Heatmap: Cluster_179 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Ovule
Ovary
Egg cell
Pollen tricellular
Pollen
Sperm
Flower (buds)
Flower
Panicle
Milk grains
Seeds
Seedling
Seedling (12-day-old, DongJin)
Seedling (12-day-old, DongJin, mutant)
Seedling (22-days-old, 22C)
Seedling (22-days-old, 30C)
Meristem
Stems
Callus
Leaf
Leaf (Azucena)
Leaf (Kinandang puti)
Leaf (Pandan wangi)
Leaf (Tadukan)
Leaf (chilling-treatment, 4C, 33h)
Leaf (drought-stress, 1 day)
Leaf (drought-stress, 3 days)
Leaf (drought-stress, 15 min)
Leaf (drought-stress, 45 min)
Leaf (drought-stress, 90 min)
Leaf (drought-stress, 90 min, recovery 15 min)
Leaf (drought-stress, 90 min, recovery 90 min)
Leaf (drought-stress, 90 min, recovery 210 min)
Leaf (heat-stress, 15 min)
Leaf (heat-stress, 150 min)
Leaf (heat-stress, 210 min)
Leaf (heat-stress, 120 min, recovery 15 min)
Leaf (heat-stress, 120 min, recovery 60 min)
Leaf (heat-stress, 120 min, recovery 120 min)
Leaf (dry season, irrigated field)
Leaf (dry season, rainfed field)
Leaf (wet season, irrigated field)
Leaf (wet season, rainfed field)
Root
Root (heading stage)
Root (tillering stage)
Root (differentiation zone)
Root (elongation zone)
Root (meristematic zone)
LOC_Os01g03340.1 (LOC_Os01g03340)
0.03 0.5 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.03 0.15 0.02 0.13 0.02 0.19 0.2 0.0 0.0 0.01 0.04 0.22 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.01 0.01 0.0 0.0 0.04 0.03 0.04 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.09 0.4 0.38 0.78 1.0
LOC_Os01g07250.1 (LOC_Os01g07250)
0.02 0.04 0.01 0.0 0.0 0.0 0.36 0.33 0.05 0.07 0.05 0.23 0.2 0.16 0.15 0.16 0.09 0.15 0.06 0.36 0.07 0.04 0.07 0.05 0.03 0.23 0.51 0.04 0.05 0.05 0.03 0.08 0.06 0.03 0.04 0.06 0.05 0.05 0.07 0.05 0.06 0.05 0.06 0.2 0.04 0.11 1.0 0.61 0.22
LOC_Os01g09300.1 (LOC_Os01g09300)
0.13 0.4 0.06 0.01 0.0 0.0 0.21 0.2 0.13 0.44 0.35 1.0 0.92 0.46 0.57 0.48 0.15 0.23 0.23 0.34 0.11 0.06 0.11 0.08 0.89 0.23 0.13 0.16 0.16 0.2 0.12 0.11 0.14 0.17 0.09 0.08 0.09 0.09 0.05 0.08 0.14 0.13 0.16 0.22 0.25 0.41 0.21 0.11 0.03
0.08 0.15 0.01 0.06 0.11 0.01 0.05 0.06 0.09 0.0 0.04 0.01 0.23 0.32 0.02 0.05 0.13 0.2 0.22 0.08 0.04 0.02 0.03 0.02 0.07 0.05 0.05 0.05 0.04 0.02 0.02 0.02 0.02 0.02 0.04 0.04 0.07 0.05 0.03 0.03 0.02 0.02 0.01 0.12 0.37 0.23 1.0 0.82 0.28
0.08 0.07 0.01 0.0 0.0 0.0 0.05 0.09 0.01 0.05 0.05 0.0 0.8 0.56 0.04 0.1 0.08 0.1 0.05 0.23 0.31 0.24 0.23 0.21 0.07 0.13 0.05 0.23 0.24 0.21 0.27 0.26 0.18 0.29 0.26 0.29 0.29 0.31 0.24 0.01 0.08 0.01 0.03 0.49 0.24 0.1 1.0 0.43 0.21
LOC_Os01g59050.1 (CYP94D2)
