Heatmap: Cluster_93 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Ovule
Ovary
Egg cell
Pollen tricellular
Pollen
Sperm
Flower (buds)
Flower
Panicle
Milk grains
Seeds
Seedling
Seedling (12-day-old, DongJin)
Seedling (12-day-old, DongJin, mutant)
Seedling (22-days-old, 22C)
Seedling (22-days-old, 30C)
Meristem
Stems
Callus
Leaf
Leaf (Azucena)
Leaf (Kinandang puti)
Leaf (Pandan wangi)
Leaf (Tadukan)
Leaf (chilling-treatment, 4C, 33h)
Leaf (drought-stress, 1 day)
Leaf (drought-stress, 3 days)
Leaf (drought-stress, 15 min)
Leaf (drought-stress, 45 min)
Leaf (drought-stress, 90 min)
Leaf (drought-stress, 90 min, recovery 15 min)
Leaf (drought-stress, 90 min, recovery 90 min)
Leaf (drought-stress, 90 min, recovery 210 min)
Leaf (heat-stress, 15 min)
Leaf (heat-stress, 150 min)
Leaf (heat-stress, 210 min)
Leaf (heat-stress, 120 min, recovery 15 min)
Leaf (heat-stress, 120 min, recovery 60 min)
Leaf (heat-stress, 120 min, recovery 120 min)
Leaf (dry season, irrigated field)
Leaf (dry season, rainfed field)
Leaf (wet season, irrigated field)
Leaf (wet season, rainfed field)
Root
Root (heading stage)
Root (tillering stage)
Root (differentiation zone)
Root (elongation zone)
Root (meristematic zone)
-1.39 2.47 -4.33 -4.04 -0.72 -1.94 -6.92 -6.18 -2.49 -3.4 -2.68 -1.02 -1.55 5.18 - -4.15 -0.08 -2.07 - -1.82 -5.35 -5.33 -4.66 -2.7 -3.0 -1.39 -2.15 -5.06 -4.34 -3.04 -5.21 -1.09 -4.14 - -5.21 -5.31 - -4.77 - -7.33 -5.99 -5.19 -6.83 -0.95 -2.29 -2.28 -5.4 -3.79 -4.1
LOC_Os01g01530.1 (LOC_Os01g01530)
-2.05 3.21 -3.56 - - - - -1.22 - - -3.36 -1.46 0.83 5.03 - - -1.79 -1.73 - -2.82 - -6.89 -3.38 -5.12 - - - - -3.1 - - - - -1.15 - - - - - -7.49 - - - - 0.39 0.51 - - -
LOC_Os01g10650.1 (LOC_Os01g10650)
-1.03 3.08 - - - - - - - - -0.99 - - 5.31 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
LOC_Os01g23340.1 (LOC_Os01g23340)
- 2.45 - - - - - - - - - - - 5.44 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
LOC_Os01g24660.1 (LOC_Os01g24660)
-3.4 3.23 - - - 0.23 - - - - -2.61 - - 5.15 - - -2.97 -3.46 - - -3.09 - - -4.41 - - - - - - -0.91 -0.67 - - - - - - - - - - - - - - - 0.07 -
LOC_Os01g34260.1 (LOC_Os01g34260)
-1.24 2.38 - - - - - - - - - - - 5.44 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
LOC_Os01g41500.1 (LOC_Os01g41500)
-2.82 2.93 - - - -1.12 - -2.52 1.02 - -4.24 - -0.47 5.09 - - -3.73 - - -2.29 - - - -2.53 0.97 - - - - - - -0.22 - - - - - - - - -4.14 - - -1.71 - - - - -
LOC_Os01g59240.1 (LOC_Os01g59240)
- 3.03 - - - - - - 0.55 - - - - 5.3 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
LOC_Os01g63750.1 (LOC_Os01g63750)
