Heatmap: Cluster_135 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
Ovule
Ovary
Egg cell
Pollen tricellular
Pollen
Sperm
Flower (buds)
Flower
Panicle
Milk grains
Seeds
Seedling
Seedling (12-day-old, DongJin)
Seedling (12-day-old, DongJin, mutant)
Seedling (22-days-old, 22C)
Seedling (22-days-old, 30C)
Meristem
Stems
Callus
Leaf
Leaf (Azucena)
Leaf (Kinandang puti)
Leaf (Pandan wangi)
Leaf (Tadukan)
Leaf (chilling-treatment, 4C, 33h)
Leaf (drought-stress, 1 day)
Leaf (drought-stress, 3 days)
Leaf (drought-stress, 15 min)
Leaf (drought-stress, 45 min)
Leaf (drought-stress, 90 min)
Leaf (drought-stress, 90 min, recovery 15 min)
Leaf (drought-stress, 90 min, recovery 90 min)
Leaf (drought-stress, 90 min, recovery 210 min)
Leaf (heat-stress, 15 min)
Leaf (heat-stress, 150 min)
Leaf (heat-stress, 210 min)
Leaf (heat-stress, 120 min, recovery 15 min)
Leaf (heat-stress, 120 min, recovery 60 min)
Leaf (heat-stress, 120 min, recovery 120 min)
Leaf (dry season, irrigated field)
Leaf (dry season, rainfed field)
Leaf (wet season, irrigated field)
Leaf (wet season, rainfed field)
Root
Root (heading stage)
Root (tillering stage)
Root (differentiation zone)
Root (elongation zone)
Root (meristematic zone)
LOC_Os01g01180.1 (LOC_Os01g01180)
0.94 5.11 0.17 0.98 0.0 0.0 0.4 0.32 0.0 0.14 0.77 0.17 0.0 0.59 0.0 0.0 0.91 0.69 5.42 0.27 0.0 0.11 0.08 0.0 1.71 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.31 0.0 0.0 99.34 0.0 0.48 0.61 0.0 3.43
0.01 0.15 0.0 0.0 0.0 0.76 0.04 0.04 0.02 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 20.3 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0
LOC_Os01g46390.1 (LOC_Os01g46390)
0.1 0.64 0.71 0.04 0.06 4.25 0.19 0.1 0.35 0.14 0.26 0.08 0.14 0.65 0.0 0.41 0.07 0.1 0.0 0.33 0.04 0.03 0.04 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.1 0.09 0.1 0.0 0.08 0.03 0.14 0.03 0.1 197.03 0.46 0.56 0.0 0.0 0.1
0.9 0.19 0.18 0.09 1.31 0.13 0.1 0.06 0.03 0.01 0.03 0.03 0.04 0.07 0.5 0.53 0.02 0.01 2.11 0.16 0.02 0.05 0.04 0.01 0.19 0.02 0.02 0.0 0.0 0.02 0.0 0.03 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.01 0.01 94.9 0.03 0.13 0.42 0.7 0.21
LOC_Os01g50490.1 (CYP706A5)
0.01 0.15 0.0 8.32 7.34 0.62 1.31 0.96 0.0 0.03 0.01 0.0 0.06 0.04 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 83.09 0.03 0.0 0.0 0.02 0.0
0.01 0.14 0.0 0.12 0.32 0.04 0.0 0.01 0.02 0.01 0.01 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.98 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 34.7 2.62 1.08 3.67 0.14 0.02
LOC_Os01g57390.1 (LOC_Os01g57390)
0.19 0.64 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.09 0.18 0.19 0.06 0.04 0.23 0.12 0.3 0.0 0.5 0.1 0.0 0.02 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 144.09 0.0 0.34 0.0 0.0 0.15
LOC_Os01g64850.1 (LOC_Os01g64850)
0.0 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.04 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 6.01 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0
LOC_Os02g12230.1 (LOC_Os02g12230)
0.0 0.22 0.0 0.0 0.0 1.11 0.0 0.03 0.0 0.0 0.04 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 52.58 0.43 0.32 0.0 0.0 0.0
LOC_Os02g44850.1 (LOC_Os02g44850)
0.03 0.27 0.01 0.0 0.0 0.04 0.01 0.02 0.02 0.03 0.19 0.07 0.04 0.12 0.0 0.0 0.06 0.07 0.16 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.08 0.02 0.09 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 31.83 0.02 0.06 0.42 0.21 0.07
LOC_Os03g38600.1 (LOC_Os03g38600)
