Heatmap: Cluster_43 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
Trophophore
Sporophore with Sporangia
Petiole
Rhizome
Root
Ore_g02711 (CHS)
4.42 15.72 4.79 19.49 101.0
Ore_g04786 (GA4)
0.97 1.07 0.76 3.89 15.11
2.15 1.67 2.5 3.97 11.72
3.12 3.99 2.81 9.72 32.09
0.99 0.79 2.32 5.32 30.09
2.68 3.01 2.2 35.82 190.06
0.73 0.56 1.23 2.01 16.43
Ore_g14039 (AHL22)
0.16 0.01 0.53 9.97 44.98
0.16 0.3 0.64 1.68 7.74
2.14 8.67 6.17 22.51 122.91
Ore_g18931 (SCL3)
0.21 1.61 0.58 6.94 24.24
0.06 0.07 0.2 1.81 12.39
0.35 1.21 0.42 3.82 17.06
1.11 0.0 0.0 16.47 89.22
0.0 0.0 0.12 24.98 153.5
0.1 0.35 1.09 7.02 30.05
0.11 0.11 0.18 2.6 16.87
0.0 0.0 0.0 0.98 4.03
1.15 0.6 1.17 9.4 37.26
0.0 0.0 0.0 1.53 15.85
Ore_g23687 (FAAH)
0.26 0.2 0.22 1.67 8.68
0.0 0.0 0.0 2.09 12.74
0.0 0.0 0.0 3.36 14.96
0.05 0.25 0.23 1.42 10.56
0.0 0.0 0.0 1.88 11.54
0.2 0.04 0.0 0.95 3.77
0.08 3.41 0.29 11.32 56.05
0.18 0.52 0.66 8.37 50.69
0.01 0.0 0.11 0.61 2.49
0.0 0.0 0.0 0.54 4.26
0.48 0.48 0.51 1.32 4.06
Ore_g25238 (PUB17)
0.32 0.3 0.19 2.98 13.09
Ore_g25341 (WRKY6)
0.0 0.02 0.08 1.34 6.94
1.68 1.25 0.99 14.72 91.54
0.0 0.0 0.23 1.54 8.78
Ore_g25990 (ORF02)
0.01 0.05 0.0 0.61 4.67
0.15 0.58 0.31 2.78 20.03
0.08 0.06 0.1 0.44 1.78
Ore_g26382 (FLA14)
0.0 0.0 0.0 4.16 21.79
0.0 0.0 0.0 1.45 7.69
Ore_g26878 (RAP2.11)
0.0 0.0 0.13 5.05 29.58
Ore_g27084 (MSS1)
0.0 0.06 0.01 2.96 12.22
0.03 0.25 0.12 2.31 11.96
0.06 0.22 0.04 1.07 6.35
0.23 0.19 0.07 0.85 6.32
0.11 0.07 0.45 6.57 25.28
Ore_g27467 (BAS1)
0.03 0.15 0.05 4.59 26.95
Ore_g27569 (EXL2)
0.3 0.69 0.15 1.49 6.87
0.0 0.0 0.0 2.04 8.97
Ore_g27663 (PTR2)
0.21 0.16 0.25 3.03 11.84
Ore_g27679 (AIR3)
0.0 0.03 0.16 2.57 18.93
0.0 0.01 0.02 1.2 10.9
Ore_g27928 (ARA12)
0.0 0.0 0.0 2.19 18.02
Ore_g27974 (RGL)
0.04 0.27 0.13 2.32 12.63
0.95 0.61 0.95 2.54 11.92
0.0 0.0 0.08 7.9 68.48
Ore_g28090 (RGP1)
0.06 0.62 0.04 1.77 9.78
0.0 0.01 0.02 3.51 19.32
0.12 0.13 0.22 1.21 5.98
