Heatmap: Cluster_62 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Ovule
Ovary
Egg cell
Pollen tricellular
Pollen
Sperm
Flower (buds)
Flower
Panicle
Milk grains
Seeds
Seedling
Seedling (12-day-old, DongJin)
Seedling (12-day-old, DongJin, mutant)
Seedling (22-days-old, 22C)
Seedling (22-days-old, 30C)
Meristem
Stems
Callus
Leaf
Leaf (Azucena)
Leaf (Kinandang puti)
Leaf (Pandan wangi)
Leaf (Tadukan)
Leaf (chilling-treatment, 4C, 33h)
Leaf (drought-stress, 1 day)
Leaf (drought-stress, 3 days)
Leaf (drought-stress, 15 min)
Leaf (drought-stress, 45 min)
Leaf (drought-stress, 90 min)
Leaf (drought-stress, 90 min, recovery 15 min)
Leaf (drought-stress, 90 min, recovery 90 min)
Leaf (drought-stress, 90 min, recovery 210 min)
Leaf (heat-stress, 15 min)
Leaf (heat-stress, 150 min)
Leaf (heat-stress, 210 min)
Leaf (heat-stress, 120 min, recovery 15 min)
Leaf (heat-stress, 120 min, recovery 60 min)
Leaf (heat-stress, 120 min, recovery 120 min)
Leaf (dry season, irrigated field)
Leaf (dry season, rainfed field)
Leaf (wet season, irrigated field)
Leaf (wet season, rainfed field)
Root
Root (heading stage)
Root (tillering stage)
Root (differentiation zone)
Root (elongation zone)
Root (meristematic zone)
0.01 0.03 0.0 0.0 0.0 0.01 0.03 0.02 0.0 0.01 0.15 0.0 0.03 0.05 0.13 0.17 0.01 0.02 0.01 0.21 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.07 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.01 1.0 0.03 0.02 0.01 0.0 0.0
LOC_Os01g43740.1 (CYP72A13)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.63 0.01 0.01 0.01 0.06 0.0 0.0 0.03 0.06 0.03 0.02 0.02 0.01 1.0 0.03 0.04 0.03 0.03 0.03 0.03 0.07 0.03 0.05 0.02 0.02 0.02 0.03 0.02 0.05 0.03 0.01 0.01 0.06 0.02 0.01 0.02 0.01 0.0
0.0 0.04 0.0 0.0 0.01 0.0 0.63 0.0 0.03 0.06 0.16 0.5 0.31 0.56 0.05 0.33 0.01 0.51 0.11 0.07 0.04 0.06 0.03 0.04 0.16 0.06 0.16 0.02 0.1 0.14 0.04 0.07 0.04 0.03 0.03 0.07 0.01 0.03 0.01 0.01 0.01 0.01 0.0 1.0 0.5 0.71 0.25 0.02 0.0
0.28 0.47 0.21 0.14 0.08 0.14 1.0 0.86 0.33 0.55 0.69 0.65 0.63 0.61 0.38 0.4 0.25 0.47 0.83 0.59 0.07 0.05 0.06 0.06 0.31 0.39 0.94 0.04 0.06 0.06 0.06 0.13 0.06 0.05 0.04 0.09 0.05 0.07 0.07 0.04 0.05 0.05 0.05 0.79 0.51 0.43 0.41 0.52 0.39
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.09 0.0 0.03 0.02 0.23 0.77 1.0 0.15 0.22 0.07 0.29 0.15 0.25 0.0 0.0 0.01 0.0 0.02 0.02 0.27 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.05 0.01 0.94 0.81 0.86 0.01 0.0 0.0
LOC_Os02g02650.1 (LOC_Os02g02650)
0.14 0.26 0.14 0.0 0.0 0.11 0.16 0.11 0.02 0.03 0.05 0.14 0.0 0.02 0.0 0.0 0.21 0.1 0.46 0.03 0.01 0.02 0.02 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.03 0.0 0.08 0.06 0.03 0.0 0.03 0.02 0.03 0.02 0.04 1.0 0.34 0.16 0.23 0.09 0.17
0.01 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.26 0.13 0.01 0.06 0.09 0.05 0.04 0.08 0.11 0.1 0.02 0.04 0.17 0.22 0.29 0.05 0.25 0.05 0.2 0.05 0.33 0.22 0.19 0.32 0.34 0.32 0.24 0.01 0.01 0.11 0.01 0.17 0.03 0.01 0.01 0.0 0.01 0.35 0.7 1.0 0.59 0.05 0.01
