Heatmap: Cluster_50 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Ovule
Ovary
Egg cell
Pollen tricellular
Pollen
Sperm
Flower (buds)
Flower
Panicle
Milk grains
Seeds
Seedling
Seedling (12-day-old, DongJin)
Seedling (12-day-old, DongJin, mutant)
Seedling (22-days-old, 22C)
Seedling (22-days-old, 30C)
Meristem
Stems
Callus
Leaf
Leaf (Azucena)
Leaf (Kinandang puti)
Leaf (Pandan wangi)
Leaf (Tadukan)
Leaf (chilling-treatment, 4C, 33h)
Leaf (drought-stress, 1 day)
Leaf (drought-stress, 3 days)
Leaf (drought-stress, 15 min)
Leaf (drought-stress, 45 min)
Leaf (drought-stress, 90 min)
Leaf (drought-stress, 90 min, recovery 15 min)
Leaf (drought-stress, 90 min, recovery 90 min)
Leaf (drought-stress, 90 min, recovery 210 min)
Leaf (heat-stress, 15 min)
Leaf (heat-stress, 150 min)
Leaf (heat-stress, 210 min)
Leaf (heat-stress, 120 min, recovery 15 min)
Leaf (heat-stress, 120 min, recovery 60 min)
Leaf (heat-stress, 120 min, recovery 120 min)
Leaf (dry season, irrigated field)
Leaf (dry season, rainfed field)
Leaf (wet season, irrigated field)
Leaf (wet season, rainfed field)
Root
Root (heading stage)
Root (tillering stage)
Root (differentiation zone)
Root (elongation zone)
Root (meristematic zone)
LOC_Os01g10090.1 (LOC_Os01g10090)
0.9 0.77 0.04 0.36 0.08 1.0 0.57 0.6 0.21 0.21 0.26 0.08 0.14 0.19 0.07 0.13 0.41 0.1 0.17 0.26 0.04 0.04 0.04 0.03 0.41 0.04 0.19 0.02 0.04 0.04 0.02 0.02 0.03 0.02 0.01 0.04 0.04 0.08 0.01 0.02 0.03 0.03 0.03 0.21 0.15 0.13 0.16 0.32 0.51
0.03 0.02 0.07 0.09 0.09 0.74 0.12 0.1 0.25 0.01 0.03 0.07 0.08 0.12 0.0 0.0 0.05 0.28 0.06 0.01 0.02 0.03 0.02 0.03 0.01 0.02 0.02 0.03 0.02 0.02 0.01 0.01 0.02 0.01 0.01 0.01 0.02 0.02 0.02 0.0 0.0 0.01 0.0 0.02 0.03 0.17 1.0 0.77 0.14
LOC_Os01g48570.1 (LOC_Os01g48570)
0.01 0.01 0.0 0.01 0.0 0.35 0.01 0.01 0.07 0.0 0.0 0.05 0.05 0.08 0.0 0.0 0.0 0.09 0.02 0.0 0.02 0.02 0.02 0.02 0.01 0.0 0.0 0.04 0.03 0.03 0.02 0.02 0.01 0.0 0.02 0.02 0.04 0.04 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.07 0.12 1.0 0.06 0.0
LOC_Os01g49440.1 (LOC_Os01g49440)
0.36 0.16 0.07 0.01 0.01 1.0 0.03 0.03 0.04 0.0 0.02 0.0 0.04 0.05 0.02 0.02 0.03 0.08 0.04 0.06 0.0 0.01 0.0 0.0 0.09 0.03 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.05 0.05 0.07 0.08 0.05
0.18 0.39 0.18 0.01 0.02 1.0 0.18 0.18 0.19 0.02 0.07 0.17 0.11 0.16 0.03 0.02 0.15 0.09 0.22 0.08 0.01 0.02 0.01 0.02 0.02 0.01 0.02 0.01 0.02 0.02 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.02 0.01 0.01 0.02 0.01 0.01 0.01 0.01 0.12 0.15 0.39 0.88 0.56 0.42
