1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_25 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

 Transpose table  Download table
Gene
Trophophore
Sporophore with Sporangia
Petiole
Rhizome
Root
12.06 9.39 6.31 4.66 1.26
12.07 9.85 7.64 8.32 0.79
Ore_g01040 (PSBQ)
 60.64 34.5 20.75 16.33 0.9
106.58 125.51 72.59 97.03 1.06
Ore_g01644 (GUN4)
 16.87 11.87 11.18 12.95 0.1
11.84 6.7 4.35 6.15 1.38
Ore_g02388 (NADP-ME2)
 14.23 10.23 7.54 8.0 1.35
23.44 16.13 11.64 13.2 2.07
7.58 4.65 1.47 2.79 0.26
15.74 9.05 7.27 7.55 3.84
54.91 43.01 31.64 30.43 3.73
Ore_g04397 (CSD2)
 194.51 129.38 112.27 93.51 30.1
Ore_g04398 (CSD2)
 297.64 225.45 181.78 183.32 57.76
373.46 226.44 183.87 210.68 1.07
55.96 32.86 35.57 19.45 5.29
Ore_g04713 (CHLM)
 28.62 21.37 15.29 15.99 5.98
Ore_g04857 (PSAH2)
 1972.83 1111.71 1210.02 633.83 0.3
8.38 6.45 5.46 4.91 2.78
3.15 1.63 1.22 1.58 0.22
19.83 13.88 14.44 8.58 0.04
18.53 8.88 6.26 5.44 2.53
123.63 70.97 75.34 41.56 0.35
Ore_g05380 (LHCB4.1)
 674.8 454.14 391.03 383.8 7.22
50.77 29.52 30.42 23.99 1.99
Ore_g05952 (D6PKL1)
 10.9 7.94 4.96 3.9 0.07
Ore_g06064 (mtLPD1)
 55.14 42.34 37.04 24.19 15.03
Ore_g06144 (PSBR)
 5685.3 3273.57 3689.06 1925.09 0.87
Ore_g06384 (CYP38)
 18.91 12.88 9.23 10.33 5.38
13.13 11.9 11.54 10.51 4.22
Ore_g07120 (PORC)
 33.46 24.31 22.76 14.96 0.32
10.95 7.36 4.26 7.9 0.45
Ore_g07170 (GPAT6)
 20.21 16.85 9.41 14.07 0.54
7.98 3.99 2.49 1.96 0.47
Ore_g07562 (PSAN)
 337.82 246.21 273.22 213.26 0.02
Ore_g07563 (PSAN)
 303.05 199.78 238.96 148.28 0.02
Ore_g07602 (GDC1)
 147.81 90.76 84.68 53.43 14.92
4.86 4.6 3.2 3.48 1.61
Ore_g07782 (CAB4)
 429.85 278.68 258.51 222.88 12.0
Ore_g07871 (GUN4)
 75.09 41.35 41.85 27.66 0.81
Ore_g08176 (CA2)
 907.59 556.87 294.36 439.2 93.64
816.12 569.98 664.77 426.31 0.26
Ore_g08673 (DXR)
 35.07 32.97 25.26 30.66 5.62
Ore_g08688 (CCH)
 99.56 69.46 44.4 37.54 1.35
66.58 35.17 29.83 21.3 0.0
40.91 27.86 23.0 11.37 6.22
33.67 28.21 22.58 25.72 0.0
9.66 5.68 4.53 4.18 1.91
Ore_g09411 (PSAE-2)
 1126.29 733.9 627.76 618.52 1.07
10.13 6.69 4.57 5.94 2.23
541.9 425.05 307.36 185.56 7.32
Ore_g10198 (UGT85A2)
 23.11 15.25 13.51 11.89 0.84
9.81 7.41 2.31 5.93 0.37
Ore_g10858 (CP24)
 283.52 256.27 175.52 217.45 4.03
3.44 1.87 1.27 0.97 0.37
Ore_g11334 (CP31B)
 58.7 33.21 28.29 25.89 17.35
16.66 14.27 11.86 12.96 0.25
51.44 41.98 20.04 27.56 2.39
6.0 4.53 3.08 2.51 1.31
Ore_g13792 (PSAK)
 1010.48 807.28 742.34 611.69 0.24
Ore_g14801 (PSAE-2)
 532.99 312.44 262.17 153.03 0.22
166.92 137.93 115.03 76.24 24.65
Ore_g15241 (CLPP6)
 40.24 32.43 27.79 22.0 13.97
Ore_g15308 (LHCB5)
 456.78 318.85 296.4 274.73 0.22
Ore_g15713 (LACS4)
 7.36 7.07 4.87 4.41 1.71