LOC_Os02g48870.1 (LOC_Os02g48870)
0.01 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.31 0.2 0.09 0.01 0.02 0.01 0.21 0.45 0.02 0.04 0.01 0.16 0.02 0.04 0.01 0.01 0.01 0.01 0.14 0.01 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.2 0.34 0.64 1.0 0.06 0.0
LOC_Os02g51900.1 (UGT85A2)
0.03 0.05 0.02 0.0 0.0 0.0 0.02 0.02 0.03 0.01 0.02 0.05 0.16 0.07 0.17 0.37 0.02 0.13 0.0 1.0 0.05 0.09 0.04 0.08 0.42 0.52 0.2 0.01 0.06 0.03 0.04 0.04 0.01 0.04 0.09 0.14 0.09 0.08 0.09 0.01 0.01 0.02 0.01 0.52 0.17 0.11 0.02 0.01 0.0
LOC_Os02g57760.1 (LOC_Os02g57760)
0.23 0.59 0.03 0.01 0.0 0.03 0.29 0.28 0.39 0.02 0.14 0.01 0.48 0.6 0.12 0.15 0.34 0.37 0.38 0.31 0.06 0.06 0.04 0.06 0.69 0.12 0.05 0.07 0.05 0.1 0.08 0.08 0.06 0.03 0.03 0.06 0.03 0.05 0.04 0.05 0.04 0.06 0.06 0.29 0.26 0.1 0.19 0.43 1.0
LOC_Os04g02410.1 (LOC_Os04g02410)
0.72 1.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.35 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.21 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.0 0.0 0.0
LOC_Os04g08200.1 (LOC_Os04g08200)
0.03 0.05 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.02 0.03 0.0 0.0 0.11 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.05 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.03 0.1 0.63 1.0 0.35
0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.5 0.64 0.08 0.01 0.03 0.29 0.0 0.01 0.34 0.06 0.06 0.03 0.03 0.05 0.08 0.0 0.0 0.09 0.05 0.06 0.05 0.06 0.05 0.06 0.06 0.03 0.03 0.03 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.2 1.0 0.28 0.28 0.04 0.04
LOC_Os04g38530.1 (LOC_Os04g38530)
0.26 0.1 0.05 0.0 0.0 0.0 0.22 0.16 0.15 0.08 0.16 0.24 0.41 0.39 0.13 0.05 0.06 0.1 0.13 0.22 0.01 0.01 0.01 0.01 0.11 0.02 0.04 0.0 0.02 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.09 0.14 0.69 1.0 0.43
0.01 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.04 0.01 0.04 0.06 0.03 0.34 0.25 0.43 0.24 0.01 0.6 0.09 0.3 0.01 0.04 0.01 0.03 0.08 0.03 1.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.01 0.01 0.02 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.2 0.23 0.25 0.0 0.0 0.0
0.66 1.0 0.58 0.0 0.0 0.0 0.02 0.03 1.0 0.0 0.12 0.08 0.25 0.41 0.0 0.0 0.65 0.3 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.04 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.06 0.07 0.18 0.06
0.0 0.19 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.06 0.0 0.03 0.09 0.51 0.76 0.0 0.0 0.53 0.04 0.0 0.24 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.02 0.77 1.0 0.28 0.0 0.0
0.21 0.14 0.02 0.0 0.0 0.08 0.94 0.37 0.29 0.09 0.09 0.38 0.44 0.52 0.07 0.1 0.48 0.46 0.11 0.53 0.07 0.1 0.07 0.1 0.03 0.08 0.41 0.07 0.07 0.05 0.03 0.04 0.07 0.03 0.04 0.06 0.05 0.07 0.07 0.02 0.02 0.04 0.03 1.0 0.28 0.24 0.37 0.48 0.2
LOC_Os05g39220.1 (LOC_Os05g39220)