LOC_Os01g59880.1 (LOC_Os01g59880)
0.28 0.14 0.07 0.54 0.39 0.48 0.14 0.24 0.06 0.01 0.04 0.11 0.07 0.09 0.02 0.01 0.24 0.06 0.18 0.02 0.01 0.02 0.02 0.02 0.02 0.01 0.01 0.01 0.01 0.02 0.02 0.02 0.02 0.0 0.01 0.02 0.02 0.01 0.02 0.0 0.0 0.01 0.01 0.03 0.06 0.13 1.0 0.71 0.33
LOC_Os02g01610.1 (LOC_Os02g01610)
0.65 0.39 0.17 0.03 0.06 1.0 0.28 0.35 0.3 0.06 0.09 0.14 0.23 0.25 0.03 0.01 0.41 0.08 0.14 0.28 0.03 0.01 0.02 0.03 0.04 0.08 0.16 0.02 0.02 0.03 0.03 0.03 0.02 0.01 0.03 0.06 0.04 0.04 0.07 0.01 0.02 0.01 0.02 0.18 0.21 0.2 0.23 0.21 0.6
LOC_Os02g48350.1 (LOC_Os02g48350)
0.85 0.26 0.26 0.01 0.06 0.95 0.22 0.23 0.21 0.18 0.16 0.33 0.23 0.29 0.13 0.08 0.22 0.17 0.1 0.06 0.03 0.03 0.03 0.05 0.06 0.34 0.1 0.03 0.03 0.03 0.02 0.03 0.03 0.09 0.05 0.06 0.07 0.03 0.02 0.01 0.01 0.02 0.02 0.11 0.47 0.48 1.0 0.52 0.22
0.04 0.36 0.04 0.0 0.02 0.7 0.04 0.04 0.03 0.0 0.07 0.04 0.02 0.02 0.01 0.0 0.0 0.03 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.22 0.2 0.17 1.0 0.45 0.04
0.01 0.05 0.04 0.03 0.01 0.43 0.08 0.04 0.02 0.01 0.03 0.03 0.04 0.03 0.01 0.0 0.0 0.05 0.01 0.0 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.0 0.0 0.01 0.01 0.01 0.01 0.03 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.03 1.0 0.24 0.0
LOC_Os03g18390.1 (LOC_Os03g18390)
0.67 0.2 0.16 0.04 0.04 1.0 0.09 0.06 0.03 0.03 0.05 0.01 0.05 0.08 0.02 0.0 0.13 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.02 0.01 0.0
0.0 0.0 0.01 0.24 0.21 0.75 0.11 0.1 0.03 0.01 0.03 0.01 0.06 0.09 0.02 0.01 0.0 0.14 0.0 0.01 0.01 0.02 0.01 0.01 0.04 0.01 0.0 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.0 0.0 0.01 0.01 0.01 0.03 0.07 1.0 0.41 0.01
0.01 0.01 0.0 0.01 0.03 0.65 0.04 0.04 0.13 0.01 0.01 0.05 0.02 0.03 0.04 0.02 0.0 0.04 0.07 0.01 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.02 0.02 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.01 0.01 0.0 0.01 0.0 0.01 0.07 0.17 0.14 1.0 0.62 0.24
LOC_Os03g64130.1 (LOC_Os03g64130)
0.01 0.07 0.0 0.0 0.01 0.42 0.13 0.14 0.02 0.0 0.02 0.02 0.07 0.17 0.05 0.1 0.03 0.12 0.13 0.01 0.02 0.02 0.02 0.02 0.01 0.01 0.0 0.05 0.01 0.0 0.02 0.01 0.02 0.0 0.02 0.02 0.02 0.02 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.04 0.06 0.07 1.0 0.55 0.17
