Heatmap: Cluster_4 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
Sterile Leaflet
Fertile Leaflet with Sori
Primary Rachis
Petiole
Root
3.21 2.9 2.99 4.23 3.04
22.85 24.93 42.33 46.57 39.32
1.35 2.44 4.12 4.26 4.65
Pir_g00168 (FOLB3)
51.31 56.81 52.32 64.64 51.03
2.11 3.56 3.57 7.11 5.38
5.64 5.48 12.29 10.47 15.59
23.44 20.8 37.65 41.07 60.38
22.32 18.7 98.75 118.03 97.97
82.24 92.4 129.99 121.48 149.18
9.4 10.12 10.79 11.11 8.74
51.05 52.76 51.21 65.93 54.07
Pir_g02211 (NF-YC13)
11.09 7.03 16.53 16.45 16.91
14.62 14.26 17.19 16.44 13.89
1.47 1.82 8.83 6.67 13.71
8.65 7.65 11.53 10.88 8.11
7.68 9.87 28.53 23.13 18.89
4.48 4.78 9.21 8.69 10.38
23.48 30.29 33.13 41.43 25.22
1.24 0.69 3.1 4.6 3.88
0.57 0.97 0.85 2.36 0.95
3.87 4.23 5.83 5.6 4.89
4.14 2.3 4.6 6.17 5.54
1.59 1.32 2.11 2.24 2.0
1.9 1.44 5.06 7.06 7.78
1.43 2.3 3.09 4.29 4.04
0.8 1.31 0.79 2.31 1.92
1.01 2.77 4.22 8.09 9.15
5.38 7.23 6.44 5.33 7.8
Pir_g05439 (AVA-P4)
3.52 3.87 4.88 4.09 5.36
0.34 0.45 3.32 9.5 8.21
1.09 0.8 3.57 4.16 2.86
128.0 70.94 589.44 510.62 426.26
3.98 3.1 6.21 7.29 6.36
1.1 1.13 1.24 1.78 2.86
1.83 0.96 5.11 8.58 17.28
3.44 4.33 4.75 5.09 6.18
3.55 4.02 3.66 4.13 4.58
97.78 103.3 153.44 158.23 113.08
52.53 53.93 87.09 98.38 89.81
13.86 11.76 16.35 22.87 15.57
1.87 2.42 2.38 3.99 3.23
Pir_g07905 (ATE1)
4.47 6.72 6.79 6.19 7.33
Pir_g07933 (SCO2)
3.77 3.82 4.06 4.43 4.35
0.83 0.89 7.63 6.12 6.25
Pir_g08263 (RR10)
5.79 8.2 11.49 13.31 9.8
5.78 6.33 6.86 7.0 7.45
8.0 4.2 7.98 9.98 7.06
1.22 1.46 3.26 2.8 5.01
2.61 1.65 0.84 4.56 5.45
1.43 1.0 3.11 3.26 4.51
1.83 2.08 3.06 3.31 2.33
5.17 4.27 6.31 6.32 5.49
2.47 2.16 4.29 5.35 3.46
6.45 5.58 7.63 8.72 7.12
0.39 4.99 6.72 11.44 11.11
3.32 5.58 6.28 7.5 6.85
0.66 0.5 2.33 1.51 2.09
Pir_g11980 (SK13)
1.55 1.24 2.59 2.5 2.84
137.64 164.11 360.11 415.6 447.38
3.13 4.51 4.32 4.59 3.92
0.18 0.25 14.7 28.99 38.54
1.17 0.62 1.87 2.17 2.69
6.54 9.55 6.61 13.48 14.33
4.67 5.48 5.1 4.38 5.65
0.12 1.1 1.38 2.2 3.75
0.27 0.64 2.01 2.54 1.52
1.71 2.02 3.41 6.96 2.99
1.69 0.94 2.58 3.93 6.46
Pir_g16113 (CPH)
2.85 3.61 5.75 7.08 7.75
2.96 2.98 3.78 4.24 3.54
1.7 1.44 2.03 2.22 3.94
5.47 1.3 10.4 8.39 19.33
0.76 0.98 1.57 2.53 1.91
2.76 2.85 5.18 4.79 4.09
2.79 2.26 2.46 3.33 5.05
0.31 1.14 7.21 8.46 7.17
4.46 7.57 7.18 7.74 7.23
9.24 9.56 11.06 10.59 13.6
0.46 2.15 3.97 3.18 2.52
Pir_g19782 (OLD3)
0.41 0.07 3.17 5.34 6.59
82.44 114.04 154.66 176.11 140.19
4.19 3.09 5.07 5.3 9.72
0.0 0.0 1.77 1.56 2.81
5.09 3.48 6.03 5.89 6.24
1.16 1.53 2.75 2.83 2.1
0.68 1.65 1.41 3.52 2.68
9.85 7.49 9.73 10.81 8.54
0.98 0.97 1.76 2.71 4.68
0.53 1.08 5.11 3.27 5.72
7.4 6.23 13.98 16.51 21.13
0.8 3.08 3.59 6.11 11.18
Pir_g24631 (ARA7)
6.5 3.07 6.46 12.56 10.84