0.19 1.0 0.01 0.24 0.65 0.21 0.05 0.14 0.5 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
LOC_Os05g48000.1 (LOC_Os05g48000)
0.03 0.06 0.05 0.0 0.0 0.06 0.04 0.06 0.0 0.1 0.09 0.04 0.4 0.17 0.0 0.1 0.0 0.17 0.0 0.06 0.01 0.01 0.01 0.0 0.0 0.04 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.02 0.0 0.02 0.0 0.02 0.0 0.0 0.01 0.01 0.01 0.04 0.14 0.65 0.39 1.0 0.31 0.06
LOC_Os06g11830.1 (LOC_Os06g11830)
0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.01 0.06 0.04 0.01 0.02 0.03 0.0 0.95 1.0 0.0 0.0 0.03 0.24 0.0 0.23 0.05 0.0 0.03 0.0 0.01 0.0 0.0 0.02 0.02 0.02 0.03 0.09 0.03 0.01 0.04 0.03 0.04 0.07 0.06 0.01 0.02 0.03 0.03 0.52 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
LOC_Os06g13220.1 (LOC_Os06g13220)
0.11 0.11 0.08 0.01 0.0 0.0 0.34 0.34 0.13 0.15 0.29 1.0 0.32 0.31 0.53 0.54 0.11 0.23 0.69 0.45 0.17 0.12 0.14 0.12 0.29 0.42 0.32 0.23 0.11 0.18 0.14 0.35 0.16 0.12 0.11 0.14 0.09 0.15 0.12 0.15 0.15 0.2 0.19 0.49 0.56 0.28 0.21 0.09 0.09
LOC_Os06g18820.1 (LOC_Os06g18820)
0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.02 0.04 0.03 0.01 0.02 0.06 0.18 0.03 0.03 0.38 0.41 0.01 0.05 0.02 0.33 0.04 0.03 0.04 0.04 0.22 0.27 1.0 0.03 0.02 0.03 0.02 0.06 0.05 0.02 0.03 0.04 0.03 0.04 0.04 0.04 0.08 0.05 0.07 0.44 0.2 0.08 0.01 0.0 0.0
0.01 0.09 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.01 0.01 0.03 0.11 0.07 0.02 0.01 0.04 0.07 0.0 0.01 0.58 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.02 0.0 0.03 0.01 0.02 0.01 0.0 0.01 0.0 0.09 0.1 0.09 0.04 0.06 0.12
0.11 0.29 0.0 0.01 0.03 0.25 0.0 0.0 0.13 0.0 0.08 0.2 0.89 1.0 0.0 0.0 0.71 0.29 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
LOC_Os06g47440.1 (LOC_Os06g47440)
0.01 0.05 1.0 0.01 0.6 0.1 0.05 0.07 0.0 0.01 0.01 0.0 0.01 0.05 0.0 0.0 0.06 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.15 0.11
LOC_Os07g15340.1 (LOC_Os07g15340)
0.01 0.03 0.01 0.0 0.0 0.01 0.02 0.01 0.0 0.02 0.11 0.0 0.28 1.0 0.0 0.0 0.11 0.1 0.0 0.32 0.05 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.02 0.04 0.0 0.02 0.01 0.12 0.0 0.05 0.03 0.03 0.05 0.02 0.04 0.29 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
LOC_Os08g04490.1 (LOC_Os08g04490)
0.18 0.76 0.01 0.0 0.0 0.17 0.0 0.0 0.53 0.02 0.05 0.32 0.09 0.08 0.13 1.0 0.01 0.4 0.0 0.16 0.05 0.06 0.04 0.12 0.27 0.18 0.0 0.31 0.0 0.17 0.09 0.15 0.13 0.0 0.0 0.11 0.17 0.0 0.08 0.18 0.31 0.22 0.58 0.02 0.09 0.04 0.0 0.0 0.0
LOC_Os08g14460.1 (LOC_Os08g14460)
0.75 0.37 0.33 0.06 0.02 1.0 0.14 0.1 0.86 0.04 0.13 0.27 0.23 0.29 0.08 0.07 0.62 0.28 0.46 0.1 0.06 0.07 0.05 0.06 0.1 0.1 0.08 0.07 0.04 0.07 0.04 0.07 0.06 0.03 0.04 0.06 0.06 0.07 0.05 0.03 0.04 0.04 0.05 0.11 0.1 0.2 0.23 0.61 0.41
LOC_Os08g37345.1 (LOC_Os08g37345)
0.2 0.96 0.02 0.03 0.07 0.01 0.07 0.11 0.14 0.11 0.67 0.01 0.44 0.74 0.01 0.01 0.1 0.17 1.0 0.08 0.01 0.01 0.01 0.01 0.11 0.01 0.02 0.01 0.0 0.01 0.03 0.02 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.08 0.09 0.07 0.01 0.02 0.01
