1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_89 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

 Transpose table  Download table
Gene
Sterile Leaflet
Mature Sterile Leaflet
Fertile Leaflet with Sori
Petiole
Crozier
Rhizome
Stolon
Stolon with Root
- - - - - 2.99 - -3.86
- - - - - 3.0 - -
- - - - - 3.0 - -
- - - - - 3.0 - -
- - - - - 2.95 - -1.87
- - - - - 2.98 -4.52 -4.44
- - - - - 3.0 - -
- - - -4.55 - 2.98 - -4.3
- - - - - 2.98 - -3.05
- - - - - 2.94 - -1.56
- - - - - 2.95 - -1.95
- - - -3.56 - 2.98 - -
- -4.93 -6.57 -4.64 - 2.94 - -1.92
- - - -3.36 - 2.89 - -1.07
- - - - - 3.0 - -
- - - - - 2.97 - -2.67
- - - - - 3.0 - -
- - - - - 3.0 - -
- - - - - 2.95 - -1.87
- - - - - 3.0 - -
- - - -5.55 - 3.0 - -
- - - - - 2.96 - -2.19
- - - - - 3.0 - -
- - - - - 3.0 - -
- - - - - 3.0 - -
- - - - - 3.0 - -
- - - - - 3.0 - -
- - - - - 2.96 - -2.23
Nbi_g32766 (CPY)
 - - - - - 3.0 - -5.33
- - - -5.42 - 2.99 - -5.17
- - - - - 3.0 - -
- - - - - 3.0 - -
- - - - - 3.0 - -
- - - - - 3.0 - -
- - - - - 3.0 - -
- - - - - 3.0 - -
- - - - - 3.0 - -
- - - - - 3.0 - -
- - - - - 3.0 - -
- - - - - 3.0 - -
Nbi_g33312 (PKS7)
 - - - - - 3.0 - -
- - - - - 2.96 - -2.18
- - - -2.59 - 2.97 - -
- - - - - 3.0 - -
- - - - - 2.98 - -3.44
Nbi_g33561 (PRMT11)
 - - - - - 3.0 - -
- - - - - 3.0 - -
- - - - - 3.0 - -
- - - - - 3.0 - -
Nbi_g33633 (NTMC2T4)
 - - - -5.43 - 2.99 - -4.11
- - - - - 2.96 - -2.11
- - - -3.59 - 2.96 - -3.12
- - - - - 2.99 - -4.2
- - - -3.35 - 2.97 - -3.59
- - - -5.54 - 2.93 - -1.48
Nbi_g33878 (CEN2)
 - - - - - 3.0 - -
- - - - - 3.0 - -
- - - -4.81 - 2.96 -6.26 -2.65
- - - - - 3.0 - -
- -4.46 - -4.61 - 2.95 - -2.51
- - - - - 3.0 - -
- - - - - 3.0 - -
- - - -3.14 - 2.93 - -2.0
- - - - - 2.98 - -3.09
- - - - - 2.99 - -4.74
- - - -4.03 - 2.98 - -4.68
Nbi_g34403 (PAH1)
 - - - -5.33 - 2.97 - -2.61
- - - - - 2.98 - -2.87
- - - -5.75 - 2.97 -5.59 -2.78
- - - - - 3.0 - -
- - - -4.67 - 2.95 - -2.02
- - - - - 2.93 - -1.49
- - - - - 3.0 - -
- - - - - 2.99 - -4.34
- - - - - 2.95 - -1.74
- - - - - 3.0 - -
- - - - - 3.0 - -
- - - - - 3.0 - -
- - - - - 3.0 - -
- - - - - 2.98 - -3.19
- - - -4.63 - 2.99 - -4.86
- - - -2.79 - 2.92 -5.41 -1.94
- - - - - 3.0 - -
- - - - - 2.96 - -2.07
- - - - - 3.0 - -
- - - -3.85 - 2.94 -5.68 -2.12
- - - - - 2.98 - -3.28
Nbi_g35893 (MIA)
 - - - - - 2.97 - -2.83
- - - - - 2.96 - -2.25
- -5.09 - - - 2.96 - -2.51
- - - - - 2.98 - -3.12
- - - - - 2.99 -6.07 -3.89
- - - - - 3.0 - -
Nbi_g36359 (SSP5)
 - - - -4.47 - 2.97 - -3.17
- -4.93 - -4.57 - 2.94 -6.38 -1.95
- - - - - 2.98 - -3.24
- - - -4.15 - 2.93 - -1.68
- - - - - 2.96 - -2.35
- - - - - 3.0 - -
- - - - - 3.0 - -
- - - -6.28 - 2.99 - -4.21
- - - -5.94 - 2.98 - -3.64
- - - - - 3.0 - -
- - - - - 3.0 - -
- -3.25 -2.93 - - 2.92 - -2.41
- - - -3.42 - 2.93 - -1.9
- - - - - 3.0 - -
- - - - - 3.0 - -
- - - -4.32 - 2.98 - -3.91
-7.58 - - -3.8 - 2.94 - -2.02
- - - - - 2.98 - -2.99
- - - - - 2.98 - -3.24
- - - -3.86 - 2.94 - -1.92
- - - - - 2.96 - -2.05
- -4.18 - -5.79 - 2.94 -6.63 -2.2
- - - -3.77 - 2.97 - -3.39
- - - - - 3.0 - -
- - -5.26 -4.64 - 2.96 - -2.55
- - - - - 2.96 - -2.04
- - - - - 3.0 - -
- - - -4.32 - 2.97 - -3.3
- - - - - 2.97 - -2.58
- - - - - 2.99 - -4.59
- -2.78 -5.41 -22.65 - 2.93 -4.66 -2.37

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.