0.31 0.62 0.02 0.0 0.0 0.0 0.08 0.08 0.08 0.06 0.24 0.03 0.31 0.48 0.08 0.05 0.13 0.18 0.63 0.16 0.04 0.02 0.03 0.01 0.19 0.03 0.04 0.03 0.04 0.0 0.04 0.07 0.01 0.02 0.02 0.01 0.02 0.03 0.02 0.02 0.03 0.02 0.03 0.4 0.31 0.17 0.87 1.0 0.61
0.3 0.18 0.09 0.02 0.03 0.0 0.16 0.18 0.36 0.06 0.13 0.93 1.0 0.49 0.25 0.21 0.31 0.17 0.2 0.38 0.54 0.44 0.42 0.42 0.33 0.33 0.41 0.46 0.49 0.5 0.46 0.95 0.34 0.28 0.39 0.51 0.48 0.51 0.42 0.08 0.09 0.11 0.08 0.27 0.26 0.24 0.45 0.41 0.29
LOC_Os02g44680.1 (LOC_Os02g44680)
0.16 0.25 0.0 0.01 0.01 0.0 0.13 0.12 0.17 0.02 0.09 0.03 0.15 0.34 0.12 0.13 0.16 0.28 0.16 0.16 0.01 0.02 0.01 0.02 0.15 0.06 0.08 0.01 0.01 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.02 0.01 0.01 0.01 0.0 0.01 0.01 0.01 0.13 0.49 0.28 1.0 0.51 0.13
0.05 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.04 0.02 0.01 0.04 0.02 0.11 0.19 0.2 0.28 0.01 0.02 0.58 0.04 0.12 0.06 0.13 0.04 0.05 0.0 0.0 0.09 0.06 0.02 0.07 0.15 0.14 0.1 0.11 0.08 0.36 0.27 0.2 0.0 0.09 0.0 0.01 1.0 0.54 0.22 0.87 0.76 0.51
0.11 0.1 0.06 0.0 0.0 0.0 0.23 0.23 0.14 0.12 0.09 0.34 0.12 0.17 0.16 0.19 0.09 0.21 0.12 0.14 0.07 0.02 0.07 0.01 0.03 0.15 0.21 0.05 0.06 0.05 0.04 0.07 0.06 0.03 0.05 0.06 0.06 0.06 0.05 0.02 0.03 0.03 0.03 0.19 0.27 0.24 1.0 0.1 0.01
0.07 0.15 0.03 0.04 0.01 0.0 0.21 0.19 0.11 0.03 0.1 0.18 0.11 0.21 0.48 0.4 0.07 0.15 0.09 0.13 0.04 0.04 0.03 0.04 0.13 0.28 0.23 0.04 0.04 0.1 0.09 0.13 0.03 0.03 0.03 0.05 0.04 0.03 0.04 0.03 0.04 0.04 0.04 0.3 0.27 0.21 1.0 0.43 0.1
LOC_Os03g36530.1 (LOC_Os03g36530)
0.03 0.16 0.06 0.0 0.0 0.02 0.02 0.02 0.11 0.0 0.01 0.01 0.24 0.32 0.02 0.01 0.03 0.1 0.12 0.11 0.02 0.02 0.03 0.01 0.05 0.02 0.03 0.02 0.03 0.01 0.01 0.01 0.02 0.01 0.01 0.02 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.07 0.21 0.14 1.0 0.81 0.22
0.01 0.03 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.02 0.02 0.02 0.02 0.0 0.23 0.15 0.04 0.06 0.05 0.06 0.19 0.06 0.03 0.02 0.01 0.02 0.14 0.15 0.13 0.02 0.03 0.02 0.03 0.02 0.01 0.01 0.03 0.03 0.04 0.02 0.02 0.0 0.01 0.0 0.0 0.08 0.24 0.15 1.0 0.64 0.28
LOC_Os04g01674.1 (LOC_Os04g01674)
0.06 0.11 0.03 0.01 0.0 0.0 0.52 0.51 0.02 0.08 0.15 0.01 0.2 0.21 0.1 0.08 0.04 0.16 0.02 0.19 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.17 0.13 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.37 0.08 0.08 1.0 0.74 0.21
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.22 0.15 0.03 0.02 0.02 0.21 0.13 0.13 0.04 0.03 0.01 0.19 0.02 0.05 0.03 0.04 0.04 0.04 0.0 0.01 0.05 0.01 0.02 0.03 0.02 0.07 0.03 0.01 0.01 0.03 0.01 0.03 0.05 0.01 0.0 0.01 0.0 0.08 0.13 0.2 1.0 0.19 0.09