0.0 0.01 0.01 0.01 0.02 1.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.04 0.26 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
LOC_Os09g20170.1 (LOC_Os09g20170)
0.0 0.13 0.88 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.04 0.0 0.03 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.28 0.42 1.0 0.06 0.0 0.0
0.24 1.0 0.03 0.07 0.02 0.08 0.04 0.04 0.3 0.11 0.35 0.02 0.24 0.52 0.12 0.0 0.77 0.28 0.0 0.06 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.07 0.07 0.03 0.74 0.35
0.43 0.49 0.02 0.0 0.0 0.02 0.07 0.06 0.97 0.0 0.09 0.25 0.44 0.53 0.0 0.0 1.0 0.33 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0
LOC_Os10g26720.1 (LOC_Os10g26720)
0.01 0.25 0.01 0.0 0.0 0.0 0.58 0.66 0.3 0.07 0.09 0.7 0.57 0.78 0.16 0.05 0.08 0.51 0.01 0.13 0.36 0.04 0.24 0.03 0.0 0.05 0.2 0.36 0.47 0.36 0.29 0.18 0.26 0.12 0.25 0.28 0.23 0.21 0.21 0.04 0.06 0.08 0.1 1.0 0.99 0.32 0.06 0.02 0.01
0.06 0.92 0.01 1.0 0.29 0.43 0.09 0.11 0.29 0.0 0.01 0.0 0.0 0.24 0.0 0.26 0.09 0.07 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
LOC_Os10g38120.1 (CYP704A1)
0.0 0.21 0.01 0.0 0.0 0.01 0.1 0.05 0.03 0.02 0.15 1.0 0.27 0.37 0.08 0.29 0.02 0.21 0.0 0.04 0.1 0.07 0.03 0.01 0.0 0.0 0.0 0.17 0.05 0.06 0.02 0.09 0.0 0.03 0.02 0.0 0.0 0.03 0.05 0.04 0.01 0.01 0.02 0.03 0.03 0.01 0.03 0.0 0.0
0.0 0.06 0.01 0.0 0.0 0.0 0.02 0.01 0.0 0.0 0.01 0.1 0.03 0.05 0.01 0.01 0.0 0.04 0.03 0.01 0.0 0.01 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.03 0.01 1.0 0.69 0.59 0.02 0.0 0.0
LOC_Os11g03190.1 (LOC_Os11g03190)
0.05 0.25 0.01 0.0 0.02 0.14 0.43 0.45 0.18 0.27 0.08 0.41 0.11 0.09 1.0 0.61 0.02 0.48 0.0 0.35 0.1 0.28 0.12 0.32 0.31 0.44 0.11 0.23 0.13 0.04 0.03 0.12 0.09 0.0 0.18 0.28 0.04 0.11 0.16 0.2 0.17 0.36 0.24 0.22 0.04 0.19 0.14 0.12 0.14
LOC_Os11g28450.1 (LOC_Os11g28450)
0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
LOC_Os11g42340.1 (LOC_Os11g42340)
0.11 1.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.04 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.0 0.0 0.0 0.02 0.01 0.03 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.26 0.39
LOC_Os12g02940.1 (LOC_Os12g02940)
0.19 0.48 0.0 0.02 0.0 0.71 0.21 0.21 0.21 0.21 0.14 0.06 0.58 0.17 1.0 0.61 0.02 0.3 0.0 0.16 0.04 0.17 0.1 0.02 0.53 0.18 0.5 0.11 0.0 0.13 0.0 0.15 0.13 0.0 0.0 0.11 0.0 0.29 0.1 0.04 0.01 0.04 0.07 0.44 0.08 0.13 0.09 0.0 0.09
LOC_Os12g10220.1 (LOC_Os12g10220)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.03 0.08 0.04 0.07 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 1.0 0.03 0.0
LOC_Os12g13810.1 (LOC_Os12g13810)
0.03 0.56 0.03 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.04 0.06 0.55 0.22 0.47 0.48 1.0 0.0 0.21 0.0 0.19 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.18 0.19 0.39 0.0 0.0 0.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)