Heatmap: Cluster_288 (HCCA cluster)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Root (elongation zone)
Root (meristematic zone)
Root (stele)
Root (tip)
Root
Leaf (3rd leaf of seedling)
Leaf (3rd leaf)
Leaf (apex)
Leaf (bundle sheath)
Leaf (mesophyll)
Leaf (Seedling)
Leaf
Internode
Stalks
Shoot
Shoot (apex)
Tassels (primordia)
Tassels
Anther
Pollen
Ear (immature)
Ear (inflorescence)
Ear (leaf)
Ear (primordia)
Ear
Silks
Kernels (germinating)
Kernels
Maternal transfer zone
Nucellus
Embryo
Endosperm (transfer layer)
Endosperm
Seeds
Coleoptyle (5 day)
Seedling
Whole Plant
Zm00001d000168 (GRMZM2G063192)
0.02 0.29 0.1 0.22 0.11 0.0 0.0 0.3 0.0 0.0 0.0 0.01 0.27 0.15 0.07 0.4 0.81 0.22 0.28 0.0 1.0 0.32 0.0 0.75 0.42 0.01 0.1 0.09 0.01 0.57 0.16 0.0 0.05 0.05 0.06 0.06 0.08
Zm00001d002601 (GRMZM2G080274)
0.06 0.05 0.02 0.06 0.07 0.02 0.03 0.18 0.01 0.01 0.01 0.05 0.2 0.04 0.06 0.15 0.38 0.16 0.17 0.0 1.0 0.6 0.05 0.29 0.44 0.04 0.07 0.16 0.05 0.7 0.18 0.02 0.06 0.07 0.03 0.07 0.14
Zm00001d003038 (GRMZM5G889644)
0.04 0.34 0.18 0.25 0.12 0.0 0.0 0.44 0.0 0.0 0.0 0.02 1.0 0.04 0.11 0.32 0.66 0.22 0.21 0.01 0.47 0.69 0.0 0.7 0.46 0.01 0.08 0.15 0.0 0.45 0.2 0.0 0.05 0.06 0.4 0.07 0.09
Zm00001d003180 (GRMZM2G112483)
0.19 0.5 0.14 0.37 0.19 0.03 0.02 0.44 0.03 0.02 0.0 0.04 0.43 0.29 0.12 0.43 0.99 0.36 0.49 0.01 0.72 1.0 0.0 0.94 0.72 0.07 0.16 0.31 0.0 0.73 0.36 0.18 0.16 0.2 0.17 0.12 0.12
Zm00001d003378 (GRMZM2G042443)
0.02 0.2 0.19 0.14 0.11 0.01 0.0 0.22 0.02 0.01 0.06 0.06 0.16 0.15 0.04 0.17 0.71 0.33 0.18 0.09 0.27 0.7 0.03 1.0 0.33 0.1 0.2 0.18 0.22 0.53 0.19 0.06 0.12 0.18 0.11 0.06 0.06
Zm00001d007164 (GRMZM2G008444)
0.0 0.04 0.06 0.07 0.04 0.0 0.0 0.29 0.0 0.0 0.01 0.02 0.34 0.11 0.04 0.24 0.85 0.19 0.18 0.0 0.53 0.7 0.03 1.0 0.35 0.02 0.03 0.13 0.0 0.31 0.12 0.01 0.05 0.08 0.17 0.04 0.04
Zm00001d009500 (GRMZM2G013465)
0.09 0.24 0.09 0.15 0.08 0.02 0.0 0.3 0.01 0.01 0.0 0.02 0.41 0.33 0.03 0.31 0.85 0.19 0.22 0.0 0.38 1.0 0.0 0.64 0.53 0.04 0.15 0.19 0.0 0.77 0.22 0.05 0.11 0.19 0.07 0.07 0.04
Zm00001d010958 (GRMZM2G119483)
0.15 0.16 0.19 0.33 0.28 0.13 0.18 0.39 0.09 0.08 0.21 0.17 0.37 0.3 0.15 0.42 0.73 0.35 0.27 0.0 1.0 0.9 0.09 0.97 0.88 0.33 0.28 0.29 0.29 0.75 0.32 0.27 0.14 0.23 0.37 0.19 0.2
Zm00001d011236 (GRMZM2G304575)