0.02 0.16 0.01 0.0 0.0 0.0 0.06 0.06 0.09 0.02 0.02 0.34 0.24 0.14 0.0 0.27 0.0 0.08 5.38 1.14 0.01 0.06 0.02 0.03 0.14 0.05 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.01 0.01 53.94 0.66 0.29 0.0 0.0 0.0
LOC_Os03g57740.1 (LOC_Os03g57740)
0.0 0.1 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.01 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 13.28 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
LOC_Os04g04750.1 (LOC_Os04g04750)
0.01 0.16 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 91.13 0.05 0.07 0.0 0.0 0.0
0.0 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 72.77 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.02 0.19 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 15.25 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
LOC_Os04g47390.1 (LOC_Os04g47390)
0.03 0.22 0.01 0.03 0.04 1.69 0.19 0.15 0.01 0.01 0.03 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 16.08 0.32 0.16 0.0 0.0 0.02
LOC_Os04g55070.1 (LOC_Os04g55070)
0.07 0.26 0.01 0.0 0.13 0.0 0.76 0.61 0.07 0.1 0.13 0.03 0.06 0.06 0.27 0.05 0.01 0.08 0.0 0.05 0.03 0.08 0.04 0.08 0.18 0.0 0.02 0.02 0.0 0.08 0.05 0.08 0.0 0.0 0.03 0.0 0.05 0.02 0.08 0.02 0.02 0.01 0.02 22.25 0.17 0.24 0.13 0.05 0.0
0.02 0.27 0.03 0.0 0.02 1.19 0.0 0.01 0.11 0.05 0.05 0.17 0.01 0.03 0.0 0.0 0.01 0.06 0.08 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 18.46 0.75 0.49 1.38 0.17 0.0
LOC_Os05g22300.1 (LOC_Os05g22300)
0.01 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.04 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 29.28 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
LOC_Os05g49790.1 (LOC_Os05g49790)
0.21 0.63 0.0 0.02 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.59 0.0 0.02 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 89.14 0.22 0.05 0.26 0.0 0.0
LOC_Os06g05340.1 (LOC_Os06g05340)
0.01 0.16 0.01 0.01 0.0 0.0 0.02 0.0 0.02 0.0 0.01 0.01 0.01 0.02 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 4.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
LOC_Os06g20120.1 (LOC_Os06g20120)
0.01 0.23 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.01 0.02 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 8.7 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
LOC_Os06g20140.1 (LOC_Os06g20140)
0.0 0.19 0.17 0.0 0.0 0.01 0.01 0.01 0.01 0.0 0.01 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 66.54 0.02 0.0 0.08 0.0 0.0
LOC_Os06g40070.1 (LOC_Os06g40070)
0.66 0.53 2.75 0.04 0.45 1.73 5.06 0.57 0.29 0.48 1.04 0.09 0.15 0.23 0.0 0.0 0.05 0.47 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.02 0.02 0.0 0.06 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 97.7 2.79 0.82 0.15 0.02 0.03
LOC_Os07g07170.1 (LOC_Os07g07170)
0.01 0.08 0.01 0.0 0.11 0.07 0.01 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 3.28 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.5 0.52 0.12 0.04 0.33 0.16 0.64 0.48 0.2 0.35 0.28 0.15 0.31 0.19 0.06 0.06 0.32 0.35 0.61 0.26 0.05 0.05 0.08 0.07 0.26 0.14 0.7 0.03 0.04 0.0 0.05 0.08 0.1 0.04 0.12 0.0 0.03 0.07 0.14 0.04 0.1 0.08 0.13 66.78 0.12 0.15 0.44 0.2 0.74
LOC_Os08g34249.1 (LOC_Os08g34249)
0.19 1.28 0.0 0.0 0.0 0.0 5.25 6.05 0.97 2.41 0.73 0.0 0.51 2.74 0.0 0.0 0.0 1.59 0.0 0.21 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 3.95 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 440.92 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
LOC_Os08g34258.1 (LOC_Os08g34258)
