 0.0 1.2 0.0 0.1 0.0 22.3 0.52 0.0 0.47 78.29 0.0 0.34 0.27 2.46 0.35 1.35
Zm00001d003282 (GRMZM2G057637)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 4.64 25.95 2.74 0.0 276.92 10.58 17.91 104.34 0.0 0.11 0.19
Zm00001d005159 (GRMZM2G064163)
188.22 277.5 218.35 84.86 112.66 71.8 63.39 103.49 126.92 63.78 48.46 87.12 175.87 74.27 69.92 150.34 113.39 112.79 245.66 10.03 76.11 113.03 102.95 121.18 111.3 102.82 275.83 69.53 77.8 106.01 219.89 7.72 29.7 240.89 160.22 68.89 68.36
Zm00001d006364 (GRMZM2G146745)
0.18 0.41 0.05 1.81 0.51 0.0 0.08 0.0 0.15 0.12 0.0 0.08 0.06 0.0 0.26 0.23 0.08 0.15 0.08 0.04 0.07 0.0 0.0 0.03 0.51 0.83 5.32 7.91 2.05 11.91 115.7 8.93 9.56 28.09 0.41 0.11 0.04
0.36 0.03 5.24 0.24 1.57 0.86 1.11 8.18 1.42 0.51 0.27 3.6 0.0 2.47 4.53 6.79 0.39 15.67 11.53 0.01 0.49 1.58 2.56 0.76 28.3 0.04 146.44 24.87 0.0 0.23 290.67 0.74 12.78 107.08 1.29 2.78 0.73
9.54 11.14 14.85 9.0 13.83 5.68 4.28 6.3 4.0 2.95 5.27 5.59 9.41 15.87 6.75 13.7 8.4 8.6 6.32 0.12 7.57 6.53 41.69 10.13 7.93 4.83 8.12 8.16 6.43 16.18 66.83 5.52 4.06 12.04 27.04 10.8 10.38
2.75 4.56 3.3 0.12 18.86 4.74 0.76 0.97 0.0 0.07 2.5 27.71 0.0 4.69 0.71 10.39 0.17 1.69 0.39 0.55 2.42 0.84 102.39 0.25 16.63 12.37 14.2 7.9 1.5 0.0 506.4 0.31 7.15 24.64 6.57 70.47 13.99
0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.06 0.0 0.0 0.01 0.26 1.01 1.32 0.01 2.28 0.13 0.0 0.48 0.81 0.0 0.82 2.11 0.0 0.0 4.7 1.0 1.91 7.97 0.01 0.02 0.01
Zm00001d013229 (GRMZM2G394688)
0.0 0.09 0.01 0.0 0.03 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.03 0.03 0.0 0.02 0.0 0.02 0.07 0.35 0.72 0.01 3.54 0.11 2.43 0.59 0.5 0.0 1.29 1.74 2.19 0.11 3.73 1.69 0.99 5.52 0.01 0.05 0.01
Zm00001d014325 (GRMZM2G048549)
2.96 6.27 7.54 3.25 14.75 22.03 11.99 36.24 12.46 29.23 28.5 30.67 2.15 1.25 22.24 19.5 0.91 7.12 2.94 0.19 6.65 4.45 14.62 4.7 16.81 12.2 29.68 15.43 1.5 0.0 110.31 15.14 38.26 42.55 9.6 41.25 16.22
Zm00001d016098 (GRMZM2G165726)
26.5 4.74 37.62 8.39 12.13 0.02 0.0 0.55 0.0 0.0 0.0 0.55 0.0 0.16 0.02 8.96 0.21 0.0 0.16 0.0 0.07 0.0 1.2 0.06 0.71 0.0 38.46 6.44 0.0 0.68 243.43 1.57 6.25 21.08 0.06 0.51 0.31
Zm00001d016255 (GRMZM2G105348)
5.72 17.15 48.73 146.74 36.72 28.8 29.43 15.51 2.82 3.97 14.7 12.03 0.91 67.81 6.59 42.71 1.02 2.44 11.43 0.46 11.44 1.17 31.75 7.07 4.77 3.09 39.99 6.6 4.51 0.7 288.63 4.88 2.43 26.54 1.83 54.3 71.47
Zm00001d017140 (GRMZM2G137399)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.02 0.25 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.01 0.04 0.01 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 14.26 4.7 0.0 0.0 66.72 0.85 1.96 33.18 0.0 0.18 0.02
Zm00001d019446 (GRMZM2G042692)
0.04 0.0 0.0 0.0 0.05 0.03 0.0 0.0 0.09 0.03 0.0 0.25 0.06 0.0 0.43 0.07 0.0 0.1 0.01 0.04 0.0 0.0 0.0 0.01 0.11 0.0 1.91 12.01 1.5 0.12 316.33 15.88 28.73 153.79 2.92 1.69 0.18
