Heatmap: Cluster_61 (HCCA cluster)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
Root (elongation zone)
Root (meristematic zone)
Root (stele)
Root (tip)
Root
Leaf (3rd leaf of seedling)
Leaf (3rd leaf)
Leaf (apex)
Leaf (bundle sheath)
Leaf (mesophyll)
Leaf (Seedling)
Leaf
Internode
Stalks
Shoot
Shoot (apex)
Tassels (primordia)
Tassels
Anther
Pollen
Ear (immature)
Ear (inflorescence)
Ear (leaf)
Ear (primordia)
Ear
Silks
Kernels (germinating)
Kernels
Maternal transfer zone
Nucellus
Embryo
Endosperm (transfer layer)
Endosperm
Seeds
Coleoptyle (5 day)
Seedling
Whole Plant
Zm00001d002124 (GRMZM2G352359)
0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.02 0.02 0.0 0.0 0.0 0.01 0.04 68.75 0.03 1.38 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.07 0.01 0.68 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02
Zm00001d002365 (GRMZM2G416045)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 10.12 0.12 0.6 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.57 0.28 0.0 0.0 0.65 0.0 0.01 0.94 0.0 0.12 0.0
Zm00001d002515 (GRMZM2G169553)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 9.2 0.0 0.26 0.0 0.0 1.06 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0
Zm00001d002679 (GRMZM2G027891)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 1.04 0.62 0.75 0.44 1.76 0.73 0.91 0.06 0.12 0.86 0.8 0.0 25.71 1.49 1.32 0.19 0.15 1.18 0.0 0.69 0.0 0.06 0.25 0.68 0.0 0.0 0.0 0.06 0.22 0.5 1.05 0.59
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 2.02 0.01 0.37 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03
Zm00001d002732 (GRMZM2G132756)
0.0 0.0 0.02 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 32.43 0.02 3.95 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Zm00001d004720 (GRMZM2G443740)
0.0 0.04 0.02 0.0 0.02 0.58 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 77.63 0.0 5.87 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.01 0.02
Zm00001d004846 (GRMZM2G348151)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.03 0.04 0.0 0.03 0.0 0.0 0.03 0.05 0.0 18.22 0.02 7.63 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.03
Zm00001d005145 (GRMZM2G173419)
0.06 0.0 0.0 0.0 0.02 6.7 0.35 0.75 0.79 1.42 0.39 1.49 0.0 0.0 0.46 0.01 0.02 73.2 0.38 8.53 0.0 0.27 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.86 0.0 0.0 0.0 0.0 0.55 0.18 0.0 1.47 1.43
Zm00001d006063 (GRMZM2G422045)
0.38 0.09 0.29 0.6 0.17 0.41 0.92 0.25 0.07 0.08 0.96 0.65 1.19 0.65 0.32 1.36 0.15 32.82 0.47 7.01 1.33 0.6 2.12 0.09 0.24 0.0 0.86 0.74 0.0 6.27 2.39 0.0 0.1 0.16 1.18 0.65 0.7
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.83 0.0 0.2 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Zm00001d008347 (GRMZM2G155260)
0.01 0.01 0.0 0.0 0.01 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 13.92 0.0 0.69 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.07
Zm00001d010601 (GRMZM2G366851)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.02 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 15.22 0.04 6.19 0.24 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.19
Zm00001d010629 (GRMZM2G138817)
0.24 0.0 0.0 0.71 0.43 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 5.62 0.02 0.57 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.37 0.0 0.01 0.0 0.0 0.02 0.01 0.07 0.63
Zm00001d011040 (GRMZM2G075000)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.05 0.0 0.09 0.0 5.6 0.39 1.39 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.03 0.0 0.0 0.0
Zm00001d011064 (GRMZM2G070978)
0.08 0.06 0.06 0.0 0.08 0.06 0.15 0.39 0.0 0.03 0.0 0.07 0.34 1.17 0.25 2.34 1.05 244.85 1.27 70.12 2.96 1.78 0.0 1.64 1.79 0.06 0.08 1.49 0.0 1.47 0.99 0.0 0.25 0.14 0.1 0.13 0.08
0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 60.47 0.1 15.81 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.02 3.53 0.01 0.06 0.0 0.02 0.01
Zm00001d011774 (GRMZM2G438704)
0.0 0.01 0.01 0.12 0.03 0.11 0.03 0.0 0.06 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.01 0.03 0.22 22.05 0.02 3.51 0.01 0.0 0.0 0.02 0.02 0.04 0.06 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.03 0.03 0.08 0.0
