1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_25 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
Sterile Leaflet
Mature Sterile Leaflet
Fertile Leaflet with Sori
Petiole
Crozier
Rhizome
Stolon
Stolon with Root
0.62 1.0 0.71 0.75 0.87 0.79 0.68 0.77
0.73 1.0 0.89 0.87 0.89 0.78 0.78 0.81
0.5 1.0 0.62 0.62 0.77 0.67 0.67 0.78
0.5 0.66 0.45 0.45 1.0 0.66 0.67 0.72
0.64 0.8 0.91 0.73 1.0 0.85 0.9 0.97
0.26 0.7 0.45 0.43 1.0 0.44 0.7 0.7
Nbi_g01775 (bZIP16)
 0.69 1.0 0.87 0.86 0.97 0.84 0.8 0.95
Nbi_g02066 (IMPA1)
 0.28 0.73 0.49 0.62 1.0 0.74 0.74 0.72
Nbi_g02262 (ATJ)
 0.6 1.0 0.81 0.78 0.85 0.74 0.8 0.81
Nbi_g02318 (MTA)
 0.64 0.73 0.71 0.6 1.0 0.7 0.83 0.83
0.46 0.67 0.64 0.52 1.0 0.63 0.65 0.61
0.53 0.57 0.63 0.46 1.0 0.4 0.68 0.64
0.32 1.0 0.65 0.73 0.92 0.2 0.37 0.79
0.72 1.0 0.69 0.5 0.82 0.33 0.53 0.52
Nbi_g02674 (EBS)
 0.61 0.87 0.76 0.8 1.0 0.66 0.68 0.67
0.81 0.89 0.88 0.55 0.79 1.0 0.57 0.72
0.48 0.74 0.68 0.64 1.0 0.72 0.67 0.69
0.48 0.94 0.67 0.76 1.0 0.75 0.69 0.73
Nbi_g03785 (CRCK1)
 0.64 1.0 0.95 0.91 0.95 0.86 0.74 0.75
Nbi_g03787 (VIM1)
 0.38 0.6 0.48 0.49 1.0 0.64 0.73 0.64
0.06 0.77 0.08 0.06 1.0 0.52 0.49 0.2
Nbi_g04066 (AL2)
 0.7 1.0 0.83 0.8 0.97 0.74 0.81 0.81
0.3 0.98 0.63 0.77 1.0 0.22 0.13 0.34
0.69 1.0 0.71 0.97 0.83 0.46 0.59 0.95
0.43 0.89 0.71 0.74 1.0 0.6 0.63 0.71
0.61 0.64 0.65 0.48 1.0 0.57 0.77 0.62
Nbi_g05518 (emb1644)
 0.54 1.0 0.78 0.79 0.78 0.71 0.85 0.68
0.3 0.82 1.0 0.81 0.73 0.75 0.69 0.68
0.37 0.93 0.58 0.65 1.0 0.58 0.61 0.43
Nbi_g06135 (ILR3)
 0.95 1.0 0.97 0.67 0.91 0.99 0.56 0.76
0.12 0.92 0.06 0.76 1.0 0.05 0.07 0.03
Nbi_g06273 (PBRP)
 0.67 1.0 0.75 0.61 0.89 0.67 0.76 0.79
0.44 1.0 0.47 0.38 0.61 0.17 0.04 0.0
0.21 0.62 0.17 0.25 1.0 0.7 0.72 0.38
0.76 1.0 0.86 0.89 1.0 0.85 0.92 0.9
0.4 0.84 0.72 0.64 0.77 0.61 0.88 1.0
Nbi_g07188 (KNAT3)
 0.04 0.63 0.01 0.09 1.0 0.01 0.0 0.0
0.01 0.53 0.08 0.08 1.0 0.86 0.7 0.34