Zm00001d019704 (GRMZM2G407223)
15.55 26.61 35.91 0.49 50.44 2.57 0.08 1.4 0.22 0.86 3.51 16.16 0.23 22.65 0.58 60.52 0.5 0.64 0.18 0.08 1.51 1.68 21.52 0.36 17.37 1.54 10.7 2.37 0.0 1.07 600.68 0.0 1.52 97.51 1.12 37.19 8.54
0.01 1.09 0.02 0.85 4.23 0.0 0.06 0.08 0.15 0.03 0.22 0.5 0.11 4.38 0.79 2.97 0.0 0.28 0.16 1.08 0.15 0.0 0.0 0.06 0.94 2.82 4.13 4.04 0.0 0.22 202.05 0.0 3.03 40.09 1.25 11.29 3.1
Zm00001d021901 (GRMZM2G374971)
1.64 1.03 1.06 8.85 39.07 6.61 3.22 19.18 0.74 0.73 6.89 23.5 2.72 11.45 18.02 7.47 0.08 7.54 42.6 0.07 1.42 0.69 99.59 2.51 3.02 15.59 141.88 59.45 3.42 0.59 65.08 12.39 33.76 332.05 1.99 28.31 26.37
Zm00001d022303 (GRMZM2G006119)
0.0 0.0 0.03 0.0 0.22 0.02 2.54 0.44 0.05 0.01 0.03 0.21 0.0 0.29 0.14 0.01 0.0 0.0 0.06 0.01 0.19 0.04 0.17 0.04 0.12 0.06 18.14 20.28 0.0 0.12 428.86 0.0 12.83 136.95 0.14 0.14 0.64
Zm00001d023985 (GRMZM2G350919)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.4 0.0 0.0 0.01 0.67 0.51 0.84 0.0 0.0 0.01
Zm00001d024302 (GRMZM2G368861)
1.22 0.13 3.32 0.0 0.73 0.0 0.0 1.14 0.0 0.0 0.0 1.53 0.0 0.22 0.26 7.44 0.0 0.08 0.07 0.08 0.1 0.0 0.0 0.08 6.57 0.0 1002.23 1062.05 6.02 0.44 10906.7 7.09 1310.94 8174.04 0.05 5.82 0.47
Zm00001d027258 (GRMZM2G333069)
2.28 8.87 9.67 3.73 11.84 0.3 0.23 2.09 1.82 1.46 2.77 3.47 5.04 26.17 3.63 31.63 8.74 4.85 7.65 0.02 17.57 1.36 0.65 14.31 5.54 20.76 24.97 44.81 2.05 5.41 859.02 29.44 36.35 175.35 3.48 9.42 5.88
Zm00001d028647 (GRMZM2G172574)
0.17 0.0 0.02 0.0 0.25 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.02 0.01 0.0 0.0 0.01 7.46 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 68.37 19.96 0.0 0.0 1014.12 10.52 47.64 247.24 0.0 0.06 0.0
Zm00001d029025 (GRMZM2G050077)
0.29 0.06 5.98 0.0 4.71 0.26 0.03 0.07 3.06 1.0 0.5 2.76 0.57 0.46 2.6 10.83 1.05 2.0 0.36 0.01 0.71 0.27 0.87 0.3 4.34 0.08 2.78 1.37 0.68 0.45 69.17 0.0 0.39 5.84 2.21 5.86 2.06
Zm00001d029778 (GRMZM2G402564)
1.26 0.0 0.09 0.0 24.05 1.05 1.29 19.15 2.3 0.97 5.29 24.75 1.19 19.49 13.55 48.71 10.7 3.24 96.6 0.27 66.52 5.01 21.71 87.12 31.81 4.58 75.25 347.14 57.15 22.67 8313.28 313.32 388.5 1074.28 2.23 43.25 23.3
Zm00001d030172 (GRMZM2G179528)
0.01 0.05 0.2 1.2 10.45 6.61 2.94 4.15 2.26 1.8 42.04 23.28 0.06 0.05 5.2 0.57 0.0 0.76 1.33 0.0 0.03 0.0 71.64 0.0 1.46 0.0 61.35 26.45 71.12 0.0 35.14 2.02 9.48 21.11 2.51 8.74 6.56
Zm00001d030262 (GRMZM2G466982)
0.0 0.0 0.0 0.35 0.21 0.18 0.38 0.41 0.0 0.03 0.49 0.34 0.0 0.0 0.11 0.21 0.65 0.01 0.38 0.0 0.55 0.46 0.0 0.0 0.06 0.63 0.0 0.52 0.0 0.0 0.77 6.59 0.28 0.05 0.73 0.13 6.37
Zm00001d030464 (GRMZM2G063824)
1.57 0.55 0.09 0.59 1.71 0.01 0.02 0.34 0.0 0.0 0.19 0.1 0.74 1.7 0.11 1.6 0.04 7.75 0.17 0.05 2.39 1.15 0.0 0.94 2.17 1.72 6.62 1.47 1.5 0.34 12.0 0.19 0.57 8.57 0.15 0.28 0.89
