Heatmap: Cluster_50 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Sterile Leaflet
Mature Sterile Leaflet
Fertile Leaflet with Sori
Petiole
Crozier
Rhizome
Stolon
Stolon with Root
0.06 0.34 0.12 0.68 0.62 1.0 0.83 0.51
0.07 0.21 0.1 1.0 0.18 0.41 0.45 0.39
Nbi_g01909 (CHAL)
0.01 0.48 0.01 1.0 0.59 0.75 0.81 0.95
0.14 0.28 0.08 1.0 0.3 0.46 0.55 0.53
0.59 0.66 0.56 0.75 0.8 0.63 1.0 0.78
0.57 0.75 0.59 0.85 0.83 0.7 1.0 0.85
Nbi_g02886 (MDH)
0.31 0.38 0.25 0.62 0.66 0.54 1.0 0.53
0.13 0.27 0.13 0.67 0.41 0.65 0.81 1.0
Nbi_g03113 (SNL3)
0.03 0.26 0.15 0.44 0.49 1.0 0.5 0.46
0.13 0.18 0.11 0.6 0.55 0.19 1.0 0.29
0.04 0.27 0.18 1.0 0.38 0.58 0.94 0.86
Nbi_g03696 (EXO70A1)
0.56 0.73 0.59 0.85 0.81 0.61 1.0 0.73
0.66 0.75 0.75 0.88 0.93 0.78 1.0 0.9
0.32 0.26 0.23 0.46 0.7 0.38 1.0 0.45
Nbi_g04864 (ENO1)
0.34 0.49 0.44 0.82 0.56 0.88 1.0 0.74
0.09 0.23 0.14 0.45 0.39 0.42 1.0 0.55
Nbi_g05338 (PTR1)
0.21 0.27 0.1 0.53 1.0 0.56 0.98 0.49
0.43 0.56 0.42 0.84 0.74 0.6 1.0 0.84
0.29 0.39 0.19 0.97 0.67 0.24 1.0 0.29
0.15 0.29 0.06 0.5 0.71 1.0 0.53 0.62
0.07 0.17 0.05 1.0 0.3 0.36 0.79 0.52
Nbi_g06459 (PAL1)
0.04 0.3 0.08 0.65 0.59 0.27 1.0 0.82
Nbi_g06888 (PTR1)
0.09 0.24 0.29 0.57 0.19 0.62 0.77 1.0
Nbi_g07176 (BGLU40)
0.09 0.31 0.07 1.0 0.28 0.57 0.53 0.6
Nbi_g07427 (MRP6)
0.11 0.26 0.22 0.62 0.53 0.65 0.79 1.0
Nbi_g07536 (AER)
0.2 0.22 0.31 0.82 0.62 0.54 1.0 0.6
0.01 0.19 0.0 0.4 0.71 0.64 1.0 0.33
0.12 0.29 0.18 0.39 0.58 0.62 1.0 0.54
Nbi_g09244 (BGLU44)
0.06 0.3 0.08 0.82 0.75 0.49 1.0 0.82
0.51 0.67 0.65 0.75 0.74 0.7 1.0 0.85
0.0 0.21 0.03 0.72 0.17 0.0 1.0 0.67
0.05 0.17 0.01 1.0 0.52 0.36 0.74 0.55
0.09 0.22 0.16 0.42 0.42 1.0 0.89 0.63
0.03 0.02 0.0 0.44 0.32 0.08 1.0 0.4
0.48 0.44 0.26 0.69 0.86 0.74 1.0 0.79
Nbi_g10005 (DFR)
0.19 0.3 0.12 1.0 0.8 0.68 0.76 0.79
Nbi_g10465 (BGLU40)
0.05 0.09 0.03 0.47 0.36 0.32 1.0 0.55
0.27 0.48 0.15 0.99 0.69 0.51 1.0 0.72
Nbi_g10581 (PAL2)
0.04 0.32 0.09 0.83 0.72 0.35 0.96 1.0
Nbi_g10582 (PAL4)
0.39 0.4 0.37 0.81 0.56 0.34 0.96 1.0
0.2 0.46 0.12 0.59 0.56 0.37 1.0 0.51
0.03 0.31 0.22 0.55 0.69 1.0 0.98 0.65
0.06 0.19 0.02 0.82 0.33 0.47 1.0 0.61
0.14 0.32 0.24 0.78 0.38 0.32 1.0 0.61
0.52 0.6 0.51 0.75 0.75 0.62 1.0 0.64
0.36 0.44 0.24 0.67 0.62 0.56 1.0 0.46
0.59 0.7 0.59 0.88 0.66 0.79 0.88 1.0
0.03 0.14 0.03 0.61 0.26 0.56 1.0 0.58
0.35 0.57 0.36 0.76 0.67 0.59 1.0 0.67
Nbi_g14021 (CHS)
0.08 0.16 0.08 0.74 0.35 0.74 0.81 1.0
0.28 0.51 0.25 0.8 0.77 0.49 1.0 0.71
0.06 0.08 0.06 0.39 0.29 0.28 1.0 0.62
Nbi_g14191 (HIP1)
0.39 0.57 0.4 0.69 0.71 0.47 1.0 0.64
Nbi_g14254 (TT5)
0.21 0.37 0.17 1.0 0.69 0.62 0.87 0.8
0.16 0.42 0.17 0.47 0.56 0.19 1.0 0.63
0.11 0.3 0.18 0.98 0.3 0.72 0.79 1.0
0.03 0.32 0.03 0.51 0.61 0.26 1.0 0.63
Nbi_g15973 (PAL4)
0.04 0.32 0.11 0.47 0.46 0.22 1.0 0.51