0.03 0.04 0.0 0.84 4.6
0.08 0.04 0.0 1.48 6.57
Ore_g28453 (COB)
0.0 0.02 0.08 1.96 11.43
0.31 0.57 0.91 1.81 10.17
0.0 0.0 0.0 2.12 14.8
0.1 0.08 0.15 0.55 2.32
Ore_g28901 (PUB17)
0.0 0.0 0.0 0.66 2.7
0.0 0.0 0.0 1.79 15.35
0.0 0.0 0.0 1.35 7.83
Ore_g29258 (FLA1)
0.0 0.0 0.0 1.14 6.01
0.0 0.48 0.19 1.25 4.91
0.6 1.36 0.16 4.76 32.85
0.0 0.01 0.02 1.96 10.21
0.0 0.0 0.0 1.69 11.01
Ore_g29975 (RFC3)
0.04 0.34 0.04 1.2 6.96
0.0 0.0 0.33 1.38 6.51
0.01 0.0 0.01 2.87 16.57
0.3 0.33 0.34 1.39 4.92
0.58 0.82 0.75 1.49 5.54
Ore_g30461 (PUP3)
0.0 0.02 0.0 2.2 13.66
5.6 3.45 3.89 9.41 44.7
Ore_g30543 (PGP18)
0.08 0.19 0.25 1.41 4.6
Ore_g30567 (MAPKKK17)
0.0 0.0 0.17 0.95 5.7
0.0 0.0 0.0 2.64 17.4
Ore_g30721 (TT7)
0.03 0.07 0.38 3.6 16.6
Ore_g30769 (RAP2.11)
0.0 0.0 0.1 9.35 40.09
Ore_g30770 (RAP2.11)
0.0 0.07 0.16 8.97 41.81
0.0 0.03 0.04 4.81 19.82
1.08 1.77 1.37 6.19 27.06
Ore_g31298 (RSL1)
0.13 0.18 0.11 0.65 3.34
0.1 0.0 0.05 0.82 5.5
0.0 0.0 0.48 0.77 7.12
Ore_g31568 (PME2)
0.0 0.03 0.0 0.96 5.78
0.0 0.0 0.07 2.26 15.66
0.06 0.13 0.0 1.25 4.91
0.17 0.04 0.0 1.87 10.87
0.0 0.23 0.32 11.44 58.65
Ore_g32248 (OPT4)
0.14 0.15 0.09 1.09 6.2
Ore_g32251 (PME2)
0.0 0.07 0.05 2.09 11.83
1.72 2.37 1.03 39.82 212.5
Ore_g32428 (CYP94D1)
0.0 0.0 0.0 0.86 5.14
Ore_g32592 (FLA3)
0.0 0.0 0.0 2.07 20.53
0.0 0.14 0.04 5.76 36.8
0.26 0.24 0.15 18.89 131.96
0.2 0.79 0.21 1.42 10.32
Ore_g32752 (SSL5)
1.66 3.16 2.05 10.28 38.68
3.21 81.4 6.29 851.38 5082.26
0.2 0.0 0.46 0.77 8.8
0.23 0.72 0.05 1.23 6.49
0.07 0.83 0.55 5.55 28.42
0.0 0.0 0.0 0.16 2.06
0.18 0.53 0.14 1.28 5.98
Ore_g33238 (MYB3R1)
0.64 0.62 0.79 1.43 5.69
Ore_g33380 (ADC2)
0.0 0.0 0.0 0.53 3.9
0.21 0.09 0.07 0.68 3.66
0.0 0.0 0.0 0.13 2.43
0.0 0.0 0.0 0.82 5.04
2.68 0.93 4.58 17.56 79.82
Ore_g33656 (HCT)
0.0 0.0 0.0 1.07 7.3
0.0 0.0 0.0 0.26 2.08
0.0 0.0 0.04 2.73 23.3
Ore_g33854 (GL22)
0.0 0.0 0.18 9.99 48.43
0.03 0.21 0.07 0.59 3.7
Ore_g33996 (RGL)
0.17 0.31 0.09 1.12 5.61
