Heatmap: Cluster_240 (HCCA cluster)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Roots (apex), 7 DAG
Roots (differentation zone), 4 DAP
Roots (elongation zone), 4 DAP
Roots (meristematic zone), 4 DAP
Roots (stele cells), 7 DAS
Roots (tip)
Leaves (rosette), 21 DAG
Leaves (rosette), 29 DAG
Leaves (rosette), 35 DAG
Leaves (rosette), 42 DAG
Leaves (rosette), 57 DAG
Epidermis cells
Mature guard cells
Stems (internode)
Stems (internode), senescent
Meristem (M1-3), 7-9 DAG
Meristem (M4-6), 1-12 DAG
Meristem (M7-1), 13-16 DAG
Axis of the inflorescence
Pedicel
Flowers (receptacles)
Flowers (floral buds)
Flowers (sepals)
Flowers (petals)
Flowers (stamen filaments)
Flowers (anthers)
Flowers (carpels)
Flowers (ovules)
Stigmatic tissues
Pollen
Siliques
Siliques, senescent
Pods of Siliques
Pods of Siliques, senescent
Embryo
Endosperm
Seeds, dry
Seeds, from senescent siliques
Seeds, young
Seeds, germinating
Seedlings, 5 DAG
Seedlings, 11 DAG
Seedlings, 14 DAG
Seedlings, etiolated
-0.49 2.19 1.12 -0.74 0.84 -0.83 -1.59 -0.37 0.65 0.73 0.51 -1.87 0.99 0.16 0.67 -0.62 -0.62 -0.51 -0.89 -0.97 0.06 -0.04 0.39 0.02 -0.77 -0.61 0.15 0.29 -0.7 -2.43 -0.5 -0.41 -0.9 0.74 -0.2 -0.27 0.54 -0.83 -0.27 -0.85 -1.33 -1.11 -0.97 -0.06
AT1G13740 (AFP2)
-2.84 -0.84 -0.79 -2.53 -8.31 -2.04 -1.33 -2.16 -0.43 -0.23 -0.83 -3.24 -2.96 -0.65 -0.39 -0.39 -0.23 0.23 -0.09 -0.08 0.16 1.05 -0.72 -0.5 0.08 -1.44 0.46 -0.28 -0.26 - -0.01 1.8 -0.04 0.48 2.08 1.05 1.69 1.64 -0.29 0.39 -1.1 -0.28 -1.25 -0.08
-0.29 -1.45 -1.37 1.1 - 0.17 -0.74 -0.29 0.1 0.12 -0.02 -2.41 -2.51 -0.85 0.11 0.75 1.07 1.15 0.84 0.09 0.03 0.02 -0.59 -1.09 -1.28 -1.5 1.15 0.82 -0.37 - -0.64 -0.88 -0.81 -0.1 1.11 1.86 -0.86 -1.21 0.4 0.25 -0.68 -0.11 -0.24 -0.51
0.19 -0.41 1.2 0.39 0.73 0.45 0.02 -2.36 -2.03 -1.82 -1.73 -2.36 -4.9 0.59 -0.51 -0.47 -0.66 -0.47 0.02 0.05 0.01 1.45 0.12 0.19 0.26 1.14 -0.11 -0.44 -0.08 1.73 0.24 -2.82 0.49 0.83 -0.55 0.98 -6.14 -4.53 -0.33 -0.67 -0.83 0.07 -0.54 -0.73
AT1G30825 (DIS2)