0.34 0.37 0.25 0.01 0.02 1.0 0.27 0.27 0.29 0.16 0.24 0.32 0.22 0.22 0.21 0.19 0.17 0.21 0.18 0.22 0.1 0.12 0.11 0.1 0.05 0.19 0.22 0.11 0.08 0.06 0.05 0.11 0.1 0.06 0.08 0.12 0.11 0.08 0.09 0.08 0.1 0.12 0.13 0.17 0.32 0.46 0.64 0.58 0.48
0.2 0.16 0.18 0.15 0.16 0.5 0.28 0.25 0.14 0.02 0.07 0.02 0.22 0.21 0.01 0.0 0.17 0.23 0.08 0.03 0.02 0.02 0.02 0.02 0.02 0.0 0.0 0.03 0.02 0.03 0.02 0.01 0.01 0.01 0.01 0.02 0.02 0.02 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.02 0.12 1.0 0.5 0.17
LOC_Os05g44916.1 (MPPalpha)
0.32 0.18 0.22 0.27 0.11 0.85 0.25 0.3 0.11 0.12 0.15 0.19 0.21 0.22 0.04 0.04 0.39 0.15 0.12 0.14 0.06 0.02 0.06 0.02 0.02 0.13 0.14 0.06 0.05 0.05 0.04 0.08 0.08 0.04 0.06 0.06 0.07 0.06 0.07 0.03 0.06 0.03 0.06 0.12 0.22 0.08 0.62 1.0 0.81
LOC_Os06g48630.1 (LOC_Os06g48630)
0.01 0.02 0.01 0.01 0.05 1.0 0.02 0.01 0.03 0.02 0.03 0.03 0.02 0.02 0.05 0.06 0.01 0.01 0.34 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.02 0.04 0.82 0.47 0.13
LOC_Os07g08510.1 (LOC_Os07g08510)
0.46 0.4 0.19 0.0 0.06 1.0 0.02 0.03 0.14 0.2 0.09 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.06 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.03 0.05 0.0 0.02 0.02
0.24 0.16 0.03 0.0 0.07 1.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.03 0.11 0.0 0.01 0.0 0.0 0.02 0.01 0.0 0.0 0.02 0.02 0.02 0.01 0.0 0.0 0.0 0.04 0.01 0.02 0.02 0.06 0.02 0.03 0.05 0.02 0.01 0.04 0.02 0.01 0.02 0.02 0.02 0.0 0.0 0.01 0.02 0.02 0.24
LOC_Os08g36370.1 (LOC_Os08g36370)
0.07 0.15 0.06 0.27 0.08 1.0 0.06 0.07 0.05 0.06 0.09 0.02 0.04 0.08 0.0 0.02 0.02 0.03 0.03 0.07 0.02 0.01 0.02 0.02 0.02 0.09 0.06 0.01 0.01 0.02 0.01 0.03 0.01 0.0 0.02 0.03 0.03 0.02 0.04 0.03 0.04 0.04 0.04 0.05 0.05 0.03 0.55 0.74 0.94
LOC_Os08g43760.1 (LOC_Os08g43760)
0.32 0.08 0.07 0.09 0.1 0.94 0.08 0.08 0.08 0.02 0.04 0.08 0.05 0.04 0.01 0.0 0.12 0.04 0.12 0.02 0.01 0.01 0.0 0.01 0.0 0.03 0.05 0.0 0.01 0.01 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.07 0.09 1.0 0.65 0.09
LOC_Os08g43770.1 (LOC_Os08g43770)
0.12 0.03 0.1 0.03 0.03 0.5 0.03 0.03 0.02 0.0 0.02 0.04 0.01 0.02 0.0 0.0 0.06 0.02 0.05 0.01 0.0 0.01 0.01 0.01 0.0 0.01 0.01 0.01 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.02 0.06 0.71 0.9 1.0
LOC_Os08g43790.1 (LOC_Os08g43790)
0.58 0.1 0.09 0.21 0.4 0.66 0.15 0.21 0.15 0.06 0.07 0.17 0.17 0.11 0.06 0.06 0.34 0.11 0.21 0.17 0.01 0.02 0.02 0.05 0.02 0.14 0.09 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.02 0.01 0.01 0.08 0.21 0.15 0.63 1.0 0.86
