Heatmap: Cluster_54 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
Trophophore
Sporophore with Sporangia
Petiole
Rhizome
Root
Ore_g03078 (XTH16)
6.17 101.52 15.79 193.24 0.09
Ore_g03533 (PRC1)
0.71 21.72 0.56 95.2 3.22
Ore_g03977 (TOR2)
37.51 259.44 58.0 378.39 133.16
Ore_g04186 (BAG1)
10.76 22.91 13.49 56.22 10.42
Ore_g05769 (GATL3)
6.03 13.79 3.98 19.93 5.74
Ore_g05770 (GATL3)
11.01 18.27 5.51 27.93 5.93
11.26 55.21 14.65 106.93 24.06
Ore_g07025 (MS2)
19.1 146.05 39.61 203.65 89.03
Ore_g07069 (PIN1)
1.35 5.41 1.63 7.27 3.57
Ore_g08217 (CYCP4;1)
1.03 8.41 0.19 18.52 5.88
Ore_g09226 (FLA17)
1.37 10.26 1.11 32.68 4.21
Ore_g13681 (ENODL18)
11.75 56.84 12.5 128.45 22.41
Ore_g13722 (EFR)
0.71 5.36 1.0 9.53 2.48
0.84 14.85 0.75 51.32 5.22
4.09 13.25 4.62 22.35 12.85
3.49 10.35 4.16 13.36 8.8
2.26 41.68 2.97 47.65 0.21
8.93 13.35 5.8 33.34 5.2
0.62 2.86 0.38 2.69 0.12
Ore_g18487 (GAE1)
8.38 41.57 8.28 108.84 1.36
Ore_g19517 (RAT4)
0.06 6.82 0.89 10.25 2.15
0.59 3.28 0.47 6.3 4.29
31.18 177.3 46.86 189.98 63.21
10.82 19.76 7.07 25.8 6.45
0.0 0.66 0.0 1.97 0.12
0.87 3.6 0.51 5.24 0.18
0.15 1.67 0.19 2.96 0.23
Ore_g22000 (XCP2)
0.24 2.28 0.14 4.75 0.3
0.36 2.66 0.4 5.57 0.11
0.09 1.03 0.16 1.98 0.22
0.25 3.44 0.34 8.17 0.91
Ore_g22726 (CYCP4;1)
0.49 3.53 0.39 8.97 0.5
0.0 1.84 0.0 3.77 0.0
Ore_g23017 (TUA3)
0.72 9.07 1.7 23.32 0.8
Ore_g23500 (MAN6)
0.82 2.98 0.32 6.91 0.91
0.0 8.09 0.19 9.41 0.01
Ore_g23776 (LAC4)
1.16 9.75 0.27 30.17 1.11
Ore_g24433 (CYCP4;1)
0.8 5.35 0.39 5.8 0.0
0.06 3.84 0.26 7.82 0.2
0.91 6.46 1.81 17.22 2.36
0.0 2.52 0.34 5.27 1.96
2.11 7.16 1.46 10.85 3.97
1.23 7.27 0.76 15.79 6.21
Ore_g25230 (TBL25)
4.88 26.67 5.19 78.53 3.02
0.0 1.79 0.16 2.95 1.18
0.27 2.0 0.19 4.34 0.36
Ore_g26719 (GATA9)
0.62 3.85 0.6 9.94 1.17
1.05 4.31 1.09 6.63 0.32
0.44 1.97 0.24 2.41 0.17
0.27 1.88 0.13 2.75 0.44
Ore_g27212 (XCP2)
0.57 5.35 0.2 14.45 0.89
11.46 65.06 11.37 120.73 19.08
1.37 5.35 1.2 8.94 5.53
Ore_g27516 (GATL7)
1.25 5.84 0.79 13.32 0.58
0.02 1.6 0.02 3.3 0.75
0.24 3.09 0.41 7.47 1.09
1.22 9.62 1.35 22.9 3.78
4.55 8.4 4.59 11.05 5.37
1.19 5.27 1.37 16.76 3.19
0.0 3.67 0.16 5.17 0.0
Ore_g28167 (CSLC5)
4.05 12.02 3.81 25.28 7.33
Ore_g28352 (COBL2)
6.42 35.19 13.34 96.74 16.08
0.35 3.36 0.25 5.48 0.0
Ore_g28947 (CYCP4;1)
0.12 3.21 0.2 10.3 0.13
Ore_g28972 (TUA3)
7.37 31.48 8.7 44.79 11.33
0.47 1.74 0.13 3.16 0.45
0.07 0.93 0.1 1.97 0.24
Ore_g29422 (GATA9)
0.15 2.71 0.0 5.29 0.63
0.1 1.18 0.33 3.12 0.25
Ore_g29776 (RAT4)
0.21 6.74 0.56 16.55 2.37
94.53 292.61 25.54 814.64 0.66
0.59 6.08 0.83 12.71 6.01
Ore_g30300 (XTR2)
0.84 6.1 0.42 15.55 1.38
Ore_g30347 (GLP5)
1.05 9.25 0.41 20.84 1.65
Ore_g30348 (GLP5)
0.24 4.7 0.04 11.35 0.55
1.47 5.0 2.09 12.61 1.61
Ore_g30519 (GATA2)
0.24 4.66 1.23 10.81 0.31
0.27 1.37 0.07 3.67 0.15
Ore_g31224 (FLA17)
1.71 15.12 1.41 50.8 4.83
3.27 7.32 0.22 13.53 0.87
1.91 14.35 1.1 31.96 5.99
6.46 49.38 13.14 69.76 24.68
0.61 1.57 0.47 3.53 0.47
Ore_g34445 (COB)
1.23 7.94 2.09 9.62 2.85
Ore_g34854 (XTH16)
15.89 237.25 32.32 614.15 3.8
Ore_g35396 (TUB8)
7.83 37.8 8.12 61.02 12.55
0.0 1.34 0.0 4.8 0.5
1.03 4.55 1.79 6.76 4.91
1.93 18.65 0.53 59.87 2.53
0.34 4.99 0.19 5.24 0.59
Ore_g38573 (GAE1)
7.56 19.04 4.35 45.25 3.14
1.0 5.57 0.0 10.09 0.74
0.55 4.14 1.61 6.62 2.54
2.52 16.37 2.02 28.26 18.38
Ore_g40542 (OSU1)
17.06 30.88 12.74 45.75 9.31
2.74 16.64 3.98 28.15 18.61
0.11 33.43 0.53 66.87 2.71
0.0 4.75 0.09 7.8 0.37
Ore_g42031 (GUT1)
0.37 3.49 0.31 10.38 0.24
1.81 8.44 2.01 13.93 4.76
Ore_g42145 (LAC11)
1.28 7.87 0.64 14.95 1.4
Ore_g42146 (LAC16)
0.91 7.22 0.06 16.57 0.6
7.82 27.89 12.07 32.57 10.65
1.23 2.49 0.57 5.29 0.49
0.64 3.58 0.94 5.67 3.2
2.81 6.55 1.12 7.54 0.03
1.92 7.7 1.16 16.82 0.84
0.51 2.37 0.83 3.74 2.39
Ore_g44150 (GATL3)
1.08 14.85 1.47 33.71 9.15
1.57 34.63 2.58 78.08 15.74
2.79 10.66 1.32 28.72 1.32

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)