Nbi_g07587 (SUVR4)
 0.73 1.0 0.9 0.81 0.82 0.87 0.77 0.9
0.16 0.73 0.2 0.4 1.0 0.71 0.61 0.41
Nbi_g07779 (U2AF35B)
 0.67 0.87 0.66 0.79 1.0 0.61 0.82 0.74
Nbi_g07787 (ATAMT1)
 0.26 0.84 0.27 0.33 1.0 0.13 0.0 0.12
0.28 1.0 0.46 0.72 0.61 0.26 0.22 0.46
0.82 0.95 1.0 0.93 0.97 0.73 0.9 0.79
Nbi_g08195 (MEI1)
 0.44 0.68 0.68 0.59 1.0 0.75 0.76 0.75
0.6 1.0 0.93 0.82 0.91 0.7 0.68 0.91
Nbi_g08579 (ZCW7)
 0.69 0.8 0.76 0.68 1.0 0.78 0.86 0.71
0.5 1.0 0.62 0.83 0.92 0.59 0.68 0.85
Nbi_g09113 (RLP44)
 0.46 0.78 0.78 0.55 1.0 0.81 0.7 0.75
Nbi_g09240 (SC35)
 0.66 0.93 0.77 0.79 1.0 0.66 0.77 0.83
0.12 0.52 0.07 0.31 1.0 0.59 0.63 0.27
Nbi_g09886 (EB1A)
 0.17 0.42 0.25 0.3 1.0 0.55 0.92 0.47
0.23 0.56 0.29 0.42 1.0 0.67 0.89 0.46
0.67 1.0 0.92 0.7 0.89 0.92 0.71 0.87
0.41 1.0 0.7 0.98 0.94 0.47 0.54 0.52
Nbi_g10914 (emb1379)
 0.4 0.81 0.62 0.85 1.0 0.58 0.51 0.6
Nbi_g10979 (TLP3)
 0.05 0.52 0.11 0.05 1.0 0.45 0.44 0.23
0.45 1.0 0.55 0.64 0.77 0.55 0.58 0.62
0.39 0.83 0.47 0.5 1.0 0.57 0.6 0.44
0.59 1.0 0.81 0.76 0.7 0.67 0.71 0.75
0.33 0.35 0.5 0.11 1.0 0.46 0.77 0.32
0.31 0.79 0.36 0.05 0.75 0.32 1.0 0.63
0.2 1.0 0.36 0.42 0.87 0.53 0.33 0.76
0.54 0.9 0.59 0.68 1.0 0.58 0.86 0.68
Nbi_g13055 (RRP4)
 0.43 0.74 0.64 0.64 1.0 0.63 0.55 0.63
0.18 1.0 0.37 0.44 0.78 0.13 0.0 0.0
0.51 1.0 0.18 0.15 0.6 0.24 0.5 0.37
0.68 1.0 0.81 0.92 1.0 0.7 0.66 0.75
0.17 0.66 0.68 0.1 1.0 0.58 0.23 0.3
0.83 1.0 0.86 0.83 0.9 0.83 0.73 0.94
0.04 0.85 0.07 0.46 1.0 0.03 0.12 0.09
0.17 1.0 0.28 0.38 0.42 0.07 0.51 0.5
0.44 0.84 0.49 0.58 1.0 0.68 0.75 0.72
0.51 0.64 0.61 0.49 1.0 0.58 0.88 0.79
0.59 0.83 0.72 0.75 1.0 0.66 0.84 0.77
0.67 0.78 0.73 0.65 1.0 0.81 0.82 0.75
0.02 0.54 0.03 0.15 1.0 0.41 0.78 0.2
0.56 1.0 0.81 0.64 0.76 0.87 0.6 0.62
Nbi_g18365 (CPSF73-I)
 0.65 1.0 0.73 0.88 1.0 0.82 0.78 0.84
0.11 0.95 0.13 0.47 1.0 0.13 0.13 0.08
0.6 1.0 0.31 0.39 0.66 0.15 0.19 0.04
0.62 0.93 0.86 0.8 1.0 0.76 0.84 0.78