0.19 0.16 0.84 1.19 1.59 0.4 -0.35 -0.68 -0.33 -0.37 -0.43 0.22 -0.6 -0.04 -0.44 -0.41 0.06 0.48 0.6 0.21 0.3 0.7 -0.14 -0.18 -0.9 -1.61 0.77 0.5 -0.21 -7.11 0.05 -2.46 -0.17 -0.91 0.37 -0.65 -3.27 -2.11 0.34 -0.37 -0.94 0.57 -0.09 -0.28
0.29 0.74 1.21 0.05 2.17 0.05 0.01 -0.7 -0.74 -0.75 -0.86 -3.82 -2.98 0.18 -0.66 -0.62 -0.48 -0.14 -0.62 -0.65 0.24 0.65 0.16 0.4 0.27 -0.71 0.22 0.23 0.55 -2.97 0.3 -1.85 0.36 0.17 -0.69 0.38 -2.29 -2.21 0.14 -0.13 -0.56 -0.18 0.22 0.46
-0.14 -0.35 -0.31 0.23 -0.22 0.16 -0.87 -0.48 0.43 0.55 0.36 -2.58 -0.75 -0.92 -0.1 0.09 0.35 0.51 -0.07 -0.35 0.38 0.04 -0.24 -0.25 -0.05 -0.05 0.73 0.84 0.12 -1.49 -0.21 -0.86 -0.27 0.13 0.65 1.4 -0.36 -0.96 0.74 -0.28 -0.57 -0.6 -0.09 -0.26
AT1G52520 (FRS6)
-0.12 -0.34 -0.28 0.11 -6.42 -0.52 -1.03 -0.44 0.05 -0.01 -0.14 -0.79 -1.56 -0.47 0.41 -0.57 -0.18 0.24 -0.01 -0.14 0.32 0.07 -0.09 0.12 -0.13 -0.67 0.78 0.9 0.38 -4.91 -0.16 0.4 -0.22 -0.06 0.62 1.34 1.19 0.65 0.63 -0.63 -1.09 -0.47 -0.01 -0.31
-0.12 -0.92 0.24 0.62 0.2 0.21 -0.87 -0.82 -0.97 -1.07 -1.16 -0.67 -2.37 0.11 -0.79 0.08 0.26 0.57 1.0 0.5 0.19 1.14 -0.17 0.32 -0.03 -2.3 0.82 0.46 0.36 -10.64 -0.11 -3.82 -0.26 -1.01 0.27 1.9 -6.09 -5.03 0.42 0.27 -1.04 0.71 0.41 -0.07
AT1G60620 (RPAC43)
0.01 -0.72 -0.85 1.18 - 0.63 -0.32 -0.81 0.04 0.07 -0.12 -3.84 -3.34 -0.59 0.52 0.2 0.46 0.57 0.57 -0.18 0.18 -0.16 -0.55 -0.47 -1.07 -1.14 0.74 0.77 -0.34 -6.74 -0.27 0.7 -0.7 -1.0 0.47 0.87 1.26 0.76 0.52 0.35 -0.89 -0.46 -0.06 -0.53
-0.13 -0.63 0.04 0.22 -0.78 0.08 -0.07 -0.57 -0.35 -0.25 -0.34 -1.68 -3.13 -0.45 -0.26 0.33 0.51 0.57 0.44 0.28 0.25 0.69 -0.23 -0.23 -0.49 -0.04 0.65 0.75 0.18 0.58 -0.28 -1.12 -0.36 -0.46 0.32 0.96 -0.85 -1.54 0.66 0.12 -0.05 0.56 -0.19 -0.15
0.85 -2.06 -0.45 1.62 -2.19 1.19 0.14 -1.04 -0.95 -1.16 -1.11 -3.92 -3.34 -0.74 -0.22 0.84 0.95 1.06 0.99 0.09 0.04 -0.12 -0.86 -1.3 -1.18 -0.84 0.8 0.67 -0.61 -9.45 -0.6 -0.89 -0.87 -1.6 1.13 1.55 -1.44 -0.86 0.59 0.53 -0.52 0.15 -0.2 -0.88
0.25 -1.73 -1.01 0.87 - 0.45 -0.72 -0.84 -1.02 -1.44 -1.32 -3.71 -3.53 -0.45 0.08 0.55 0.88 0.95 0.82 0.39 -0.07 0.83 -0.19 -0.24 -0.46 -0.69 0.74 0.96 0.19 -6.39 -0.25 -0.37 -0.64 -0.09 0.93 0.5 0.6 -0.05 0.71 0.71 -1.01 0.54 -0.33 -0.82
