Heatmap: Cluster_40 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Sterile Leaflet
Fertile Leaflet with Sori
Primary Rachis
Petiole
Root
1.0 0.93 0.2 0.02 0.01
1.0 0.81 0.28 0.16 0.07
1.0 0.7 0.18 0.07 0.02
1.0 0.84 0.11 0.05 0.02
Pir_g00873 (CA1)
1.0 0.72 0.1 0.02 0.0
1.0 0.79 0.29 0.19 0.11
1.0 0.77 0.47 0.3 0.15
1.0 0.77 0.2 0.15 0.07
Pir_g01597 (TSO2)
1.0 0.98 0.56 0.32 0.17
Pir_g01636 (MS2)
1.0 0.94 0.32 0.14 0.01
1.0 0.85 0.18 0.06 0.01
Pir_g01807 (LHCA1)
0.98 1.0 0.19 0.03 0.01
1.0 0.82 0.32 0.24 0.13
1.0 0.97 0.13 0.04 0.01
Pir_g02490 (THF1)
1.0 0.81 0.45 0.34 0.07
Pir_g02537 (ALDH11A3)
1.0 0.71 0.38 0.1 0.05
Pir_g03021 (ACHT1)
1.0 0.84 0.48 0.4 0.1
1.0 0.85 0.4 0.37 0.11
Pir_g05003 (CYP704B1)
1.0 1.0 0.44 0.29 0.01
Pir_g05199 (STI)
1.0 0.68 0.21 0.13 0.01
Pir_g05247 (OE23)
0.98 1.0 0.28 0.07 0.02
Pir_g05428 (PSAO)
1.0 0.82 0.23 0.06 0.01
Pir_g05449 (ACSF)
1.0 0.9 0.31 0.12 0.05
1.0 0.84 0.4 0.29 0.14
1.0 0.79 0.08 0.03 0.01
1.0 0.77 0.3 0.19 0.11
1.0 0.88 0.25 0.11 0.02
0.85 1.0 0.45 0.33 0.09
Pir_g08208 (RCA)
1.0 0.65 0.08 0.02 0.0
1.0 0.97 0.52 0.25 0.02
0.95 1.0 0.11 0.07 0.0
1.0 0.81 0.27 0.19 0.12
1.0 0.83 0.48 0.42 0.15
Pir_g09552 (PTAC17)
1.0 0.87 0.19 0.17 0.09
Pir_g09686 (RNR1)
1.0 0.84 0.15 0.07 0.03
Pir_g09734 (HDS)
1.0 0.81 0.29 0.25 0.16
0.97 1.0 0.5 0.22 0.03
Pir_g09968 (PSBX)
0.96 1.0 0.2 0.02 0.0
1.0 0.82 0.07 0.02 0.0
1.0 0.76 0.17 0.09 0.03
1.0 0.69 0.24 0.15 0.12
1.0 0.82 0.01 0.0 0.0
1.0 0.76 0.25 0.16 0.09
1.0 0.68 0.31 0.25 0.09
1.0 0.8 0.46 0.3 0.13
Pir_g11364 (PDF2)
1.0 0.86 0.4 0.21 0.01
Pir_g11414 (CCH)
1.0 0.9 0.24 0.08 0.02
Pir_g11416 (PDR6)
0.85 1.0 0.5 0.24 0.0
1.0 0.92 0.38 0.37 0.18
1.0 0.77 0.29 0.19 0.1
1.0 0.79 0.32 0.11 0.05
Pir_g11639 (GAPB)
1.0 0.91 0.13 0.01 0.0
Pir_g12153 (HEMA1)
1.0 0.96 0.45 0.23 0.09
1.0 0.91 0.58 0.49 0.22
Pir_g12224 (ARC5)
1.0 0.74 0.19 0.12 0.06
1.0 0.83 0.12 0.04 0.01
Pir_g12897 (SIGB)
1.0 0.87 0.49 0.38 0.04
1.0 0.83 0.24 0.18 0.07
1.0 0.85 0.13 0.02 0.0
1.0 0.91 0.03 0.06 0.12
1.0 0.85 0.38 0.22 0.02
1.0 0.8 0.33 0.25 0.13
Pir_g14144 (CYP709B1)
1.0 0.89 0.13 0.03 0.01