0.17 0.12 0.08 0.14 0.11 0.01 0.01 0.18 0.01 0.01 0.01 0.03 0.42 0.07 0.1 0.24 0.29 0.15 0.11 0.0 1.0 0.54 0.02 0.36 0.48 0.08 0.14 0.15 0.02 0.43 0.13 0.02 0.07 0.07 0.09 0.08 0.06
Zm00001d011771 (GRMZM2G138967)
0.06 0.28 0.13 0.34 0.15 0.01 0.01 0.31 0.03 0.03 0.01 0.07 0.44 0.24 0.12 0.25 0.7 0.17 0.14 0.0 0.64 0.41 0.03 1.0 0.26 0.06 0.21 0.11 0.04 0.21 0.23 0.52 0.16 0.15 0.24 0.08 0.06
Zm00001d012718 (GRMZM2G180021)
0.04 0.09 0.15 0.05 0.14 0.0 0.0 0.28 0.0 0.0 0.0 0.01 0.26 0.24 0.04 0.39 0.66 0.31 0.14 0.0 0.5 0.81 0.0 1.0 0.72 0.01 0.07 0.09 0.01 0.29 0.16 0.0 0.03 0.06 0.08 0.05 0.09
Zm00001d012826 (GRMZM2G083620)
0.17 0.51 0.24 0.2 0.22 0.05 0.05 0.38 0.15 0.13 0.1 0.16 0.25 0.17 0.2 0.26 1.0 0.43 0.45 0.0 0.59 0.52 0.19 0.87 0.57 0.17 0.31 0.21 0.09 0.94 0.39 0.08 0.18 0.27 0.39 0.16 0.15
Zm00001d013703 (GRMZM5G826465)
0.0 0.08 0.03 0.01 0.02 0.0 0.0 0.21 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.03 0.01 0.27 0.76 0.16 0.03 0.0 0.66 1.0 0.0 0.88 0.46 0.0 0.02 0.05 0.02 0.0 0.12 0.0 0.0 0.03 0.02 0.01 0.01
Zm00001d015485 (GRMZM2G472945)
0.0 0.06 0.04 0.03 0.03 0.0 0.0 0.2 0.0 0.0 0.0 0.01 0.18 0.03 0.04 0.24 1.0 0.14 0.04 0.0 0.53 0.32 0.0 0.68 0.47 0.0 0.05 0.05 0.0 0.06 0.16 0.0 0.04 0.03 0.13 0.04 0.04
Zm00001d016977 (GRMZM5G861269)
0.04 0.06 0.03 0.07 0.08 0.02 0.02 0.27 0.03 0.02 0.05 0.07 0.12 0.12 0.06 0.16 0.48 0.16 0.12 0.0 0.52 1.0 0.04 0.49 0.45 0.04 0.07 0.13 0.16 0.25 0.09 0.22 0.06 0.12 0.01 0.06 0.06
Zm00001d020580 (GRMZM2G071959)
0.46 0.28 0.13 0.21 0.2 0.02 0.02 0.17 0.03 0.03 0.04 0.06 0.59 0.15 0.15 0.29 0.41 0.28 0.2 0.2 1.0 0.63 0.06 0.49 0.63 0.14 0.28 0.32 0.11 0.5 0.29 0.03 0.2 0.21 0.16 0.11 0.15
Zm00001d020585 (GRMZM2G073275)
0.24 0.18 0.04 0.09 0.11 0.01 0.0 0.23 0.02 0.02 0.01 0.02 0.36 0.04 0.24 0.2 0.44 0.18 0.14 0.01 1.0 0.6 0.0 0.44 0.86 0.05 0.08 0.09 0.06 0.19 0.14 0.05 0.1 0.08 0.11 0.06 0.08
Zm00001d021706 (GRMZM2G041381)
0.3 0.33 0.11 0.25 0.19 0.0 0.0 0.28 0.03 0.02 0.0 0.02 0.42 0.03 0.19 0.18 0.88 0.58 0.31 0.15 1.0 0.93 0.0 0.67 0.73 0.1 0.19 0.2 0.04 0.35 0.32 0.1 0.1 0.18 0.08 0.12 0.09
Zm00001d022401 (GRMZM2G009265)
0.05 0.09 0.08 0.04 0.05 0.01 0.01 0.24 0.01 0.01 0.01 0.02 0.21 0.07 0.05 0.23 0.8 0.27 0.16 0.0 0.53 1.0 0.0 0.54 0.44 0.03 0.05 0.11 0.0 0.26 0.11 0.05 0.05 0.08 0.11 0.05 0.06
Zm00001d022562 (GRMZM2G113039)
0.3 0.28 0.11 0.04 0.11 0.01 0.0 0.27 0.0 0.0 0.0 0.02 0.46 0.17 0.09 0.27 0.81 0.27 0.39 0.07 1.0 0.46 0.04 0.55 0.69 0.04 0.09 0.29 0.04 0.33 0.25 0.28 0.07 0.2 0.15 0.06 0.05