AT2G04240 (XERICO)
-0.49 0.78 0.1 -1.44 2.56 -1.74 -1.33 0.12 -0.28 -0.81 -0.57 -7.34 -7.78 -0.02 0.89 -2.17 -1.87 -0.63 -0.91 0.02 0.43 -0.15 0.89 1.06 0.3 -0.83 0.52 0.6 -0.69 -8.45 0.07 -0.29 0.47 0.83 -1.61 -0.34 0.29 -0.19 -0.13 -0.84 -1.03 -1.97 -0.06 0.88
0.22 0.75 0.25 0.54 1.11 0.03 -1.64 0.8 1.13 1.34 1.52 -3.17 -2.95 -0.41 1.04 -0.62 -0.71 -0.53 -0.79 -1.08 -0.08 0.42 -0.77 -0.3 -0.5 -0.92 -0.27 -0.25 -0.52 - -0.63 -0.74 -0.77 -0.69 0.02 0.49 0.51 -0.18 -0.42 -0.54 -1.28 0.21 0.03 0.2
-0.19 -1.65 -0.95 1.11 - -0.07 -1.97 -4.18 -1.74 -1.27 -1.19 -0.28 2.07 -0.49 -0.71 0.44 0.92 1.32 0.88 0.17 -0.19 -1.11 -1.98 -3.36 -2.99 0.12 0.76 1.04 -2.11 0.47 -0.27 -1.46 -0.7 0.45 1.34 1.99 -4.35 -1.41 0.41 -1.27 -1.67 -0.44 0.11 -1.26
0.64 -0.08 1.25 0.76 0.54 0.74 0.28 -0.81 -1.48 -1.63 -1.26 -2.59 -2.77 1.16 -0.91 0.17 0.53 0.55 0.3 0.24 0.25 0.17 0.17 0.43 0.64 -1.21 0.05 0.4 0.11 -3.57 0.42 -3.76 0.21 -1.51 0.06 -1.11 -4.51 -4.16 0.38 0.1 -0.11 0.38 0.37 0.23
-2.79 -5.04 -2.99 -1.43 0.66 -1.69 -1.56 -3.34 -2.9 -2.64 -2.73 -1.45 -2.83 -1.03 -0.59 1.91 2.12 1.96 0.59 0.32 -0.34 0.93 -0.02 0.36 -0.41 1.6 0.95 0.7 0.2 -0.34 -0.26 -0.33 -0.72 -1.54 0.34 1.29 -0.83 -0.8 -0.19 -0.65 -1.8 -1.59 -4.46 -1.93
0.44 -0.73 0.76 0.77 0.96 0.78 0.05 -1.29 -1.45 -1.52 -1.42 -1.9 -3.36 -0.03 -0.9 0.09 0.52 0.58 0.9 0.77 -0.06 0.02 0.45 -0.16 -0.24 -0.21 0.38 0.35 0.28 -1.73 0.33 -2.2 0.33 0.03 0.72 -1.97 -3.83 -2.7 0.24 0.93 -0.63 0.21 0.53 -0.38
1.02 -0.61 0.77 0.68 1.65 0.8 -0.36 -0.18 -0.05 -0.21 0.01 -2.21 -3.28 0.17 -0.24 -0.33 -0.0 0.39 0.43 0.03 0.17 -0.3 -0.32 0.02 -0.09 -1.37 0.5 0.54 0.06 -8.94 -0.18 -1.4 -0.36 -0.88 0.18 1.1 -1.8 -1.76 0.44 0.19 -0.99 -0.6 -0.07 -0.24
AT2G30260 (U2B'')
-0.08 -0.67 -0.07 1.27 0.14 0.97 -0.53 0.78 0.34 0.61 0.55 -1.44 0.97 -0.59 -0.04 0.59 0.66 0.65 0.27 -0.27 0.26 -0.76 -0.72 -0.75 -0.69 -1.54 0.56 0.59 -0.45 -10.89 -0.51 -1.66 -0.87 -1.3 0.91 -1.28 -1.35 -1.26 0.42 0.02 -0.45 -0.79 0.45 -0.13