Pir_g14367 (emb2394)
1.0 0.88 0.51 0.34 0.09
1.0 0.84 0.41 0.27 0.15
1.0 0.87 0.5 0.34 0.1
Pir_g15314 (Phox2)
1.0 0.84 0.5 0.26 0.08
Pir_g15383 (SPL8)
1.0 0.82 0.03 0.0 0.0
Pir_g15404 (EMB2369)
1.0 0.77 0.33 0.27 0.11
Pir_g15736 (CLM)
1.0 0.61 0.07 0.06 0.0
1.0 0.87 0.15 0.07 0.09
1.0 0.82 0.18 0.08 0.12
Pir_g16551 (PPDK)
1.0 0.89 0.55 0.4 0.08
Pir_g16593 (APG6)
1.0 0.8 0.48 0.3 0.11
1.0 0.75 0.22 0.15 0.07
Pir_g16873 (UPP)
1.0 0.86 0.11 0.03 0.03
1.0 0.92 0.14 0.12 0.22
Pir_g17558 (PSAE-2)
1.0 0.82 0.22 0.06 0.01
1.0 0.81 0.55 0.39 0.1
Pir_g17587 (GUN4)
1.0 0.86 0.23 0.16 0.05
1.0 0.9 0.34 0.24 0.02
1.0 0.62 0.12 0.03 0.0
1.0 0.82 0.54 0.4 0.11
1.0 0.71 0.3 0.23 0.14
1.0 0.78 0.25 0.25 0.13
Pir_g18906 (KEA2)
1.0 0.81 0.48 0.42 0.16
1.0 0.79 0.32 0.23 0.09
1.0 0.74 0.1 0.06 0.04
1.0 0.73 0.24 0.16 0.18
1.0 0.86 0.15 0.03 0.01
Pir_g20033 (ATPC1)
1.0 0.8 0.21 0.09 0.02
1.0 0.81 0.16 0.11 0.06
1.0 0.79 0.39 0.32 0.17
1.0 0.83 0.42 0.29 0.12
Pir_g37858 (PSBY)
1.0 0.82 0.28 0.11 0.01
1.0 0.83 0.12 0.07 0.06
Pir_g41401 (ACS)
1.0 0.86 0.2 0.15 0.07
1.0 0.75 0.28 0.21 0.09
Pir_g42601 (emb2726)
1.0 0.74 0.19 0.09 0.04
1.0 0.9 0.44 0.24 0.02
1.0 0.75 0.27 0.21 0.1
1.0 0.76 0.25 0.25 0.13
Pir_g55752 (emb2394)
1.0 0.92 0.55 0.32 0.09
1.0 0.77 0.21 0.17 0.06
1.0 1.0 0.03 0.0 0.0
1.0 1.0 0.21 0.08 0.01
Pir_g56872 (PGR1)
1.0 0.83 0.2 0.07 0.01
0.97 1.0 0.11 0.01 0.0
Pir_g58493 (CCD4)
1.0 0.64 0.01 0.0 0.01
1.0 0.95 0.02 0.01 0.01
1.0 0.95 0.17 0.09 0.03
1.0 0.82 0.12 0.0 0.01
1.0 0.76 0.02 0.03 0.0
1.0 0.86 0.46 0.35 0.11
1.0 0.79 0.05 0.05 0.06
Pir_g61350 (SSI)
1.0 0.8 0.01 0.0 0.05
Pir_g61824 (CTF2A)
1.0 0.66 0.25 0.19 0.08
1.0 0.9 0.11 0.02 0.01
1.0 0.74 0.06 0.01 0.01
1.0 0.92 0.53 0.26 0.02
1.0 0.81 0.19 0.09 0.05
1.0 0.79 0.26 0.27 0.1
Pir_g63695 (RBCS1A)
1.0 0.93 0.12 0.03 0.01
1.0 0.64 0.11 0.05 0.0
Pir_g64520 (GH3.17)
1.0 0.71 0.13 0.08 0.01
1.0 0.9 0.38 0.23 0.02
0.98 1.0 0.13 0.04 0.0
1.0 0.73 0.28 0.23 0.08
1.0 0.85 0.1 0.03 0.01
Pir_g66239 (ACSF)
1.0 0.86 0.27 0.09 0.03
Pir_g66470 (PSAK)
1.0 0.84 0.16 0.02 0.01

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)