0.0 0.0 0.58 0.0 0.03 0.0 0.29 0.0 5.99 5.44 0.0 0.22 0.0 0.0 0.79 0.13 0.0 0.12 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.37 0.0 0.0 0.56 0.0 0.17 1.28 0.49 0.98 0.0
Zm00001d031228 (GRMZM2G169535)
0.0 1.5 0.21 0.0 0.52 0.39 0.1 1.65 0.0 0.0 0.27 6.72 0.11 0.0 0.12 0.54 0.0 0.04 0.02 1.11 0.0 0.0 49.02 0.0 0.6 0.0 10.82 0.46 0.0 0.0 510.97 0.0 1.58 180.31 0.31 5.63 0.83
Zm00001d031785 (GRMZM2G117250)
0.15 0.19 0.14 0.0 0.75 0.15 0.03 0.0 0.0 0.0 0.04 0.13 0.17 0.78 0.04 0.05 0.6 0.0 0.02 0.01 0.05 0.0 0.03 0.08 0.09 0.0 0.31 0.41 0.0 0.12 4.99 0.31 0.28 1.11 0.04 0.22 0.28
Zm00001d032130 (GRMZM2G055143)
0.0 0.0 0.33 0.0 0.57 0.27 0.35 0.37 0.0 0.03 0.42 0.52 0.28 8.3 0.11 1.12 0.19 2.81 17.51 0.1 1.8 2.37 1.78 0.02 1.85 4.55 1.29 4.99 10.94 29.27 75.04 14.37 3.38 25.52 0.14 0.24 1.01
Zm00001d033064 (GRMZM2G461548)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.57 0.01 0.17 0.0 0.0 0.01
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.19 0.4 0.0 0.0 0.13 0.0 0.07 0.31 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.25 0.0 0.0 1.71 0.0 0.21 0.7 0.0 0.0 0.51
Zm00001d034848 (GRMZM2G159353)
0.0 0.0 0.02 0.0 0.07 1.25 0.04 3.59 0.3 0.01 0.24 0.55 0.0 2.21 0.42 0.19 0.02 0.0 0.07 4.18 0.0 0.0 2.79 0.0 0.1 0.0 0.78 1.06 0.0 0.0 30.09 0.0 0.66 13.35 0.07 0.18 0.38
Zm00001d036911 (GRMZM2G423378)
0.32 1.98 0.69 0.36 0.43 0.06 0.03 0.41 0.95 0.55 0.0 0.11 0.11 0.56 0.23 0.57 0.16 1.83 0.94 0.19 0.12 1.01 0.03 0.05 0.61 0.04 0.69 0.21 1.5 0.0 6.2 0.0 1.14 13.96 0.23 1.48 0.0
Zm00001d037915 (GRMZM5G826767)
0.02 0.04 0.0 0.0 0.38 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.03 0.0 0.0 0.01 0.48 0.01 0.06 0.24 0.04 0.41 0.71 0.0 0.05 0.82 16.15 3.03 16.77 0.0 0.0 199.38 23.3 14.69 27.96 0.0 0.01 0.0
Zm00001d037918 (GRMZM2G055699)
0.09 2.12 2.65 6.51 9.68 28.45 24.48 8.47 4.22 5.6 32.24 18.85 0.34 2.29 5.99 5.12 28.55 9.89 5.07 0.0 1.79 1.01 79.66 1.29 5.76 0.0 59.28 20.5 97.23 0.0 32.87 4.77 16.22 69.08 2.84 15.26 12.57
Zm00001d038099 (GRMZM2G061143)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.4 0.0 0.0 0.0 0.0 0.27 0.24 0.0 0.0 0.0
Zm00001d038974 (GRMZM2G085641)
0.18 0.28 1.34 0.24 1.98 6.96 4.26 2.27 2.07 2.77 13.67 10.67 0.06 4.89 5.99 2.06 2.2 16.07 5.0 7.39 2.78 0.44 8.75 1.56 5.78 2.55 5.01 1.4 0.0 19.85 103.74 2.2 1.15 27.59 3.74 6.95 13.57
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.83 0.0 0.0 0.07 1.65 0.65 1.25 0.0 0.0 0.0
Zm00001d043302 (GRMZM2G039166)
0.09 0.05 0.07 0.0 0.03 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.21 0.0 0.0 0.0 0.02 0.02 0.03 0.05 0.1 0.02 0.11 0.0 1.2 0.1 0.0 11.13 26.23 0.0 0.0 438.5 0.47 25.46 66.52 0.0 0.3 0.06
Zm00001d044078 (GRMZM2G067600)
