1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_38 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

 Transpose table  Download table
Gene
Ovule
Ovary
Egg cell
Pollen tricellular
Pollen
Sperm
Flower (buds)
Flower
Panicle
Milk grains
Seeds
Seedling
Seedling (12-day-old, DongJin)
Seedling (12-day-old, DongJin, mutant)
Seedling (22-days-old, 22C)
Seedling (22-days-old, 30C)
Meristem
Stems
Callus
Leaf
Leaf (Azucena)
Leaf (Kinandang puti)
Leaf (Pandan wangi)
Leaf (Tadukan)
Leaf (chilling-treatment, 4C, 33h)
Leaf (drought-stress, 1 day)
Leaf (drought-stress, 3 days)
Leaf (drought-stress, 15 min)
Leaf (drought-stress, 45 min)
Leaf (drought-stress, 90 min)
Leaf (drought-stress, 90 min, recovery 15 min)
Leaf (drought-stress, 90 min, recovery 90 min)
Leaf (drought-stress, 90 min, recovery 210 min)
Leaf (heat-stress, 15 min)
Leaf (heat-stress, 150 min)
Leaf (heat-stress, 210 min)
Leaf (heat-stress, 120 min, recovery 15 min)
Leaf (heat-stress, 120 min, recovery 60 min)
Leaf (heat-stress, 120 min, recovery 120 min)
Leaf (dry season, irrigated field)
Leaf (dry season, rainfed field)
Leaf (wet season, irrigated field)
Leaf (wet season, rainfed field)
Root
Root (heading stage)
Root (tillering stage)
Root (differentiation zone)
Root (elongation zone)
Root (meristematic zone)
- 5.61 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
LOC_Os01g18790.1 (LOC_Os01g18790)
 0.07 5.58 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
LOC_Os01g23080.1 (LOC_Os01g23080)
 1.31 5.28 - - - - - - - - - - - 1.89 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.98 - - - - - - - - - - - - - - - - -
LOC_Os01g32810.1 (LOC_Os01g32810)
 - 5.61 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
LOC_Os01g39210.1 (LOC_Os01g39210)
 - 5.61 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
LOC_Os01g39510.1 (LOC_Os01g39510)
 - 5.61 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
LOC_Os01g41080.1 (LOC_Os01g41080)
 0.76 4.85 - - 0.38 - - - - - -4.86 - - 0.87 - - - - - -0.28 - - - -0.22 - 2.55 2.07 - - - - 1.68 - - - - - - - - - - - -1.5 - - - - -
LOC_Os01g45920.1 (LOC_Os01g45920)
 1.76 5.46 - - - - - - - - -1.78 - - - - - - - - - - - - 0.38 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
LOC_Os01g54310.1 (LOC_Os01g54310)
 - 5.61 - - - - - - - - -3.53 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
LOC_Os02g14310.1 (LOC_Os02g14310)
 1.75 5.22 - - - - - - 2.86 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.25 - - - - - - - -
LOC_Os02g16750.1 (LOC_Os02g16750)
 -0.01 5.59 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
LOC_Os02g20370.1 (LOC_Os02g20370)
 - 5.27 - - - - - - - - - - - 3.38 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
LOC_Os02g21050.1 (LOC_Os02g21050)
 - 5.61 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
LOC_Os02g35920.1 (LOC_Os02g35920)
 - 5.61 - - - - - - - - -1.85 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
LOC_Os02g43960.1 (LOC_Os02g43960)
 0.37 5.49 - - - - - - - - - - - - - - - -0.3 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.92 - - - - -
LOC_Os03g21200.1 (LOC_Os03g21200)
 2.34 5.02 0.97 - - - - - 3.24 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
LOC_Os03g26520.1 (LOC_Os03g26520)
 0.93 4.87 - 1.31 - - -1.01 - 2.06 - -6.24 - - 2.2 - - - - - -4.78 - - - - - - - - - - - 1.88 - - - - - - - -1.38 - 0.73 - -1.7 - - - - -
LOC_Os03g29400.1 (LOC_Os03g29400)
 2.11 4.98 -0.28 - - 1.15 - - -0.15 -1.7 -2.28 1.73 - 2.11 - - -1.67 - - - -1.99 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -0.99 - - - - - - -
LOC_Os03g35880.1 (LOC_Os03g35880)
 1.48 5.49 - - - - - - - - -0.38 - - - - - - - - -1.22 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
LOC_Os03g37070.1 (LOC_Os03g37070)
 - 5.02 - - - - - - - - -1.36 - - 4.02 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
LOC_Os03g59950.1 (LOC_Os03g59950)
