Heatmap: Cluster_120 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Sterile Leaflet
Fertile Leaflet with Sori
Primary Rachis
Petiole
Root
Pir_g22762 (RR1)
- - - - 2.32
Pir_g23676 (SGT1A)
- - - -6.69 2.32
- - -6.37 - 2.32
Pir_g24102 (AVP1)
- - - -9.35 2.32
Pir_g24194 (GCN3)
- - - - 2.32
Pir_g24323 (RPB2)
- -9.53 - -7.41 2.32
- - -6.59 - 2.32
Pir_g25892 (RAB7B)
- - - - 2.32
Pir_g25970 (ARF3)
- - - - 2.32
Pir_g26469 (Hsp89.1)
- - - -6.69 2.32
Pir_g27186 (GSR 1)
- - - - 2.32
Pir_g27206 (HDT3)
- -8.73 - -8.61 2.32
Pir_g27513 (PLP6)
- - -7.18 -8.22 2.32
Pir_g27540 (SDH1-1)
-9.25 - -8.13 - 2.32
-7.86 - - - 2.32
Pir_g28415 (TUB8)
-9.15 -8.01 -9.52 -10.66 2.32
- - - -10.12 2.32
- - -7.12 -6.61 2.32
Pir_g29447 (CINV2)
- - - - 2.32
Pir_g29477 (HSC70-5)
- - - - 2.32
- - -7.2 -7.71 2.32
-7.45 -8.4 - - 2.32
Pir_g29856 (HSC70)
-7.14 - -7.04 - 2.32
Pir_g30037 (CAM3)
-9.83 -9.93 - -7.49 2.32
Pir_g30239 (ACT11)
- -8.44 - -7.33 2.32
Pir_g30397 (ATMS1)
-9.8 -9.8 - - 2.32
Pir_g30433 (CUL4)
-8.9 - - -7.84 2.32
Pir_g30448 (HSP70)
- - -10.68 -6.56 2.32
Pir_g30474 (PUM2)
- - - - 2.32
- - - -10.43 2.32
Pir_g30941 (TUA6)
-9.88 -9.46 -7.36 -9.18 2.32
Pir_g31106 (PIP3)
- - -8.12 - 2.32
Pir_g31289 (KIN10)
- - - - 2.32
- -7.61 - - 2.32
Pir_g31391 (UBP12)
- - - - 2.32
Pir_g32075 (UBQ11)
-9.28 -7.84 - -6.94 2.32
Pir_g32108 (TUB8)
- - - - 2.32
Pir_g32121 (GRF4)
- -6.78 -9.07 -8.16 2.32
Pir_g32450 (UBQ4)
-9.25 -10.88 -8.41 -8.21 2.32
Pir_g32570 (HOG1)
-10.77 -8.43 -9.26 -8.21 2.32
Pir_g32577 (KJK)
- - - -7.46 2.32
Pir_g32619 (IXR1)
- - -10.74 -8.49 2.32
Pir_g32646 (RPB1)
- - -9.58 -9.07 2.32
- -8.82 - - 2.32
Pir_g34151 (MCM4)
- - - - 2.32
Pir_g34228 (emb1075)
- - - - 2.32
Pir_g35297 (RGP1)
- - - -9.21 2.32
Pir_g35477 (ACA2)
- - - -7.59 2.32
Pir_g37689 (PDAT)
- - - - 2.32
Pir_g38180 (ARFA1E)
- - - - 2.32
Pir_g38494 (ADG1)
-9.22 -9.09 - -7.27 2.32
Pir_g39278 (EMB2766)
- - - - 2.32
- - -7.33 -8.9 2.32
Pir_g41095 (ALA2)
- - - - 2.32
Pir_g43182 (TUB1)
-8.21 -7.74 - -6.83 2.32
Pir_g43183 (TUB6)
- -9.65 -12.11 -9.84 2.32
Pir_g43239 (SRG3)
- - - -6.97 2.32
Pir_g44138 (CAS1)
- - - -9.04 2.32
- - -7.01 - 2.32
- - - - 2.32
- - -7.44 - 2.32
- - - -7.69 2.32
Pir_g46629 (MEKK1)
- - - - 2.32
Pir_g46725 (ELP3)
- - - - 2.32
- - - - 2.32
- - -7.11 - 2.32
Pir_g49094 (DiT1)
- - - - 2.32
Pir_g49312 (AATP1)
- - - - 2.32
- - -6.58 - 2.32
Pir_g49825 (HTA12)
- - -6.95 -11.75 2.32
Pir_g51208 (PSL4)
- - -7.86 - 2.32
-9.73 -8.2 -7.98 -6.42 2.32
- - - - 2.32

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.