Heatmap: Cluster_40 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
Sterile Leaflet
Mature Sterile Leaflet
Fertile Leaflet with Sori
Petiole
Crozier
Rhizome
Stolon
Stolon with Root
35.1 2.35 23.93 0.11 29.78 0.0 1.95 0.13
40.6 6.61 37.54 3.28 50.08 6.76 20.36 8.71
16.47 4.85 7.78 3.06 8.06 0.94 4.05 0.69
Nbi_g00711 (LIP1)
13.96 2.98 4.53 1.27 8.56 1.66 3.67 1.4
28.08 10.9 16.81 8.54 17.44 7.47 11.52 6.91
45.17 26.05 39.33 23.34 38.45 15.02 30.91 18.66
4.21 2.02 2.96 1.0 3.93 1.68 1.88 1.69
2.13 0.07 1.37 0.18 2.56 0.67 0.53 0.17
113.36 18.63 36.0 3.92 120.17 3.98 54.9 10.93
Nbi_g02214 (UVR3)
6.77 1.86 4.9 1.31 5.69 0.33 0.98 0.37
Nbi_g02386 (GUN1)
24.74 12.01 22.78 9.42 15.97 6.68 9.65 8.34
1.79 0.36 1.29 0.17 2.25 0.31 0.5 0.33
22.08 14.14 17.76 13.36 18.31 10.35 14.08 11.86
67.59 14.02 42.42 10.12 32.93 4.32 17.66 5.54
46.36 14.81 28.23 5.68 22.97 4.22 11.35 4.48
10.17 4.25 5.21 2.85 9.5 3.05 4.19 2.48
Nbi_g02969 (GFA2)
15.77 10.84 14.52 10.28 15.17 9.07 11.41 8.99
9.38 2.71 6.78 2.15 8.43 1.54 2.92 2.33
41.95 13.71 19.18 2.55 35.9 0.37 2.73 1.25
517.47 94.02 22.78 4.69 527.03 3.74 160.61 39.55
Nbi_g03618 (DXR)
82.34 40.96 54.65 35.89 59.55 21.67 49.85 31.82
35.0 12.15 14.58 10.54 23.01 3.36 12.74 7.27
17.11 1.09 6.55 0.29 11.24 0.25 2.73 1.29
Nbi_g03822 (IDD2)
18.64 11.35 12.61 7.84 21.37 5.15 7.72 6.16
52.35 27.17 43.28 30.68 43.61 18.87 33.85 21.12
100.17 18.61 35.28 15.88 53.62 4.47 11.11 6.97
60.26 24.56 47.12 22.13 48.32 11.14 31.8 11.01
Nbi_g04111 (PSBY)
264.92 59.92 129.75 43.43 179.83 14.23 77.69 25.37
Nbi_g04183 (APX4)
132.5 11.93 50.71 4.36 57.06 0.99 15.63 1.88
Nbi_g04234 (ZFP10)
7.71 1.67 4.57 0.58 4.25 1.95 1.32 1.14
19.77 7.84 15.45 6.45 25.02 3.31 8.63 4.13
11.65 2.22 5.02 1.58 6.5 0.61 2.78 1.02
6.77 1.13 1.3 0.84 6.85 1.02 3.61 1.32
Nbi_g04942 (SPL8)
10.05 0.85 6.41 0.07 11.69 0.08 0.47 0.43
93.18 20.71 58.73 19.11 45.27 9.89 16.17 10.03
83.82 8.33 40.64 0.18 54.39 0.06 12.72 0.73
100.15 41.26 48.84 22.09 83.09 10.32 38.17 13.7
9.52 3.69 4.46 1.99 7.72 1.49 4.75 1.77
7.77 2.01 5.25 0.41 4.28 0.11 0.29 0.12
1170.58 246.1 482.85 189.33 898.44 47.59 404.65 224.04
32.63 5.52 19.03 4.05 18.06 0.76 4.21 1.36
7.04 2.93 4.54 2.78 4.79 1.35 5.12 3.07