LOC_Os08g43810.1 (LOC_Os08g43810)
0.21 0.04 0.04 0.09 0.13 0.34 0.05 0.1 0.03 0.02 0.03 0.06 0.1 0.06 0.02 0.02 0.17 0.04 0.06 0.07 0.01 0.01 0.01 0.02 0.01 0.05 0.04 0.01 0.01 0.0 0.01 0.01 0.01 0.0 0.01 0.02 0.0 0.0 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.04 0.03 0.07 0.55 0.69 1.0
LOC_Os08g43815.1 (LOC_Os08g43815)
0.41 0.06 0.1 0.15 0.62 0.7 0.18 0.22 0.07 0.06 0.05 0.12 0.19 0.12 0.04 0.01 0.27 0.08 0.04 0.15 0.02 0.01 0.02 0.01 0.0 0.19 0.19 0.02 0.01 0.01 0.01 0.02 0.03 0.04 0.01 0.04 0.04 0.02 0.03 0.01 0.01 0.01 0.02 0.07 0.12 0.09 1.0 0.54 0.38
LOC_Os08g43850.1 (LOC_Os08g43850)
0.3 0.07 0.12 0.1 0.16 0.87 0.09 0.1 0.15 0.04 0.05 0.11 0.07 0.05 0.04 0.05 0.15 0.08 0.04 0.06 0.02 0.03 0.02 0.02 0.02 0.09 0.05 0.03 0.01 0.02 0.01 0.03 0.03 0.0 0.04 0.04 0.02 0.01 0.01 0.03 0.04 0.03 0.04 0.03 0.12 0.31 0.86 1.0 0.71
LOC_Os08g43860.1 (LOC_Os08g43860)
0.16 0.03 0.04 0.02 0.01 0.21 0.03 0.03 0.08 0.01 0.02 0.06 0.02 0.01 0.01 0.01 0.09 0.03 0.06 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.06 0.12 0.76 1.0 0.79
LOC_Os08g43870.1 (LOC_Os08g43870)
0.38 0.06 0.08 0.1 0.29 0.9 0.1 0.12 0.08 0.03 0.04 0.13 0.12 0.06 0.04 0.03 0.16 0.07 0.06 0.11 0.02 0.02 0.01 0.02 0.01 0.15 0.12 0.02 0.01 0.02 0.01 0.02 0.02 0.0 0.01 0.02 0.01 0.01 0.02 0.01 0.02 0.02 0.03 0.04 0.1 0.21 1.0 0.99 1.0
LOC_Os08g43880.1 (LOC_Os08g43880)
0.5 0.13 0.1 0.11 0.01 1.0 0.07 0.1 0.08 0.02 0.04 0.03 0.02 0.01 0.02 0.07 0.18 0.03 0.08 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.06 0.06 0.06 0.03
LOC_Os08g43890.1 (LOC_Os08g43890)
0.66 0.11 0.05 0.08 0.01 0.76 0.04 0.1 0.11 0.03 0.06 0.05 0.01 0.0 0.03 0.0 0.24 0.03 0.04 0.02 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.03 0.04 1.0 0.69 0.32
LOC_Os08g43900.1 (LOC_Os08g43900)
1.0 0.18 0.13 0.11 0.04 0.56 0.09 0.15 0.36 0.05 0.07 0.12 0.02 0.03 0.01 0.08 0.33 0.06 0.15 0.04 0.0 0.03 0.0 0.02 0.0 0.02 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.02 0.03 0.11 0.91 0.77 0.92
LOC_Os08g43910.1 (LOC_Os08g43910)
0.95 0.23 0.09 0.08 0.02 0.27 0.12 0.13 0.27 0.04 0.06 0.12 0.03 0.02 0.12 0.16 0.29 0.07 0.06 0.04 0.0 0.02 0.0 0.03 0.0 0.01 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.02 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.02 0.03 0.1 1.0 0.61 0.62
LOC_Os08g43920.1 (LOC_Os08g43920)
