Heatmap: Cluster_3 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	Sterile Leaflet	Mature Sterile Leaflet	Fertile Leaflet with Sori	Petiole	Crozier	Rhizome	Stolon	Stolon with Root
Nbi_g00248 (SP1L2)	0.33	0.54	0.19	0.6	1.0	0.45	0.95	0.68
Nbi_g00402	0.01	0.39	0.15	0.18	0.58	0.16	1.0	0.51
Nbi_g00618 (GUT1)	0.59	0.69	0.52	0.74	0.91	0.59	1.0	0.77
Nbi_g00911	0.25	0.58	0.38	0.67	1.0	0.48	0.94	0.62
Nbi_g00932 (FLA17)	0.19	0.34	0.05	0.32	0.77	0.3	1.0	0.7
Nbi_g00992 (I9H)	0.21	0.56	0.3	0.32	0.85	0.25	1.0	0.46
Nbi_g01150 (GUX3)	0.06	0.45	0.07	0.31	0.95	0.2	1.0	0.44
Nbi_g01249	0.55	0.72	0.45	0.75	1.0	0.71	0.98	0.75
Nbi_g01486	0.34	0.68	0.38	0.66	1.0	0.57	0.94	0.66
Nbi_g01518 (MOR1)	0.41	0.49	0.28	0.48	0.77	0.42	1.0	0.98
Nbi_g01600	0.28	0.68	0.01	0.46	0.59	0.16	1.0	0.43
Nbi_g01832 (BAG4)	0.54	0.67	0.37	0.59	0.81	0.39	1.0	0.66
Nbi_g01895	0.62	0.71	0.59	0.7	0.9	0.63	1.0	0.78
Nbi_g01943 (LysoPL2)	0.05	0.39	0.17	0.14	0.62	0.31	1.0	0.45
Nbi_g02017 (BAG1)	0.29	0.55	0.07	0.54	0.98	0.34	1.0	0.5
Nbi_g02241	0.06	0.5	0.12	0.28	0.48	0.15	1.0	0.57
Nbi_g02329	0.65	0.65	0.52	0.62	0.96	0.53	1.0	0.9
Nbi_g02548	0.21	0.65	0.0	0.42	0.61	0.14	1.0	0.5
Nbi_g02654	0.43	0.57	0.31	0.66	1.0	0.53	1.0	0.59
Nbi_g02776	0.42	0.51	0.31	0.54	0.84	0.4	1.0	0.63
Nbi_g02781	0.63	0.6	0.54	0.67	0.73	0.59	1.0	0.66
Nbi_g02991 (LGT4)	0.55	0.7	0.44	0.63	0.93	0.5	1.0	0.78
Nbi_g02998 (GUT2)	0.22	0.57	0.17	0.34	0.77	0.14	1.0	0.51
Nbi_g03029	0.63	0.67	0.54	0.69	0.86	0.68	1.0	0.83
Nbi_g03651 (TBL23)	0.14	0.35	0.03	0.22	0.61	0.17	1.0	0.46
Nbi_g03855 (GRL)	0.25	0.41	0.23	0.47	0.69	0.39	1.0	0.83
Nbi_g03955	0.27	0.52	0.07	0.47	0.89	0.33	1.0	0.47
Nbi_g04090 (CCoAOMT1)	0.04	0.41	0.26	0.15	0.73	0.24	1.0	0.49
Nbi_g04235	0.64	0.53	0.52	0.52	1.0	0.51	0.94	0.9
Nbi_g04827 (LAC11)	0.03	0.39	0.03	0.19	0.9	0.01	1.0	0.06
Nbi_g05172	0.51	0.59	0.42	0.46	0.65	0.42	1.0	0.52
Nbi_g05401	0.22	0.49	0.0	0.33	0.59	0.12	1.0	0.45
Nbi_g05485 (CIP7)	0.38	0.59	0.24	0.58	0.85	0.38	1.0	0.58
Nbi_g05768	0.58	0.62	0.29	0.57	0.89	0.4	1.0	0.77
Nbi_g06336 (ALA1)	0.37	0.55	0.32	0.44	0.85	0.42	1.0	0.72
Nbi_g06895 (CAD5)	0.15	0.54	0.29	0.14	0.73	0.14	1.0	0.78
Nbi_g07138 (CSLC5)	0.24	0.33	0.05	0.22	0.69	0.32	1.0	0.88
Nbi_g07269 (CCR1)	0.11	0.46	0.37	0.22	0.53	0.21	1.0	0.62
Nbi_g07854 (TBL14)	0.34	0.43	0.13	0.35	0.55	0.39	1.0	0.66
Nbi_g07939 (ATK1)	0.14	0.31	0.07	0.23	0.64	0.23	1.0	0.63
Nbi_g07940	0.2	0.43	0.09	0.31	0.61	0.26	1.0	0.58
Nbi_g08585 (BAG1)	0.58	0.6	0.06	0.53	0.77	0.3	1.0	0.69