-0.6 -1.05 -0.73 0.22 2.6 -0.24 -1.65 -1.29 -0.57 -0.72 -0.44 -5.5 -5.6 -1.19 -0.08 0.29 0.7 0.69 0.19 -0.53 -0.17 0.66 -0.8 -0.96 -0.9 -1.4 0.63 0.81 -0.35 - -0.5 -0.24 -1.01 0.13 0.61 1.72 0.4 0.09 0.7 -0.06 -1.92 -0.08 -0.97 -1.0
0.34 0.42 0.57 0.62 1.58 -0.04 0.19 -3.49 -3.79 -4.76 -5.1 -3.16 - 0.67 -2.18 1.04 1.24 1.43 0.83 0.56 0.59 -0.39 0.27 -1.86 -0.62 -1.68 0.86 0.85 -1.07 - -0.13 -4.47 0.22 -0.73 1.38 -1.28 - -7.78 -0.05 0.23 -0.27 -0.09 0.31 0.08
AT2G41500 (LIS)
0.46 -0.84 -0.31 1.65 0.24 0.63 -1.19 0.59 0.46 0.25 0.28 -2.01 -2.25 -0.72 0.38 0.11 0.39 0.69 0.4 -0.18 -0.0 0.19 -0.79 -0.8 -0.98 -1.38 1.06 0.83 -0.44 -9.25 -0.61 -0.38 -1.06 -1.59 0.76 -0.19 0.24 -0.36 0.51 0.03 -0.87 -0.37 -0.03 -0.32
0.03 -1.2 -0.32 1.54 -2.07 0.96 -0.06 -0.34 -0.46 -0.4 -0.39 -4.21 -4.18 -0.73 0.05 0.62 0.62 0.79 0.58 0.06 0.06 1.13 -0.56 -1.25 -1.28 -1.12 0.64 0.54 -0.67 -5.24 -0.4 -0.44 -0.93 -1.03 0.78 0.3 0.04 -0.4 0.36 0.7 -0.49 1.32 -0.64 -0.53
AT3G03340 (UNE6)
-0.22 -0.23 -0.34 0.29 1.68 -0.32 -0.98 -0.12 0.39 0.41 0.53 -2.45 -2.63 -0.54 0.87 -0.5 -0.24 0.22 0.25 -0.04 0.06 0.96 -0.26 -0.07 -1.06 -1.41 0.56 0.34 -0.21 -6.68 -0.42 -0.07 -0.52 0.73 0.26 -0.0 -0.11 -0.27 0.1 0.03 -0.63 0.3 0.18 -0.55
AT3G06910 (ELS1)
-0.21 -0.68 -0.23 0.6 2.74 -0.3 -0.93 -1.43 -0.72 -1.36 -1.07 -4.96 -1.96 -0.23 0.02 -0.75 0.08 0.38 0.49 0.37 -0.11 0.37 0.03 -0.12 -0.6 -1.16 0.86 0.95 0.45 -5.71 -0.01 -1.6 -0.02 -0.27 0.41 0.14 -1.87 -1.23 0.81 0.17 -0.98 -0.03 -0.29 -0.68
0.0 -1.9 -0.35 1.47 - 0.62 -0.17 -0.98 -0.76 -0.83 -0.89 -4.43 -3.67 -0.52 0.07 -0.09 0.17 0.42 0.65 0.38 0.05 0.97 0.24 0.65 -0.2 -1.69 0.76 0.67 0.17 -8.07 -0.07 -0.39 -0.33 -2.11 0.72 0.39 0.12 -0.03 0.52 0.53 -0.16 0.5 0.6 -0.83
0.17 -0.7 0.3 1.02 0.53 0.61 -1.13 -0.65 -0.13 -0.08 0.07 -0.89 -0.4 -0.13 0.2 -0.69 -0.15 0.29 0.44 -0.12 0.2 1.1 -0.38 -0.41 -1.03 -1.7 0.49 0.54 -0.23 - -0.11 -1.14 -0.2 0.01 0.03 1.75 -1.15 -1.41 0.27 -0.1 -1.17 0.3 0.41 -0.43
0.22 -0.94 -0.6 0.77 -1.39 0.31 -0.69 -0.91 -0.91 -0.85 -1.07 -1.9 -1.9 -1.4 -1.04 0.27 0.63 0.87 0.52 0.0 0.16 0.29 -0.3 -0.34 -0.66 -0.56 1.11 1.3 -0.13 -5.5 -0.49 -0.5 -0.78 -0.69 1.35 1.38 0.02 -0.58 0.86 -0.07 -1.22 0.58 0.56 -0.44
AT3G10370 (SDP6)
