Heatmap: Cluster_4 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	Sterile Leaflet	Mature Sterile Leaflet	Fertile Leaflet with Sori	Petiole	Crozier	Rhizome	Stolon	Stolon with Root
Nbi_g00997	0.18	0.34	0.15	0.22	0.2	1.0	0.22	0.36
Nbi_g01350	0.16	0.31	0.11	0.17	0.19	1.0	0.27	0.44
Nbi_g03481 (tny)	0.12	0.28	0.07	0.2	0.31	1.0	0.16	0.3
Nbi_g03557	0.06	0.08	0.31	0.08	0.21	1.0	0.2	0.57
Nbi_g03570 (AT2353)	0.0	0.09	0.0	0.11	0.03	1.0	0.04	0.24
Nbi_g03636 (CPK17)	0.13	0.32	0.05	0.14	0.17	1.0	0.29	0.5
Nbi_g03760 (MYC2)	0.08	0.31	0.07	0.26	0.11	1.0	0.12	0.39
Nbi_g04002 (ERF12)	0.14	0.32	0.08	0.16	0.16	1.0	0.17	0.31
Nbi_g04330 (JAR1)	0.03	0.24	0.09	0.17	0.09	1.0	0.26	0.35
Nbi_g04914	0.22	0.33	0.2	0.25	0.19	1.0	0.17	0.3
Nbi_g05059	0.18	0.28	0.14	0.18	0.28	1.0	0.21	0.4
Nbi_g06077	0.17	0.3	0.14	0.13	0.31	1.0	0.29	0.44
Nbi_g06086	0.03	0.09	0.06	0.11	0.08	1.0	0.12	0.31
Nbi_g06249	0.11	0.24	0.1	0.16	0.26	1.0	0.18	0.46
Nbi_g07549	0.14	0.21	0.26	0.14	0.17	1.0	0.23	0.47
Nbi_g07578	0.01	0.1	0.01	0.19	0.14	1.0	0.33	0.48
Nbi_g07861	0.11	0.34	0.08	0.23	0.25	1.0	0.27	0.44
Nbi_g07983	0.0	0.04	0.03	0.07	0.02	1.0	0.02	0.38
Nbi_g08028	0.02	0.08	0.01	0.06	0.07	1.0	0.12	0.34
Nbi_g08155	0.09	0.19	0.2	0.07	0.15	1.0	0.14	0.43
Nbi_g09034	0.01	0.25	0.01	0.09	0.09	1.0	0.08	0.08
Nbi_g09626 (ERF12)	0.11	0.31	0.09	0.23	0.29	1.0	0.29	0.54
Nbi_g09799 (MYC2)	0.04	0.1	0.04	0.12	0.06	1.0	0.08	0.29
Nbi_g10241	0.02	0.21	0.04	0.18	0.03	1.0	0.04	0.17
Nbi_g11943 (RLP3)	0.11	0.08	0.18	0.08	0.14	1.0	0.15	0.54
Nbi_g12175	0.19	0.36	0.4	0.19	0.42	1.0	0.37	0.48
Nbi_g12286 (LOX4)	0.12	0.17	0.13	0.14	0.14	1.0	0.14	0.28
Nbi_g12746	0.03	0.04	0.02	0.12	0.11	1.0	0.17	0.14
Nbi_g13388	0.06	0.02	0.09	0.01	0.01	1.0	0.09	0.34
Nbi_g13800 (FEI1)	0.01	0.17	0.01	0.12	0.09	1.0	0.03	0.08
Nbi_g14155 (CPK16)	0.14	0.2	0.1	0.16	0.18	1.0	0.16	0.39
Nbi_g14297 (SIS7)	0.01	0.23	0.04	0.21	0.1	1.0	0.24	0.22
Nbi_g14977	0.01	0.11	0.15	0.02	0.11	1.0	0.17	0.22
Nbi_g15067	0.1	0.18	0.04	0.28	0.1	1.0	0.29	0.44
Nbi_g16237	0.06	0.11	0.07	0.13	0.08	1.0	0.07	0.35
Nbi_g16539	0.0	0.14	0.03	0.09	0.0	1.0	0.07	0.32
Nbi_g16686 (HCT)	0.0	0.06	0.0	0.03	0.01	1.0	0.08	0.52
Nbi_g17081	0.12	0.18	0.15	0.18	0.17	1.0	0.1	0.41
Nbi_g17299	0.14	0.3	0.11	0.34	0.02	1.0	0.06	0.26
Nbi_g17918	0.07	0.09	0.06	0.13	0.13	1.0	0.21	0.09
Nbi_g18425	0.08	0.15	0.13	0.13	0.25	1.0	0.39	0.5
Nbi_g19113	0.14	0.19	0.18	0.12	0.24	1.0	0.22	0.27
Nbi_g19264	0.02	0.19	0.09	0.12	0.03	1.0	0.1	0.35
Nbi_g19587	0.14	0.34	0.11	0.28	0.29	1.0	0.2	0.18
Nbi_g19630	0.02	0.16	0.04	0.12	0.08	1.0	0.13	0.46
Nbi_g20130	0.04	0.11	0.0	0.12	0.01	1.0	0.37	0.03
Nbi_g20235	0.05	0.11	0.24	0.09	0.17	1.0	0.18	0.48
Nbi_g20239	0.12	0.3	0.07	0.14	0.2	1.0	0.42	0.43
Nbi_g20339 (PAT1)	0.19	0.21	0.08	0.14	0.21	1.0	0.24	0.5
Nbi_g20603	0.19	0.45	0.37	0.22	0.38	1.0	0.29	0.43
Nbi_g20827	0.07	0.06	0.0	0.07	0.13	1.0	0.14	0.18
Nbi_g20846	0.0	0.03	0.0	0.14	0.0	1.0	0.0	0.0