LOC_Os04g42420.1 (LOC_Os04g42420)
0.1 0.12 0.02 0.0 0.0 0.0 0.19 0.2 0.16 0.12 0.12 0.42 0.51 0.41 0.48 0.47 0.17 0.24 0.08 0.22 0.16 0.11 0.14 0.13 0.56 0.1 0.2 0.18 0.17 0.29 0.24 0.24 0.16 0.12 0.07 0.09 0.09 0.14 0.13 0.15 0.13 0.17 0.25 0.14 0.23 0.16 1.0 0.28 0.05
LOC_Os04g51660.1 (LOC_Os04g51660)
0.01 0.21 0.01 0.0 0.0 0.0 0.04 0.05 0.04 0.01 0.04 0.01 0.24 0.37 0.02 0.03 0.07 0.05 0.01 0.07 0.01 0.01 0.01 0.01 0.05 0.24 0.13 0.01 0.01 0.03 0.03 0.02 0.01 0.01 0.01 0.02 0.02 0.01 0.01 0.02 0.01 0.01 0.0 0.11 0.32 0.34 1.0 0.89 0.76
LOC_Os04g52990.1 (LOC_Os04g52990)
0.06 0.09 0.06 0.01 0.0 0.0 0.14 0.25 0.0 0.04 0.07 0.01 0.36 0.77 0.0 0.0 0.12 0.25 0.0 0.37 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.22 0.24 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.24 0.0 0.0 0.94 1.0 0.83
LOC_Os04g53000.1 (LOC_Os04g53000)
0.06 0.06 0.03 0.0 0.0 0.0 0.18 0.17 0.08 0.03 0.03 0.1 0.35 0.37 0.03 0.02 0.13 0.16 0.0 0.24 0.01 0.01 0.01 0.0 0.04 0.11 0.12 0.0 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.02 0.01 0.02 0.0 0.02 0.01 0.01 0.02 0.02 0.26 0.02 0.01 1.0 0.66 0.39
LOC_Os04g59480.1 (LOC_Os04g59480)
0.02 0.26 0.03 0.01 0.01 0.0 0.27 0.31 0.05 0.03 0.06 0.03 0.15 0.22 0.05 0.04 0.02 0.16 0.03 0.22 0.01 0.01 0.01 0.01 0.22 0.06 0.33 0.01 0.01 0.01 0.01 0.03 0.01 0.0 0.01 0.02 0.01 0.02 0.02 0.0 0.01 0.01 0.01 0.47 0.31 0.19 1.0 0.38 0.05
0.05 0.03 0.01 0.0 0.0 0.01 0.13 0.12 0.07 0.11 0.09 0.09 0.23 0.2 0.02 0.02 0.07 0.15 0.06 0.1 0.02 0.02 0.02 0.02 0.2 0.06 0.06 0.02 0.03 0.03 0.03 0.05 0.02 0.01 0.02 0.02 0.02 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.08 0.13 0.13 1.0 0.49 0.19
LOC_Os05g42070.1 (UGT73C7)
0.02 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.02 0.04 0.15 0.03 0.06 0.23 0.0 0.01 0.09 0.02 0.28 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.08 0.0 0.0 0.04 0.02 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.02 0.13 0.08 0.76 1.0 0.88
LOC_Os05g49260.1 (LOC_Os05g49260)
0.01 0.05 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.02 0.01 0.05 0.07 0.32 0.24 0.25 0.13 0.1 0.03 0.08 0.16 0.14 0.06 0.06 0.05 0.05 0.21 0.07 0.1 0.04 0.06 0.14 0.11 0.13 0.05 0.03 0.04 0.06 0.04 0.05 0.05 0.02 0.02 0.03 0.03 0.14 0.23 0.36 1.0 0.6 0.1
0.13 0.14 0.18 0.3 0.09 0.13 0.41 0.44 0.07 0.13 0.19 0.26 0.22 0.24 0.15 0.13 0.11 0.15 0.2 0.2 0.13 0.12 0.12 0.11 0.18 0.16 0.2 0.14 0.11 0.12 0.1 0.14 0.11 0.1 0.1 0.14 0.08 0.12 0.13 0.12 0.11 0.14 0.13 0.14 0.14 0.17 0.93 1.0 0.72
LOC_Os06g07869.1 (LOC_Os06g07869)
