Heatmap: Cluster_78 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	Sterile Leaflet	Mature Sterile Leaflet	Fertile Leaflet with Sori	Petiole	Crozier	Rhizome	Stolon	Stolon with Root
Nbi_g00084	1.0	0.9	0.67	0.76	0.65	0.2	0.05	0.0
Nbi_g02698	0.33	0.57	0.39	0.48	0.27	0.18	0.17	1.0
Nbi_g04280	0.76	0.91	0.95	0.82	0.7	0.75	0.74	1.0
Nbi_g04345	0.77	0.91	0.83	1.0	0.71	0.93	0.68	0.88
Nbi_g04711	0.76	0.99	0.81	0.98	0.81	0.92	0.74	1.0
Nbi_g05958	0.73	0.21	1.0	0.32	0.24	0.08	0.48	0.29
Nbi_g07338	0.91	0.84	0.74	0.58	0.57	0.47	0.75	1.0
Nbi_g07355	0.83	1.0	0.88	0.93	0.62	0.64	0.61	0.62
Nbi_g07370	0.6	0.62	0.62	0.93	0.37	0.68	0.58	1.0
Nbi_g07539	0.87	0.79	1.0	0.94	0.48	0.86	0.63	0.96
Nbi_g07727	0.66	1.0	0.93	0.77	0.6	0.36	0.42	0.63
Nbi_g08109 (SRT2)	0.52	1.0	0.75	1.0	0.42	0.8	0.51	0.87
Nbi_g08207	0.75	0.95	0.81	1.0	0.61	0.55	0.56	0.88
Nbi_g08404 (SD2-5)	0.24	0.58	0.33	0.54	0.51	0.16	0.23	1.0
Nbi_g08566	0.87	0.28	1.0	0.29	0.56	0.18	0.31	0.16
Nbi_g09438	0.78	1.0	0.72	0.69	0.36	0.37	0.27	0.51
Nbi_g09537	1.0	0.92	0.84	0.81	0.43	0.45	0.38	0.47
Nbi_g09787	0.81	0.81	0.7	0.81	0.68	0.66	0.61	1.0
Nbi_g10107	0.17	0.87	0.96	1.0	0.2	0.44	0.8	0.72
Nbi_g10453	0.78	0.91	1.0	0.93	0.6	0.64	0.7	0.76
Nbi_g10520	0.54	0.82	0.74	0.81	0.51	1.0	0.69	0.97
Nbi_g10764	0.1	0.47	0.2	1.0	0.32	0.34	0.63	0.61
Nbi_g12226	0.57	1.0	0.8	0.98	0.15	0.36	0.51	0.45
Nbi_g12591	1.0	0.57	0.7	0.81	0.35	0.2	0.2	0.97
Nbi_g12815	0.67	1.0	0.73	0.79	0.6	0.58	0.54	0.7
Nbi_g13192	0.84	0.93	0.96	1.0	0.84	0.79	0.79	0.91
Nbi_g13667 (REME1)	0.67	0.82	0.98	1.0	0.62	0.68	0.64	0.64
Nbi_g15102	0.43	0.53	0.37	1.0	0.23	0.23	0.48	0.62
Nbi_g15222	0.6	1.0	0.92	0.93	0.37	0.46	0.37	0.5
Nbi_g15490	0.63	0.6	0.83	1.0	0.79	0.77	0.43	0.45
Nbi_g15605	0.31	1.0	0.53	0.91	0.03	0.2	0.25	0.24
Nbi_g15610	0.11	0.26	0.25	1.0	0.02	0.12	0.79	0.89
Nbi_g15735	0.33	0.56	0.43	0.41	0.23	0.39	0.12	1.0
Nbi_g16327	0.96	0.37	1.0	0.44	0.27	0.28	0.41	0.12
Nbi_g16332	0.23	0.4	0.29	0.44	0.23	0.25	0.28	1.0
Nbi_g16444	0.6	0.94	0.35	1.0	0.28	0.33	0.3	0.66
Nbi_g16475 (DOT4)	0.4	0.78	0.59	0.76	0.0	0.0	0.26	1.0
Nbi_g16576 (LOX4)	0.63	0.85	0.59	0.37	0.0	0.0	0.4	1.0
Nbi_g16987	0.04	0.33	0.01	0.31	0.04	0.06	0.32	1.0