0.0 0.02 0.0 1.3 6.83
0.09 0.42 0.19 1.2 6.96
0.0 0.04 0.0 0.43 2.19
5.01 4.29 6.46 14.46 41.23
0.0 0.27 0.45 4.73 43.34
0.0 0.0 0.0 0.95 10.07
0.0 0.04 0.09 0.97 5.6
0.15 0.15 0.0 1.04 8.89
0.0 0.46 0.0 1.75 9.78
Ore_g35081 (HEXO3)
0.0 0.19 0.01 1.54 7.12
Ore_g35099 (WRI)
0.0 0.1 0.0 1.76 13.39
0.47 0.91 0.84 5.24 26.54
0.03 0.59 0.37 2.91 12.95
Ore_g35159 (BGAL8)
0.05 0.15 0.05 1.29 6.88
0.07 0.21 0.08 0.67 3.04
Ore_g35656 (VIT1)
0.72 0.4 0.38 2.07 10.27
Ore_g35665 (EXL2)
0.0 0.01 0.0 0.56 3.17
0.0 0.04 0.0 1.37 7.79
0.02 0.04 0.19 1.15 4.87
0.0 0.0 0.2 4.17 41.07
0.47 0.7 0.71 1.8 7.42
0.0 0.0 0.02 0.93 4.09
0.07 0.06 0.04 20.38 121.05
Ore_g35850 (HEXO3)
0.0 0.06 0.01 1.75 10.27
0.09 0.0 0.0 0.31 2.73
0.0 0.06 0.02 3.55 24.16
0.0 0.0 0.0 4.53 25.29
0.0 0.14 0.1 0.95 5.49
0.0 0.0 0.01 1.43 6.06
0.0 0.0 0.0 0.49 3.06
0.0 0.0 0.0 3.23 15.91
Ore_g37079 (RBOHF)
0.0 0.0 0.0 0.57 4.25
0.0 0.0 0.0 0.66 4.96
0.0 0.0 0.06 3.6 26.48
0.12 0.05 0.13 4.12 19.97
Ore_g37387 (RD19)
0.5 0.71 0.38 2.85 15.94
0.23 0.43 0.09 5.35 38.69
Ore_g37397 (CPK7)
0.62 0.29 0.05 2.59 10.59
0.0 0.29 0.0 1.15 5.85
Ore_g37513 (EXL2)
0.0 0.01 0.01 0.51 2.38
0.96 0.64 0.48 4.31 19.39
0.16 0.35 0.08 2.39 13.72
0.04 0.14 0.28 8.3 48.64
0.06 0.29 0.0 0.56 3.94
Ore_g38198 (AAE12)
0.0 0.01 0.04 1.44 10.54
0.0 0.0 0.0 0.32 1.87
0.0 0.0 0.0 0.48 3.62
0.0 0.0 0.0 0.71 5.05
0.09 0.12 0.08 0.55 2.8
Ore_g38367 (RGL2)
0.11 0.09 0.13 0.77 3.65
Ore_g38481 (UGT85A7)
0.21 0.12 1.11 4.06 16.31
0.16 0.82 4.23 54.68 319.21
Ore_g38654 (RAP2.11)
0.0 0.0 0.0 1.1 6.98
0.2 0.93 0.16 3.99 14.83
Ore_g38939 (PLDBETA2)
0.24 0.91 0.19 2.12 7.3
0.0 0.0 0.0 3.74 32.57
Ore_g39041 (UGT76D1)
0.62 0.72 0.32 1.98 8.97
0.05 0.58 0.01 7.02 54.04
0.39 0.6 1.16 11.19 60.67
Ore_g40023 (HA11)
0.18 0.56 0.0 2.22 11.12
Ore_g41469 (GPAT6)
0.0 0.22 0.19 0.86 5.49
0.0 0.78 0.25 2.48 11.17
Ore_g41961 (PTR1)
0.17 0.41 0.16 1.38 5.67

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)