Heatmap: Cluster_113 (HCCA cluster)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Roots (apex), 7 DAG
Roots (differentation zone), 4 DAP
Roots (elongation zone), 4 DAP
Roots (meristematic zone), 4 DAP
Roots (stele cells), 7 DAS
Roots (tip)
Leaves (rosette), 21 DAG
Leaves (rosette), 29 DAG
Leaves (rosette), 35 DAG
Leaves (rosette), 42 DAG
Leaves (rosette), 57 DAG
Epidermis cells
Mature guard cells
Stems (internode)
Stems (internode), senescent
Meristem (M1-3), 7-9 DAG
Meristem (M4-6), 1-12 DAG
Meristem (M7-1), 13-16 DAG
Axis of the inflorescence
Pedicel
Flowers (receptacles)
Flowers (floral buds)
Flowers (sepals)
Flowers (petals)
Flowers (stamen filaments)
Flowers (anthers)
Flowers (carpels)
Flowers (ovules)
Stigmatic tissues
Pollen
Siliques
Siliques, senescent
Pods of Siliques
Pods of Siliques, senescent
Embryo
Endosperm
Seeds, dry
Seeds, from senescent siliques
Seeds, young
Seeds, germinating
Seedlings, 5 DAG
Seedlings, 11 DAG
Seedlings, 14 DAG
Seedlings, etiolated
-6.02 -3.06 -9.42 -6.78 - -7.3 - - -11.29 - - - - - -8.38 -9.54 -9.91 -8.41 -9.3 -8.8 -10.37 - -5.09 -9.55 -6.66 5.45 -3.56 -8.36 -7.83 - -7.18 -7.23 -9.41 - -8.19 -9.87 -7.83 -10.02 -9.13 -7.19 -9.26 - -7.15 -8.1
-1.12 - -2.87 - - - - - - - - - - - -3.71 - - - - - - - - - - 5.35 -3.02 - - -3.73 -1.05 - -2.04 - - 0.47 - - - - -2.6 - - -
AT1G11980 (RUB3)
- - - - - - - - - - - - - - - - -6.16 - - - - - -3.64 - - 5.43 -2.45 - - - -3.04 - -4.77 - - -2.77 - -1.39 - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -1.27 5.44 -4.53 - - - - - - - - -1.95 - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.31 -4.34 - - - -2.75 - -2.23 - - 1.89 - - - - -2.76 - - -
-3.67 -4.47 - - - - -8.12 - -8.32 - -8.32 - -7.58 -6.08 -3.64 -5.93 -6.24 -5.45 - -3.52 -9.16 - -3.26 - -7.01 5.43 -3.41 -5.35 -5.73 - -4.65 -4.66 -8.75 -6.69 - -8.68 -4.68 -8.23 -7.04 -6.31 - - -6.92 -8.03
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.78 - - - -0.85 5.25 -2.83 - - - - - - - - 1.85 - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.15 - - 1.73 1.1 -2.35 - - - - 1.35 - - -1.4 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.34 -1.78 - - - - - - - - 1.7 - - - - - - - -
AT1G35440 (CYCT1;1)
- - - - - - - - - - - - - - - - -5.98 - - - -5.31 - -2.88 - - 5.42 -3.2 - - - -5.12 -4.09 - - - -0.24 - - -6.21 -4.46 - - - -
-7.04 -6.12 -3.8 - - - - -13.53 -6.37 -7.08 -7.25 - - - -7.94 -9.95 -8.66 -9.18 -10.4 -6.86 -7.31 -0.08 -5.7 - -7.2 4.96 -3.74 -8.46 -9.93 -3.36 -7.15 1.6 -8.5 -5.4 -9.71 -2.59 2.2 1.83 -9.81 -3.62 -5.97 -8.88 -9.39 -7.48