Nbi_g17079	0.53	0.35	1.0	0.31	0.37	0.06	0.5	0.85
Nbi_g17710 (PSBX)	1.0	0.4	0.63	0.56	0.0	0.0	0.1	0.07
Nbi_g17935	0.52	0.31	0.78	0.19	0.09	0.21	0.69	1.0
Nbi_g17954 (SWA3)	1.0	0.98	0.95	0.84	0.56	0.52	0.47	0.55
Nbi_g17998	0.61	1.0	0.66	0.68	0.57	0.63	0.37	0.43
Nbi_g18252 (PDC2)	0.27	1.0	0.71	0.71	0.05	0.07	0.58	0.09
Nbi_g18546	0.8	0.24	1.0	0.02	0.0	0.03	0.12	0.9
Nbi_g18797	0.02	0.65	0.02	0.84	0.0	0.0	0.23	1.0
Nbi_g18963	0.78	0.48	1.0	0.86	0.05	0.03	0.15	0.59
Nbi_g18982	0.6	0.67	1.0	0.74	0.63	0.68	0.53	0.83
Nbi_g19120	0.25	0.28	0.78	0.3	0.04	0.15	0.49	1.0
Nbi_g19125	1.0	0.72	0.81	0.64	0.82	0.36	0.33	0.42
Nbi_g19179	0.89	0.58	1.0	0.28	0.04	0.73	0.33	0.74
Nbi_g19510	0.32	0.76	0.19	0.52	0.15	0.22	0.67	1.0
Nbi_g19549	0.17	0.75	0.17	0.78	0.0	0.0	0.15	1.0
Nbi_g20044	1.0	0.83	0.84	0.63	0.15	0.98	0.45	0.73
Nbi_g20128	0.56	0.74	1.0	0.99	0.16	0.49	0.38	0.45
Nbi_g20196 (MAA3)	0.67	0.9	0.77	0.86	0.74	0.81	0.94	1.0
Nbi_g20203	0.6	0.8	0.73	0.65	0.43	0.48	0.67	1.0
Nbi_g20391	0.18	0.7	0.69	1.0	0.03	0.75	0.04	0.92
Nbi_g20422 (CRR22)	0.67	0.71	0.79	0.74	0.4	0.82	0.61	1.0
Nbi_g20589	0.58	1.0	0.91	0.76	0.18	0.2	0.29	0.37
Nbi_g20633	0.71	0.12	1.0	0.4	0.69	0.3	0.58	0.57
Nbi_g20825	0.27	0.64	0.32	0.55	0.09	0.14	0.17	1.0
Nbi_g20957	0.14	0.31	0.29	0.47	0.0	0.01	0.23	1.0
Nbi_g20994	0.53	0.86	0.42	0.81	0.42	0.3	0.5	1.0
Nbi_g21049	0.27	0.46	0.15	0.54	0.02	0.12	0.66	1.0
Nbi_g21187	1.0	0.61	0.86	0.59	0.47	0.22	0.36	0.2
Nbi_g21236	0.28	0.3	0.09	0.38	0.0	0.0	0.17	1.0
Nbi_g21320	1.0	0.61	0.99	0.61	0.1	0.21	0.28	0.12
Nbi_g21366	0.98	1.0	0.99	0.98	0.54	0.45	0.25	0.37
Nbi_g21378	0.95	1.0	0.89	0.76	0.19	0.55	0.63	0.45
Nbi_g21418	0.53	0.94	0.84	0.81	0.52	0.71	0.68	1.0
Nbi_g21663	0.62	0.47	0.47	0.88	0.62	0.23	0.52	1.0
Nbi_g21744	0.56	0.53	0.4	0.29	0.01	0.23	0.69	1.0
Nbi_g22013	0.36	0.97	0.52	0.5	0.4	0.31	1.0	0.85
Nbi_g22116	0.86	0.99	0.89	1.0	0.7	0.45	0.65	0.93
Nbi_g22168	0.49	0.12	1.0	0.27	0.0	0.0	0.15	0.17
Nbi_g22229	0.62	0.0	1.0	0.02	0.0	0.12	0.01	0.03
Nbi_g22424 (VAC1)	0.45	0.2	0.79	0.34	0.49	0.49	0.69	1.0
Nbi_g22427	1.0	0.17	0.82	0.38	0.04	0.06	0.0	0.07
Nbi_g22486	0.73	0.93	0.82	1.0	0.39	0.57	0.44	0.57
Nbi_g22594	0.7	0.64	0.17	1.0	0.0	0.0	0.32	0.93
