Heatmap: Cluster_165 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
Sterile Leaflet
Mature Sterile Leaflet
Fertile Leaflet with Sori
Petiole
Crozier
Rhizome
Stolon
Stolon with Root
Nbi_g00196 (NDH-O)
132.15 35.52 114.76 24.64 31.25 7.41 9.92 9.23
66.74 33.45 72.91 25.51 26.31 10.83 14.8 15.64
61.38 8.95 72.05 3.04 14.28 1.26 3.71 1.76
Nbi_g00761 (FNR1)
713.93 226.38 808.8 111.38 158.16 17.18 75.48 36.26
52.08 21.01 54.55 12.56 10.26 4.68 5.54 5.71
Nbi_g00972 (ATPC1)
619.67 137.95 630.67 75.9 135.71 12.8 37.99 20.75
192.21 38.25 191.41 29.34 34.68 5.78 18.39 8.95
16.77 0.92 17.49 0.55 1.62 0.43 0.98 1.37
Nbi_g01898 (ATAB2)
22.89 5.08 27.32 2.53 5.32 0.13 1.07 0.38
42.85 18.47 43.8 10.86 13.47 5.73 7.41 6.09
123.16 32.96 117.84 20.8 31.1 6.8 16.91 10.49
Nbi_g02641 (ATF1)
170.03 60.05 152.29 50.17 42.07 33.01 20.82 29.95
55.35 22.97 52.9 20.26 18.42 9.32 12.24 10.86
162.79 42.84 165.5 22.99 29.81 3.44 6.54 6.62
Nbi_g02729 (PMDH1)
809.54 101.79 827.14 59.91 70.9 14.55 21.99 15.33
71.03 14.89 68.98 10.35 14.6 1.51 3.28 2.1
67.2 19.99 72.6 20.54 21.11 4.81 6.47 6.63
78.72 21.12 91.55 26.77 21.71 10.25 10.22 11.0
94.22 17.23 108.23 7.88 16.25 2.66 5.91 2.83
Nbi_g02879 (GATA15)
55.29 13.11 56.51 5.83 9.24 0.69 0.21 0.24
48.46 15.12 50.03 8.96 10.68 1.56 2.74 1.64
Nbi_g03063 (STM)
642.86 165.2 727.94 93.17 187.53 33.95 98.12 45.63
129.33 53.02 146.28 33.83 36.49 8.88 17.67 11.21
36.75 11.86 46.45 8.11 11.22 3.02 5.24 4.6
Nbi_g03182 (PREP1)
97.23 33.24 108.27 18.0 33.03 8.97 15.96 13.69
125.36 30.1 157.03 16.85 30.29 13.07 18.16 16.67
32.88 13.22 36.13 12.64 11.15 4.96 8.31 6.04
1608.98 513.08 1567.26 411.59 420.34 105.06 185.53 117.12
Nbi_g03424 (ATARD2)
391.58 22.56 486.68 1.55 20.72 2.59 0.13 8.9
43.22 20.28 46.77 15.03 17.23 8.78 13.05 10.24
86.71 31.83 89.17 27.47 34.4 10.86 21.3 12.23
Nbi_g03780 (SPPA)
56.88 24.94 69.48 20.49 20.78 10.28 13.28 11.59
Nbi_g04085 (NPQ4)
3103.13 683.05 3673.86 610.98 923.35 107.77 454.56 146.31
371.58 99.68 414.56 64.85 64.03 12.03 21.79 15.61
67.28 30.29 72.06 20.98 19.83 6.28 10.48 7.71
Nbi_g06712 (STN8)
47.94 16.92 50.65 11.55 16.46 4.47 6.33 3.97
48.13 17.05 47.89 11.17 15.62 3.02 5.82 4.84