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.45 -2.78 - - - - - - - - - - - -6.01 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - -3.0 0.04 - - -5.3 - - -4.01 - - -3.19 - 5.4 -3.1 - - - - - - -2.02 - -4.04 - - - - - - - -5.01
- - - - - - - - - - - - - - - -7.29 -6.03 - - - - - -3.59 - -2.76 5.41 -2.57 -3.09 - - -4.28 - -5.48 - -4.26 -1.9 - - - -1.63 - - -4.68 -3.61
AT2G01960 (TET14)
- - -2.48 - - -4.27 - - - -3.47 - - - -1.77 -3.28 -1.91 - -5.53 -0.34 -3.36 -5.14 - - - - 5.23 -1.74 0.21 -3.44 - -4.54 -3.46 - -3.29 -2.22 0.29 -0.85 -4.04 -2.41 -2.58 - - -2.63 -3.18
AT2G03170 (SK14)
-3.95 - - - - - - - - - - - - - - -6.15 - - -4.06 - - -4.02 -6.06 - -5.54 5.4 -3.18 -5.05 - 0.29 -5.55 - -5.09 - - -2.79 - - -3.31 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.45 -1.75 - - - - - - - - - - - -3.66 - - - - -
- - - - - - -3.24 - - - - - - - - - - - - - - - -3.71 - - 5.33 -4.78 - - - -4.85 -1.43 - -0.47 - 1.15 - - -3.73 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - -1.04 - - - - - - - -0.03 -3.56 - -0.3 5.12 -3.23 - - - -3.74 - - - - 2.67 - - -2.0 - - - - -4.66
- - - -0.27 - - - - - -0.95 - - - - -0.75 - - - - - - - - - - 5.32 -1.65 - - - -3.08 - - - - 0.42 -1.32 - - - - - - -
-3.02 - - - - -4.97 - - -2.13 -0.19 -0.75 -2.85 - -4.06 -3.1 - -4.77 -6.38 - -2.94 -3.63 -1.46 -3.99 - -4.42 5.28 -3.28 - - - -4.88 - -6.09 -4.22 -3.92 -0.6 - - - -1.25 - - -3.33 -0.46
- - - - - - - - - - - 2.35 - - - - - - - - - - - - - 5.28 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-1.86 - - -1.39 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -2.88 - -2.31 5.26 -1.81 -1.96 - -0.89 -6.11 0.22 - - - - 0.73 -0.55 - -4.12 - - - -3.98
-4.32 - - - - - - - - - - - - - - -3.47 -7.46 -6.74 - - - -2.35 -5.38 - -2.91 5.27 -1.17 -1.38 - - -1.6 - -3.86 -1.94 -3.22 1.71 - - -3.79 -6.5 -4.17 - - -
-0.39 - - - - - -3.0 -4.09 - - - - - -2.48 - - - -2.09 - - -3.7 - -2.41 - - 5.37 -2.62 - - - -3.62 - -4.56 - - -3.53 - - - -3.16 -3.52 - - -0.99
-7.85 - - - - - - - - -9.64 -8.76 - - -6.96 -6.35 -8.39 -8.17 -7.79 -7.89 -5.59 -0.33 - -3.86 -4.82 -3.76 5.42 -3.6 - -8.01 - -7.79 -8.04 - -6.98 - -6.9 -7.42 - -10.3 -7.3 - - - -
- - - - - - - - - - - - - -0.39 - 0.08 -2.87 -2.71 - - - - - - - 5.08 -3.59 - - -0.33 -0.59 - -2.41 - - 2.43 - - - - -0.42 - - -2.42
-4.0 - - -2.48 - - - - - -6.8 -3.81 -4.97 - -5.06 - -3.72 -2.72 -4.16 - - - - -4.49 - -2.32 5.41 -3.02 - -3.73 -2.14 -10.2 - - - -4.89 - - - - - -5.85 - -4.31 -2.43
AT3G03760 (LBD20)
-6.81 - - - - - - - - - - - - - - -10.75 -9.14 -8.62 - -6.74 -5.88 - -4.68 -7.95 -5.23 5.36 -5.05 -5.08 -6.36 - -0.51 -5.73 -1.05 -6.91 -2.11 0.33 -6.77 -8.44 -4.27 -9.01 - - -6.14 -
