Heatmap: Cluster_5 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
Sterile Leaflet
Mature Sterile Leaflet
Fertile Leaflet with Sori
Petiole
Crozier
Rhizome
Stolon
Stolon with Root
Nbi_g00449 (LOG1)
7.13 3.4 3.66 4.01 12.35 16.07 60.02 18.24
Nbi_g00878 (GPAT6)
1.09 0.41 0.04 0.14 2.22 0.76 5.49 0.9
22.4 9.29 12.88 2.05 102.49 8.1 246.11 30.22
Nbi_g01284 (ADC2)
0.94 1.09 2.74 5.54 3.51 1.85 19.08 5.19
1.08 1.08 0.94 0.73 3.35 3.1 5.67 2.72
Nbi_g02867 (UCC1)
29.51 24.18 26.02 28.21 48.08 29.05 59.94 26.51
3.31 3.79 2.11 2.95 4.58 4.66 15.92 5.31
16.35 25.52 19.7 19.13 33.49 21.9 56.62 29.08
0.06 0.0 0.0 0.0 2.76 0.61 31.55 22.84
0.0 0.0 0.0 0.0 8.19 5.08 19.81 0.0
Nbi_g04228 (PDR11)
1.06 0.53 0.38 0.35 2.56 0.59 3.29 2.05
0.0 0.06 0.08 0.0 4.37 2.33 9.14 1.5
Nbi_g04607 (GST8)
0.21 0.15 0.02 0.09 1.4 0.46 5.63 0.91
2.9 1.7 0.99 1.94 7.84 2.09 14.55 4.09
0.38 0.22 0.12 0.07 3.18 0.13 4.84 1.17
Nbi_g06079 (EXP10)
38.3 4.96 7.78 0.62 55.64 6.8 178.23 32.33
Nbi_g06210 (CYP71B34)
2.29 5.78 0.0 0.72 9.2 7.37 21.41 3.23
8.52 7.35 7.6 7.5 17.59 16.22 59.66 22.7
3.74 8.06 12.54 5.1 26.98 4.19 62.52 12.73
0.58 0.16 0.25 0.12 2.38 0.63 2.74 0.85
Nbi_g06663 (PDR12)
0.84 1.44 0.31 0.29 2.2 0.84 4.09 1.55
0.41 0.06 0.17 0.01 1.07 0.17 2.31 0.29
0.95 0.63 0.9 0.72 2.12 2.19 8.93 3.93
0.92 0.12 0.0 0.0 1.7 0.12 2.96 0.56
Nbi_g07947 (UGT85A7)
0.0 0.33 0.24 0.2 7.62 3.52 7.46 3.73
1.83 0.61 0.0 0.23 5.65 0.8 8.05 0.76
0.0 0.0 0.3 0.0 0.58 0.67 2.51 0.0
Nbi_g08534 (GT72B1)
3.64 0.37 4.98 0.0 17.34 1.79 7.7 2.01
0.75 0.0 0.31 0.0 7.88 2.66 25.08 2.73
0.08 0.0 0.0 0.0 1.65 0.13 20.57 2.79
Nbi_g08930 (EXPB1)
1.31 0.61 0.74 0.0 5.75 1.21 49.0 6.83
4.24 5.49 4.61 3.2 11.79 5.29 16.64 9.39
Nbi_g09043 (EXP10)
18.45 3.56 12.78 0.08 20.3 5.92 136.73 22.82
0.1 0.0 0.26 0.0 0.33 0.58 3.53 0.9
0.81 0.33 0.76 0.95 2.6 0.81 4.53 2.18
0.23 0.03 0.15 0.06 2.01 0.15 1.68 0.26
Nbi_g10111 (LHB1B2)
83.58 34.29 133.29 6.36 150.38 1.16 1574.57 209.23
0.31 0.16 0.16 0.4 0.72 0.66 4.48 0.47
Nbi_g10402 (CYP76C2)
2.51 0.7 0.0 0.23 4.02 3.2 16.38 2.28
1.87 2.25 0.12 0.5 3.78 0.27 12.96 0.67
0.0 0.0 0.0 0.0 1.01 0.82 3.04 0.17
Nbi_g11366 (AGL3)
24.37 23.9 4.08 32.29 63.8 30.13 120.47 47.96
Nbi_g11856 (PDR6)
0.78 0.6 0.52 0.51 1.28 0.87 2.2 1.18
1.53 1.05 0.96 0.04 3.1 1.35 2.92 0.71
0.0 0.0 0.0 0.0 0.99 0.91 3.42 0.17
Nbi_g12465 (OMT1)
3.92 1.61 0.05 0.43 10.71 0.85 10.82 1.27
2.72 0.46 0.87 0.21 5.35 0.49 12.93 5.91
15.78 4.56 0.8 3.83 56.06 16.26 135.25 17.45
0.23 0.06 0.18 0.04 2.26 0.68 2.07 0.43
3.15 4.55 4.68 3.66 11.82 9.0 15.31 7.34
1.57 0.32 0.0 0.08 4.68 2.0 18.01 5.23
0.18 0.0 0.0 0.08 1.59 1.55 4.57 0.46
0.66 0.32 0.07 0.17 1.42 1.39 2.38 0.12
0.02 0.09 0.41 0.08 1.56 0.19 7.06 1.16