28.64 2.89 32.54 1.01 3.09 0.11 0.34 0.1
77.84 19.15 74.28 12.94 18.56 2.61 4.85 3.5
264.51 68.2 286.95 42.68 44.6 6.36 9.76 6.38
16.34 6.07 17.34 4.89 5.78 2.36 3.16 2.86
Nbi_g08298 (OTP84)
15.72 5.68 18.38 4.91 6.14 1.83 3.07 2.94
Nbi_g08490 (GLU1)
143.92 33.33 147.79 21.2 32.4 8.13 14.12 13.63
31.24 8.87 30.73 7.21 9.41 2.68 3.72 3.13
3023.11 598.48 2956.76 409.11 519.72 194.12 246.77 259.68
Nbi_g08917 (CA1)
3790.08 458.29 3903.61 205.8 337.74 19.31 56.92 28.12
41.37 10.72 39.76 7.95 13.28 3.41 5.28 3.52
24.33 10.61 28.68 7.89 8.08 3.53 7.13 3.83
30.16 9.81 32.03 8.85 13.34 4.62 7.22 4.96
102.96 19.51 109.66 10.81 16.97 7.7 5.12 7.45
Nbi_g09159 (TT7)
67.1 11.21 80.01 4.36 5.35 0.18 0.01 0.01
43.61 11.76 48.29 8.71 5.22 1.62 0.68 0.97
61.14 17.62 69.95 13.91 13.19 4.88 3.65 4.4
53.83 15.32 50.57 7.8 16.14 5.11 5.56 3.81
Nbi_g09508 (DEG8)
15.55 4.98 18.2 4.6 4.83 1.44 2.87 1.84
45.94 14.44 47.9 9.55 12.73 2.05 3.19 1.65
156.51 45.41 168.64 46.23 23.73 6.78 15.02 8.28
49.78 13.2 52.51 11.16 12.04 4.13 8.39 5.55
10.37 4.48 10.33 3.44 4.46 1.85 2.89 1.92
75.21 19.21 79.39 8.59 20.82 2.0 9.1 3.94
Nbi_g11378 (GGT1)
521.96 68.8 515.58 24.36 86.19 17.79 31.71 27.58
Nbi_g11426 (FTSH8)
367.04 99.06 457.12 55.74 97.7 19.64 46.96 31.54
234.45 25.68 277.25 7.39 29.46 0.64 0.45 0.69
Nbi_g11595 (GAPB)
1171.12 224.15 1155.78 82.13 159.68 2.86 17.88 3.44
Nbi_g11947 (GR2)
42.21 12.05 44.57 10.15 14.21 4.11 7.81 4.84
Nbi_g12160 (FTSH1)
393.82 107.5 410.1 65.53 103.9 14.09 36.92 25.45
86.08 30.17 93.09 22.03 21.51 7.28 10.1 7.9
28.44 1.18 27.21 0.47 2.31 0.0 0.53 0.1
69.89 28.72 77.45 24.73 23.95 9.89 10.45 10.46
Nbi_g12798 (ARASP)
44.14 11.13 45.22 8.2 12.3 3.72 5.17 4.61
6.22 1.29 5.98 1.63 1.21 1.03 0.76 1.25
33.98 4.67 34.31 1.02 4.7 0.37 0.37 0.35
106.07 19.68 141.19 6.28 9.96 0.28 0.34 0.63
37.03 10.3 34.47 8.71 12.11 5.33 6.72 4.03
Nbi_g13870 (NDF1)
72.49 16.55 74.84 9.77 15.91 3.5 6.37 6.36
376.88 11.3 424.44 0.59 47.98 5.34 4.04 0.78
Nbi_g14053 (FUG1)
108.53 25.35 131.29 15.22 30.08 10.02 17.15 16.54
446.74 167.27 536.54 117.21 119.7 38.43 49.66 37.85
60.08 31.48 73.31 25.76 25.97 11.1 19.44 13.46
Nbi_g14325 (NDH-M)