Zm00001d022598 (GRMZM2G440831)
0.0 0.11 0.05 0.05 0.05 0.0 0.0 0.54 0.01 0.0 0.05 0.03 0.29 0.07 0.04 0.27 0.93 0.19 0.1 0.0 0.62 0.52 0.06 1.0 0.39 0.02 0.08 0.07 0.0 0.07 0.23 0.0 0.05 0.08 0.12 0.04 0.04
Zm00001d023692 (GRMZM2G040389)
0.06 0.16 0.06 0.1 0.08 0.0 0.0 0.39 0.01 0.0 0.0 0.02 0.29 0.05 0.08 0.2 1.0 0.23 0.15 0.0 0.73 0.48 0.0 0.74 0.54 0.06 0.11 0.07 0.04 0.14 0.23 0.04 0.06 0.05 0.11 0.03 0.06
Zm00001d024321 (GRMZM2G173321)
0.09 0.29 0.2 0.18 0.15 0.03 0.05 0.29 0.04 0.02 0.06 0.07 0.47 0.15 0.14 0.26 1.0 0.19 0.22 0.0 0.55 0.43 0.12 0.62 0.54 0.06 0.26 0.13 0.27 0.36 0.3 0.15 0.06 0.11 0.09 0.08 0.04
Zm00001d024530 (GRMZM2G178014)
0.17 0.23 0.09 0.16 0.12 0.0 0.0 0.26 0.02 0.02 0.0 0.02 0.07 0.1 0.04 0.18 0.87 0.23 0.07 0.0 0.95 0.68 0.0 0.93 0.29 0.06 0.1 0.29 0.04 1.0 0.59 0.25 0.09 0.18 0.06 0.03 0.04
Zm00001d024905 (GRMZM2G006871)
0.02 0.17 0.03 0.12 0.07 0.0 0.0 0.6 0.0 0.0 0.0 0.01 0.52 0.21 0.07 0.35 0.85 0.37 0.2 0.0 0.52 0.63 0.05 1.0 0.87 0.0 0.08 0.08 0.0 0.37 0.2 0.08 0.07 0.08 0.27 0.04 0.08
Zm00001d025721 (GRMZM2G047143)
0.04 0.28 0.11 0.16 0.11 0.01 0.01 0.27 0.02 0.02 0.01 0.02 0.5 0.16 0.08 0.3 1.0 0.43 0.18 0.02 0.96 0.6 0.0 0.86 0.9 0.01 0.1 0.15 0.04 0.64 0.34 0.05 0.08 0.11 0.16 0.07 0.06
Zm00001d025958 (GRMZM2G155502)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.4 0.0 0.0 0.0 0.01 0.09 0.35 0.1 0.21 0.65 0.24 0.24 0.0 1.0 0.36 0.0 0.45 0.53 0.02 0.16 0.16 0.0 0.58 0.09 0.01 0.02 0.11 0.07 0.09 0.15
Zm00001d026111 (GRMZM2G702579)
0.04 0.11 0.07 0.06 0.07 0.02 0.01 0.39 0.02 0.02 0.03 0.02 0.12 0.14 0.05 0.22 0.89 0.22 0.09 0.0 0.33 0.34 0.01 1.0 0.29 0.03 0.08 0.11 0.0 0.4 0.1 0.02 0.04 0.1 0.05 0.05 0.1
Zm00001d028284 (GRMZM2G469304)
0.12 0.37 0.08 0.3 0.21 0.01 0.09 0.76 0.03 0.02 0.0 0.05 0.42 0.38 0.22 0.43 1.0 0.45 0.41 0.0 0.68 0.57 0.0 0.89 0.76 0.04 0.33 0.16 0.02 0.79 0.41 0.02 0.03 0.16 0.4 0.24 0.43
Zm00001d030982 (GRMZM2G155314)
0.01 0.11 0.07 0.03 0.06 0.0 0.0 0.39 0.0 0.0 0.0 0.01 0.11 0.01 0.02 0.2 1.0 0.26 0.21 0.02 0.52 0.46 0.0 0.79 0.36 0.02 0.13 0.16 0.0 0.47 0.46 0.05 0.09 0.16 0.11 0.02 0.02
Zm00001d031211 (GRMZM2G461278)
0.02 0.11 0.07 0.09 0.06 0.06 0.01 0.48 0.01 0.01 0.02 0.03 0.26 0.24 0.08 0.35 0.98 0.22 0.16 0.0 1.0 0.58 0.04 0.76 0.51 0.0 0.07 0.08 0.0 0.16 0.12 0.03 0.06 0.04 0.09 0.07 0.13