Nbi_g08636 (FIP2)	0.53	0.51	0.35	0.51	0.79	0.42	1.0	0.69
Nbi_g08845 (COBL1)	0.29	0.56	0.05	0.42	0.9	0.31	1.0	0.67
Nbi_g08881	0.55	0.71	0.57	0.76	0.98	0.61	1.0	0.77
Nbi_g09513 (RAC3)	0.44	0.71	0.48	0.74	0.98	0.63	1.0	0.71
Nbi_g09630 (MTHFR2)	0.38	0.58	0.3	0.49	0.88	0.3	1.0	0.44
Nbi_g09869	0.0	0.42	0.0	0.1	0.49	0.27	1.0	0.42
Nbi_g10144	0.42	0.45	0.18	0.47	0.88	0.36	1.0	0.91
Nbi_g10980 (FLA7)	0.02	0.3	0.02	0.09	0.55	0.11	1.0	0.5
Nbi_g12433	0.3	0.46	0.15	0.39	0.7	0.15	1.0	0.52
Nbi_g12473	0.56	0.78	0.54	0.68	1.0	0.64	1.0	0.68
Nbi_g12835 (UGE5)	0.5	0.52	0.35	0.49	0.78	0.51	1.0	0.86
Nbi_g13342	0.55	0.78	0.67	0.85	0.98	0.73	1.0	0.84
Nbi_g14016 (LCBK1)	0.29	0.67	0.51	0.61	0.91	0.54	1.0	0.65
Nbi_g14267	0.55	0.53	0.12	0.75	0.68	0.34	1.0	0.91
Nbi_g14698	0.09	0.51	0.26	0.3	0.66	0.29	1.0	0.48
Nbi_g15046 (AIR9)	0.12	0.31	0.09	0.25	0.64	0.28	1.0	0.71
Nbi_g15256	0.56	0.48	0.4	0.49	1.0	0.52	0.89	0.64
Nbi_g15355	0.06	0.54	0.19	0.23	0.69	0.12	1.0	0.39
Nbi_g15423 (QWRF8)	0.2	0.33	0.21	0.38	0.74	0.29	1.0	0.81
Nbi_g15678	0.57	0.67	0.5	0.72	1.0	0.58	0.93	0.74
Nbi_g15824	0.14	0.46	0.05	0.23	0.65	0.17	1.0	0.5
Nbi_g16649	0.71	0.71	0.48	0.92	1.0	0.88	1.0	0.91
Nbi_g16754	0.4	0.52	0.3	0.43	0.83	0.36	1.0	0.75
Nbi_g16820	0.32	0.64	0.32	0.5	0.86	0.42	1.0	0.74
Nbi_g18035	0.16	0.52	0.1	0.3	0.56	0.32	1.0	0.41
Nbi_g18059 (CSI1)	0.51	0.49	0.15	0.37	0.75	0.32	1.0	0.62
Nbi_g23269	0.7	0.68	0.48	0.74	0.97	0.66	1.0	0.88
Nbi_g23709	0.79	0.75	0.71	0.67	0.99	0.71	1.0	0.95
Nbi_g23908	0.46	0.47	0.22	0.46	0.84	0.4	1.0	0.81
Nbi_g25205 (HCT)	0.08	0.62	0.19	0.21	0.7	0.24	1.0	0.56
Nbi_g25978 (IXR1)	0.44	0.45	0.11	0.38	0.84	0.3	1.0	0.68
Nbi_g26244 (ATH-A)	0.18	0.4	0.04	0.34	0.7	0.31	1.0	0.69
Nbi_g26291 (ROP1)	0.77	0.63	0.53	0.63	1.0	0.62	0.97	0.8
Nbi_g26707	0.36	0.55	0.37	0.52	0.51	0.38	1.0	0.44
Nbi_g27086	0.4	0.38	0.33	0.4	0.42	0.29	1.0	0.32
Nbi_g27561	0.01	0.35	0.04	0.12	0.62	0.12	1.0	0.57
Nbi_g27565	0.14	0.51	0.05	0.43	1.0	0.23	0.94	0.62
Nbi_g27874	0.58	0.42	0.23	0.41	1.0	0.45	0.97	0.6
Nbi_g28652	0.56	0.63	0.35	0.61	0.88	0.47	1.0	0.65
Nbi_g31404	0.22	0.51	0.23	0.6	1.0	0.4	0.93	0.63
Nbi_g31913 (AGAL2)	0.25	0.47	0.05	0.21	0.56	0.27	1.0	0.6
Nbi_g36313	0.59	0.41	0.2	0.36	0.97	0.34	1.0	0.44
Nbi_g38315	0.24	0.3	0.06	0.19	0.62	0.26	1.0	0.73
Nbi_g39257	0.31	0.47	0.18	0.6	0.97	0.42	1.0	0.57
Nbi_g40636	0.14	0.27	0.03	0.21	0.58	0.25	1.0	0.62
Nbi_g40698 (ARA5)	0.47	0.52	0.35	0.54	0.75	0.39	1.0	0.76

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)