-1.4 - - - - - - - -3.14 - -3.09 - - - -1.4 - - - - - -2.51 - - - - 5.38 -2.26 - - - - - - - -1.34 - -0.65 - - - - - - -
- -4.68 -4.04 - - - - - - - - - - - -4.58 - -6.08 -5.26 -5.55 - - - -6.47 - - 5.44 -2.94 - - - -4.3 - -6.01 - - -5.29 - - -5.46 -4.36 -3.76 - -5.81 -3.52
- - - - - - - - - - - - - - -2.12 - - - - - - - -1.29 - - 5.38 -3.89 - - - - - - - - 0.64 -2.43 - - - - - - -
- - - - - - - -3.87 -4.65 - - - - - -3.62 - - -6.01 - - - - - - - 5.42 -3.64 - - -0.58 -3.89 - - - - -2.76 - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.42 -2.45 - - - - - - - - -0.33 - - -2.4 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - 1.45 - - - - - - - - - - 5.36 -3.13 - - - - - - - - - - - - - - - - -4.39
- - - - - - - - - -5.61 -5.66 - - - -2.43 - -6.94 - -3.8 - - - - - -4.34 5.42 -2.78 - - - -4.1 - - - - -1.58 -3.33 - -4.63 -1.93 - - - -
- 0.67 -2.27 - - -3.09 - - - - - - - - - - - - - -2.18 - - -3.2 - - 5.37 -2.99 - - - -7.35 - - - - - - - - - - - -2.46 -3.98
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.43 -4.92 - - - - - - - - -0.4 - - - - - - - -
-2.47 0.17 -0.47 - - -5.05 -4.61 -5.84 -1.49 -2.63 -1.21 -0.16 - -3.15 -1.12 -4.84 - - -4.1 - -4.6 -3.13 -5.12 - -3.64 5.14 -0.32 -1.35 - - -2.28 -2.7 -3.87 -1.05 -2.41 -0.03 -2.63 - -3.95 -4.26 -2.44 - - -3.03
AT3G56560 (NAC065)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -3.08 - - 5.45 -3.05 - - - -3.84 - - - - -3.18 - - - - - - - -
-6.35 - - - - - - - - - - - - - -8.2 - -9.88 -8.01 - -7.23 -9.24 - -6.41 - -6.08 5.46 -4.54 -5.72 - - -10.29 - - - - -9.03 -8.5 - - - - - - -
-2.5 - - - - - - - - - - - - - - - -6.67 - - - - -1.54 -4.58 - - 5.34 -1.27 -0.77 - -3.42 -2.14 - - - - 0.31 -4.04 - -2.13 - - - - -
- - - -1.72 - -2.58 -4.75 -5.37 - - - - - - - -4.91 - - - - - - -3.65 - -4.64 5.43 -2.99 - - - -6.44 - - - - -4.35 - - -6.67 -6.42 - -3.31 - -5.2
- - - - - - - - - - - - - - - - -5.7 - - - - -1.59 - - - 5.19 -1.44 -0.62 - 0.81 -1.41 - -1.87 - -2.46 1.58 - - -0.99 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -3.79 - -1.95 5.44 -2.54 - - -2.63 - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - -6.8 - - - -3.18 - - - - 5.42 -3.82 -2.1 - -1.93 -6.82 - - - - -0.83 - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -4.16 - - 5.45 -3.78 - - - - - - - - - - - - -5.37 - - - -
AT4G18190 (PUP6)
- - - - - - - - - - - - - - -8.46 -10.16 -10.14 -9.59 - - -8.47 - -4.83 - -7.15 5.43 -2.87 - - - -1.58 -7.52 -5.73 - - -3.06 - - -3.45 -8.42 - - - -
- - - - -1.9 - - - - -4.83 -4.68 - - - - - -4.82 - - - -3.78 - - - - 5.42 -2.92 - - - - - - - -0.92 -4.12 - - - - - - - -4.94
- - - - - - - - - - - - - 0.29 -0.87 - - - - - - - - - - 5.36 -2.19 - - - -5.86 - - - - -0.2 - - - - - - - -