0.07 0.04 0.11 0.05 0.11 0.07 0.09 0.09 0.18 0.03 0.14 0.1 0.17 0.2 0.05 0.05 0.07 0.1 0.12 0.11 0.06 0.07 0.05 0.06 0.14 0.07 0.06 0.06 0.06 0.06 0.04 0.06 0.05 0.06 0.06 0.07 0.06 0.06 0.05 0.04 0.05 0.05 0.06 0.05 0.08 0.1 1.0 0.85 0.58
LOC_Os06g07905.1 (LOC_Os06g07905)
0.15 0.01 0.16 0.02 0.05 0.01 0.08 0.06 0.5 0.02 0.22 0.2 0.0 0.0 0.18 0.12 0.04 0.06 0.26 0.19 0.11 0.11 0.11 0.1 0.09 0.16 0.13 0.11 0.12 0.1 0.09 0.13 0.1 0.09 0.05 0.18 0.12 0.13 0.15 0.08 0.11 0.08 0.1 0.03 0.09 0.16 0.98 1.0 0.63
LOC_Os06g14400.1 (LOC_Os06g14400)
0.09 0.2 0.06 0.04 0.01 0.0 0.66 0.63 0.06 0.24 0.33 0.19 0.24 0.36 0.56 0.74 0.14 0.17 0.04 0.19 0.09 0.14 0.08 0.03 0.42 0.13 0.1 0.1 0.06 0.1 0.07 0.16 0.11 0.09 0.08 0.12 0.07 0.11 0.1 0.1 0.16 0.14 0.19 0.37 0.07 0.07 1.0 0.43 0.26
0.07 0.02 0.02 0.01 0.02 0.09 0.11 0.15 0.08 0.04 0.04 0.36 0.15 0.09 0.05 0.05 0.1 0.11 0.04 0.05 0.04 0.05 0.05 0.04 0.04 0.08 0.19 0.03 0.03 0.05 0.03 0.07 0.03 0.03 0.04 0.04 0.04 0.03 0.03 0.02 0.02 0.04 0.03 0.04 0.22 0.16 1.0 0.1 0.05
LOC_Os07g19444.1 (LOC_Os07g19444)
0.01 0.12 0.0 0.06 0.02 0.01 0.25 0.28 0.08 0.05 0.13 0.2 0.22 0.24 0.29 0.24 0.02 0.23 0.04 0.16 0.05 0.02 0.02 0.02 0.34 0.1 0.09 0.04 0.04 0.06 0.05 0.08 0.04 0.02 0.03 0.04 0.04 0.04 0.04 0.04 0.04 0.04 0.05 0.27 0.15 0.13 1.0 0.25 0.04
LOC_Os08g02110.1 (LOC_Os08g02110)
0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.06 0.0 0.01 0.01 0.04 0.02 0.02 0.66 0.3 0.01 0.15 0.09 0.12 0.01 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.45 1.0 0.17 0.92 0.17 0.01
LOC_Os08g20570.1 (LOC_Os08g20570)
0.03 0.05 0.01 0.0 0.0 0.0 0.16 0.17 0.07 0.01 0.05 0.03 0.39 0.34 0.08 0.08 0.03 0.15 0.09 0.11 0.03 0.02 0.02 0.02 0.1 0.2 0.31 0.03 0.02 0.04 0.03 0.06 0.02 0.02 0.02 0.03 0.02 0.02 0.02 0.0 0.01 0.01 0.01 0.15 0.23 0.17 1.0 0.41 0.05
LOC_Os09g23140.1 (LOC_Os09g23140)
0.04 0.01 0.03 0.0 0.01 0.02 0.01 0.01 0.1 0.03 0.12 0.33 0.13 0.08 0.16 0.24 0.02 0.04 0.36 0.08 0.04 0.04 0.03 0.03 0.05 0.02 0.04 0.05 0.04 0.02 0.02 0.03 0.04 0.04 0.04 0.04 0.02 0.02 0.02 0.05 0.05 0.08 0.09 0.21 0.23 0.09 1.0 0.26 0.01
LOC_Os09g27500.1 (CYP76C4)
0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.01 0.02 0.1 0.04 0.03 0.0 0.0 0.01 0.02 0.42 0.26 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.76 1.0 0.21 0.05 0.03 0.08
LOC_Os09g28730.1 (LOC_Os09g28730)
0.33 0.36 0.1 0.0 0.0 0.01 0.31 0.34 0.8 0.07 0.24 0.01 0.44 0.77 0.77 0.7 0.37 0.35 0.27 0.35 0.04 0.04 0.03 0.05 0.14 0.45 0.16 0.05 0.04 0.05 0.04 0.05 0.03 0.03 0.05 0.04 0.06 0.03 0.04 0.06 0.06 0.07 0.06 0.34 0.17 0.2 1.0 0.81 0.6
