Heatmap: Cluster_26 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Sterile Leaflet
Mature Sterile Leaflet
Fertile Leaflet with Sori
Petiole
Crozier
Rhizome
Stolon
Stolon with Root
0.43 0.72 0.03 0.45 1.0 0.76 0.96 0.99
0.66 0.89 0.51 0.89 0.95 0.76 1.0 0.97
0.18 0.55 0.03 0.37 1.0 0.48 0.94 0.87
Nbi_g00579 (IAA8)
0.02 0.4 0.03 0.19 0.86 1.0 0.33 0.47
0.54 0.78 0.59 0.87 0.78 0.78 0.83 1.0
0.56 0.76 0.21 1.0 0.83 0.81 0.42 0.65
Nbi_g00946 (TMO6)
0.74 0.87 0.75 0.86 1.0 0.81 1.0 0.89
0.71 0.95 0.66 0.93 1.0 0.88 0.92 0.84
Nbi_g01021 (MYB1)
0.78 0.93 0.74 0.85 1.0 0.82 0.94 0.8
Nbi_g01175 (MAP65-6)
0.49 0.68 0.13 0.69 1.0 0.6 0.57 0.69
0.51 0.52 0.49 0.57 1.0 0.77 0.61 0.75
Nbi_g01315 (SUS3)
0.06 0.41 0.08 0.22 0.93 0.57 0.41 1.0
0.24 0.99 0.03 0.22 1.0 0.8 0.42 0.64
0.53 0.79 0.13 0.62 1.0 0.38 0.72 0.49
0.74 0.49 0.21 0.36 1.0 0.34 0.99 0.73
Nbi_g01995 (MC1)
0.59 0.8 0.5 0.84 0.87 0.79 0.87 1.0
Nbi_g02137 (ACL5)
0.08 0.46 0.14 0.37 1.0 0.42 0.67 0.9
0.52 0.68 0.47 0.77 0.84 0.71 0.76 1.0
0.59 0.97 0.16 0.91 1.0 0.68 0.57 0.69
Nbi_g02661 (IAA3)
0.22 0.48 0.04 0.48 0.98 0.71 1.0 0.49
Nbi_g02843 (NUDT16)
0.25 0.47 0.5 0.47 1.0 0.8 0.73 0.79
0.3 0.56 0.32 0.53 1.0 0.8 0.68 0.8
Nbi_g02979 (GATL7)
0.44 0.76 0.04 0.49 1.0 0.79 0.84 0.89
0.07 0.09 0.06 0.07 1.0 0.71 0.43 0.51
0.87 0.97 0.73 0.9 1.0 0.8 0.97 0.9
0.36 0.42 0.11 0.43 1.0 0.38 0.46 0.79
Nbi_g03701 (BIR1)
0.58 0.81 0.68 0.7 1.0 0.84 0.81 0.92
Nbi_g03707 (RLP4)
0.45 0.58 0.49 0.58 1.0 0.68 0.72 0.76
0.23 0.74 0.28 0.69 0.79 0.78 0.6 1.0
Nbi_g04298 (IQD3)
0.5 0.76 0.08 0.9 0.79 0.7 0.84 1.0
Nbi_g04323 (FTR)
0.52 0.71 0.35 0.81 1.0 0.66 1.0 0.81
0.74 0.94 0.28 1.0 0.56 0.71 0.81 0.92
0.37 0.74 0.12 0.53 1.0 0.68 0.65 0.55
0.6 0.74 0.43 0.66 1.0 0.88 0.87 0.78
0.61 0.58 0.23 0.69 1.0 0.52 0.76 0.9
0.15 0.38 0.03 0.42 1.0 0.56 1.0 0.39
Nbi_g06680 (TUB6)
0.36 0.7 0.23 0.64 0.76 0.83 0.86 1.0
0.2 0.33 0.41 0.3 1.0 0.77 0.56 0.64
0.0 0.0 0.02 0.0 1.0 0.65 0.5 0.53
0.1 0.32 0.12 0.24 1.0 0.37 0.44 0.64
0.36 0.77 0.11 0.39 0.41 0.61 0.46 1.0
0.12 0.39 0.14 0.38 0.81 0.43 0.52 1.0
Nbi_g09071 (QUA1)
0.42 0.51 0.18 0.39 1.0 0.86 0.98 0.67
Nbi_g09085 (ACR4)
0.32 0.46 0.17 0.28 1.0 0.63 0.62 0.74
0.85 0.47 0.19 0.47 0.87 0.47 1.0 0.61
0.31 0.64 0.32 0.6 1.0 0.73 0.6 0.52
0.03 0.35 0.01 0.66 1.0 0.54 0.51 0.29
Nbi_g09678 (IAA3)
0.41 0.56 0.46 0.46 1.0 0.63 0.84 0.42
0.33 0.45 0.35 0.34 0.87 1.0 0.53 0.63
0.03 0.41 0.08 0.12 0.67 0.3 0.23 1.0
0.05 0.31 0.0 0.02 0.67 0.18 0.11 1.0
0.5 0.88 0.59 0.74 1.0 0.85 0.91 0.92
Nbi_g10279 (MC4)
0.67 1.0 0.34 0.9 0.94 0.75 0.76 0.81
0.12 0.37 0.06 0.23 1.0 0.18 0.26 0.38
Nbi_g11361 (ICK3)
0.45 0.85 0.25 0.66 1.0 0.94 0.67 0.66
0.16 0.8 0.06 0.28 1.0 0.51 0.27 0.61
0.58 0.73 0.47 0.68 1.0 0.63 0.9 0.67
0.04 0.16 0.12 0.18 0.8 0.28 0.47 1.0