Nbi_g22641	0.43	0.67	0.98	0.64	0.62	0.5	0.88	1.0
Nbi_g23179	0.72	0.21	1.0	0.42	0.23	0.28	0.46	0.41
Nbi_g23399	1.0	0.52	0.83	0.27	0.02	0.0	0.12	0.57
Nbi_g23768	1.0	0.8	0.86	0.79	0.44	0.34	0.3	0.31
Nbi_g23912	0.51	0.38	0.9	0.69	0.45	0.57	0.66	1.0
Nbi_g23961	0.75	0.79	0.67	0.96	0.36	0.63	0.3	1.0
Nbi_g24480 (CYP72A9)	0.61	0.23	1.0	0.17	0.0	0.51	0.9	0.25
Nbi_g24557	0.49	0.67	0.35	1.0	0.12	0.74	0.41	0.77
Nbi_g24612	0.07	0.16	0.21	0.29	0.03	0.04	0.26	1.0
Nbi_g24844	0.06	0.49	0.42	0.16	0.03	0.19	0.33	1.0
Nbi_g24947 (TZ)	0.87	0.19	1.0	0.1	0.06	0.14	0.65	0.28
Nbi_g24980	0.97	0.9	1.0	0.74	0.41	0.5	0.39	0.54
Nbi_g25048	0.67	0.44	1.0	0.38	0.34	0.3	0.75	0.89
Nbi_g25176	1.0	0.78	0.47	0.42	0.18	0.0	0.31	0.41
Nbi_g25207	0.49	0.75	1.0	0.95	0.27	0.17	0.26	0.78
Nbi_g25350	0.69	1.0	0.77	0.77	0.51	0.51	0.57	0.54
Nbi_g25428	0.35	0.6	0.66	1.0	0.2	0.33	0.25	0.41
Nbi_g25466	0.15	1.0	0.23	0.32	0.16	0.15	0.47	0.78
Nbi_g25492 (CRR2)	0.79	0.55	1.0	0.63	0.42	0.64	0.61	0.68
Nbi_g25557	1.0	0.04	0.96	0.07	0.07	0.04	0.33	0.29
Nbi_g25707	0.62	0.79	1.0	0.89	0.59	0.75	0.65	0.88
Nbi_g26108	0.52	0.96	0.71	0.59	0.2	0.37	0.38	1.0
Nbi_g26255	0.49	0.86	0.58	0.83	0.43	0.89	0.55	1.0
Nbi_g26340	0.96	0.86	1.0	0.88	0.2	0.22	0.32	0.42
Nbi_g26447	0.93	0.36	1.0	0.43	0.39	0.4	0.55	0.4
Nbi_g26678	0.28	0.8	0.49	0.73	0.4	0.31	0.34	1.0
Nbi_g26791	0.75	0.49	1.0	0.53	0.01	0.0	0.11	0.52
Nbi_g27019	0.67	1.0	0.63	0.82	0.49	0.69	0.34	0.65
Nbi_g27117	0.8	0.6	1.0	0.24	0.05	0.03	0.07	0.14
Nbi_g27178	0.76	0.2	1.0	0.25	0.05	0.02	0.09	0.19
Nbi_g27308	1.0	0.22	0.9	0.37	0.04	0.13	0.05	0.16
Nbi_g27707 (EMB2758)	0.72	0.47	1.0	0.64	0.22	0.3	0.13	0.45
Nbi_g27845	1.0	0.9	0.99	0.82	0.6	0.67	0.51	0.51
Nbi_g28092	0.32	0.46	0.39	0.11	0.09	0.03	0.67	1.0
Nbi_g28290	0.52	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.13	0.0
Nbi_g28593	0.64	1.0	0.48	0.65	0.0	0.41	0.03	0.36
Nbi_g28664	0.6	0.67	1.0	0.85	0.39	0.62	0.37	0.86
Nbi_g28946	0.81	0.57	1.0	0.48	0.5	0.49	0.46	0.35
Nbi_g29418	1.0	0.78	0.87	0.6	0.63	0.45	0.44	0.57
Nbi_g29448	0.64	0.36	0.79	1.0	0.1	0.05	0.05	0.1
Nbi_g29897	0.52	0.31	1.0	0.86	0.37	0.16	0.18	0.77
Nbi_g29931 (PDC2)	0.28	0.33	0.28	0.36	0.05	0.21	0.12	1.0