Zm00001d031316 (GRMZM2G113840)
0.07 0.13 0.07 0.05 0.05 0.01 0.0 0.36 0.04 0.04 0.0 0.01 0.16 0.2 0.06 0.26 0.9 0.23 0.11 0.08 0.4 0.44 0.0 1.0 0.32 0.03 0.07 0.07 0.01 0.41 0.24 0.01 0.02 0.07 0.05 0.09 0.07
Zm00001d034410 (GRMZM2G371210)
0.23 1.0 0.19 0.44 0.25 0.01 0.0 0.56 0.0 0.0 0.0 0.02 0.19 0.23 0.09 0.35 0.64 0.19 0.25 0.0 0.36 0.44 0.0 0.39 0.22 0.0 0.28 0.11 0.04 0.75 0.44 0.0 0.05 0.12 0.3 0.15 0.16
Zm00001d034788 (GRMZM2G114899)
0.03 0.09 0.01 0.08 0.06 0.03 0.01 0.37 0.01 0.01 0.03 0.03 0.18 0.12 0.05 0.28 1.0 0.25 0.12 0.21 0.28 0.27 0.0 0.54 0.2 0.1 0.03 0.08 0.0 0.34 0.17 0.0 0.03 0.07 0.1 0.08 0.06
Zm00001d037114 (GRMZM5G809695)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.22 0.01 0.01 0.0 0.01 0.16 0.21 0.04 0.12 1.0 0.26 0.24 0.0 0.54 0.61 0.0 0.84 0.24 0.01 0.04 0.08 0.0 0.81 0.04 0.0 0.0 0.02 0.08 0.06 0.04
Zm00001d038301 (GRMZM2G131733)
0.09 0.22 0.09 0.14 0.09 0.04 0.03 0.44 0.06 0.1 0.03 0.07 0.36 0.86 0.12 0.67 1.0 0.23 0.32 0.0 0.51 0.91 0.04 0.94 0.45 0.03 0.08 0.28 0.0 0.99 0.78 0.02 0.09 0.15 0.54 0.17 0.2
Zm00001d038688 (GRMZM2G176217)
0.01 0.07 0.07 0.06 0.06 0.01 0.03 0.28 0.01 0.03 0.01 0.03 0.21 0.18 0.06 0.37 0.91 0.44 0.11 0.0 1.0 0.76 0.02 0.79 0.82 0.05 0.08 0.1 0.05 0.1 0.59 0.02 0.04 0.12 0.08 0.1 0.1
Zm00001d038861 (GRMZM5G892879)
0.0 0.04 0.1 0.09 0.06 0.0 0.0 0.25 0.0 0.0 0.0 0.01 0.16 0.08 0.04 0.3 0.77 0.26 0.11 0.15 0.86 1.0 0.0 0.96 0.85 0.01 0.02 0.13 0.0 0.54 0.21 0.0 0.04 0.08 0.08 0.04 0.05
Zm00001d039471 (GRMZM2G077227)
0.02 0.14 0.04 0.1 0.07 0.0 0.0 0.51 0.0 0.0 0.0 0.02 0.43 0.08 0.08 0.39 0.97 0.24 0.12 0.0 0.97 1.0 0.0 0.9 0.77 0.0 0.06 0.1 0.0 0.39 0.26 0.0 0.05 0.05 0.11 0.06 0.1
Zm00001d041215 (GRMZM2G147857)
0.01 0.2 0.01 0.08 0.05 0.0 0.0 0.69 0.02 0.02 0.0 0.02 0.46 0.19 0.08 0.36 1.0 0.14 0.15 0.0 0.9 0.61 0.01 0.93 0.48 0.01 0.07 0.07 0.0 0.21 0.18 0.0 0.05 0.05 0.09 0.07 0.07
Zm00001d042582 (GRMZM2G080917)
0.06 0.05 0.11 0.15 0.08 0.04 0.04 0.22 0.03 0.04 0.02 0.05 0.19 0.18 0.07 0.24 0.52 0.25 0.28 0.01 0.48 1.0 0.04 0.67 0.53 0.13 0.1 0.17 0.07 0.63 0.21 0.04 0.08 0.19 0.3 0.09 0.14
Zm00001d043524 (GRMZM2G005082)
0.02 0.05 0.01 0.08 0.02 0.03 0.02 0.28 0.02 0.03 0.01 0.02 0.33 0.24 0.05 0.17 0.63 0.14 0.07 0.0 0.28 1.0 0.02 0.76 0.29 0.05 0.04 0.14 0.07 0.54 0.31 0.14 0.08 0.12 0.08 0.05 0.04
Zm00001d044247 (GRMZM2G079089)