 0.51 5.44 - 2.1 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
LOC_Os04g10140.1 (LOC_Os04g10140)
 0.09 5.43 - 2.17 - - - - - - -1.37 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
LOC_Os04g16060.1 (LOC_Os04g16060)
 - 5.61 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
LOC_Os04g19920.1 (LOC_Os04g19920)
 -2.94 5.22 -0.48 - - 2.22 - -1.18 - - - - - 0.65 - - - 0.23 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -1.72 - - - - 1.41 - - - -
LOC_Os04g24720.1 (LOC_Os04g24720)
 1.28 4.81 - - - - - - - - -2.32 - - 4.05 - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.75 - - - - - - - - - - - - - - - - -
LOC_Os04g29060.1 (LOC_Os04g29060)
 -1.01 5.6 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
LOC_Os04g32290.1 (LOC_Os04g32290)
 - 5.46 - - - - - - 2.33 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
LOC_Os04g34780.1 (LOC_Os04g34780)
 - 5.61 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
LOC_Os04g40820.1 (LOC_Os04g40820)
 - 5.61 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
LOC_Os04g48600.1 (LOC_Os04g48600)
 - 5.41 - - - - - - - - - - - - - - -0.08 - - - - - - - - - - - - - - 2.45 - - - - - - - - - - - - - - - - -
LOC_Os05g10320.1 (LOC_Os05g10320)
 - 5.61 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
1.35 5.54 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
LOC_Os05g15710.1 (LOC_Os05g15710)
 2.06 5.21 - - - - - - - - - - - 2.97 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
LOC_Os05g21060.1 (LOC_Os05g21060)
 1.37 5.46 - - - - - - - - -2.8 - - - - - - - - - - - - 0.06 - - - - - - - - - - - - - - - 0.41 - - - - - - - - -
LOC_Os05g24080.1 (LOC_Os05g24080)
 - 5.39 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.23 - - - - - - - 2.54 - - - - - - - - - - - - - - - - -
LOC_Os05g35550.1 (LOC_Os05g35550)
 - 5.24 - - 3.12 - - - - 0.58 -2.5 - - - - - - - - -0.12 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
LOC_Os05g46900.1 (LOC_Os05g46900)
 - 5.61 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
LOC_Os06g07430.1 (LOC_Os06g07430)
 0.68 5.03 - 1.58 - - - - 1.17 0.47 -1.62 - - - - - - - - -4.06 - -0.75 - -0.3 - - - - - - - 2.01 - - - - - - - 0.55 -0.39 - - - - - - - -
LOC_Os06g14660.1 (LOC_Os06g14660)
 1.22 5.4 - 1.28 - - - - - 0.58 -0.8 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
LOC_Os06g25380.1 (LOC_Os06g25380)
 -1.72 4.73 -1.14 0.42 2.57 0.21 0.86 -2.19 - - -3.03 - - 0.84 - - - -0.6 - -2.97 - -0.38 -0.36 -0.49 - 1.93 - - - - - 1.01 - - - - - - - - - - - -1.29 - - - - -
LOC_Os06g39440.1 (LOC_Os06g39440)
 1.58 5.52 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
LOC_Os06g43260.1 (LOC_Os06g43260)
 - 5.3 1.33 - - - 1.37 - - - - - - - - - 1.18 1.24 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
LOC_Os07g05070.1 (LOC_Os07g05070)
 -0.17 5.35 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.87 - - - - - - - - - - - - - - - - -
LOC_Os07g08550.1 (LOC_Os07g08550)
 0.14 5.58 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
LOC_Os07g08990.1 (LOC_Os07g08990)
 - 5.61 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
LOC_Os07g09570.1 (LOC_Os07g09570)
 0.79 5.56 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
LOC_Os07g31950.1 (LOC_Os07g31950)
 -0.04 5.59 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
LOC_Os07g37910.1 (LOC_Os07g37910)
 0.85 5.5 - - - - - - - - -2.26 - - - - - - - - - 0.09 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -0.37 - - - - - - - -
LOC_Os07g48940.1 (LOC_Os07g48940)
 2.0 4.96 0.23 - - - - 0.75 1.02 -1.17 -1.55 - - - - - - - - -0.7 -2.17 - - -0.94 - - - - - - - 2.69 - - - - - - - - - - -1.13 - - - - - -
LOC_Os08g01440.1 (LOC_Os08g01440)
 2.24 5.45 - - - - - - - - -0.7 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
LOC_Os08g11700.1 (LOC_Os08g11700)
 - 5.51 1.77 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
LOC_Os08g15620.1 (LOC_Os08g15620)
