Heatmap: Cluster_163 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	Sterile Leaflet	Mature Sterile Leaflet	Fertile Leaflet with Sori	Petiole	Crozier	Rhizome	Stolon	Stolon with Root
Nbi_g00070	1.0	0.57	0.9	0.69	0.57	0.43	0.38	0.39
Nbi_g00106	1.0	0.28	0.61	0.36	0.4	0.13	0.31	0.16
Nbi_g00120	1.0	0.44	0.65	0.39	0.32	0.05	0.14	0.06
Nbi_g00268 (LHCA1)	1.0	0.28	0.65	0.31	0.45	0.04	0.18	0.06
Nbi_g00366	1.0	0.75	0.99	0.63	0.47	0.41	0.24	0.33
Nbi_g00395	1.0	0.24	0.46	0.34	0.45	0.07	0.17	0.1
Nbi_g00399	1.0	0.56	0.78	0.61	0.56	0.28	0.35	0.26
Nbi_g00545	1.0	0.52	0.69	0.5	0.55	0.07	0.07	0.06
Nbi_g00555 (LHCA2)	1.0	0.32	0.67	0.35	0.38	0.05	0.18	0.06
Nbi_g00616	1.0	0.41	0.72	0.38	0.55	0.18	0.41	0.26
Nbi_g00623 (CDF1)	1.0	0.35	0.68	0.42	0.37	0.2	0.23	0.15
Nbi_g00754	1.0	0.48	0.78	0.44	0.45	0.14	0.13	0.12
Nbi_g00835	1.0	0.33	0.67	0.33	0.38	0.16	0.18	0.15
Nbi_g00865	1.0	0.37	0.69	0.41	0.2	0.07	0.11	0.08
Nbi_g00906	1.0	0.57	0.75	0.48	0.32	0.17	0.17	0.16
Nbi_g01740	1.0	0.58	0.85	0.61	0.56	0.22	0.39	0.32
Nbi_g01748 (SECE1)	1.0	0.38	0.71	0.43	0.57	0.29	0.33	0.28
Nbi_g01766	1.0	0.75	0.86	0.63	0.56	0.3	0.41	0.37
Nbi_g01819 (LHCB5)	1.0	0.33	0.66	0.37	0.37	0.04	0.15	0.05
Nbi_g01855 (LHCB4.2)	1.0	0.29	0.72	0.28	0.29	0.02	0.12	0.04
Nbi_g01911	1.0	0.55	0.78	0.45	0.34	0.13	0.08	0.13
Nbi_g02033 (OE23)	1.0	0.42	0.76	0.4	0.37	0.05	0.16	0.07
Nbi_g02142 (ROF2)	1.0	0.69	0.91	0.59	0.55	0.23	0.23	0.2
Nbi_g02806	1.0	0.67	0.93	0.62	0.64	0.31	0.25	0.31
Nbi_g02832 (PSAN)	1.0	0.25	0.78	0.28	0.26	0.04	0.17	0.06
Nbi_g02956 (HEMA1)	1.0	0.23	0.57	0.27	0.3	0.1	0.19	0.13
Nbi_g03338 (PSB27)	1.0	0.23	0.61	0.26	0.37	0.06	0.14	0.06
Nbi_g03344 (LEJ1)	1.0	0.47	0.68	0.49	0.48	0.22	0.18	0.18
Nbi_g03389	1.0	0.26	0.67	0.26	0.41	0.13	0.32	0.14
Nbi_g03396	1.0	0.57	0.94	0.49	0.42	0.15	0.11	0.17
Nbi_g03418 (CP24)	1.0	0.27	0.62	0.32	0.42	0.03	0.12	0.04
Nbi_g03954 (PSAH2)	1.0	0.33	0.66	0.3	0.39	0.02	0.19	0.06
Nbi_g03983	1.0	0.63	0.79	0.53	0.42	0.11	0.2	0.14
Nbi_g03988 (PSAE-2)	1.0	0.29	0.46	0.26	0.51	0.02	0.14	0.03