0.13 0.12 0.07 0.19 0.11 0.03 0.02 0.21 0.02 0.02 0.04 0.07 0.33 0.26 0.1 0.19 0.45 0.19 0.18 0.0 1.0 0.67 0.12 0.53 0.46 0.11 0.16 0.21 0.1 0.4 0.19 0.08 0.11 0.16 0.14 0.09 0.13
Zm00001d044355 (GRMZM2G111123)
0.04 0.2 0.06 0.09 0.06 0.0 0.0 0.32 0.0 0.0 0.0 0.01 0.28 0.14 0.05 0.3 1.0 0.24 0.17 0.0 0.6 0.57 0.0 0.68 0.66 0.01 0.08 0.11 0.1 0.52 0.24 0.11 0.03 0.18 0.04 0.04 0.02
Zm00001d045157 (GRMZM2G167212)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.31 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.31 0.02 0.23 0.42 0.25 0.04 0.01 1.0 0.93 0.03 0.92 0.65 0.0 0.0 0.07 0.13 0.06 0.15 0.01 0.01 0.02 0.01 0.01 0.0
Zm00001d045445 (GRMZM2G097313)
0.01 0.04 0.02 0.03 0.02 0.0 0.0 0.27 0.0 0.0 0.0 0.01 0.08 0.05 0.03 0.14 0.86 0.17 0.06 0.0 0.63 1.0 0.0 0.64 0.36 0.01 0.03 0.03 0.0 0.22 0.06 0.0 0.01 0.03 0.06 0.03 0.03
Zm00001d048491 (GRMZM2G472696)
0.21 0.25 0.04 0.19 0.14 0.0 0.0 0.31 0.0 0.0 0.0 0.01 0.34 0.06 0.17 0.23 0.71 0.23 0.16 0.0 1.0 0.53 0.0 0.57 0.54 0.05 0.12 0.14 0.04 0.35 0.22 0.02 0.12 0.13 0.08 0.09 0.2
Zm00001d048718 (GRMZM2G070553)
0.0 0.05 0.03 0.07 0.05 0.0 0.0 0.42 0.0 0.0 0.01 0.02 0.15 0.17 0.07 0.2 0.57 0.17 0.25 0.0 0.64 0.57 0.0 0.41 0.3 0.01 0.1 0.06 0.04 1.0 0.14 0.0 0.01 0.05 0.09 0.07 0.07
Zm00001d049094 (GRMZM2G001048)
0.06 0.11 0.19 0.15 0.14 0.06 0.03 0.37 0.04 0.05 0.13 0.09 0.24 0.18 0.1 0.27 1.0 0.32 0.21 0.0 0.8 0.78 0.2 0.87 0.48 0.14 0.16 0.21 0.18 0.74 0.36 0.06 0.07 0.16 0.17 0.12 0.14
Zm00001d050905 (GRMZM2G145027)
0.05 0.08 0.05 0.07 0.09 0.05 0.03 0.49 0.04 0.04 0.03 0.06 0.2 0.22 0.09 0.26 0.47 0.15 0.18 0.0 1.0 0.71 0.04 0.63 0.33 0.07 0.07 0.11 0.0 0.32 0.17 0.09 0.05 0.09 0.11 0.07 0.13
Zm00001d051591 (GRMZM2G342515)
0.22 0.19 0.04 0.09 0.07 0.0 0.01 0.14 0.0 0.0 0.0 0.01 0.38 0.04 0.1 0.12 0.52 0.18 0.11 0.0 1.0 0.41 0.0 0.5 0.43 0.05 0.09 0.08 0.03 0.28 0.09 0.01 0.07 0.09 0.06 0.05 0.05
Zm00001d052495 (GRMZM2G006252)
0.07 0.11 0.06 0.35 0.24 0.01 0.04 0.39 0.04 0.01 0.01 0.02 0.08 0.06 0.05 0.29 0.83 0.38 0.08 0.0 1.0 0.52 0.0 0.79 0.58 0.07 0.14 0.13 0.02 0.95 0.17 0.07 0.03 0.06 0.07 0.06 0.11
Zm00001d053694 (GRMZM5G869469)
0.01 0.26 0.12 0.25 0.1 0.0 0.0 0.3 0.0 0.0 0.0 0.01 0.36 0.1 0.08 0.31 0.94 0.23 0.11 0.0 1.0 0.53 0.09 0.68 0.34 0.02 0.1 0.14 0.22 0.51 0.1 0.0 0.03 0.03 0.11 0.05 0.04

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)