0.19 1.28 0.0 0.0 0.0 0.0 5.25 6.05 0.97 2.41 0.73 0.0 0.51 2.74 0.0 0.0 0.0 1.59 0.0 0.21 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 3.95 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 440.92 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.06 0.33 0.21 0.49 0.09 0.04 0.52 0.82 0.13 0.02 0.11 0.0 0.24 0.21 0.0 0.0 0.01 0.19 0.0 0.19 0.06 0.0 0.05 0.0 0.0 0.04 0.01 0.01 0.04 0.09 0.0 0.09 0.04 0.0 0.0 0.02 0.04 0.01 0.05 0.06 0.15 0.12 0.14 15.9 0.0 0.0 0.49 0.69 0.05
LOC_Os09g39090.1 (LOC_Os09g39090)
0.0 0.21 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.02 0.02 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 13.15 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0
LOC_Os09g39100.1 (LOC_Os09g39100)
0.02 0.16 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 8.61 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0
0.06 0.41 1.13 0.0 0.0 0.0 0.03 0.14 0.01 0.08 0.15 0.0 0.12 1.41 0.0 0.0 0.45 0.03 0.0 0.02 0.0 0.02 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 118.78 0.0 0.0 0.11 0.1 0.08
0.11 0.2 0.02 0.0 0.0 0.0 0.02 0.03 0.04 0.01 0.02 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.05 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 58.44 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03
0.3 0.35 0.17 0.01 0.0 0.03 1.13 0.7 0.51 0.32 1.02 0.13 0.24 2.81 0.0 0.1 1.19 0.06 2.84 0.05 0.0 0.01 0.05 0.0 0.21 0.0 0.0 0.1 0.07 0.0 0.0 0.05 0.0 0.18 0.0 0.04 0.0 0.11 0.04 0.01 0.02 0.02 0.01 381.93 0.04 0.0 1.61 0.88 1.08
0.0 0.21 0.0 0.0 0.15 0.01 0.0 0.04 0.0 0.02 0.01 0.04 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 42.76 0.48 0.12 0.23 0.0 0.0
0.0 0.18 0.01 0.01 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.11 0.27 0.03 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 31.43 0.11 0.18 0.05 0.0 0.05
LOC_Os10g34040.1 (LOC_Os10g34040)
0.01 0.17 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.06 0.0 0.01 0.03 1.65 0.78 0.07 0.1 0.01 0.04 0.56 0.37 0.01 0.02 0.01 0.01 0.07 0.05 0.03 0.02 0.0 0.0 0.0 0.03 0.02 0.02 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.04 0.03 0.04 0.03 26.44 0.89 0.89 0.11 0.0 0.0
0.0 0.19 0.02 0.0 0.0 0.06 0.01 0.01 0.0 0.01 0.01 0.1 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 4.7 0.32 0.08 0.48 0.26 0.02
LOC_Os11g14080.1 (LOC_Os11g14080)
0.01 0.12 0.09 0.0 0.0 0.0 0.07 0.04 0.05 0.03 0.01 0.02 0.04 0.02 0.0 0.0 0.02 0.02 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.03 0.41 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.03 0.04 11.23 0.05 0.04 0.03 0.0 0.0
0.01 0.12 0.0 0.0 0.01 0.01 0.02 0.01 0.0 0.01 0.02 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.03 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 3.88 0.01 0.02 0.13 0.02 0.0
0.01 0.1 0.01 0.0 0.0 0.0 0.12 0.22 0.31 0.14 0.12 8.44 0.0 0.04 0.0 0.05 0.03 0.01 0.34 0.03 0.01 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 390.27 19.46 9.05 0.07 0.0 0.0
LOC_Os12g01040.1 (EXO70H6)
0.01 0.18 0.0 0.0 0.0 0.01 0.03 0.09 0.12 0.02 0.08 0.07 0.03 0.18 0.2 0.07 0.0 0.05 0.0 0.07 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 21.05 0.21 0.1 0.04 0.02 0.0
LOC_Os12g04350.1 (LOC_Os12g04350)
0.0 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.04 0.19 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 3.94 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0
0.47 3.43 0.04 0.0 0.0 0.06 0.84 0.77 0.0 0.13 0.17 0.02 0.43 3.2 0.03 0.0 0.09 1.28 0.0 0.62 0.1 0.16 0.06 0.09 2.75 0.0 0.0 0.16 0.36 0.15 0.19 0.08 0.13 0.26 0.1 0.14 0.1 0.02 0.14 0.32 0.36 0.51 0.68 180.27 0.01 0.65 21.6 4.44 0.02

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)