0.2 -0.09 0.36 -1.03 0.21 0.02 -0.23 -0.74 0.37 0.56 0.4 -0.81 0.26 -0.34 0.05 -0.77 -0.57 -0.32 -0.01 -0.32 0.16 0.28 0.41 0.68 0.53 0.23 -0.07 -0.25 0.49 -0.95 -0.22 -0.59 -0.07 1.52 -1.38 0.03 -1.29 -1.66 -0.0 1.07 -0.57 -0.49 -0.88 -0.19
AT3G10620 (NUDX26)
-0.37 -0.68 -0.66 0.66 0.35 0.37 0.19 0.21 -0.37 -0.33 -0.36 1.31 -2.22 0.4 0.23 0.26 0.17 0.19 0.56 0.44 0.1 -0.22 0.4 0.08 -0.01 -0.4 0.07 -0.38 0.13 -1.53 0.11 -0.36 0.09 -0.44 0.06 -0.93 0.26 -0.28 -0.35 0.16 -0.25 -0.05 -0.97 -0.15
AT3G17880 (TDX)
-0.32 0.54 -0.51 -0.54 1.85 -0.53 -0.95 0.58 1.02 1.03 1.02 -1.58 -1.63 -0.18 0.97 -0.72 -0.35 0.01 -0.04 -0.22 0.18 0.27 -0.05 -0.41 -0.63 -1.46 0.27 -0.17 -0.15 -9.07 -0.29 -0.52 -0.26 0.54 -0.31 0.1 0.19 -0.59 -0.33 -0.35 -0.88 -0.39 -0.13 -0.18
-0.06 0.31 0.01 0.6 -6.04 0.32 -0.56 -0.75 0.73 0.73 0.55 -2.58 -3.68 -0.46 0.35 0.11 0.4 0.45 0.27 -0.13 -0.12 0.6 0.13 0.39 0.36 -0.46 0.07 -0.01 0.03 -3.94 0.22 -0.48 -0.1 0.12 0.86 0.35 -0.5 -0.56 0.01 0.52 -1.63 0.18 -0.32 -0.38
AT3G20780 (BIN3)
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AT3G24315 (AtSec20)
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AT3G24660 (TMKL1)
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AT3G27010 (PCF1)
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AT3G47690 (EB1A)
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AT3G48470 (EMB2423)
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AT4G21560 (VPS28-1)
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AT4G23060 (IQD22)
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AT4G24470 (ZIM)
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AT4G31540 (EXO70G1)
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AT5G06960 (TGA5)
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AT5G13390 (NEF1)
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AT5G16260 (ELF9)
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AT5G17430 (BBM)
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AT5G17690 (TFL2)
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AT5G47760 (PGLP2)