-3.59 3.36 - - - - - - 0.2 - -1.79 - - 5.18 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -2.63 - -2.55 - -0.94 - - - -
LOC_Os02g21820.1 (LOC_Os02g21820)
-2.26 3.01 - - - - - - - - -3.7 -1.13 - 5.23 - - - -2.47 - - - - - - - - - - - - - - 1.26 - - - - - - - - - - - - - - - -
LOC_Os02g26640.1 (LOC_Os02g26640)
-0.07 3.17 - - - 0.76 - - -0.38 - - - - 5.15 - - - - - - - - - -0.26 - - - - - - - - - - - - - - - - -2.49 - - - - - - - -
LOC_Os02g29950.1 (LOC_Os02g29950)
-1.01 2.4 -5.22 -3.55 - 0.45 -1.24 -0.92 -0.03 -1.89 -1.62 - 0.63 5.0 - - 1.08 -1.24 - -1.38 -4.45 - -5.17 -3.84 - - - - - -1.32 - - - - - - -1.24 - - - -4.75 - - 0.79 - - - - -
LOC_Os03g31640.1 (LOC_Os03g31640)
-3.73 2.76 -4.33 -2.29 - - - - -1.09 - - -1.53 - 5.16 - - - -3.26 - -3.07 -4.74 - - -3.23 - - - - - -0.77 - 0.29 - - -0.68 - -0.89 -1.24 - -2.4 -1.27 -3.36 -1.13 -2.11 - -2.08 - - -
LOC_Os03g33074.1 (LOC_Os03g33074)
- 3.15 0.9 - - - - - - - - - - 5.25 - - -2.01 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
LOC_Os03g37230.1 (LOC_Os03g37230)
-4.2 2.9 - - -0.01 - -3.62 -0.94 - - -5.24 -2.03 -0.0 5.0 - - - -3.49 - - -1.7 - -9.61 -2.51 - - - -0.17 - - - 1.41 - - - - -0.29 - - - -2.56 -1.66 -1.62 -2.66 - -0.68 - - -
LOC_Os03g38804.1 (LOC_Os03g38804)
-0.09 2.68 - - - 0.87 - - - - -0.57 - - 5.29 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
LOC_Os04g05460.1 (LOC_Os04g05460)
-1.37 2.09 -0.68 -1.33 2.05 2.24 -0.55 -0.64 -1.99 -2.23 -1.58 -1.4 -1.35 4.72 -2.45 -2.43 -0.68 -2.59 - -1.78 -5.48 - -5.57 -4.1 - -2.63 -1.71 - - - -3.49 -3.33 - - -2.91 - - - - -6.24 -4.36 -6.2 -3.27 -0.95 -0.12 -0.41 -1.04 -3.13 -
LOC_Os04g05600.1 (LOC_Os04g05600)
- 2.58 -0.6 - - - - - -2.61 - - - - 5.36 - - -7.48 -3.63 - -1.4 - - - -3.53 - -0.95 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
LOC_Os04g08130.1 (LOC_Os04g08130)
-0.95 3.72 - - 0.63 - - - -2.34 - -5.93 - - 5.06 - - - - - - - - - -2.55 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
LOC_Os04g14420.1 (LOC_Os04g14420)
-4.73 2.74 - - - -1.29 - -4.17 - - -1.31 - -2.29 5.19 - - -1.21 -4.23 1.89 -3.86 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -2.91 -1.26 - - - -
LOC_Os04g14870.1 (LOC_Os04g14870)
-2.6 2.69 -3.07 0.39 - 0.29 - - -2.11 - -5.96 - - 5.27 - - - - - - - - -4.05 -3.46 - - - - - - - -1.5 - - - - - - - - -3.51 - -1.95 -3.95 - - - - -
LOC_Os04g22820.1 (LOC_Os04g22820)
- 3.22 - - - - -2.76 -0.08 - - - - - 5.26 - - - - - -6.53 - - - - - - - - - - - -1.45 - - - - - - - - - - - - - - - - -
LOC_Os04g24970.1 (LOC_Os04g24970)