286.63 71.03 289.03 52.4 54.23 16.07 18.49 15.92
Nbi_g15038 (ATATH8)
33.54 13.42 34.69 10.22 13.68 7.18 7.8 7.75
Nbi_g15669 (PIFI)
398.79 88.87 446.14 42.02 102.84 8.79 37.79 15.62
Nbi_g15838 (EMB2369)
22.71 8.88 22.34 5.8 6.62 3.26 3.96 3.81
34.71 8.04 36.16 5.19 6.11 0.91 1.04 1.88
Nbi_g17587 (CRR23)
113.05 29.86 118.73 22.09 23.25 3.84 10.08 4.81
11.92 2.49 14.61 1.64 1.07 0.36 0.35 0.35
12.31 2.02 11.59 1.02 1.84 0.78 0.11 1.48
33.74 11.75 37.19 7.85 11.9 3.49 5.56 4.15
45.95 16.11 48.06 12.03 16.51 6.22 9.52 7.18
133.97 45.02 158.42 43.14 36.03 20.07 19.04 18.1
Nbi_g19497 (RPE)
365.19 65.1 353.63 52.29 76.31 15.01 41.32 19.39
31.11 10.54 28.58 6.73 9.88 4.74 5.16 5.05
142.05 29.16 159.72 48.22 41.39 15.33 11.73 14.58
Nbi_g22329 (HPR)
593.95 26.49 626.2 1.92 44.95 3.99 5.85 3.51
24.47 6.76 23.87 5.97 6.52 2.07 3.01 3.45
8.91 4.0 10.13 2.76 2.83 1.79 2.02 1.58
27.33 10.75 30.04 8.41 7.97 3.18 4.49 3.97
44.27 9.58 44.88 4.36 6.88 0.75 1.94 1.65
Nbi_g26752 (ANTR2)
168.92 57.9 182.5 36.93 36.96 10.58 10.35 10.54
94.08 9.94 107.94 4.58 13.62 0.37 1.43 1.19
247.29 46.31 223.1 16.27 26.81 0.42 2.42 0.84
1349.04 182.67 1150.22 90.11 109.57 27.08 34.08 23.6
Nbi_g27230 (GPX6)
20.35 5.46 23.25 4.35 5.86 1.1 2.13 2.56
4.49 1.13 4.5 0.89 1.13 0.56 1.2 1.11
Nbi_g28728 (scpl42)
32.4 7.04 30.28 4.1 7.29 3.21 1.39 3.03
120.22 2.17 113.08 0.15 4.82 0.31 0.03 0.42
243.11 36.39 221.28 42.59 35.1 16.8 15.65 10.97
Nbi_g29953 (CYP709B2)
53.31 2.48 62.44 0.3 7.1 0.28 0.73 0.12
Nbi_g30040 (NS1)
37.81 16.66 39.57 11.51 13.57 5.93 8.73 7.46
Nbi_g30376 (APE1)
104.29 31.32 103.97 27.75 25.08 8.03 10.54 7.15
Nbi_g30705 (PTR2)
33.17 3.49 34.54 0.88 1.83 0.38 0.4 0.25
4.46 0.94 4.4 0.24 1.05 0.77 0.25 0.29
1874.71 445.76 1979.03 177.41 227.71 17.38 26.5 26.94
22.51 8.05 24.82 5.75 6.93 2.76 3.25 4.23
33.89 5.94 32.87 3.8 7.63 1.05 2.54 0.79
47.24 3.89 40.36 1.34 3.29 0.0 0.15 0.29
118.59 28.08 139.12 20.98 30.39 4.2 13.14 6.93
Nbi_g39756 (CTF2A)
24.82 3.0 21.5 3.24 3.17 1.17 0.17 0.73
114.07 8.56 103.55 0.81 10.16 0.2 1.48 0.34
15.74 0.27 14.65 0.46 1.19 0.0 0.32 0.15
22.31 7.78 25.18 6.51 9.71 2.93 7.14 3.74

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)