 - 5.61 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
LOC_Os08g45050.1 (LOC_Os08g45050)
 2.03 5.31 - - - - - - - -0.29 0.2 - - - - - 1.41 -0.94 - -3.83 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
LOC_Os09g02240.1 (LOC_Os09g02240)
 0.39 5.25 - - - - - - - - - - - 3.27 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
LOC_Os09g07560.1 (LOC_Os09g07560)
 -0.13 5.21 - - - - - - - - -1.99 - - - - - - - - - - - - - - 3.43 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
LOC_Os09g08770.1 (LOC_Os09g08770)
 1.25 5.29 - - - - - - - - - - - 2.9 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
LOC_Os09g10580.1 (LOC_Os09g10580)
 -1.51 5.29 - - 2.73 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.54 - - - - - - - - - - - - - - - - -
LOC_Os09g11700.1 (LOC_Os09g11700)
 - 5.61 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
LOC_Os09g14420.1 (LOC_Os09g14420)
 - 5.61 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
LOC_Os09g15740.1 (LOC_Os09g15740)
 0.87 5.43 - - - - - - - -1.59 -2.48 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.82 - - - - - - - - - - - 0.83 - - - - -
LOC_Os09g20600.1 (LOC_Os09g20600)
 - 4.93 - - - 2.97 - - - - - - - - - - - - - -0.37 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.3 -
LOC_Os09g36170.1 (LOC_Os09g36170)
 - 5.56 - - - - - - - - 0.75 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
LOC_Os09g39140.1 (LOC_Os09g39140)
 - 5.3 - - - - - - - - - 0.87 - 1.64 - - - 0.94 - - - - - - - - - - - - - 1.1 - - - - - - - - - - - -0.89 - - - - -
LOC_Os10g09340.1 (LOC_Os10g09340)
 0.43 5.57 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
LOC_Os10g09830.1 (LOC_Os10g09830)
 - 4.88 - 1.35 - - 3.64 2.19 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
LOC_Os10g29940.1 (LOC_Os10g29940)
 -1.19 5.6 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
LOC_Os10g30500.1 (LOC_Os10g30500)
 - 5.51 - - - - - - - 1.78 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
LOC_Os10g31840.1 (LOC_Os10g31840)
 1.27 5.54 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
LOC_Os11g14860.1 (LOC_Os11g14860)
 -1.16 5.38 1.68 - - - - - 1.79 - - - - - - - - - - -3.25 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
LOC_Os11g26730.1 (LOC_Os11g26730)
 -1.12 5.4 - - - - - - - - - - - 2.34 - - - - - - - - - 0.49 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
LOC_Os11g27390.1 (LOC_Os11g27390)
 -0.04 5.59 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
LOC_Os11g42740.1 (LOC_Os11g42740)
 - 5.58 - - - - - - - - 0.32 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
LOC_Os12g08390.1 (LOC_Os12g08390)
 - 5.61 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
LOC_Os12g08750.1 (LOC_Os12g08750)
 - 5.54 - - - - - - - - - - - - - - - 1.3 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
LOC_Os12g11060.1 (LOC_Os12g11060)
 - 5.55 - - - - - - - - - - - - - - 1.16 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
LOC_Os12g11520.1 (LOC_Os12g11520)
 -0.73 5.55 - - - - - - - - -0.3 - - - - - - - - -0.79 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
LOC_Os12g12820.1 (LOC_Os12g12820)
 - 5.61 - - - - - - - - -1.8 - - -8.95 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -6.27 - - - -
LOC_Os12g13500.1 (LOC_Os12g13500)
 - 5.61 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
LOC_Os12g18000.1 (LOC_Os12g18000)
 - 5.61 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
LOC_Os12g27430.1 (LOC_Os12g27430)
 -1.37 5.38 - - - - - - - - - - - 2.14 - - - - - -0.63 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.98 - - - - - -
LOC_Os12g28300.1 (LOC_Os12g28300)
 0.17 5.56 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -0.41 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
LOC_Os12g40960.1 (LOC_Os12g40960)
 1.63 5.44 - - - - - - - - - - - - - - - 0.49 - - - 0.24 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.