-0.18 2.04 -1.37 -2.15 1.45 0.73 -1.0 -1.05 -0.9 -3.22 -2.19 -1.09 -0.88 4.55 -1.39 -1.26 0.93 -1.77 -0.87 -1.35 -2.63 -2.81 -2.05 -2.15 -2.46 -0.64 -2.43 -3.05 -2.23 -2.03 -3.16 -1.02 -3.0 -2.9 -3.09 -2.33 -2.08 -2.78 -2.85 -3.21 -2.74 -2.25 -1.92 -1.1 0.78 0.23 -2.44 -1.87 -2.9
LOC_Os04g49080.1 (LOC_Os04g49080)
-1.67 2.91 -1.92 - - - -3.06 - - - -3.3 - - 5.31 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -0.14 - -
LOC_Os05g02100.1 (LOC_Os05g02100)
-3.08 3.02 -1.38 -2.46 -0.15 - - - 0.22 -2.7 -3.05 -1.81 - 4.97 0.92 - - - - -4.57 -2.87 -4.66 - 1.06 - - -1.37 - - - - -0.84 - - - -1.27 - - - -3.57 -2.91 - -1.97 - -1.68 - - - -
LOC_Os05g08680.1 (LOC_Os05g08680)
- 2.92 - -3.17 -1.72 - - -4.01 - - -4.83 - - 5.35 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
LOC_Os05g35560.1 (LOC_Os05g35560)
-1.75 3.31 - - - 0.8 - - - - - - - 5.21 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
LOC_Os06g23080.1 (LOC_Os06g23080)
-2.68 2.81 -4.04 - - - - - -0.81 - -5.07 -0.48 - 5.27 - - - - - - -3.11 -4.44 -5.25 -3.9 -2.12 - -1.19 - - - - -0.1 - - - - - - - - - -3.59 - - - - - - -
LOC_Os06g24390.1 (LOC_Os06g24390)
-2.07 3.84 - - - - - - - - - - - 5.11 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
LOC_Os06g25630.1 (LOC_Os06g25630)
-1.85 2.95 - - - 0.66 -2.14 -0.66 - -3.97 -2.04 -2.08 - 5.07 - - - - - -1.95 -2.22 -4.55 -2.29 -2.16 - 0.8 - - - - - 0.52 - - - - - - - -4.39 - - -3.3 -3.58 - - - - -
LOC_Os06g32150.1 (LOC_Os06g32150)
-3.9 2.66 - -1.24 - 1.57 - -2.22 - -0.08 -1.83 - - 5.07 - - 2.04 -3.34 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
LOC_Os06g35990.1 (LOC_Os06g35990)
-0.14 2.78 -0.45 - - - - - -0.15 - -6.87 - - 5.24 - - -1.88 - - - - - - - - - - - - - - 0.67 - - - - - - - - - - - - - - - - -
LOC_Os06g38720.1 (LOC_Os06g38720)
- 3.35 - - - - - - - - - - - 5.26 - - - - - - -1.3 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
LOC_Os07g04470.1 (LOC_Os07g04470)
-1.33 2.93 -4.0 -2.79 -0.51 2.29 -3.25 -2.08 -1.67 -2.8 -2.36 -1.89 -0.73 4.87 - - 0.13 -1.71 - -1.44 -6.07 -6.29 -5.33 -3.87 - -1.2 -1.82 - - - - -2.94 - - - - -2.7 - - - -4.6 -4.97 - -0.25 -3.04 - -2.9 - -
LOC_Os07g11180.1 (LOC_Os07g11180)
-3.92 2.48 - - - 2.5 - -4.31 - - -5.92 - -0.1 5.1 - - -1.67 -4.03 - - -4.32 - - -4.53 - -1.23 - - - - - -3.01 - - - - - - - - -3.64 -4.03 -2.67 - - - - 0.07 -
LOC_Os07g11520.1 (LOC_Os07g11520)
- 2.54 - - - 1.33 - -3.29 - - - -19.34 - 5.31 - - - -5.06 - -6.84 - -6.18 - -1.98 - - -13.61 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -0.96 - - -
LOC_Os07g13010.1 (LOC_Os07g13010)