2.04 1.26 2.1 1.35 7.99 0.79 14.94 6.33
0.51 0.08 0.0 0.0 1.81 0.2 2.82 0.29
0.0 0.0 0.1 0.0 0.19 0.0 2.23 0.65
Nbi_g14488 (CHS)
0.0 0.0 0.0 0.29 0.3 0.41 1.86 0.29
20.92 8.06 0.98 3.87 52.47 26.83 156.58 16.08
10.0 5.62 1.5 2.49 37.26 3.31 63.12 3.37
0.03 1.45 0.03 0.0 15.02 9.04 74.63 12.06
Nbi_g16629 (EXP10)
18.18 1.92 0.31 0.14 22.73 3.23 70.93 6.66
12.26 17.66 2.09 3.98 52.91 11.47 92.54 14.12
Nbi_g18197 (UGT85A1)
1.94 0.17 1.99 0.43 6.6 1.73 10.74 3.12
7.01 3.1 6.87 1.78 19.37 7.47 44.47 12.04
0.79 0.44 0.04 0.07 4.99 4.09 16.61 4.42
Nbi_g18871 (HCT)
1.92 1.05 0.03 0.23 5.49 1.76 11.65 2.18
1.03 8.47 3.18 2.59 21.03 3.9 53.74 6.46
0.01 1.43 0.0 0.03 7.57 5.8 53.96 7.23
3.02 2.94 1.13 2.32 11.12 0.63 18.45 3.43
Nbi_g21028 (OMT1)
0.31 0.29 0.0 0.0 1.17 0.95 2.43 0.55
2.6 4.06 2.22 7.1 8.29 5.32 13.28 8.48
0.0 0.12 0.0 0.11 0.39 0.11 2.48 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 1.78 0.83 82.22 17.58
0.0 0.0 0.0 0.0 0.96 1.25 4.2 0.15
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 2.53 0.19
0.0 0.0 0.05 0.0 0.14 0.2 1.99 0.0
0.04 0.0 0.0 0.0 0.21 0.03 24.09 4.41
0.59 1.08 0.57 0.95 1.06 1.4 3.03 1.33
0.1 0.0 0.0 0.21 0.33 1.1 5.96 0.63
9.39 4.04 0.15 0.6 9.59 4.52 40.13 7.93
0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.41 1.89 0.64
0.23 7.28 2.25 3.61 14.61 3.19 42.36 8.2
0.46 0.14 0.06 0.44 0.62 0.58 2.58 0.23
1.75 1.37 0.0 0.41 4.88 0.1 7.1 1.0
0.15 0.15 0.3 0.08 0.94 0.73 2.01 0.05
1.07 1.98 1.43 0.27 5.23 1.14 9.58 1.61
0.0 0.34 1.36 0.22 2.77 2.95 8.95 0.92
0.37 5.91 3.79 3.01 23.07 10.72 17.92 4.74
1.37 1.83 0.03 0.5 2.44 0.44 7.86 0.22
0.0 0.0 0.33 0.0 0.06 1.37 23.6 9.65
0.31 0.25 0.0 0.0 0.0 0.0 16.23 0.27
1.19 8.41 0.94 3.03 30.42 4.54 39.0 9.86
20.75 4.59 2.23 2.2 99.07 27.8 131.74 35.41
0.0 0.0 0.51 0.0 2.07 0.0 3.31 0.43
0.06 0.07 0.18 0.0 0.82 0.33 2.1 0.03
0.69 0.49 1.62 0.47 3.71 2.0 6.88 4.44
Nbi_g24698 (CYP71A25)
0.23 0.12 0.0 0.05 2.41 1.12 9.81 1.28
Nbi_g24717 (EXP10)
5.47 1.17 5.79 0.68 25.6 9.34 117.75 21.53
0.13 0.26 0.27 0.13 0.57 0.58 1.93 0.44
0.5 0.3 0.44 0.51 1.66 0.99 2.55 0.65
0.13 0.0 0.0 0.25 0.0 0.0 1.86 0.0
Nbi_g25119 (TT7)
2.31 3.67 0.53 2.13 6.57 3.76 10.08 4.66
0.32 0.2 0.13 0.0 1.11 0.0 3.83 0.8
Nbi_g25545 (FKBP12)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 2.7 1.16
0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.07 5.91 0.42
0.22 0.32 0.16 0.32 6.51 1.8 11.21 1.75
0.13 0.0 0.49 0.11 0.0 0.13 2.29 0.0
Nbi_g25957 (CHS)
0.09 0.49 0.14 0.38 1.54 1.14 13.52 0.39
Nbi_g26327 (OMT1)
0.08 0.12 0.0 0.05 0.39 0.69 3.54 0.97
0.0 0.08 0.02 0.02 0.61 0.02 6.43 0.02
0.15 0.45 0.0 0.02 0.68 0.02 6.68 0.02
0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.1 3.45 0.08