Nbi_g20931	0.08	0.33	0.08	0.22	0.12	1.0	0.22	0.17
Nbi_g21273	0.02	0.16	0.01	0.28	0.16	1.0	0.21	0.43
Nbi_g21274	0.02	0.1	0.01	0.21	0.11	1.0	0.23	0.33
Nbi_g22166 (CPS)	0.0	0.03	0.0	0.12	0.0	1.0	0.07	0.18
Nbi_g22203	0.01	0.19	0.0	0.12	0.01	1.0	0.03	0.16
Nbi_g22376 (LOX3)	0.19	0.28	0.18	0.12	0.36	1.0	0.36	0.51
Nbi_g22742	0.05	0.05	0.04	0.1	0.07	1.0	0.22	0.23
Nbi_g22869	0.08	0.06	0.05	0.07	0.11	1.0	0.07	0.11
Nbi_g23189	0.01	0.05	0.05	0.03	0.02	1.0	0.13	0.48
Nbi_g23802	0.05	0.03	0.0	0.01	0.06	1.0	0.13	0.13
Nbi_g24019	0.11	0.23	0.06	0.19	0.25	1.0	0.42	0.52
Nbi_g24027 (MTN3)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.08	0.05
Nbi_g24083 (CLM)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.23	0.02
Nbi_g24562	0.02	0.25	0.01	0.14	0.11	1.0	0.29	0.15
Nbi_g24910	0.11	0.28	0.07	0.19	0.16	1.0	0.32	0.55
Nbi_g24925	0.0	0.03	0.0	0.08	0.05	1.0	0.22	0.09
Nbi_g25457	0.06	0.3	0.02	0.18	0.15	1.0	0.26	0.49
Nbi_g25508	0.04	0.03	0.01	0.02	0.03	1.0	0.31	0.14
Nbi_g25807 (SD2-5)	0.02	0.07	0.01	0.06	0.1	1.0	0.19	0.38
Nbi_g26074	0.03	0.17	0.02	0.13	0.13	1.0	0.19	0.29
Nbi_g26125	0.0	0.06	0.03	0.03	0.04	1.0	0.06	0.38
Nbi_g26415	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.31	0.42
Nbi_g26494 (SHI)	0.01	0.09	0.15	0.03	0.09	1.0	0.16	0.22
Nbi_g26836	0.01	0.1	0.04	0.16	0.05	1.0	0.07	0.22
Nbi_g28829	0.19	0.25	0.23	0.19	0.41	1.0	0.35	0.44
Nbi_g29204	0.0	0.01	0.0	0.06	0.02	1.0	0.31	0.47
Nbi_g29588	0.15	0.28	0.19	0.34	0.2	1.0	0.13	0.26
Nbi_g29694	0.01	0.18	0.01	0.1	0.05	1.0	0.14	0.22
Nbi_g31078	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.24
Nbi_g31270	0.22	0.33	0.16	0.22	0.28	1.0	0.23	0.38
Nbi_g31587	0.0	0.0	0.0	0.07	0.0	1.0	0.0	0.15
Nbi_g31729	0.03	0.31	0.16	0.29	0.12	1.0	0.12	0.37
Nbi_g31803	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.17
Nbi_g31815	0.0	0.02	0.0	0.04	0.0	1.0	0.05	0.03
Nbi_g31890	0.17	0.13	0.18	0.12	0.36	1.0	0.21	0.31
Nbi_g32078	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.03
Nbi_g32388	0.0	0.0	0.0	0.0	0.06	1.0	0.2	0.06
Nbi_g32632	0.08	0.05	0.09	0.09	0.14	1.0	0.33	0.36
Nbi_g32665	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.38
Nbi_g32998 (CPK9)	0.01	0.17	0.0	0.28	0.06	1.0	0.04	0.34
Nbi_g33337	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	1.0	0.04	0.16
Nbi_g33553	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.11
Nbi_g33642 (ACT11)	0.0	0.0	0.0	0.04	0.0	1.0	0.0	0.27
Nbi_g33671	0.0	0.11	0.0	0.22	0.0	1.0	0.0	0.38
Nbi_g33970	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.16
Nbi_g33995	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.04
Nbi_g34010	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	1.0	0.0	0.09
Nbi_g34122 (ATG8B)	0.0	0.0	0.0	0.03	0.0	1.0	0.0	0.27
Nbi_g34587	0.0	0.0	0.0	0.16	0.0	1.0	0.0	0.25
Nbi_g34720	0.09	0.05	0.0	0.11	0.04	1.0	0.1	0.51
Nbi_g34879 (CPK16)	0.06	0.19	0.03	0.2	0.17	1.0	0.06	0.14
Nbi_g34971	0.02	0.09	0.03	0.18	0.19	1.0	0.42	0.53