Zm00001d012466 (GRMZM2G004440)
0.04 0.06 0.01 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.03 0.05 0.0 10.67 0.37 2.45 0.11 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.07 3.42 0.0 0.0 0.0 0.04 0.06 0.0 0.0 0.0
Zm00001d012521 (GRMZM2G130831)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.05 0.0 0.01 0.0 0.06 0.17 0.0 0.01 0.05 0.0 30.22 0.04 4.21 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.08 0.03 0.0 0.0 6.56 0.0 0.09 2.4 0.0 0.01 0.1
Zm00001d012676 (GRMZM2G153217)
0.0 0.0 0.02 0.0 0.01 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 52.08 0.01 5.58 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.16 0.0 0.01 0.02 0.0 0.01 0.19
Zm00001d015386 (GRMZM2G433908)
0.0 0.03 0.01 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.03 0.16 0.0 6.66 0.09 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.46 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.02 0.0 0.08 0.02 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 3.54 0.0 0.63 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Zm00001d016259 (GRMZM2G312827)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 79.55 0.02 28.87 0.0 0.05 0.0 0.0 0.02 0.1 0.0 0.0 0.68 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06
Zm00001d017731 (GRMZM2G409286)
0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 36.98 0.0 5.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.23 0.25 0.0 0.24 0.16 0.01 0.87 0.09 0.08 0.01 0.0 0.02 0.0 0.0 0.12 0.01 0.02 20.38 0.09 3.47 0.0 0.0 0.03 0.02 0.04 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.38 0.02 0.07 0.04 0.06 0.0
Zm00001d018027 (GRMZM2G140635)
0.0 0.0 0.0 0.35 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 128.19 0.09 17.66 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.04 0.19 0.0 0.0 0.04 0.06 0.03
0.0 0.0 0.02 0.0 0.07 0.17 0.03 0.09 0.16 0.03 0.11 0.11 0.11 0.08 0.11 0.19 0.0 20.92 0.03 3.92 0.0 0.0 0.03 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.04 0.09 0.04
Zm00001d025022 (GRMZM2G390358)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 44.36 0.03 5.5 0.0 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.01 0.0 0.0 0.0
Zm00001d026135 (GRMZM2G090627)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.13 0.08 0.0 0.0 0.0 0.06 0.07 0.0 0.0 0.01 0.04 0.0 12.29 0.03 4.41 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.26 0.0 0.0 0.02 0.0 0.58 0.09 0.0 0.04 0.12
Zm00001d026604 (GRMZM2G062844)
0.0 0.0 0.62 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 21.49 0.08 6.8 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.05 0.68 0.0 0.34 1.26 0.0 0.03 0.01 0.01 0.02
Zm00001d026711 (GRMZM2G178062)
0.01 0.0 0.12 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 12.68 0.0 0.5 0.0 0.05 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.68 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0
Zm00001d029568 (GRMZM2G072448)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 631.22 0.12 0.03 0.0 0.44 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Zm00001d030506 (GRMZM2G177461)
0.1 0.16 0.07 0.0 0.13 0.1 0.09 0.0 0.02 0.01 0.9 0.24 0.0 0.0 0.03 0.06 0.09 137.23 3.18 46.33 0.03 0.11 1.04 0.1 0.23 0.47 0.04 0.29 1.5 0.47 0.65 0.12 0.17 0.28 0.02 0.19 0.51
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.28 0.0 0.03 0.01 0.04 20.47 0.08 5.87 0.04 0.0 0.0 0.04 0.01 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0
0.59 0.12 0.0 0.36 0.16 0.0 0.02 0.12 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.03 0.11 0.0 83.34 0.31 8.3 0.05 0.24 0.0 0.01 0.0 0.29 0.04 0.3 0.0 0.0 0.0 0.0 0.23 0.0 0.02 0.03 0.01
Zm00001d031341 (GRMZM2G118919)
0.95 0.07 0.0 0.24 0.33 0.0 0.07 0.4 0.0 0.0 0.03 0.04 0.06 0.09 0.07 0.2 0.01 123.96 0.31 13.51 0.06 0.64 0.0 0.02 0.01 2.8 0.14 0.66 0.0 0.0 0.01 0.0 0.49 0.0 0.1 0.06 0.14
Zm00001d032104 (GRMZM2G048475)
0.05 0.04 0.36 0.96 0.11 2.06 0.14 0.9 0.71 0.99 0.14 1.43 0.06 0.19 1.14 0.33 0.01 90.49 1.82 18.24 0.97 0.33 0.0 0.02 1.08 1.56 0.04 0.35 0.0 0.0 0.38 1.07 0.39 1.0 0.38 1.1 1.52
Zm00001d032256 (GRMZM2G485898)
