Heatmap: Cluster_99 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Sterile Leaflet
Mature Sterile Leaflet
Fertile Leaflet with Sori
Petiole
Crozier
Rhizome
Stolon
Stolon with Root
- -1.36 -0.4 -1.15 -2.5 0.63 -3.09 2.19
-4.54 -2.87 -3.7 -5.57 -6.21 0.55 -3.98 2.63
-8.62 -10.4 -8.09 -9.14 -6.86 0.71 -5.85 2.66
Nbi_g30685 (SCPL34)
-7.29 -5.44 -0.77 - -5.53 -4.81 -5.98 2.87
-6.88 -3.23 -2.9 -5.37 - 0.03 -3.2 2.72
- - - - - -1.11 - 2.91
- - - - - 0.45 - 2.73
- - - - - 0.93 -5.19 2.6
- - - - - -0.06 - 2.82
- - - - - 0.9 - 2.62
- - - - - -0.43 - 2.86
- -2.4 -3.17 -1.96 - 0.68 - 2.55
- - - - - -0.63 - 2.88
- - - - - -0.08 - 2.82
- - - - - -0.98 - 2.91
Nbi_g34016 (VAMP7B)
- - - - - 0.15 - 2.79
- - - - - -0.46 - 2.86
- - - - - -0.9 - 2.9
- - - - - 0.21 -3.58 2.76
- - - - - -0.06 -3.62 2.8
- - - - - 0.91 - 2.61
- - - - - 0.64 - 2.69
- - - - - 0.45 - 2.73
-4.72 -2.91 -3.11 -3.4 -5.3 0.37 -0.92 2.53
- - - - - 0.06 -2.98 2.77
- - - - - 0.97 - 2.6
- - - - - -0.44 - 2.86
-5.42 -7.33 -4.3 - -5.46 -2.56 - 2.95
- - - - - - - 3.0
- - - - - -0.63 - 2.88
- - - - - -0.62 - 2.88
- - - - - -0.51 - 2.87
Nbi_g40665 (ACT11)
- -5.33 -5.85 -4.36 - 0.55 - 2.69
- - - - - -1.16 - 2.92
- - - - - -1.54 - 2.94
Nbi_g40688 (ARA7)
- - - - - -0.57 -4.76 2.87
- - - - - -1.02 - 2.91
- - - - - - - 3.0
- - - - - -2.9 - 2.98
-5.38 -5.34 -5.06 -1.99 - 0.61 - 2.62
- - - - - -1.01 - 2.91
- - - - - -0.68 - 2.88
- - - - - 0.69 - 2.67
- - - - - -2.19 - 2.96
- - - - - -2.58 - 2.97
- - - - - 0.09 - 2.79
- - - - - -0.76 - 2.89
- - - - - - - 3.0
- - - - - -0.8 - 2.89
- - - - - 0.45 - 2.73
- - - - - -1.8 - 2.95
- - - - - -1.48 - 2.93
- - - - - -1.84 - 2.95
- - - - - - - 3.0
- - - -3.3 - 0.29 -2.95 2.71
- -3.29 - - - 0.47 -3.67 2.69
- - - - - -1.96 - 2.95
- - - - - -0.26 - 2.84
- - - - - -0.51 - 2.87
- - - - - - - 3.0
- - - - - -2.24 -2.42 2.93
-5.46 - -5.46 -7.14 -4.76 0.63 -2.11 2.62
- - -3.02 - - 0.55 -6.16 2.68
- - - - - -3.46 -7.33 2.98
- - - - - 0.98 -3.1 2.56
- - - - - -0.19 - 2.83
Nbi_g41881 (MAX1)
- - -2.45 - -4.53 0.47 -4.11 2.66
Nbi_g41886 (GAPC2)
- - - - - -1.21 - 2.92
- - - - - 1.0 - 2.58
- - - - - 0.09 - 2.79
- - - - - -0.18 - 2.83
- - - - - 0.38 - 2.74
- - - - - 0.25 - 2.77
- - - - - -0.44 - 2.86
- - - - - -0.03 - 2.81
- - -4.69 -3.03 -3.03 -1.44 -2.97 2.85
- -2.54 -3.91 -2.62 - 0.14 - 2.7
Nbi_g42246 (PBG1)
- - - - - -1.53 - 2.94
-6.48 -8.67 -1.3 -6.43 -4.57 0.5 -3.19 2.59
- - - - - -4.94 - 2.99
Nbi_g42395 (CHX19)
-3.31 -4.67 -0.89 -7.03 -6.71 0.69 -4.64 2.5
-3.68 - - - - -3.12 - 2.96