36.0 3.08 10.87 0.95 12.46 0.94 6.16 2.62
Nbi_g05847 (CRK)
16.54 8.39 11.77 6.26 16.66 3.86 8.48 5.2
30.83 2.31 18.22 2.5 21.84 5.89 7.18 5.57
17.17 7.14 9.04 6.46 19.37 5.12 10.23 5.64
25.58 9.24 1.83 3.89 12.55 1.7 2.89 2.78
165.18 45.45 72.11 25.39 100.68 11.25 22.31 12.46
275.21 50.26 144.66 39.17 136.5 18.32 28.47 17.16
Nbi_g06531 (SGS3)
34.23 15.45 21.47 16.66 23.89 8.19 22.34 13.28
68.43 22.17 38.98 20.84 48.69 11.64 25.73 10.55
Nbi_g06562 (CIA5)
26.67 14.92 19.47 16.68 22.87 12.54 19.02 13.82
11.73 2.55 6.79 1.38 9.69 2.46 4.32 1.97
Nbi_g06660 (CRR2)
9.48 2.51 2.97 1.89 4.5 0.99 1.28 1.26
13.58 5.96 10.4 6.17 15.03 8.86 8.6 8.52
Nbi_g06808 (PTAC2)
7.51 4.74 7.44 4.03 7.24 3.66 4.36 3.11
Nbi_g06836 (ALDH11A3)
114.0 45.24 77.0 54.3 92.37 33.63 111.68 56.37
Nbi_g07243 (DFB)
14.99 5.24 9.49 3.06 8.52 2.86 4.76 5.26
109.63 6.06 0.18 0.52 39.18 0.06 0.13 0.03
Nbi_g07518 (LIP1)
24.62 3.69 8.07 0.89 27.69 1.08 12.17 3.23
10.4 0.5 2.76 0.05 5.58 1.47 3.2 1.04
14.79 1.69 7.39 0.75 10.92 0.97 1.28 1.12
Nbi_g07932 (emb1211)
30.01 10.81 16.47 9.87 20.87 5.48 13.13 5.94
39.75 7.98 14.73 7.85 22.31 2.68 5.01 3.52
Nbi_g08225 (OMT1)
279.91 30.82 13.23 15.31 110.51 7.56 74.18 53.81
25.93 6.75 18.57 6.36 24.73 2.91 6.71 2.79
22.38 9.29 8.38 5.87 20.44 1.3 5.86 1.27
Nbi_g08831 (PME2)
20.57 4.53 0.82 1.58 18.51 4.28 1.15 1.29
Nbi_g09275 (MEX1)
1.94 0.24 0.93 0.01 0.68 0.01 0.06 0.0
Nbi_g09385 (PAL4)
21.6 7.46 7.21 7.79 20.35 4.82 8.11 5.19
84.31 27.59 51.97 32.34 65.69 7.88 29.53 11.19
297.9 98.99 187.61 108.1 235.27 71.09 271.69 166.26
Nbi_g09762 (HY4)
20.73 8.34 18.75 8.27 18.02 6.23 7.89 6.9
7.08 2.28 4.57 0.55 5.07 1.5 1.54 0.42
31.1 9.74 10.84 5.74 17.39 2.17 2.31 0.51
811.75 164.24 270.51 126.77 427.39 17.66 191.75 38.68
8.7 1.44 6.73 0.87 10.09 1.8 4.01 2.18
12.07 5.08 7.75 4.61 8.53 3.22 5.02 3.85
Nbi_g11258 (YLMG2)
33.75 7.36 15.94 4.52 18.8 1.88 7.14 4.37
8.65 2.28 3.56 1.99 5.15 1.3 2.38 1.49
3.1 0.99 1.44 1.03 2.47 0.32 1.33 0.94
Nbi_g11740 (BLH2)
4.91 0.66 4.3 0.65 3.78 0.16 0.06 0.08
Nbi_g11773 (CH1)
12.29 1.43 3.18 0.78 5.06 0.24 4.95 0.89
Nbi_g11774 (CH1)
13.24 1.48 2.82 0.85 5.67 0.42 4.58 0.6
2.47 0.2 0.86 0.02 3.23 0.11 1.43 0.32
4.32 1.1 2.33 0.65 3.34 0.29 0.32 0.26