0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 1.03 18.47 0.2
0.38 0.11 0.01 0.06 1.29 0.59 3.18 0.49
0.49 0.19 0.11 0.9 0.86 0.94 4.94 0.44
0.65 0.06 0.04 0.0 0.21 0.49 4.42 0.15
Nbi_g26766 (ATF1)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 2.93 0.53
0.02 0.01 0.0 0.01 0.13 0.21 3.61 0.2
0.0 0.0 0.0 0.02 0.32 0.62 3.34 1.12
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.34 3.46 1.16
14.51 16.89 12.2 17.72 19.05 15.16 28.44 15.39
0.35 0.12 0.0 0.0 0.66 0.36 3.61 0.28
Nbi_g27681 (HTA6)
0.4 0.0 2.73 0.0 3.66 0.73 7.31 2.27
2.62 5.18 5.22 2.78 9.4 6.9 28.1 5.6
0.82 0.17 0.24 0.0 1.62 0.62 2.62 0.79
3.99 2.69 3.26 3.2 5.03 5.75 13.29 4.51
0.36 0.0 0.0 0.0 2.58 0.71 3.18 0.29
0.31 0.86 0.0 0.34 0.73 0.76 4.59 0.29
0.0 0.0 0.0 0.31 0.28 0.11 4.68 0.4
0.27 0.09 0.04 0.11 1.14 0.37 2.39 0.17
0.4 0.0 1.02 0.0 0.54 0.1 4.55 0.0
0.04 0.0 0.03 0.0 0.13 0.34 4.76 0.68
0.11 1.65 0.34 0.69 2.89 1.76 7.64 3.05
0.41 0.47 0.88 0.65 0.52 0.63 2.11 0.53
0.0 1.3 0.22 0.6 1.17 0.67 2.87 0.79
0.08 0.05 0.16 0.09 1.4 0.76 5.68 1.26
Nbi_g34676 (GST8)
0.12 0.04 0.04 0.05 5.03 1.77 23.4 3.57
0.8 0.82 0.56 0.9 1.28 1.13 2.26 0.74
Nbi_g35042 (STP7)
0.57 0.3 0.0 0.01 0.49 0.61 3.45 0.58
0.77 0.35 0.11 0.09 1.53 1.66 4.42 1.06
1.25 0.49 0.67 0.58 0.57 0.76 3.31 0.43
0.4 0.12 0.27 0.06 9.61 2.35 22.74 7.67
7.06 4.21 3.38 5.33 40.57 7.78 90.31 20.07
2.59 0.58 2.39 0.56 9.12 1.02 5.65 2.0
Nbi_g38943 (HMG1)
2.24 0.87 0.89 0.73 3.44 2.99 18.14 6.28
1.37 22.52 0.06 3.89 47.2 15.63 280.32 67.34
0.89 1.19 1.57 0.49 1.77 1.03 8.77 1.44
Nbi_g39999 (STI)
3.58 3.32 4.2 3.21 6.6 4.82 20.56 7.77
0.99 4.73 0.78 2.15 15.35 4.77 9.72 1.57
5.78 1.49 5.71 0.26 21.65 10.05 65.9 23.29
0.38 0.08 0.6 0.67 3.17 1.45 5.56 0.17
Nbi_g40642 (NUDX1)
8.14 6.48 10.98 4.82 31.72 13.82 84.24 17.87
0.3 0.62 0.43 0.0 0.95 0.49 5.41 2.66
0.0 0.52 0.0 0.13 3.0 0.71 12.17 0.33
10.92 9.17 10.55 6.02 20.91 12.17 18.98 14.52
Nbi_g42633 (CYP71A14)
0.0 0.07 0.0 0.41 0.08 2.17 10.58 4.54
Nbi_g42743 (CXE17)
6.14 4.45 6.42 1.93 29.51 14.46 97.53 37.15
53.56 4.22 2.87 0.59 57.56 9.09 187.15 16.67
0.77 3.25 1.39 1.17 4.5 4.66 41.15 6.27
0.36 0.11 0.4 0.0 7.08 1.88 11.86 4.92
0.0 0.0 0.0 0.05 0.27 2.99 14.88 3.35
0.32 0.07 0.63 0.04 0.49 0.49 2.4 0.81
12.23 2.28 7.03 0.79 32.78 10.98 72.66 16.42
Nbi_g43554 (SPL8)
0.04 0.26 0.0 0.4 1.11 0.31 7.79 1.67
0.06 0.07 0.25 0.0 0.93 0.96 8.63 3.66
Nbi_g44083 (TDX)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.27 2.63 0.92
Nbi_g44432 (WAT1)
0.81 0.12 0.0 0.02 5.8 1.73 25.55 10.32
0.57 0.26 0.0 0.0 8.78 11.41 144.85 28.11
0.64 0.39 0.81 0.28 1.3 1.76 5.75 1.36

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)