Nbi_g19286 (RSL4)
 0.03 0.65 0.07 0.2 1.0 0.85 0.98 0.63
0.46 0.87 1.0 0.96 0.89 0.38 0.89 0.55
0.64 0.83 0.7 0.76 1.0 0.61 0.71 0.86
0.59 1.0 0.71 0.94 0.91 0.6 0.78 0.88
0.65 1.0 0.84 0.75 0.94 0.86 0.71 0.7
0.61 0.83 0.71 0.82 1.0 0.7 0.67 0.83
0.68 1.0 0.9 0.68 0.95 0.86 0.69 0.82
0.73 1.0 0.87 0.62 0.96 0.77 0.69 0.65
Nbi_g22440 (RFC3)
 0.55 0.94 0.85 0.86 1.0 0.69 0.76 0.67
0.33 0.82 1.0 0.39 0.39 0.68 0.4 0.64
0.71 1.0 0.75 0.54 0.81 0.42 0.85 0.55
0.68 0.96 0.97 0.63 0.66 1.0 0.39 0.78
0.15 1.0 0.4 0.23 0.39 0.09 0.51 0.68
0.53 1.0 0.72 0.8 0.74 0.67 0.68 0.68
Nbi_g25231 (CRCK2)
 0.63 0.82 0.76 0.78 1.0 0.63 0.81 0.89
Nbi_g25600 (ATX4)
 0.59 0.87 0.68 0.8 1.0 0.87 0.83 0.82
0.42 1.0 0.8 0.73 0.95 0.41 0.45 0.91
0.43 0.42 0.54 0.36 1.0 0.55 0.75 0.51
0.75 0.95 0.84 0.87 0.92 0.63 0.7 1.0
0.22 1.0 0.39 0.28 0.55 0.01 0.43 0.57
0.68 0.86 0.82 0.78 1.0 0.66 0.66 0.88
0.58 1.0 0.61 0.64 0.91 0.59 0.54 0.55
0.13 1.0 0.19 0.92 0.93 0.02 0.19 0.07
0.52 0.78 0.56 0.58 1.0 0.44 0.85 0.55
0.49 1.0 0.56 0.58 0.56 0.58 0.47 0.62
0.34 0.81 0.74 0.35 1.0 0.59 0.86 0.85
0.61 0.94 0.77 0.65 1.0 0.53 0.67 0.8
0.54 1.0 0.51 0.73 0.88 0.67 0.57 0.74
0.09 0.89 0.36 0.12 1.0 0.59 0.03 0.01
0.65 0.94 0.65 0.79 1.0 0.67 0.8 0.87
0.73 0.93 0.63 0.68 1.0 0.43 0.07 0.22
0.67 1.0 0.74 0.8 1.0 0.58 0.74 0.89
0.34 1.0 0.37 0.58 0.69 0.65 0.5 0.49
0.16 0.65 0.4 0.31 0.96 0.61 1.0 0.44
0.59 1.0 0.68 0.75 0.85 0.59 0.73 0.78
0.65 1.0 0.75 0.88 0.91 0.84 0.76 0.73
0.54 0.92 0.7 0.76 1.0 0.58 0.71 0.62
0.59 0.75 0.59 0.53 1.0 0.61 0.67 0.62
0.72 0.91 0.86 0.82 1.0 0.83 0.95 0.78
0.12 1.0 0.21 0.64 0.65 0.53 0.33 0.35
0.16 1.0 0.36 0.38 0.75 0.12 0.39 0.52
0.42 1.0 0.58 0.54 0.68 0.4 0.7 0.56
0.52 1.0 0.88 0.83 0.84 0.53 0.18 0.35
0.67 1.0 0.69 0.77 0.95 0.41 0.52 0.88
0.71 0.88 0.53 1.0 0.79 0.43 0.54 0.81
0.2 0.9 0.84 0.22 1.0 0.72 0.22 0.32

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)