1.21 1.71 4.1 4.56 2.99
3.62 2.89 6.35 8.08 9.59
0.66 1.49 2.25 3.97 3.79
47.73 45.55 46.33 56.79 62.93
Pir_g25635 (ELC-Like)
2.26 2.24 2.5 2.48 4.21
0.92 0.89 1.48 3.52 3.22
52.35 49.9 72.56 76.73 76.0
0.43 0.91 4.54 3.51 3.72
0.85 0.0 3.32 2.81 4.28
67.3 74.3 153.79 180.19 203.13
60.2 69.09 105.82 106.25 121.98
Pir_g29295 (TBL5)
0.42 0.1 1.71 4.01 3.75
9.38 6.88 12.83 19.68 17.6
6.39 7.92 7.43 5.62 8.47
0.36 0.56 3.94 6.0 8.32
0.46 0.13 4.66 5.54 7.13
1.26 0.79 4.84 3.19 3.82
7.85 11.39 11.85 13.53 12.42
2.93 3.32 8.6 7.22 7.98
25.8 28.29 48.1 49.65 40.72
Pir_g33795 (RSZ22a)
4.93 5.02 6.91 7.75 8.87
25.78 29.35 39.78 46.01 33.65
2.47 2.51 3.0 3.77 3.55
0.81 0.33 3.48 3.49 4.45
1.75 1.76 3.34 3.94 3.25
2.98 2.94 15.12 16.41 17.51
7.91 6.72 13.74 12.23 16.47
59.87 55.7 69.84 69.2 53.35
16.04 14.77 19.79 19.24 23.89
7.68 6.93 9.74 9.61 6.99
3.64 2.08 4.1 4.68 9.41
12.43 15.26 19.72 19.57 13.88
Pir_g42938 (MTP11)
0.45 0.74 8.92 11.56 13.12
2.02 3.5 3.19 5.14 3.19
3.03 3.98 5.25 8.36 6.12
3.17 2.4 3.78 3.33 2.92
2.12 2.51 2.86 2.92 3.96
Pir_g47261 (P5CDH)
1.93 1.28 2.48 2.38 2.71
7.12 6.73 9.65 10.05 10.07
7.27 6.34 8.71 9.69 7.78
4.3 3.9 6.47 9.98 7.83
0.63 1.76 4.18 4.8 7.35
5.4 6.7 7.55 7.77 7.76
4.53 3.39 14.42 22.06 21.37
Pir_g56156 (VSR4)
29.27 36.72 28.12 35.52 40.67
3.47 2.52 4.71 5.07 2.99
Pir_g56924 (VAMP726)
10.79 7.48 12.36 11.1 20.43
3.95 4.84 3.77 6.29 4.66
3.61 5.14 7.16 8.44 4.91
5.53 5.19 6.15 8.76 4.91
2.12 1.74 2.79 3.81 3.13
4.23 6.68 9.8 8.92 10.03
2.89 5.52 7.2 9.18 8.93
Pir_g57914 (ECHIA)
3.65 4.45 5.75 5.5 5.93
Pir_g57943 (TUA6)
30.28 31.36 52.44 44.96 61.39
0.44 0.96 3.23 3.81 2.33
47.46 44.7 65.51 72.18 53.28
Pir_g58569 (TRFL9)
2.67 2.82 2.61 3.62 2.62
7.69 7.71 7.93 9.48 6.93
3.84 2.58 9.04 14.63 17.51
5.52 5.82 10.06 10.85 6.93
3.19 7.98 16.96 14.42 17.93
Pir_g59658 (DRB2)
0.87 1.5 1.78 2.76 2.67
1.68 2.53 3.69 4.35 3.22
2.47 2.41 2.4 3.26 6.95
1.82 2.51 2.49 3.84 6.69
1.61 2.94 3.57 2.82 3.81
1.59 1.82 1.16 2.94 2.78
7.6 6.46 7.0 9.88 7.77
4.29 6.82 9.61 10.11 6.0
0.96 1.22 5.47 5.97 3.76
5.06 7.43 8.11 10.7 9.68
8.31 9.71 18.7 23.99 25.31
0.27 1.43 1.47 2.89 2.26
1.59 1.37 2.54 2.97 2.04
0.44 0.49 2.06 2.81 2.15
17.36 15.19 19.15 21.58 15.9
13.86 3.09 58.54 45.64 63.82
Pir_g63329 (CDC48B)
1.62 1.66 1.27 2.25 1.82
12.06 11.75 21.0 26.83 17.34
4.0 3.85 7.07 7.01 9.8
2.87 4.43 6.08 6.61 11.22
5.9 4.63 7.4 7.06 5.11
1.53 2.52 3.81 6.21 5.01
2.37 2.09 1.27 3.14 4.3
3.55 4.75 7.66 11.12 9.85
3.42 4.48 6.69 13.22 9.2
10.11 10.55 11.46 13.34 9.85
9.47 12.86 13.99 18.69 18.82
0.45 0.38 0.89 1.3 2.88
3.21 1.7 7.63 5.62 5.73
1.55 2.76 5.61 7.36 6.53
0.87 1.26 4.84 3.11 3.32

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)