Nbi_g30278	0.32	0.0	1.0	0.13	0.04	0.26	0.04	0.03
Nbi_g31904	0.53	0.74	0.65	0.85	0.33	0.93	0.49	1.0
Nbi_g32187	0.79	0.77	1.0	0.74	0.72	0.69	0.5	0.85
Nbi_g34105	0.58	0.68	0.87	0.76	0.52	1.0	0.56	0.76
Nbi_g34549	1.0	0.63	0.96	0.82	0.35	0.68	0.51	0.69
Nbi_g35006	1.0	0.58	0.93	0.62	0.56	0.35	0.49	0.57
Nbi_g35856	0.32	0.55	0.3	0.23	0.15	0.16	0.69	1.0
Nbi_g35960	0.19	1.0	0.3	0.53	0.52	0.48	0.9	0.88
Nbi_g37538	0.87	0.61	1.0	0.58	0.06	0.8	0.3	0.5
Nbi_g38519	0.54	0.74	0.66	1.0	0.13	0.22	0.22	0.76
Nbi_g38578	0.46	1.0	0.84	1.0	0.23	0.38	0.24	0.47
Nbi_g38588	1.0	0.87	0.92	0.86	0.32	0.41	0.19	0.29
Nbi_g38699 (LOP1)	1.0	0.48	0.7	0.55	0.43	0.37	0.21	0.45
Nbi_g39130	0.07	0.47	0.07	0.43	0.0	0.08	0.15	1.0
Nbi_g39210	0.53	0.51	0.75	0.42	0.0	0.59	0.73	1.0
Nbi_g39427	0.37	0.27	1.0	0.43	0.12	0.11	0.21	0.42
Nbi_g39986	0.68	0.3	0.75	0.52	0.28	0.46	0.67	1.0
Nbi_g40095	1.0	0.38	0.98	0.41	0.05	0.02	0.2	0.67
Nbi_g40193	1.0	0.81	0.45	0.71	0.63	0.61	0.84	0.93
Nbi_g40210	0.94	0.46	1.0	0.41	0.11	0.14	0.8	0.7
Nbi_g40762 (VAC1)	0.58	0.09	1.0	0.12	0.33	0.1	0.2	0.38
Nbi_g40778	0.52	0.12	1.0	0.06	0.08	0.02	0.25	0.8
Nbi_g40792	0.45	0.62	0.59	1.0	0.0	0.0	0.32	0.94
Nbi_g40833	0.45	0.28	1.0	0.27	0.0	0.23	0.48	0.79
Nbi_g40998	0.91	0.84	1.0	0.75	0.03	0.36	0.55	0.8
Nbi_g41669	0.13	0.48	0.24	0.68	0.0	0.0	0.09	1.0
Nbi_g41817	0.41	0.43	0.47	0.18	0.0	0.1	0.34	1.0
Nbi_g42044	0.27	0.37	0.35	0.33	0.0	0.0	0.47	1.0
Nbi_g42096	0.93	0.29	1.0	0.45	0.47	0.25	0.35	0.62
Nbi_g42181	0.23	0.26	0.18	0.37	0.12	0.1	0.4	1.0
Nbi_g42511 (G3)	0.76	0.65	0.91	1.0	0.72	0.72	0.65	0.74
Nbi_g42659	0.39	0.59	0.49	0.67	0.22	0.15	0.64	1.0
Nbi_g42681	0.54	1.0	0.82	0.6	0.43	0.5	0.38	0.36
Nbi_g42735 (RAT5)	0.28	0.39	1.0	0.56	0.0	0.0	0.19	0.94
Nbi_g43471	0.43	0.62	0.56	1.0	0.58	0.87	0.6	0.95
Nbi_g43685	0.65	0.89	0.73	0.9	0.53	0.7	0.19	1.0
Nbi_g43809	0.33	0.43	0.15	0.58	0.12	0.24	0.05	1.0
Nbi_g43964	0.13	0.45	0.36	0.14	0.05	0.0	0.31	1.0
Nbi_g44699	0.33	0.23	0.41	0.37	0.05	0.16	0.49	1.0
Nbi_g44747	0.25	0.2	0.74	0.28	0.18	0.1	0.36	1.0
Nbi_g44753	0.95	1.0	0.8	0.42	0.0	0.0	0.51	0.82
Nbi_g44760	0.88	0.77	1.0	0.7	0.19	0.35	0.8	0.69

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)