-1.44 2.87 -2.26 -3.76 -2.54 1.17 -5.85 -5.84 -1.3 -3.14 -2.07 - -3.97 4.85 -1.52 - -2.8 -2.97 - -3.35 -3.52 -5.36 -5.17 -2.03 1.36 -0.21 -2.75 - - -2.31 - 1.12 - - -2.56 - -1.31 - - - -5.45 -4.99 - -3.62 -0.39 -1.06 - - -
LOC_Os07g18200.1 (LOC_Os07g18200)
- 2.83 - - - -1.16 - - -2.56 - -3.0 - - 5.24 - - -20.96 -3.57 - - -3.41 - - -1.75 - - -1.05 - - - - 0.8 - - - -0.81 - - - - - - - - - - - - -
LOC_Os07g26130.1 (LOC_Os07g26130)
-3.47 2.95 - - - - -1.73 - - - -3.98 - - 5.23 - - - - - -3.06 - - - - - 1.28 - - - - - - - - - - - - - - -1.38 - -1.22 - - - - - -
LOC_Os08g13500.1 (LOC_Os08g13500)
-1.02 2.67 -2.35 -1.91 -0.94 0.74 -1.55 -0.19 - -1.46 -2.09 -2.84 -1.28 4.94 - - -1.63 -3.19 - -2.06 -4.09 -4.01 -3.66 -1.72 0.07 -1.5 - - - - - 0.08 - - - - -1.3 -0.69 - -2.55 -2.43 -2.75 -1.82 -3.3 - -2.28 -0.68 - -
LOC_Os08g13560.1 (LOC_Os08g13560)
-2.19 3.02 -3.52 - - - - -3.72 - -3.97 -3.23 -1.04 -0.39 4.88 - - - -2.35 - -2.47 -4.57 -4.41 - -1.39 - -0.8 - - - -0.27 - 0.39 - 0.01 -0.44 0.48 - 0.68 -0.69 - -3.09 -3.26 -3.09 -1.77 - - - - -
LOC_Os08g16150.1 (LOC_Os08g16150)
-4.08 3.18 - - - -0.63 -2.52 - -0.25 - -3.18 - - 5.18 - - - -4.04 - -5.25 - - - - - - 0.58 - - - - - - - - - - - - - - - -1.84 -3.58 - - - - -
LOC_Os08g16160.1 (LOC_Os08g16160)
-3.47 2.59 -2.76 -3.65 - - -4.72 -3.64 - -2.75 -6.73 - - 5.17 - - - - - -4.55 -4.27 -4.92 -4.46 -1.85 - - - - - - - -0.22 - - -1.41 - - - - -4.74 - - - -2.68 - - - 1.77 0.12
LOC_Os08g19460.1 (LOC_Os08g19460)
-3.59 2.65 - - - - - - - - -4.13 -2.41 - 5.36 - - - -4.93 - - - - - -4.87 - - - - - - - -0.55 - - -0.88 - - - - - -4.87 - - - - - - - -
LOC_Os08g23900.1 (LOC_Os08g23900)
-4.86 2.86 -1.01 - - - - - -1.03 - -7.97 - - 5.29 - - -8.41 - - -2.33 - - - -4.45 - -0.29 -0.73 - - - - - - - - - - - - - - - - -5.67 - - - - -
LOC_Os08g26080.1 (LOC_Os08g26080)
-5.19 3.41 - -24.64 - - - - - - -29.42 - - 5.26 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
LOC_Os08g32820.1 (LOC_Os08g32820)
-5.9 3.77 -27.19 -25.34 - - - - - - -30.12 - - 5.07 - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.88 - - - - - - - - - - - - - - - - -
LOC_Os08g36270.1 (LOC_Os08g36270)
-1.88 2.54 -3.95 - - - - - 1.13 - - - - 5.33 - - - -3.63 - -5.56 - - - - - - - - - - - -1.77 - - - - - - - - - - - - - - - - -
LOC_Os08g38150.1 (LOC_Os08g38150)
-0.77 2.65 -2.4 -1.08 0.25 1.07 -5.77 - -1.97 - -1.24 -4.0 - 4.96 - - 1.23 -2.32 - -3.56 -5.01 -2.78 -5.81 -2.85 -1.33 -2.64 - - - -1.43 - 0.09 - - - - -2.43 - -2.73 -3.58 -4.03 -2.84 -3.19 -3.51 -1.97 - - -1.36 -
LOC_Os08g44990.1 (LOC_Os08g44990)
-4.02 2.52 -1.71 - - 1.58 - - -1.0 -4.69 -2.78 -4.5 -13.12 4.91 -0.44 -0.57 - -4.42 - -1.53 -1.57 -1.26 -3.63 -0.97 - -2.08 -25.86 -3.14 - -2.92 -2.55 -1.24 -0.52 - -2.04 - -1.69 - -1.55 -0.76 -0.18 -0.65 -0.41 - -3.62 - -2.19 - -