Nbi_g12616 (PIN1)
0.06 0.4 0.18 0.44 1.0 0.99 0.62 0.64
0.31 0.66 0.4 0.58 0.87 0.7 0.54 1.0
0.48 0.95 0.29 0.85 1.0 0.82 0.92 0.84
0.19 0.51 0.08 0.48 0.83 0.71 0.8 1.0
0.49 0.53 0.57 0.58 1.0 0.77 0.68 0.73
0.18 0.36 0.24 0.2 0.98 1.0 0.74 0.42
Nbi_g13598 (BAS1)
0.48 0.47 0.1 0.42 1.0 0.42 0.72 0.41
0.2 0.57 0.0 0.15 1.0 0.74 0.37 0.39
Nbi_g14065 (SRF6)
0.4 0.42 0.26 0.41 1.0 0.52 0.48 0.61
Nbi_g14864 (SKIP1)
0.33 1.0 0.45 0.51 0.67 0.52 0.77 0.6
0.69 0.77 0.74 0.68 1.0 0.75 0.87 0.87
0.64 0.51 0.28 0.61 1.0 0.44 0.82 0.81
Nbi_g15539 (GK-2)
0.43 0.38 0.39 0.43 0.95 1.0 0.97 0.78
0.63 0.57 0.23 0.76 1.0 0.49 0.62 0.71
0.04 1.0 0.13 0.21 0.94 0.83 0.79 0.5
0.04 0.84 0.17 0.08 0.25 0.21 0.06 1.0
0.5 1.0 0.39 0.94 0.88 0.61 0.15 0.49
Nbi_g17028 (BIR1)
0.34 0.58 0.16 0.37 1.0 0.69 0.78 0.77
Nbi_g17285 (AGL16)
0.55 0.6 0.23 0.68 1.0 0.55 0.61 0.44
0.13 0.82 0.12 0.83 0.89 0.83 0.98 1.0
0.43 0.75 0.31 0.66 1.0 0.84 0.72 0.8
Nbi_g19649 (CEJ1)
0.41 1.0 0.26 0.5 0.74 0.62 0.66 0.76
0.42 0.81 0.15 0.5 1.0 0.72 0.76 0.59
Nbi_g21131 (OBP3)
0.78 0.74 0.39 0.54 0.82 0.78 1.0 0.75
0.24 0.67 0.33 0.65 1.0 0.64 0.87 0.83
Nbi_g21905 (SIS7)
0.33 0.78 0.16 0.3 0.77 0.78 0.94 1.0
Nbi_g22084 (CYP709B2)
0.59 0.62 0.08 0.48 1.0 0.3 0.55 0.38
0.38 0.52 0.13 0.55 1.0 0.58 0.67 0.81
Nbi_g22131 (PAT1)
0.56 0.74 0.23 1.0 0.88 0.88 0.6 0.88
0.33 0.71 0.09 0.41 1.0 0.65 0.64 0.48
Nbi_g23410 (TET8)
0.16 0.39 0.08 0.25 1.0 0.21 0.32 0.34
0.54 0.77 0.37 0.75 1.0 0.67 0.88 0.78
0.37 1.0 0.2 0.41 0.72 0.75 0.85 1.0
0.39 0.33 0.07 0.57 1.0 0.4 0.59 0.82
Nbi_g25186 (ZFN1)
0.46 0.58 0.4 0.58 1.0 0.96 0.96 0.61
Nbi_g26328 (OSU1)
0.4 0.7 0.13 0.42 1.0 0.59 0.8 0.62
0.29 0.45 0.15 0.58 1.0 0.38 0.55 0.71
0.35 0.68 0.17 0.39 1.0 0.69 1.0 0.75
0.22 0.45 0.13 0.2 0.94 0.45 0.49 1.0
0.35 0.35 0.16 0.32 1.0 0.95 0.59 0.65
0.33 0.46 0.18 0.17 0.75 1.0 0.54 0.57
0.04 0.85 0.19 0.27 1.0 0.54 0.61 0.3
0.82 1.0 0.18 0.98 0.64 0.63 0.62 0.8
0.5 0.92 0.33 0.48 0.71 0.77 0.46 1.0
Nbi_g30886 (HAL3)
0.55 0.62 0.42 0.56 1.0 0.51 0.65 0.64
Nbi_g30903 (IQD6)
0.36 0.44 0.08 0.53 0.99 0.52 0.81 1.0
0.2 0.49 0.13 0.29 1.0 0.24 0.35 0.38
0.25 0.83 0.15 0.48 0.45 0.6 0.33 1.0
0.51 0.48 0.4 0.45 0.88 1.0 0.9 0.7
0.03 0.72 0.02 0.14 0.65 0.83 0.59 1.0
0.39 0.92 0.19 0.66 1.0 0.91 0.55 0.51
0.17 0.61 0.27 0.41 1.0 0.59 0.97 0.57
0.31 0.94 0.32 0.64 0.71 0.68 0.63 1.0
0.53 0.73 0.22 0.5 1.0 0.58 0.89 0.91
0.39 0.64 0.03 0.36 1.0 0.68 0.93 0.9
0.25 0.45 0.49 0.36 1.0 0.7 0.9 0.95
0.11 0.17 0.29 0.22 1.0 0.75 0.68 0.4
Nbi_g41601 (TAF5)
0.77 0.77 0.52 0.78 1.0 0.73 0.77 0.72
0.56 0.7 0.27 0.75 0.97 1.0 0.7 0.92
0.34 0.72 0.55 0.48 1.0 0.69 0.65 0.98
0.25 0.48 0.37 0.48 1.0 0.52 0.86 0.86
0.15 0.86 0.0 0.47 0.59 0.8 0.63 1.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)