Nbi_g04102	1.0	0.25	0.47	0.25	0.43	0.09	0.2	0.12
Nbi_g04117 (TY1)	1.0	0.53	0.77	0.57	0.5	0.11	0.14	0.12
Nbi_g04688 (THF1)	1.0	0.47	0.9	0.46	0.36	0.12	0.15	0.1
Nbi_g04715 (ACSF)	1.0	0.46	0.74	0.66	0.54	0.11	0.25	0.1
Nbi_g04969 (VAC1)	1.0	0.7	0.96	0.76	0.49	0.42	0.3	0.41
Nbi_g05167 (LHCB2)	1.0	0.29	0.68	0.35	0.39	0.02	0.13	0.04
Nbi_g05306	1.0	0.36	0.63	0.31	0.41	0.08	0.15	0.12
Nbi_g05340	1.0	0.58	0.76	0.66	0.62	0.37	0.53	0.35
Nbi_g05429	1.0	0.43	0.91	0.45	0.24	0.1	0.17	0.14
Nbi_g05634 (PSAF)	1.0	0.31	0.78	0.32	0.34	0.01	0.13	0.04
Nbi_g05658 (CAB4)	1.0	0.39	0.57	0.35	0.46	0.03	0.26	0.09
Nbi_g05999	1.0	0.46	0.57	0.46	0.4	0.04	0.26	0.08
Nbi_g06549 (PPL1)	1.0	0.3	0.6	0.26	0.43	0.05	0.19	0.05
Nbi_g06591 (PSAD-1)	1.0	0.32	0.77	0.28	0.28	0.03	0.11	0.05
Nbi_g06623 (PTAC4)	1.0	0.66	0.82	0.72	0.59	0.29	0.4	0.31
Nbi_g06629	1.0	0.3	0.72	0.32	0.25	0.08	0.11	0.08
Nbi_g07054 (CSD2)	1.0	0.2	0.59	0.18	0.39	0.07	0.27	0.09
Nbi_g07161 (LHCA1)	1.0	0.28	0.47	0.32	0.46	0.03	0.3	0.08
Nbi_g07164	1.0	0.38	0.85	0.43	0.33	0.1	0.13	0.09
Nbi_g08104	1.0	0.5	0.69	0.63	0.46	0.13	0.37	0.2
Nbi_g08122	1.0	0.71	0.93	0.56	0.56	0.14	0.12	0.15
Nbi_g08274	1.0	0.52	0.82	0.49	0.52	0.2	0.28	0.23
Nbi_g08315	1.0	0.54	0.7	0.42	0.49	0.1	0.2	0.16
Nbi_g08483	1.0	0.28	0.61	0.25	0.4	0.05	0.19	0.08
Nbi_g08626	1.0	0.63	0.89	0.54	0.58	0.23	0.34	0.3
Nbi_g09263	1.0	0.43	0.75	0.32	0.29	0.04	0.06	0.02
Nbi_g09569 (RFC3)	1.0	0.38	0.83	0.42	0.36	0.16	0.14	0.13
Nbi_g10126 (emb1703)	1.0	0.57	0.87	0.45	0.6	0.33	0.28	0.31
Nbi_g10293 (PTAC16)	1.0	0.32	0.76	0.29	0.41	0.04	0.11	0.05
Nbi_g10858	1.0	0.43	0.65	0.48	0.52	0.19	0.21	0.2
Nbi_g10943	1.0	0.59	0.81	0.7	0.67	0.31	0.46	0.33
Nbi_g11055 (CP31)	1.0	0.6	0.87	0.6	0.45	0.22	0.22	0.24
Nbi_g11369	1.0	0.48	0.76	0.36	0.45	0.11	0.13	0.14
Nbi_g12136 (TGD2)	1.0	0.7	0.81	0.75	0.67	0.45	0.51	0.47
Nbi_g12302	1.0	0.41	0.77	0.42	0.44	0.23	0.18	0.16
Nbi_g13179 (HEME2)	1.0	0.31	0.66	0.42	0.57	0.09	0.19	0.1
Nbi_g13818 (FZL)	1.0	0.42	0.95	0.5	0.28	0.09	0.14	0.09