Nbi_g42429 (FATB)
- -6.93 -6.45 -6.96 -5.74 -4.63 - 2.98
- - - - - -2.08 - 2.96
Nbi_g42472 (PFL2)
- - - - - -0.15 - 2.83
Nbi_g42526 (MAPKKK19)
- - - - - -3.74 - 2.99
- - - - - -0.58 - 2.87
- - - - - -1.04 - 2.91
- - - - - 0.39 - 2.74
- - - - - - - 3.0
- - - - - -1.31 - 2.93
- - - - - -1.38 - 2.93
Nbi_g42814 (FRO6)
-4.26 - - - - -1.92 - 2.94
Nbi_g42820 (FKBP15-2)
- - - - - - - 3.0
- - - - - -2.21 - 2.96
- - - - - 0.34 - 2.75
Nbi_g43097 (XSP1)
-6.27 - -4.98 - -8.57 -3.17 -8.54 2.97
Nbi_g43109 (RPS15)
- - - -3.61 - -1.13 - 2.9
- - - - - -1.35 - 2.93
- - - - - 0.02 - 2.8
- - - - - -1.8 - 2.95
- - - - - - - 3.0
- - - - - 0.06 - 2.8
- -6.65 - - - -4.0 - 2.99
- - - - - -0.53 - 2.87
- - - - - -2.28 - 2.96
- - - - - -0.25 - 2.84
Nbi_g43408 (PTR2)
-2.38 -4.22 -2.28 - -4.7 -4.27 - 2.9
- - - - - -2.02 -3.05 2.93
- - - - - -3.26 - 2.98
- - - - - -1.2 -5.91 2.92
Nbi_g43552 (RPB1)
- - - - - -1.02 - 2.91
- - - - - -0.57 - 2.87
- - - - - -2.34 - 2.96
Nbi_g43702 (TOR2)
- -2.75 -4.73 -3.98 - -0.68 -6.79 2.83
- - - - - -0.98 - 2.91
-4.85 - - -3.2 -5.81 -2.13 -4.82 2.92
-6.67 - -5.81 - -2.68 -0.1 -4.0 2.77
Nbi_g43901 (KAO2)
-5.78 - -7.45 - - -0.75 -5.96 2.88
- - - - - -0.2 - 2.83
- - - - - -0.66 - 2.88
- - - - - -0.21 - 2.83
- - - - - -0.36 - 2.85
- - - - - 0.19 - 2.78
- - - -3.9 -4.82 -0.67 - 2.86
Nbi_g44147 (CPS)
-5.27 -6.82 -2.58 - -7.57 0.61 -5.67 2.64
- - - -5.49 - 0.43 -3.48 2.71
- - - - - -0.34 - 2.85
- -2.84 -4.57 -3.75 - 0.74 -2.25 2.55
- - - - - -0.16 - 2.83
- - - - - -2.16 - 2.96
- - - - - -0.9 - 2.9
- - - - - -0.58 - 2.87
Nbi_g44443 (RAB8)
- -3.2 -4.96 - - -0.38 - 2.83
- - - - - -1.23 - 2.92
- - - - - 0.17 -2.99 2.76
- - - -3.42 - 0.25 - 2.75
Nbi_g44490 (ARA5)
- - - - -4.76 0.48 - 2.72
Nbi_g44494 (GB2)
- - - - - -0.88 - 2.9
-2.05 -5.41 -7.89 - -2.79 -2.52 -2.77 2.86
- - - - - -1.7 - 2.94
Nbi_g44571 (GATA19)
- - - - - -0.87 - 2.9
-2.55 -3.38 -5.18 -1.72 -4.98 -0.49 -2.56 2.7
- - - - - -0.88 - 2.9
- - - -2.27 - 0.6 -3.22 2.63
- - - - - 0.81 - 2.64
- - - - - 0.32 -4.46 2.75
Nbi_g44743 (PAB8)
- - - - - -0.38 - 2.85
- - - - - 0.5 - 2.72
- - - - - -2.77 - 2.97
- - - - - -4.22 - 2.99
- -2.76 - - - -0.37 - 2.82
- - - - - - - 3.0
- - - - - -1.22 - 2.92
- - - - - 0.65 -3.72 2.67
- - - - - -1.26 - 2.92
- - - - - -1.0 - 2.91
- - - - - -0.08 - 2.82
- - - - - -0.03 - 2.81
- - - - - -0.6 - 2.88
- - - - - -0.31 - 2.85
- - - - - -4.34 - 2.99
- - - - - -2.7 - 2.97
- - - - - -0.7 - 2.88
- - - - - 0.66 - 2.68

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.