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-2.29 -4.86 -2.69 0.32 -0.92 -1.06 -8.23 - - - - -1.74 -6.61 -3.64 -5.54 0.59 1.35 1.8 -0.53 -1.57 0.66 0.09 -2.23 -0.96 -0.96 -1.18 1.86 2.5 1.52 - 0.82 -6.64 -0.66 -4.93 0.1 2.79 -4.66 -6.22 2.27 -3.04 -3.7 -5.01 -2.2 -3.59
0.13 -1.01 -0.06 1.37 0.11 0.75 -0.22 -2.43 -3.35 -4.69 -4.21 -2.32 -8.17 0.29 -0.72 0.5 0.88 1.35 1.06 0.55 0.47 -0.19 -0.06 -0.6 -0.39 -1.79 1.33 1.29 0.09 - 0.62 -3.62 0.31 -5.2 1.1 -0.6 -4.87 -4.05 1.7 -0.63 -0.62 -0.31 -0.02 -1.4
AT5G51940 (NRPE6A)
-0.74 -0.99 -0.91 0.92 -2.06 0.38 -0.42 -0.91 -0.91 -1.08 -0.95 -3.31 -0.32 -0.58 -0.07 0.42 0.68 0.72 0.06 -0.46 0.35 1.72 -0.64 -0.32 -0.98 -0.81 0.69 0.91 0.22 -3.19 -0.24 -0.09 -0.78 -0.71 0.18 1.35 0.03 0.09 0.59 0.22 -0.62 1.06 -0.74 -0.67
AT5G58003 (CPL4)
-0.05 -0.0 0.05 0.62 2.34 0.03 -1.01 -0.72 -0.14 -0.12 -0.11 -3.17 -7.46 -0.16 -0.04 -0.38 0.29 0.49 0.26 -0.11 0.29 0.53 -0.57 -0.39 -0.94 -1.68 0.7 0.48 -0.07 -7.74 -0.12 -0.94 -0.22 -0.15 0.7 0.7 -0.71 -0.84 0.46 -0.55 -1.01 0.06 0.19 -0.45
AT5G58190 (ECT10)
0.22 -0.57 0.13 0.2 0.44 -0.06 -1.44 -1.21 -0.77 -0.48 -0.3 -3.3 -2.8 -0.38 -0.38 0.12 0.48 0.69 0.09 -0.41 -0.1 -0.1 -0.52 0.32 0.08 0.92 0.74 0.92 0.75 1.51 0.11 -1.1 -0.26 -0.09 0.49 0.86 -1.07 -1.06 0.71 -0.11 -1.47 -1.73 -0.42 -0.57
AT5G59800 (MBD7)
-1.0 -0.85 0.55 0.36 -6.09 -0.32 -1.17 -2.22 -3.44 -3.98 -3.4 -3.12 - -0.26 -0.88 -0.12 0.33 0.34 0.11 -0.15 0.69 0.47 0.22 0.76 -0.04 0.51 1.4 1.91 0.77 -5.95 0.79 -0.13 0.68 -2.05 0.7 -0.2 -0.21 -0.9 1.86 -1.17 -0.09 -1.24 -0.49 -0.59
0.04 -0.17 0.37 0.18 0.4 0.44 -0.96 -0.15 0.36 1.11 1.23 -1.91 -2.22 0.02 -0.07 -1.11 -0.72 -0.38 -0.51 -0.89 1.08 1.11 0.32 -0.21 -0.69 -0.71 -0.17 -0.12 -0.16 -4.5 0.69 -1.48 0.31 1.93 -0.13 0.16 -3.8 -2.96 -0.06 -0.45 -1.34 0.01 -0.34 -0.47
-0.12 -0.5 -0.38 1.16 -3.98 0.62 -0.6 0.33 -0.32 -0.23 -0.14 -2.65 -4.04 -0.55 0.02 0.84 0.8 0.8 0.19 -0.1 0.5 0.83 -0.24 0.15 -0.18 -0.43 0.92 0.61 0.11 -6.5 -0.43 -0.64 -0.75 -0.71 0.4 -0.01 -0.05 -0.71 0.3 -0.08 -0.02 0.32 -0.53 0.24

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.