Nbi_g35249 (CAMBP25)	0.31	0.28	0.27	0.2	0.3	1.0	0.18	0.45
Nbi_g35603	0.01	0.17	0.01	0.28	0.05	1.0	0.04	0.38
Nbi_g35725	0.18	0.25	0.18	0.18	0.27	1.0	0.21	0.33
Nbi_g35799	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	1.0	0.0	0.08
Nbi_g35904	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0
Nbi_g36015	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.04
Nbi_g36036	0.02	0.1	0.01	0.08	0.0	1.0	0.0	0.3
Nbi_g36218 (TUB7)	0.0	0.08	0.05	0.06	0.0	1.0	0.0	0.38
Nbi_g36353	0.0	0.0	0.0	0.04	0.0	1.0	0.0	0.1
Nbi_g36461	0.0	0.0	0.0	0.18	0.0	1.0	0.0	0.29
Nbi_g36513 (XCP2)	0.0	0.0	0.0	0.03	0.02	1.0	0.0	0.11
Nbi_g36541	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.36
Nbi_g36694	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.12
Nbi_g36881	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.27
Nbi_g37015	0.0	0.0	0.0	0.04	0.0	1.0	0.0	0.17
Nbi_g37062	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.26
Nbi_g37080	0.0	0.04	0.0	0.02	0.01	1.0	0.0	0.0
Nbi_g37326	0.0	0.15	0.0	0.04	0.0	1.0	0.0	0.27
Nbi_g37398	0.01	0.19	0.01	0.1	0.03	1.0	0.17	0.17
Nbi_g37400 (ALPHAVPE)	0.0	0.0	0.0	0.04	0.0	1.0	0.0	0.2
Nbi_g37402	0.13	0.37	0.05	0.18	0.16	1.0	0.25	0.43
Nbi_g37417	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.1
Nbi_g37552	0.16	0.36	0.16	0.24	0.15	1.0	0.2	0.34
Nbi_g37574 (PUB23)	0.1	0.11	0.27	0.08	0.2	1.0	0.13	0.46
Nbi_g37639	0.0	0.04	0.0	0.07	0.0	1.0	0.0	0.13
Nbi_g37651	0.16	0.3	0.08	0.31	0.19	1.0	0.12	0.43
Nbi_g37745	0.0	0.0	0.0	0.21	0.0	1.0	0.0	0.17
Nbi_g37746	0.0	0.0	0.0	0.0	0.06	1.0	0.06	0.39
Nbi_g37757	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.36
Nbi_g37866	0.0	0.0	0.0	0.03	0.0	1.0	0.0	0.27
Nbi_g38409	0.27	0.37	0.21	0.3	0.28	1.0	0.28	0.4
Nbi_g38455	0.02	0.1	0.01	0.06	0.09	1.0	0.16	0.32
Nbi_g38991	0.07	0.12	0.12	0.06	0.12	1.0	0.19	0.35
Nbi_g39308	0.01	0.12	0.01	0.19	0.14	1.0	0.3	0.57
Nbi_g39832	0.02	0.01	0.0	0.05	0.0	1.0	0.16	0.06
Nbi_g40257	0.23	0.29	0.22	0.29	0.25	1.0	0.23	0.33
Nbi_g40258	0.02	0.23	0.01	0.18	0.05	1.0	0.13	0.3
Nbi_g40332	0.09	0.36	0.22	0.21	0.29	1.0	0.31	0.33
Nbi_g40879	0.01	0.2	0.0	0.11	0.08	1.0	0.18	0.32
Nbi_g40964	0.01	0.14	0.0	0.14	0.03	1.0	0.05	0.2
Nbi_g41119	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.39
Nbi_g41246	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.29
Nbi_g41561	0.01	0.05	0.05	0.04	0.03	1.0	0.04	0.16
Nbi_g42027	0.11	0.29	0.06	0.2	0.22	1.0	0.31	0.46
Nbi_g42204	0.03	0.1	0.03	0.05	0.09	1.0	0.08	0.15
Nbi_g42650	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	1.0	0.01	0.1
Nbi_g43006	0.0	0.0	0.0	0.07	0.0	1.0	0.0	0.24
Nbi_g43580	0.02	0.28	0.02	0.27	0.01	1.0	0.04	0.16
Nbi_g43834	0.03	0.08	0.09	0.21	0.1	1.0	0.36	0.26
Nbi_g43867	0.03	0.13	0.1	0.06	0.06	1.0	0.14	0.38
Nbi_g44033	0.0	0.09	0.03	0.02	0.08	1.0	0.32	0.23
Nbi_g45051	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.24

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)