0.2 0.04 0.04 0.04 0.02 0.37 0.05 0.05 0.05 0.01 0.02 0.06 0.01 0.02 0.02 0.02 0.09 0.04 0.07 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.13 0.82 0.99 1.0
LOC_Os08g43930.1 (LOC_Os08g43930)
0.38 0.08 0.06 0.05 0.08 0.87 0.08 0.09 0.09 0.02 0.05 0.06 0.05 0.05 0.06 0.02 0.14 0.07 0.1 0.02 0.01 0.02 0.01 0.02 0.0 0.03 0.01 0.01 0.01 0.01 0.0 0.01 0.02 0.0 0.0 0.01 0.02 0.0 0.01 0.0 0.01 0.01 0.02 0.01 0.02 0.17 1.0 0.82 0.76
LOC_Os08g43940.1 (LOC_Os08g43940)
0.28 0.05 0.05 0.03 0.02 0.2 0.03 0.05 0.04 0.01 0.02 0.05 0.03 0.02 0.01 0.0 0.06 0.04 0.15 0.01 0.01 0.01 0.01 0.0 0.0 0.01 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.01 0.01 0.0 0.01 0.01 0.01 0.0 0.01 0.19 0.73 0.96 1.0
LOC_Os08g43950.1 (LOC_Os08g43950)
0.29 0.11 0.1 0.06 0.07 0.78 0.1 0.1 0.06 0.04 0.03 0.08 0.06 0.04 0.04 0.04 0.17 0.05 0.21 0.03 0.01 0.01 0.0 0.01 0.0 0.02 0.02 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.01 0.01 0.01 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.02 0.18 0.37 0.81 1.0
LOC_Os09g18010.1 (LOC_Os09g18010)
0.0 0.04 0.0 0.01 0.01 0.46 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.08 0.01 1.0 0.13 0.0
0.0 0.01 0.17 0.07 0.04 0.72 0.04 0.07 0.0 0.01 0.01 0.07 0.01 0.01 0.02 0.01 0.01 0.0 0.0 0.03 0.0 0.01 0.02 0.0 0.0 0.03 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.13 0.04 1.0 0.28 0.02
LOC_Os10g22570.1 (LOC_Os10g22570)
0.15 0.06 0.03 0.02 0.04 0.71 0.08 0.08 0.05 0.07 0.07 0.05 0.17 0.11 0.08 0.06 0.16 0.09 0.16 0.13 0.0 0.03 0.0 0.03 0.14 0.08 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.25 0.48 1.0 0.69 0.56
0.3 0.24 0.23 0.13 0.2 1.0 0.18 0.18 0.25 0.08 0.15 0.22 0.24 0.21 0.11 0.09 0.32 0.16 0.35 0.17 0.06 0.08 0.08 0.08 0.16 0.12 0.12 0.05 0.05 0.07 0.05 0.07 0.05 0.04 0.06 0.07 0.06 0.13 0.13 0.11 0.15 0.1 0.11 0.15 0.07 0.14 0.38 0.98 0.68
LOC_Os12g07990.1 (LOC_Os12g07990)
0.14 0.09 0.02 0.19 0.08 0.78 0.06 0.06 0.02 0.05 0.06 0.03 0.02 0.02 0.01 0.01 0.05 0.01 0.04 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.01 0.0 0.03 0.01 0.02 0.0 0.02 0.0 0.02 0.01 0.01 0.0 0.01 0.01 0.02 0.01 0.11 0.19 0.11 1.0 0.91 0.15
LOC_Os12g24519.1 (LOC_Os12g24519)
0.24 0.16 0.0 0.0 0.04 1.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.02 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.04 0.04 0.0 0.06 0.01 0.02 0.01 0.02 0.01 0.06 0.0 0.02 0.03 0.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)