0.0 0.19 0.04 0.72 0.17 0.38 0.63 0.14 0.11 0.49 0.13 0.16 0.0 0.0 0.06 0.14 0.0 64.04 0.44 5.1 0.05 0.05 0.27 0.01 0.32 0.04 0.0 0.02 0.0 0.0 0.04 0.0 0.04 0.02 0.0 0.13 0.15
Zm00001d033188 (GRMZM2G058244)
0.0 0.0 0.02 0.24 0.87 0.15 0.11 0.0 0.0 0.0 0.04 0.2 0.06 0.25 0.07 0.39 0.56 66.17 0.66 6.77 0.33 1.24 1.26 0.06 0.24 0.0 0.08 0.07 0.68 0.46 0.17 0.12 0.1 0.04 0.0 0.29 0.24
Zm00001d033988 (GRMZM2G074395)
0.03 0.0 0.1 0.0 0.02 5.01 4.54 0.78 1.87 1.67 4.5 3.27 0.0 0.0 3.81 0.21 0.0 45.83 6.82 2.82 0.09 0.0 8.61 0.02 0.66 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.99 0.93
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.78 0.0 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Zm00001d036931 (GRMZM2G416733)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 10.44 0.03 2.66 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.37 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Zm00001d037643 (GRMZM2G043340)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.5 0.26 0.01 0.6 0.82 0.0 0.2 0.0 0.05 0.15 0.06 0.0 164.14 0.0 6.88 0.03 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.59 0.1
Zm00001d039224 (GRMZM2G425148)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.27 0.0 0.07 0.04 0.0 0.0 18.29 0.0 2.08 0.01 0.09 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.4
Zm00001d040269 (GRMZM2G180071)
0.01 0.0 0.03 0.0 0.07 0.01 0.05 0.02 0.0 0.03 0.0 0.08 0.0 0.36 0.05 0.25 0.0 16.9 0.4 0.65 0.15 0.0 0.03 0.01 0.0 0.0 0.09 0.1 0.0 0.0 0.19 0.0 0.06 0.01 0.0 0.22 0.63
Zm00001d040609 (GRMZM2G007685)
0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 333.89 0.02 101.28 0.0 0.11 0.0 0.0 0.01 0.5 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Zm00001d041198 (GRMZM2G457523)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 16.79 0.15 6.1 0.04 0.0 0.0 0.0 0.31 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.02 0.0 0.01 0.04
Zm00001d041944 (GRMZM2G062587)
0.0 0.04 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.06 0.05 0.0 0.2 0.0 23.12 0.17 1.68 0.01 0.05 0.0 0.0 0.03 0.0 0.04 0.01 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.03 0.05 0.01 0.0
Zm00001d042651 (GRMZM2G332258)
0.01 0.0 0.0 0.0 0.05 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.07 0.11 0.57 0.03 0.29 1.1 41.24 0.77 3.04 0.39 0.11 0.0 0.29 0.09 0.0 0.0 0.23 0.0 1.13 0.0 0.0 0.15 0.25 0.0 0.1 0.05
Zm00001d044675 (GRMZM2G079574)
0.01 0.08 0.1 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.11 0.0 0.0 0.09 0.0 517.9 0.28 163.37 0.02 1.7 0.0 0.01 0.02 1.63 0.0 0.25 10.94 0.0 0.18 0.0 0.03 0.38 0.0 0.03 0.0
Zm00001d046319 (GRMZM2G080907)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.21 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.02 0.02 0.01 556.72 0.02 20.66 0.01 0.99 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0
Zm00001d046482 (GRMZM2G095441)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 17.53 0.01 2.21 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.19 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 75.16 0.04 2.22 0.0 0.11 0.0 0.0 0.01 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0
Zm00001d050149 (GRMZM2G399421)
0.0 0.0 0.02 0.0 0.03 0.01 0.0 0.28 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.05 0.05 0.0 124.36 0.04 3.02 0.0 0.11 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.45 0.0 0.08 0.01 0.18 0.02 0.05
Zm00001d051376 (GRMZM2G342691)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 20.61 0.44 6.87 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Zm00001d051703 (GRMZM2G427319)
0.0 0.0 2.46 0.0 0.22 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.17 0.38 0.4 0.1 34.55 0.21 9.69 0.06 0.04 0.0 0.47 0.01 4.86 0.33 0.06 0.68 0.22 0.03 0.0 0.05 0.08 0.01 0.08 0.0
Zm00001d052856 (GRMZM2G317270)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.01 0.06 0.23 0.0 0.34 0.13 32.28 0.7 3.44 1.82 0.59 0.0 0.28 0.29 0.0 0.31 0.3 0.0 0.0 0.54 0.0 0.17 0.95 0.0 0.03 0.02
Zm00001d053850 (GRMZM2G420010)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 4.24 0.03 1.26 0.0 0.0 0.6 0.02 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)