0.3 0.4 0.03 0.05 0.01 0.08 0.25 0.23 0.37 0.1 0.25 0.02 0.29 0.47 0.26 0.25 0.06 0.23 0.35 0.29 0.02 0.01 0.02 0.02 0.45 0.21 0.1 0.05 0.01 0.03 0.03 0.02 0.02 0.07 0.02 0.02 0.01 0.02 0.01 0.02 0.02 0.03 0.03 0.27 0.29 0.22 1.0 0.41 0.13
0.03 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.04 0.03 0.14 0.04 0.03 0.0 0.0 0.2 0.26 0.0 0.01 0.22 0.18 0.02 0.03 0.03 0.04 0.16 0.13 0.08 0.02 0.02 0.02 0.02 0.02 0.02 0.02 0.03 0.02 0.02 0.02 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.18 0.15 0.06 1.0 0.76 0.3
0.03 0.12 0.06 0.02 0.02 0.0 0.07 0.08 0.05 0.02 0.04 0.36 0.5 0.4 0.07 0.05 0.04 0.09 0.01 0.17 0.04 0.04 0.04 0.04 0.42 0.12 0.15 0.07 0.06 0.07 0.06 0.08 0.03 0.03 0.02 0.02 0.02 0.03 0.03 0.01 0.02 0.04 0.03 0.14 0.18 0.16 1.0 0.46 0.12
LOC_Os11g25454.1 (LOC_Os11g25454)
0.03 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.08 0.04 0.05 0.12 0.12 0.2 0.21 0.1 0.15 0.03 0.12 0.31 0.16 0.08 0.02 0.1 0.02 0.22 0.1 0.11 0.09 0.09 0.08 0.07 0.08 0.1 0.06 0.08 0.07 0.08 0.07 0.06 0.08 0.08 0.09 0.1 0.21 0.23 0.28 0.39 0.72 1.0
0.22 0.13 0.05 0.31 0.03 0.0 0.16 0.13 0.15 0.14 0.13 0.33 0.26 0.22 0.23 0.23 0.36 0.21 0.14 0.2 0.1 0.07 0.09 0.09 0.06 0.32 0.29 0.15 0.09 0.13 0.1 0.19 0.11 0.09 0.08 0.09 0.09 0.1 0.09 0.18 0.19 0.18 0.21 0.1 0.07 0.19 1.0 0.94 0.42
0.06 0.03 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.01 0.02 0.03 0.01 1.0 0.58 0.0 0.01 0.02 0.05 0.44 0.07 0.28 0.23 0.21 0.22 0.17 0.43 0.18 0.31 0.25 0.2 0.24 0.39 0.23 0.24 0.16 0.23 0.25 0.16 0.13 0.01 0.02 0.01 0.01 0.2 0.25 0.14 0.8 0.55 0.13
LOC_Os12g29950.1 (LOC_Os12g29950)
0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.02 0.01 0.05 0.07 0.01 0.09 0.14 0.31 0.47 0.01 0.09 0.25 0.35 0.02 0.03 0.03 0.03 0.04 0.0 0.04 0.02 0.01 0.01 0.01 0.02 0.02 0.01 0.02 0.03 0.01 0.02 0.02 0.04 0.03 0.07 0.07 0.47 0.26 0.13 1.0 0.66 0.71
0.07 0.09 0.01 0.01 0.0 0.0 0.3 0.25 0.06 0.35 0.28 0.79 0.51 0.47 0.85 0.91 0.04 0.39 0.36 0.31 0.14 0.14 0.12 0.17 0.85 0.21 0.19 0.16 0.12 0.16 0.11 0.2 0.13 0.08 0.08 0.09 0.09 0.13 0.11 0.12 0.13 0.16 0.17 0.39 0.5 0.26 1.0 0.51 0.22
0.04 0.06 0.08 0.0 0.0 0.01 0.39 0.45 0.31 0.03 0.03 0.21 0.28 0.25 0.04 0.05 0.17 0.18 0.05 0.18 0.06 0.07 0.06 0.07 0.07 0.15 0.13 0.05 0.05 0.03 0.03 0.05 0.06 0.03 0.07 0.09 0.07 0.07 0.08 0.06 0.05 0.06 0.06 0.08 0.1 0.08 1.0 0.37 0.1
0.13 0.16 0.03 0.0 0.0 0.02 0.23 0.17 0.2 0.15 0.21 0.75 0.43 0.42 0.62 0.57 0.16 0.47 0.17 0.36 0.17 0.16 0.14 0.16 1.0 0.32 0.38 0.16 0.16 0.24 0.19 0.27 0.17 0.11 0.1 0.13 0.12 0.14 0.21 0.19 0.19 0.2 0.23 0.2 0.41 0.33 0.91 0.31 0.1

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)