27.34 6.64 8.63 5.98 33.43 6.95 16.87 7.53
Nbi_g12287 (LUT5)
54.5 16.19 20.54 12.72 46.35 5.69 24.24 7.02
26.81 4.8 13.88 5.28 12.94 1.41 5.93 4.08
Nbi_g12531 (PTAC14)
13.57 7.37 10.68 5.07 10.84 4.07 6.99 4.17
5.63 0.54 2.0 0.01 6.04 0.97 3.19 1.23
2.07 0.19 0.28 0.17 2.05 0.01 0.13 0.2
9.43 5.8 6.65 4.71 8.56 4.03 4.37 3.2
Nbi_g12679 (OHP)
160.62 33.44 95.05 18.03 83.43 11.96 19.8 13.29
Nbi_g12789 (DegP10)
9.98 5.69 8.49 6.38 9.97 5.35 5.96 5.05
10.2 3.86 7.99 3.22 12.7 3.57 4.86 4.55
33.55 0.56 0.0 0.14 24.54 0.0 0.07 0.08
4.72 0.73 1.98 0.58 2.95 0.38 0.25 0.48
51.46 19.86 35.46 17.25 33.46 10.71 20.06 17.3
4.8 1.39 3.07 1.13 2.78 1.12 0.74 0.73
Nbi_g13577 (RUS1)
11.48 6.63 11.37 5.58 10.04 3.84 5.66 4.53
37.75 18.67 32.65 17.28 30.74 12.84 20.7 15.35
2.4 0.13 0.23 0.01 3.75 0.16 0.66 0.19
20.64 13.74 21.69 10.39 18.84 7.91 10.86 8.76
10.11 4.44 5.9 3.6 8.33 2.25 5.0 3.16
15.62 7.45 9.17 7.46 11.59 5.84 4.63 5.16
Nbi_g14705 (JAZ4)
56.26 11.39 30.83 8.77 23.44 11.59 9.09 9.41
33.9 5.56 6.87 3.75 28.71 0.18 1.61 0.2
35.26 3.59 6.07 0.04 17.45 2.31 0.27 0.12
26.64 10.08 13.05 4.91 36.05 2.0 15.8 3.21
306.91 81.85 114.21 54.83 205.64 39.28 98.5 32.03
13.45 5.06 4.61 4.19 9.65 4.12 4.6 2.48
Nbi_g17281 (ALMT12)
2.26 0.94 1.15 0.82 2.41 0.76 1.71 1.11
31.77 12.69 17.32 10.71 17.08 7.04 11.71 9.56
Nbi_g17775 (LZF1)
31.07 6.54 13.66 4.67 25.61 5.86 10.65 4.2
Nbi_g18125 (GGH1)
21.27 13.18 16.57 12.92 17.3 6.54 10.95 10.71
47.84 6.34 12.71 0.34 39.21 0.57 5.23 0.36
Nbi_g18447 (SPT)
2.79 1.51 2.47 1.34 2.52 1.05 1.44 0.98
17.87 6.6 11.52 5.56 14.75 1.23 6.13 2.29
38.71 17.46 24.7 9.51 27.55 5.78 11.37 9.42
29.03 11.12 17.48 10.54 17.55 6.88 10.59 7.57
Nbi_g19697 (KAS1)
15.11 2.17 4.68 2.5 10.83 1.56 7.28 2.31
12.73 2.31 0.61 0.18 8.65 1.03 3.02 1.71
9.91 1.75 5.53 1.53 6.53 2.48 1.79 2.28
5.62 0.48 4.88 0.64 3.71 0.0 0.15 0.08
Nbi_g21175 (FAD8)
157.06 44.25 80.41 28.35 134.54 23.84 67.07 24.31
18.88 3.78 12.95 0.66 17.82 0.84 4.6 1.55
8.33 5.51 5.88 4.51 6.34 4.2 4.14 4.51
196.08 14.09 9.47 2.46 255.88 1.86 11.38 1.56
16.71 5.94 7.72 0.38 23.48 1.57 7.28 2.28
30.65 10.29 3.53 4.17 16.63 1.27 3.21 4.38
799.95 320.25 781.3 295.28 629.09 141.64 288.07 108.83
Nbi_g24121 (SEP1)
