Heatmap: Cluster_30 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	Sterile Leaflet	Mature Sterile Leaflet	Fertile Leaflet with Sori	Petiole	Crozier	Rhizome	Stolon	Stolon with Root
Nbi_g00155	0.62	0.52	1.0	0.56	0.56	0.35	0.34	0.31
Nbi_g00680	1.0	0.39	0.67	0.51	0.34	0.15	0.17	0.22
Nbi_g01114 (NRAMP6)	0.93	0.76	1.0	0.68	0.71	0.35	0.53	0.5
Nbi_g02287	0.82	0.68	1.0	0.59	0.71	0.42	0.5	0.51
Nbi_g02864	1.0	0.48	0.87	0.47	0.47	0.17	0.18	0.19
Nbi_g03183	1.0	0.39	0.94	0.45	0.57	0.15	0.25	0.27
Nbi_g03441	0.77	0.68	1.0	0.61	0.66	0.22	0.45	0.33
Nbi_g03485 (ACHT1)	0.76	0.64	1.0	0.6	0.69	0.44	0.5	0.43
Nbi_g03803 (VAC1)	0.89	0.57	1.0	0.54	0.6	0.42	0.34	0.44
Nbi_g04637	0.88	0.64	1.0	0.58	0.69	0.35	0.47	0.41
Nbi_g04781	1.0	0.44	0.8	0.42	0.6	0.2	0.19	0.18
Nbi_g04989	0.82	0.78	1.0	0.7	0.7	0.37	0.51	0.49
Nbi_g04999	0.7	0.4	1.0	0.38	0.46	0.26	0.18	0.31
Nbi_g05482	1.0	0.57	0.94	0.55	0.79	0.35	0.36	0.3
Nbi_g05646	1.0	0.51	0.88	0.49	0.7	0.35	0.39	0.4
Nbi_g06114	0.78	0.75	1.0	0.65	0.66	0.44	0.55	0.44
Nbi_g06203	0.96	0.63	1.0	0.59	0.73	0.42	0.37	0.42
Nbi_g06328	1.0	0.77	0.94	0.81	0.71	0.38	0.47	0.42
Nbi_g06654	1.0	0.43	0.95	0.54	0.58	0.35	0.25	0.28
Nbi_g06656 (OTP84)	0.78	0.59	1.0	0.59	0.64	0.37	0.21	0.36
Nbi_g06820	1.0	0.62	0.93	0.7	0.72	0.26	0.34	0.29
Nbi_g07066	0.77	0.38	1.0	0.4	0.47	0.19	0.16	0.21
Nbi_g07162	0.86	0.65	1.0	0.67	0.75	0.41	0.56	0.49
Nbi_g07543	0.81	0.58	1.0	0.53	0.54	0.5	0.32	0.4
Nbi_g07554 (VAC1)	0.85	0.6	1.0	0.65	0.74	0.4	0.37	0.37
Nbi_g07936	0.77	0.72	1.0	0.56	0.84	0.43	0.53	0.45
Nbi_g08399	0.81	0.46	1.0	0.46	0.57	0.28	0.3	0.35
Nbi_g08461	0.91	0.46	1.0	0.52	0.68	0.24	0.57	0.39
Nbi_g08833 (PTAC3)	1.0	0.41	0.86	0.46	0.35	0.15	0.2	0.27
Nbi_g10281 (VAC1)	1.0	0.62	0.91	0.71	0.57	0.35	0.39	0.46
Nbi_g10982 (ftsh4)	0.8	0.72	1.0	0.62	0.77	0.51	0.61	0.56
Nbi_g11753 (PPDK)	0.67	0.67	1.0	0.47	0.55	0.18	0.3	0.17
Nbi_g12506	0.76	0.72	1.0	0.67	0.69	0.47	0.53	0.51
Nbi_g12682 (EMB2751)	0.9	0.79	1.0	0.78	0.69	0.39	0.52	0.38
Nbi_g12902	0.83	0.53	1.0	0.44	0.71	0.39	0.47	0.37
Nbi_g13119	0.87	0.71	1.0	0.54	0.64	0.26	0.31	0.28
Nbi_g13749	0.92	0.7	1.0	0.72	0.74	0.49	0.42	0.49
Nbi_g14673	1.0	0.44	0.86	0.52	0.53	0.31	0.42	0.32
Nbi_g15299	1.0	0.5	0.93	0.5	0.7	0.32	0.39	0.34
Nbi_g15421 (CRR22)	0.98	0.61	1.0	0.75	0.62	0.42	0.51	0.48
Nbi_g15700	1.0	0.52	0.97	0.54	0.65	0.45	0.39	0.4
Nbi_g17040	0.88	0.69	1.0	0.59	0.7	0.39	0.43	0.32
Nbi_g17413	1.0	0.43	0.77	0.56	0.46	0.29	0.13	0.11
Nbi_g17962 (DECR)	0.88	0.66	1.0	0.48	0.72	0.2	0.25	0.18
Nbi_g18568	0.93	0.5	1.0	0.51	0.65	0.24	0.29	0.25
Nbi_g19047	0.72	0.66	1.0	0.54	0.58	0.22	0.13	0.32
Nbi_g19343	1.0	0.36	0.84	0.32	0.58	0.11	0.21	0.11
Nbi_g21707	0.67	0.52	1.0	0.47	0.54	0.26	0.2	0.24
Nbi_g21944	0.86	0.24	1.0	0.17	0.44	0.08	0.08	0.03
Nbi_g23246	1.0	0.5	0.79	0.6	0.43	0.25	0.18	0.26
Nbi_g23419 (OPCL1)	0.94	0.54	1.0	0.66	0.73	0.32	0.59	0.46
Nbi_g23758	1.0	0.46	0.82	0.51	0.61	0.3	0.28	0.32
Nbi_g25275	0.77	0.56	1.0	0.59	0.76	0.34	0.25	0.3
Nbi_g25376	0.7	0.54	1.0	0.46	0.69	0.25	0.24	0.34
Nbi_g25628	1.0	0.69	0.88	0.78	0.74	0.51	0.55	0.59
Nbi_g27635	0.72	0.58	1.0	0.56	0.71	0.41	0.39	0.44
Nbi_g28710	0.66	0.55	1.0	0.46	0.47	0.27	0.21	0.33
Nbi_g28886	1.0	0.38	0.83	0.37	0.59	0.23	0.33	0.26
Nbi_g33692	0.83	0.44	1.0	0.38	0.7	0.37	0.33	0.38
Nbi_g36343	0.8	0.51	1.0	0.38	0.43	0.11	0.35	0.19
Nbi_g38558	1.0	0.47	0.98	0.45	0.67	0.24	0.25	0.26
Nbi_g38654 (DOT4)	0.87	0.7	1.0	0.64	0.68	0.49	0.55	0.45
Nbi_g39268	0.72	0.58	1.0	0.43	0.42	0.3	0.31	0.35
Nbi_g40082	0.95	0.63	1.0	0.62	0.75	0.41	0.45	0.42

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)