Heatmap: Cluster_154 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
Sterile Leaflet
Mature Sterile Leaflet
Fertile Leaflet with Sori
Petiole
Crozier
Rhizome
Stolon
Stolon with Root
28.55 29.49 30.94 26.01 36.17 18.93 40.46 39.11
22.76 26.43 22.16 25.18 31.59 30.51 35.23 29.24
34.73 43.31 52.0 43.83 40.42 30.87 44.09 49.24
Nbi_g00823 (ENDO 2)
28.1 32.98 49.42 30.16 34.48 25.09 39.61 43.73
Nbi_g00843 (MEE18)
5.55 7.27 8.24 5.9 8.36 4.03 9.87 8.72
Nbi_g00983 (NADK1)
9.77 8.55 11.78 7.09 12.42 8.58 12.16 11.75
11.55 9.26 12.98 8.32 17.43 6.47 17.2 14.45
15.42 16.72 16.87 14.95 18.12 12.42 17.19 18.11
Nbi_g01043 (LTA1)
4.73 6.29 6.87 5.77 5.69 5.44 7.98 6.22
25.13 22.95 31.03 24.07 24.85 20.73 25.47 23.65
14.37 15.83 19.2 16.33 17.8 13.36 16.34 16.21
26.45 21.91 27.78 17.42 26.85 23.07 35.21 27.68
8.0 8.91 11.14 9.73 13.52 6.82 12.55 12.34
Nbi_g01399 (APG9)
8.07 8.88 12.05 8.41 9.97 7.94 10.68 10.86
15.96 24.18 33.65 18.09 22.52 19.93 26.23 25.52
24.24 18.94 40.95 13.79 24.32 16.78 26.46 25.39
22.13 31.21 35.06 28.77 26.19 20.33 24.93 22.87
Nbi_g01717 (MUB6)
59.16 72.7 88.45 62.06 64.76 58.36 83.53 72.57
72.9 62.61 78.96 54.14 65.85 63.47 72.76 64.74
Nbi_g02138 (CAX2)
37.48 26.23 47.16 24.91 34.15 21.69 41.07 39.16
7.8 8.77 10.76 8.42 10.39 7.64 9.78 9.53
3.32 3.81 5.34 3.88 4.71 2.83 4.08 4.32
Nbi_g02232 (BAM2)
9.01 11.07 12.09 9.81 14.4 9.13 12.18 11.78
12.46 11.98 15.62 11.75 13.39 10.32 12.26 11.04
Nbi_g02507 (PGP6)
9.36 9.58 14.45 7.88 10.34 8.91 8.99 9.7
36.04 33.8 46.33 30.76 45.58 28.84 60.6 47.35
4.01 13.95 11.89 12.64 9.91 7.94 9.39 12.1
Nbi_g03505 (RBL15)
23.43 30.94 26.48 34.78 31.66 26.0 36.83 34.27
17.15 21.18 21.75 23.4 22.27 17.63 24.39 23.55
38.55 40.03 56.56 42.12 46.53 35.88 45.5 51.72
Nbi_g04125 (NDT1)
15.02 12.38 16.84 12.74 15.07 13.0 14.33 14.8
22.43 22.53 24.78 16.71 28.73 14.84 31.12 21.37
7.24 10.75 9.65 10.8 10.03 7.75 10.59 10.61
36.65 31.04 40.32 29.69 33.33 26.18 37.9 33.55
11.83 9.62 13.54 9.43 13.86 8.35 13.61 11.34
12.85 12.17 13.33 10.99 15.21 10.21 15.97 13.81
51.26 51.34 74.02 59.32 76.28 50.02 73.06 68.18
13.74 14.56 21.94 15.13 17.4 13.4 20.21 18.81
19.05 25.41 26.93 23.93 24.51 17.38 24.82 25.72
Nbi_g05412 (UBP18)
9.58 10.29 11.33 9.28 10.85 8.96 10.57 9.89
40.66 53.96 54.26 54.35 51.53 38.21 58.94 50.94
Nbi_g05784 (MHX)
2.72 1.98 3.47 1.87 3.72 1.84 3.83 2.47
Nbi_g05797 (MKK3)
12.23 17.15 20.35 15.17 17.47 12.3 17.14 18.45
17.3 23.15 26.44 18.39 33.38 24.85 37.64 28.26
3.25 4.17 5.47 4.15 5.88 3.62 5.82 5.79
Nbi_g07389 (PS3)
17.15 21.5 25.26 21.77 21.72 16.91 23.03 22.45
2.47 2.68 3.06 2.24 3.77 2.64 3.72 3.3
Nbi_g08262 (SAG18)
14.44 20.85 22.16 20.38 18.72 14.51 20.45 20.85
27.84 16.27 26.61 18.67 33.78 17.61 35.77 30.75
Nbi_g08962 (G6PD2)
3.0 2.15 4.28 2.45 3.54 1.69 3.93 3.01
Nbi_g09143 (RD21)
237.38 161.34 275.28 178.25 353.42 197.09 350.44 255.22
Nbi_g09335 (BRK1)
12.01 11.13 23.7 16.44 15.05 8.62 15.61 15.21
8.17 10.82 12.65 8.46 10.84 7.35 10.12 11.68
Nbi_g09433 (RD21)