26.75 52.27 109.75 24.78 90.59 10.37 16.39 50.51 16.41 10.99 11.21 34.18 0.0 2.22 3.82 21.8 0.08 1.62 0.14 2.51 0.15 0.22 13.29 0.42 3.82 131.07 60.05 21.67 0.0 0.47 837.76 9.17 16.59 190.42 0.69 156.08 51.61
Zm00001d044351 (GRMZM2G019578)
0.01 0.0 0.58 0.12 1.02 0.01 0.02 0.01 0.0 0.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.21 0.02 0.05 0.27 0.13 0.0 0.0 0.05 0.0 0.01 0.06 0.71 0.03 0.08 0.68 0.0 2.55 0.55 0.23 0.97 0.21 0.13 0.07
Zm00001d044352 (GRMZM2G023631)
0.02 0.0 0.08 0.0 0.44 0.32 0.03 0.03 0.03 0.02 0.03 1.02 0.0 0.48 0.12 0.08 0.02 0.73 0.3 0.11 0.03 0.0 1.79 0.0 0.49 3.68 0.42 0.13 0.0 0.0 5.88 0.0 0.32 2.68 3.15 1.17 0.4
Zm00001d045321 (GRMZM2G098750)
0.01 0.18 0.0 0.0 0.41 0.05 0.01 0.03 0.02 0.05 0.08 0.5 0.0 0.24 0.03 0.59 0.09 0.19 0.05 1.75 0.01 0.0 0.0 0.25 0.74 0.68 20.42 13.14 7.38 0.12 214.68 1.81 13.35 95.51 0.17 0.28 0.14
0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.02 0.0 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.32 0.0 0.0 0.0 1.6 0.36 0.66 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.29 0.39 0.0 0.0 0.0
Zm00001d047259 (GRMZM2G125813)
0.11 1.63 2.11 1.68 4.73 0.28 0.33 6.1 0.03 0.0 0.0 1.31 4.87 42.02 0.7 40.02 3.09 1.29 0.49 0.13 15.75 31.0 0.0 1.27 18.93 10.63 6.28 18.87 15.31 24.09 144.63 11.01 4.8 6.13 0.11 1.4 2.84
Zm00001d047710 (GRMZM2G083186)
0.84 1.55 9.12 0.35 3.31 0.7 2.02 2.02 2.56 7.11 2.18 4.55 1.19 5.38 0.77 4.28 1.08 3.72 10.09 0.64 1.94 1.12 7.79 1.86 1.54 0.0 11.51 8.11 4.51 0.0 25.53 6.08 2.86 24.22 0.75 4.52 0.6
0.04 0.5 0.07 0.0 0.11 0.0 0.0 1.01 0.0 0.18 0.22 0.01 0.0 0.3 0.21 0.25 0.0 0.41 0.27 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.11 0.0 0.23 0.12 0.0 0.0 0.48 0.0 0.27 0.11 0.1 0.05 0.0
Zm00001d048629 (GRMZM2G107286)
0.01 0.0 0.0 0.0 0.2 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.0 0.4 0.24 0.01 0.0 1.72 0.0 0.66 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 2.72 7.55 1.12 0.0 0.0 391.01 0.0 6.06 183.27 0.03 0.3 0.03
Zm00001d048948 (GRMZM2G419675)
0.0 0.0 0.23 0.0 1.31 0.19 1.06 0.75 0.03 0.0 2.96 0.47 0.0 0.15 0.24 0.05 0.0 0.42 0.93 0.02 0.0 0.0 2.08 0.54 0.48 2.75 124.95 41.39 0.0 0.0 41.77 0.0 16.62 180.04 1.36 2.57 0.95
Zm00001d049813 (GRMZM2G047533)
0.0 0.0 1.74 3.9 1.49 0.41 0.17 0.35 0.4 0.24 0.79 1.04 1.08 30.73 0.65 6.64 0.27 0.53 4.28 0.0 1.45 0.48 2.6 0.27 0.34 0.15 16.9 7.44 1.37 0.0 53.02 0.88 12.85 9.72 0.49 1.18 1.6
Zm00001d050984 (GRMZM2G453494)
0.0 0.0 0.0 0.49 0.0 0.06 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.25 0.0 0.01 0.0
Zm00001d051459 (GRMZM2G044627)
0.3 0.0 0.23 0.12 0.19 24.61 0.0 0.0 0.0 0.0 0.38 3.92 0.0 0.22 2.07 1.33 0.0 0.02 0.01 0.07 0.05 0.05 0.0 0.07 0.02 0.0 17.24 59.54 0.0 0.12 1027.5 9.15 59.98 145.11 0.01 4.64 0.35

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)