0.05 0.39 0.09 0.63 0.73 0.19 1.0 0.67
0.49 0.62 0.47 0.75 0.79 0.56 1.0 0.84
0.1 0.12 0.23 0.33 0.24 0.51 1.0 0.35
0.34 0.38 0.27 0.57 0.55 0.46 1.0 0.55
0.36 0.55 0.43 0.69 0.72 0.81 0.91 1.0
0.16 0.35 0.15 0.93 0.46 0.57 0.85 1.0
0.01 0.09 0.0 0.43 0.53 0.22 1.0 0.07
0.02 0.1 0.02 0.53 0.33 0.46 1.0 0.65
Nbi_g19363 (CSY4)
0.44 0.53 0.45 0.72 0.59 0.58 1.0 0.7
0.12 0.15 0.05 0.96 0.24 0.77 0.84 1.0
0.04 0.08 0.05 0.48 0.26 0.46 1.0 0.4
Nbi_g20002 (DFR)
0.05 0.2 0.06 1.0 0.17 0.25 0.3 0.34
0.0 0.0 0.01 1.0 0.08 0.13 0.65 0.26
0.39 0.54 0.29 0.74 0.79 0.64 1.0 0.57
0.15 0.13 0.06 0.57 0.19 0.14 1.0 0.74
0.15 0.19 0.11 0.42 1.0 0.38 0.73 0.44
0.06 0.2 0.07 1.0 0.12 0.48 0.99 0.5
0.18 0.41 0.14 0.9 0.46 0.37 1.0 0.58
0.5 0.44 0.25 0.97 0.64 0.47 1.0 0.82
0.29 0.24 0.19 0.66 0.4 0.39 1.0 0.6
0.06 0.25 0.16 0.35 0.42 0.49 1.0 0.63
0.05 0.17 0.09 1.0 0.1 0.4 0.9 0.43
0.14 0.28 0.35 0.41 0.4 0.38 1.0 0.82
0.14 0.38 0.04 0.61 0.23 0.45 1.0 0.44
0.15 0.29 0.19 0.71 0.47 0.73 1.0 0.97
0.0 0.36 0.02 0.24 0.3 0.12 0.99 1.0
0.04 0.02 0.07 1.0 0.3 0.31 0.68 0.46
0.14 0.37 0.17 0.33 0.26 0.46 1.0 0.46
0.0 0.17 0.12 0.44 0.56 0.21 1.0 0.96
0.16 0.3 0.22 0.59 0.69 0.38 1.0 0.71
Nbi_g26670 (PRT1)
0.18 0.33 0.2 0.9 0.66 0.9 0.71 1.0
0.22 0.24 0.22 0.27 0.71 0.35 1.0 0.48
0.03 0.15 0.18 0.28 0.55 0.46 1.0 0.31
0.16 0.36 0.2 1.0 0.72 0.79 0.78 0.84
Nbi_g27402 (PAL2)
0.02 0.33 0.1 0.53 0.42 0.23 1.0 0.68
0.04 0.2 0.12 1.0 0.1 0.2 0.55 0.72
0.34 0.49 0.38 0.58 0.52 0.57 1.0 0.73
0.02 0.21 0.1 0.51 0.48 0.21 1.0 0.54
Nbi_g29808 (CHS)
0.03 0.13 0.07 1.0 0.15 0.33 0.44 0.41
0.16 0.29 0.25 0.6 0.63 0.29 1.0 0.17
0.0 0.22 0.2 0.42 0.47 0.78 1.0 0.64
0.08 0.13 0.06 0.79 0.59 0.33 1.0 0.51
0.58 0.33 0.28 1.0 0.54 0.29 0.8 0.35
0.07 0.15 0.23 0.41 0.44 0.77 1.0 0.48
0.09 0.16 0.09 0.19 0.26 1.0 0.52 0.25
0.03 0.33 0.14 1.0 0.05 0.36 0.64 0.4
0.31 0.5 0.2 0.7 0.52 0.41 1.0 0.47
0.06 0.09 0.33 0.82 0.3 0.48 1.0 0.2
0.0 0.23 0.26 1.0 0.16 0.27 0.61 0.42
0.15 0.46 0.29 0.58 0.6 0.49 1.0 0.96
Nbi_g36364 (OEP16)
0.53 0.46 0.4 0.75 0.68 0.53 1.0 0.68
0.8 0.71 0.6 0.83 0.85 0.8 1.0 0.99
0.16 0.38 0.17 0.84 0.66 0.33 1.0 0.71
0.55 0.42 0.26 0.67 0.81 0.75 1.0 0.73
Nbi_g39274 (ATZW10)
0.71 0.74 0.72 0.82 1.0 0.81 1.0 0.85
0.08 0.12 0.03 1.0 0.25 0.15 0.54 0.71
0.04 0.23 0.04 0.39 0.18 0.38 1.0 0.29
0.06 0.0 0.0 0.85 0.63 0.58 1.0 0.26
0.1 0.25 0.11 1.0 0.33 0.54 0.66 0.72
Nbi_g42374 (BGLU40)
0.06 0.18 0.08 0.6 0.5 0.81 1.0 0.98
0.38 0.34 0.23 1.0 0.32 0.61 0.54 0.67
0.04 0.03 0.06 1.0 0.27 0.34 0.5 0.56
0.04 0.0 0.0 0.65 0.04 0.08 1.0 0.49
0.11 0.19 0.08 0.41 0.73 0.61 1.0 0.54
0.22 0.06 0.16 0.17 0.53 0.36 1.0 0.13
0.14 0.24 0.18 0.47 0.23 0.38 1.0 0.17
Nbi_g44887 (PEN2)
0.09 0.22 0.02 1.0 0.27 0.57 0.47 0.37

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)