LOC_Os09g02640.1 (LOC_Os09g02640)
- 3.02 - - - - - - - - -4.35 - - 5.34 - - - - - - - - -2.06 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
LOC_Os09g18420.1 (LOC_Os09g18420)
- 2.68 - -1.64 - - - -2.5 - - -3.14 - - 5.35 - - - - - -0.78 - - - -1.84 - - - - - - - - - - - - - - - - -1.62 - - -3.19 - - - - -
LOC_Os09g22200.1 (LOC_Os09g22200)
-3.2 2.26 - - - -0.57 - -3.15 -2.02 - - - - 5.31 - - - - - - - - - -2.14 - -0.04 - - 0.62 - - -0.83 - - - - - - - - -3.82 - - - - - - - -
LOC_Os10g11930.1 (LOC_Os10g11930)
-0.32 2.7 -1.1 - - 2.14 -1.84 0.83 - -0.69 -1.22 - 0.26 4.88 - - -1.08 -3.89 - -1.08 - - -3.18 -2.57 - -1.41 - - - - - - - - - - -1.01 - - -4.48 -4.0 - -2.53 -1.76 - - -1.24 - -
LOC_Os11g23210.1 (LOC_Os11g23210)
-3.48 3.42 - - - - - - - - - -0.8 - 5.23 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
LOC_Os11g25290.1 (LOC_Os11g25290)
- 3.37 -1.96 - - -1.03 -0.76 - -2.32 - -4.24 - - 5.06 - - -3.68 -3.75 - -3.73 -3.47 - -3.87 -2.64 - -0.51 - - - -0.43 - -1.23 - - - - - - - -4.16 -3.29 - -1.79 -0.22 - - - - -
LOC_Os11g37840.1 (LOC_Os11g37840)
-1.34 2.86 -3.64 -1.97 0.63 1.03 -2.13 -1.97 -2.03 -4.0 -1.02 - -3.13 5.12 - - -4.53 -3.71 - - -5.88 - - -5.0 -0.94 - - - - - - -4.04 -1.89 - - - - - - - - - - - - -2.85 - - -
LOC_Os11g39110.1 (LOC_Os11g39110)
-2.01 3.0 - 0.45 - - - - 0.03 - - - - 5.14 - - -1.02 - - - - - - - - 1.43 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
LOC_Os12g09050.1 (LOC_Os12g09050)
-1.64 2.6 - - - - - - - - -3.75 - - 5.41 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
LOC_Os12g12830.1 (LOC_Os12g12830)
-4.06 3.42 - - - - - - - - -3.99 - -0.96 5.16 - - -5.1 - - - - - -5.49 -3.93 - - - - - - - -0.77 - - - - - - -1.1 - -6.14 - -4.95 -3.95 - -0.82 - - -
LOC_Os12g16960.1 (LOC_Os12g16960)
-4.24 3.07 - - - -1.01 - -0.94 - - -6.12 - - 5.07 - - - -0.04 - 0.05 -2.59 - -2.09 - - - - - 0.15 - - - - - 0.79 - -0.51 - - - - - - -4.68 - - - - -
LOC_Os12g20350.1 (LOC_Os12g20350)
-3.02 2.4 -2.42 -3.65 -2.23 1.14 - - -1.76 -4.97 -3.81 0.86 -1.46 4.89 - -0.37 -3.86 -1.61 - -1.21 -4.2 - - -1.07 - 1.18 0.31 - - -1.52 - - - - - - - - - - -4.13 - - -5.36 -0.03 -0.87 -1.62 -0.56 -
LOC_Os12g29170.1 (LOC_Os12g29170)
-3.62 3.5 - - - - - - - - -2.01 - - 5.22 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
LOC_Os12g29240.1 (LOC_Os12g29240)
- 3.35 - - - - - - - - -1.17 - - 5.19 - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.03 - - - - - - -0.52 - - - -4.37 - - -2.68 - - -

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.