0.95 2.06 -0.28 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.16 -4.15 - - - -5.7 - - - - -1.61 - - - -0.32 - - - -4.18
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.45 -6.14 - - - - - - - - -2.05 - - - - - - - -
- -0.56 - - - - - - - -5.18 -5.24 - - 1.53 -2.33 -3.94 -3.81 -5.72 - - -3.29 -0.08 -1.81 - -2.19 4.9 -3.53 - - -0.99 1.53 -3.65 1.93 - - -0.38 - - -5.8 -5.59 -3.34 - -2.69 -3.73
- - - -1.01 - -2.47 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -3.07 5.39 - - - - -0.85 - -3.04 - - -0.92 - - - - - - - -
- - - - - - - - - -1.93 - - - - - - - - - - - - - - - 5.42 - - - - -3.42 - - - - -0.2 - - - - - - - -
- - - - - - - - - -2.56 -2.28 - - - 0.94 - - - - - - -0.82 - - - 4.57 -3.1 - - 3.76 -5.39 - - - - 1.91 - - - - - - - -5.95
-6.42 - - - - - - - - - - - - - - -8.15 -9.39 -8.23 -9.66 -6.15 -10.42 - -5.34 - -6.54 5.45 -3.75 -6.5 -9.78 - -7.72 -7.41 -10.78 - - -10.74 -6.97 - -7.91 -7.41 - - - -
- - - - - - - - - - -4.16 - - 3.13 1.18 - - - - - - - - - - 4.82 -4.3 - - - 1.04 -2.66 0.2 -2.72 - -2.33 -3.04 - - -2.69 - - -0.83 -4.43
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.46 -4.52 - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -2.99 - - - - 5.45 -3.33 - - -2.68 - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - -6.18 - -5.58 - -3.76 - - -2.73 - - 5.17 -4.02 - - - -0.97 -3.4 -1.99 - - 2.74 - - - -5.44 - - - -
AT5G49240 (PRR4)
- - - -3.74 - -2.83 - - - - - - - - - - - -6.58 - -4.3 - - -3.68 - -1.98 5.42 -2.81 -2.73 - - -6.27 - - - - -3.06 - - - - -5.11 - - -
- - - - - - -1.65 - - - - - - - 2.17 - -1.54 - - -1.64 -2.63 - - - -1.68 5.02 -4.76 - - 0.46 - - -3.24 - - - 2.03 - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -5.21 0.31 -6.71 - -4.92 5.2 -4.31 - - 2.52 -6.3 - -9.42 -6.37 - -6.1 - -5.2 -9.68 -7.91 - - - -6.78
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -0.89 5.44 -6.15 - - - - - - - - -2.62 - - - - - - - -
- - - - - - -3.77 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.45 -5.33 - - - - - - - - -3.38 - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -1.35 5.44 -4.28 - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 5.42 -3.95 - - - - - - - -1.41 -0.44 - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - -6.72 - - - - - - - - 5.42 -3.07 - - - -5.88 - - - -3.13 0.1 - - - - - - - -
AT5G62320 (MYB99)
-3.1 -3.72 -3.03 -3.28 - -2.94 -6.06 -6.77 - - - - - -4.16 - -4.47 -5.71 -7.4 -5.55 -6.37 -6.27 -6.15 -4.82 -6.37 -5.98 5.42 -2.82 -7.18 -5.44 - -5.07 -7.4 -6.23 - - - - - -7.21 -4.94 -6.46 -6.19 - -6.66

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.