461.43 309.43 485.05 299.57 687.8 287.93 811.58 535.75
Nbi_g09563 (RD19)
192.27 243.98 275.51 249.16 280.77 181.75 274.24 302.17
21.63 15.5 24.39 18.77 25.2 19.71 26.94 22.24
34.99 36.85 64.01 35.34 50.84 20.06 41.82 41.89
35.97 44.97 45.76 48.79 49.21 34.99 49.08 44.02
2.27 1.74 2.66 1.72 3.43 1.81 2.86 2.21
19.05 25.62 35.41 19.08 22.03 18.77 28.34 25.84
4.31 6.63 5.44 7.12 6.97 5.12 8.28 7.69
17.8 15.13 24.87 16.49 26.99 19.71 26.59 20.62
0.41 1.21 3.35 1.18 0.42 0.91 1.44 2.41
Nbi_g13155 (ERD5)
2.34 7.76 8.59 9.0 8.19 4.8 14.62 8.18
Nbi_g13468 (SAG18)
8.41 11.14 10.67 8.83 11.12 7.29 14.58 10.57
Nbi_g13491 (UBP2)
4.11 4.64 5.49 4.65 5.67 4.35 5.28 4.85
8.71 6.73 10.48 3.68 7.03 6.28 11.19 7.14
Nbi_g13883 (SNF4)
15.72 18.0 20.57 15.53 23.01 14.82 21.43 20.58
Nbi_g13957 (SPHK1)
6.42 6.83 7.87 8.2 6.78 6.56 7.63 8.23
27.41 25.13 29.44 25.53 34.0 20.85 40.34 32.15
23.81 27.0 29.09 27.07 22.33 23.18 25.24 31.54
27.11 27.56 30.73 23.63 32.81 22.11 42.0 33.55
87.28 72.97 103.42 65.54 69.77 38.26 80.47 73.12
26.12 34.48 43.03 38.73 31.53 26.18 42.09 42.29
24.14 26.62 28.27 23.89 32.08 21.2 31.91 24.78
6.01 6.9 10.57 7.07 8.5 6.0 8.73 8.17
12.09 11.73 15.84 11.67 14.3 10.03 14.89 12.41
3.36 2.77 8.04 4.64 5.1 3.82 4.74 3.34
Nbi_g17557 (SAY1)
12.27 12.63 16.83 11.36 13.0 9.81 14.51 13.64
Nbi_g17845 (FC2)
14.02 14.02 17.8 12.57 21.84 11.31 20.62 19.33
24.02 31.15 29.72 30.18 33.53 24.47 31.83 33.58
2.78 2.29 5.36 1.05 4.59 1.29 3.68 2.37
24.18 26.32 32.69 25.92 24.2 20.3 24.02 30.63
12.29 11.74 13.0 11.38 15.0 8.37 13.8 12.87
19.12 25.97 27.25 23.42 22.4 20.5 22.99 21.28
0.35 1.76 8.86 5.93 0.8 0.58 3.34 1.57
8.88 22.58 23.51 24.1 22.73 13.16 38.91 20.09
3.16 3.72 6.79 2.88 5.26 3.73 7.77 5.14
Nbi_g24051 (ALIS1)
20.45 17.11 21.22 13.9 22.91 17.22 29.37 21.98
2.16 1.36 2.59 1.48 3.26 1.55 3.38 3.07
10.64 9.21 13.32 8.01 11.39 9.44 12.23 10.45
6.75 6.55 8.2 6.64 7.81 6.77 8.14 7.9
Nbi_g25494 (PLSP1)
24.71 16.42 28.76 13.71 37.17 18.23 41.96 28.7
3.58 3.84 6.15 2.2 5.41 3.38 6.31 6.0
2.05 1.92 3.3 1.64 3.24 1.72 3.44 2.17
27.56 25.73 40.08 27.6 36.76 18.21 36.1 32.59
60.89 74.13 73.82 73.62 58.96 44.91 91.97 73.78
13.71 16.87 22.34 15.4 21.71 14.63 20.4 15.29
0.0 0.67 3.35 0.53 1.09 0.06 1.09 2.06
Nbi_g29236 (RAPTOR1)
19.76 18.82 26.28 18.28 27.14 16.15 25.64 25.8
4.57 6.64 5.86 6.42 6.55 4.96 6.99 7.31
3.52 3.31 5.25 3.86 5.48 3.11 5.43 4.84
Nbi_g30846 (DND1)
3.55 6.08 9.2 5.98 3.59 4.24 5.31 7.05
14.06 21.95 20.4 20.34 20.07 15.93 19.8 22.46
Nbi_g31905 (AIP2)
13.09 12.96 23.14 13.23 15.4 13.88 17.23 14.44
37.48 39.31 32.33 35.82 50.48 21.02 53.35 37.49
Nbi_g34064 (SUT2)
11.0 10.58 10.43 10.59 13.18 6.77 14.43 12.32
2.99 2.95 3.96 1.7 1.99 3.4 3.77 1.84
17.61 21.5 32.54 23.57 31.05 22.08 28.8 28.17
7.7 7.32 11.82 5.77 10.33 3.84 9.8 8.13
2.37 1.88 3.1 1.49 2.64 1.39 2.6 2.34
14.41 18.02 16.39 15.41 20.46 12.49 21.42 17.9
0.29 0.35 6.66 1.73 3.24 2.3 3.79 5.39

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)