72.94 35.43 48.53 34.9 50.65 22.4 41.0 21.73
10.07 0.42 4.61 0.05 7.74 1.08 1.53 0.21
Nbi_g24712 (XT2)
7.29 0.53 0.09 0.49 3.41 0.29 2.1 0.36
20.47 8.75 14.88 8.71 16.27 6.5 12.87 8.92
Nbi_g25485 (BGLU40)
8.0 2.04 4.6 1.33 6.32 1.45 2.21 1.68
33.96 1.8 12.48 0.31 21.86 0.79 5.94 0.91
11.04 2.02 6.0 0.67 12.88 0.79 5.47 1.83
Nbi_g26273 (SPL8)
13.47 1.45 9.1 0.15 13.24 0.6 1.84 2.34
100.89 24.39 22.77 24.36 106.2 21.05 44.94 17.25
22.32 2.85 13.18 0.4 14.62 1.29 1.93 1.41
22.55 1.01 4.36 0.0 11.33 4.4 5.25 1.71
6.84 0.24 1.05 0.38 2.73 0.0 0.89 0.14
Nbi_g29496 (SSL3)
10.56 2.65 6.19 1.51 9.02 1.74 1.84 1.66
4.85 2.05 3.7 1.16 3.79 1.08 2.1 0.98
2.86 0.78 1.61 0.95 1.49 0.75 1.18 0.68
Nbi_g30143 (ELF4-L3)
35.12 9.08 15.83 9.87 37.0 0.44 12.52 1.9
36.52 2.02 3.83 0.14 13.78 0.1 0.03 0.15
Nbi_g30871 (MAR1)
3.93 1.62 2.27 1.19 2.81 0.56 1.47 0.82
12.33 5.89 8.65 5.05 10.31 2.51 6.86 2.99
1565.8 658.75 1488.17 568.36 1174.32 277.44 549.22 197.01
29.48 6.42 15.43 4.73 18.97 1.59 6.74 2.27
11.04 2.22 10.79 0.04 13.38 1.34 2.1 1.04
25.17 12.16 17.21 11.48 17.11 7.77 13.05 10.25
27.47 13.63 15.92 11.94 26.19 5.77 17.36 10.31
15.78 0.65 2.91 0.0 6.08 0.83 0.04 0.0
Nbi_g34887 (EME1B)
6.01 2.62 5.42 2.9 6.12 2.44 3.61 2.59
15.77 3.18 1.92 0.64 17.2 2.22 6.2 3.26
61.92 19.86 32.69 17.12 40.36 4.43 23.59 10.88
Nbi_g36950 (LUT1)
13.65 4.66 9.76 3.4 8.16 2.1 4.9 3.06
332.59 139.09 341.92 122.79 274.25 59.78 116.13 54.81
7.89 0.09 3.19 0.08 7.59 0.3 1.1 0.0
137.54 36.62 72.61 37.4 94.0 11.28 43.48 15.53
9.83 1.85 2.77 0.0 14.64 0.72 3.26 0.73
9.18 0.66 3.34 0.8 4.06 0.36 0.75 0.05
Nbi_g38545 (RNEE/G)
7.07 4.78 6.91 4.69 7.9 2.96 4.63 3.7
33.86 6.95 11.44 1.57 20.7 2.13 13.17 3.8
3.22 0.22 0.65 0.59 3.58 0.15 0.48 0.27
7.25 0.37 0.0 0.0 7.02 0.1 0.0 0.0
Nbi_g40241 (SFD4)
133.05 59.18 76.82 50.21 85.26 25.77 62.31 42.69
Nbi_g40755 (OTP86)
3.52 1.85 2.78 1.8 2.91 1.89 1.75 1.68
214.94 88.73 177.61 99.18 213.68 34.01 95.06 20.0
651.92 279.02 741.05 163.55 502.62 8.41 163.16 22.38
326.65 152.02 291.57 130.81 221.62 126.5 135.99 105.2
56.75 20.44 43.01 23.81 64.71 12.99 30.67 14.71
32.95 8.9 16.82 7.27 16.86 0.99 9.86 2.37
9.16 1.93 6.47 2.65 5.58 1.06 1.25 2.14

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)