12.66 12.4 6.68 9.67 0.0
12.66 10.68 9.19 8.3 4.96
Ore_g16765 (HEME2)
 32.0 28.98 25.72 24.36 3.17
995.18 653.0 522.62 332.33 3.14
Ore_g17545 (PSAD-1)
 754.73 554.93 560.02 462.23 0.84
Ore_g17986 (UGT85A7)
 38.35 31.08 29.7 32.76 7.28
6.18 4.85 3.31 3.94 2.57
31.98 21.6 14.57 15.67 10.88
21.89 17.7 15.73 15.16 12.34
Ore_g18768 (AAE1)
 9.5 5.7 3.71 3.09 1.54
7.6 6.32 3.72 5.93 4.07
11.49 8.82 7.06 4.67 1.43
282.13 171.67 152.42 127.02 21.18
Ore_g19666 (2CPB)
 257.26 166.2 117.25 111.75 55.76
Ore_g20049 (APX4)
 50.78 35.94 26.59 28.88 3.96
6.1 4.84 4.69 4.51 0.86
Ore_g20498 (PSAL)
 714.38 558.1 491.64 459.75 1.5
Ore_g21011 (PSBQ)
 650.76 450.44 450.21 285.35 3.74
Ore_g21027 (LHCB2)
 2860.87 2475.7 2487.88 2771.54 1.45
6.5 5.86 2.66 5.21 2.11
389.91 311.92 271.72 182.66 163.74
137.83 107.43 70.31 90.83 0.18
Ore_g26025 (PETE2)
 837.08 639.28 547.58 518.0 0.27
70.25 46.99 40.02 26.53 7.43
87.97 65.85 50.53 39.77 8.29
153.69 103.78 96.64 64.65 1.21
Ore_g27683 (PSBY)
 315.55 237.7 206.51 171.08 4.67
556.27 358.61 224.74 171.9 43.48
Ore_g28549 (CSD1)
 226.6 248.72 178.29 172.49 90.22
Ore_g28641 (CHL)
 18.59 13.62 12.04 10.42 3.69
Ore_g28824 (LIL3:1)
 35.98 24.25 18.66 15.16 11.41
7.36 5.57 4.66 5.56 1.99
26.13 18.33 17.82 12.39 3.6
Ore_g30216 (LHCA3)
 414.58 288.08 337.08 245.09 0.82
Ore_g30336 (LPA19)
 19.45 14.55 11.14 9.98 4.39
Ore_g30412 (LHCA1)
 537.42 360.87 359.03 318.55 4.7
Ore_g31124 (OEC33)
 924.58 523.34 556.28 313.9 0.26
Ore_g31125 (OEC33)
 145.8 94.73 96.59 49.37 0.0
17535.14 12921.11 10225.91 8904.16 4.33
27.01 12.25 10.67 13.2 1.34
Ore_g33396 (LHCA3)
 282.77 201.44 196.64 141.06 2.06
9.39 6.98 6.46 6.54 5.03
Ore_g34253 (PSBQ)
 249.39 188.41 157.15 124.32 4.46
Ore_g34262 (CH1)
 53.26 46.67 37.41 39.25 5.55
Ore_g34762 (PMSR4)
 28.49 22.73 16.1 17.36 10.63
Ore_g35944 (LHCB5)
 235.98 200.95 152.52 169.83 0.23
Ore_g35945 (PSAE-2)
 643.49 485.38 386.34 432.57 4.09
46.97 44.35 34.71 28.72 14.23
Ore_g36702 (PSAK)
 312.11 211.12 238.32 138.82 0.17
Ore_g36756 (LHCA1)
 273.28 200.34 189.19 188.62 11.07
260.33 236.06 238.04 161.27 1.74
12.27 8.77 6.92 6.65 0.93
Ore_g38506 (PETE1)
 12.62 11.46 10.28 9.14 2.65
8.48 5.67 4.39 3.74 3.55
15.82 11.91 7.22 8.38 1.75
Ore_g41501 (TT7)
 28.59 17.97 20.21 13.57 0.39
46.55 36.15 28.63 15.03 4.25
366.17 263.58 335.0 192.34 12.13
Ore_g42003 (CXE16)
 2.32 2.08 1.38 1.86 0.91
Ore_g42614 (MEE59)
 18.0 17.03 11.51 8.42 0.0
Ore_g43266 (LHCA2)
 354.76 249.85 164.23 228.65 0.14
Ore_g43267 (LHCA2)
 108.35 69.85 47.86 53.91 0.06
10.8 7.11 6.48 5.81 4.9
Ore_g44375 (NPY3)
 2.48 2.23 0.72 2.13 0.28
Ore_g45079 (LHCA1)
 172.14 129.54 113.67 139.75 4.47

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)