Nbi_g14085 (CaS)	1.0	0.38	0.71	0.41	0.34	0.1	0.25	0.13
Nbi_g14134 (FdC1)	0.98	0.46	1.0	0.47	0.28	0.16	0.12	0.11
Nbi_g14226 (RPL4)	1.0	0.25	0.56	0.25	0.43	0.07	0.17	0.07
Nbi_g14245 (OEC33)	1.0	0.35	0.73	0.36	0.33	0.03	0.13	0.04
Nbi_g14313 (EGY2)	1.0	0.18	0.41	0.16	0.37	0.05	0.15	0.06
Nbi_g15665 (LHCB3)	1.0	0.22	0.58	0.25	0.32	0.03	0.15	0.06
Nbi_g15957	1.0	0.21	0.57	0.14	0.14	0.02	0.05	0.02
Nbi_g17006 (TLP18.3)	1.0	0.26	0.7	0.28	0.3	0.03	0.12	0.04
Nbi_g17336	1.0	0.53	0.7	0.31	0.28	0.05	0.01	0.01
Nbi_g17871 (PSRP5)	1.0	0.31	0.7	0.26	0.36	0.1	0.17	0.13
Nbi_g18076	1.0	0.44	0.59	0.4	0.48	0.1	0.23	0.13
Nbi_g18651 (CHLM)	1.0	0.2	0.58	0.18	0.29	0.05	0.11	0.05
Nbi_g18702 (PY)	0.95	0.7	1.0	0.55	0.51	0.13	0.2	0.18
Nbi_g19658	0.99	0.61	1.0	0.53	0.42	0.27	0.24	0.29
Nbi_g20592	1.0	0.42	0.58	0.31	0.37	0.02	0.09	0.04
Nbi_g20995	1.0	0.38	0.7	0.36	0.32	0.09	0.14	0.1
Nbi_g21203 (CP24)	1.0	0.19	0.42	0.18	0.31	0.02	0.11	0.04
Nbi_g21205	1.0	0.35	0.67	0.3	0.49	0.11	0.34	0.13
Nbi_g23005	1.0	0.64	0.91	0.57	0.62	0.27	0.23	0.24
Nbi_g23197	1.0	0.55	0.82	0.66	0.49	0.2	0.23	0.19
Nbi_g23251 (PSBW)	1.0	0.33	0.59	0.32	0.31	0.04	0.12	0.06
Nbi_g25451 (NAP7)	1.0	0.58	0.97	0.7	0.58	0.26	0.29	0.28
Nbi_g26139 (GCP1)	1.0	0.67	0.85	0.58	0.51	0.31	0.37	0.41
Nbi_g27406	1.0	0.34	0.67	0.37	0.36	0.13	0.24	0.15
Nbi_g27611 (PSBQ)	1.0	0.47	0.85	0.49	0.35	0.06	0.14	0.08
Nbi_g27710 (LHCA3)	1.0	0.29	0.79	0.27	0.31	0.02	0.12	0.04
Nbi_g28257	1.0	0.14	0.42	0.1	0.31	0.01	0.13	0.02
Nbi_g28300 (PSAL)	1.0	0.28	0.56	0.29	0.42	0.04	0.21	0.05
Nbi_g29744	1.0	0.6	0.94	0.5	0.26	0.14	0.11	0.13
Nbi_g29946	1.0	0.42	0.85	0.49	0.41	0.22	0.26	0.25
Nbi_g30493 (SK1)	1.0	0.57	0.99	0.53	0.33	0.13	0.21	0.18
Nbi_g30520	1.0	0.44	0.75	0.43	0.48	0.18	0.26	0.24
Nbi_g30759	1.0	0.51	0.79	0.35	0.46	0.14	0.24	0.17
Nbi_g30821	1.0	0.41	0.94	0.36	0.38	0.04	0.13	0.1
Nbi_g32148 (PSAK)	1.0	0.21	0.59	0.18	0.29	0.03	0.13	0.05
Nbi_g32508	1.0	0.31	0.57	0.38	0.43	0.14	0.27	0.18
Nbi_g34784 (SS3)	1.0	0.67	0.89	0.69	0.63	0.39	0.58	0.4
Nbi_g38205 (GSA2)	1.0	0.34	0.72	0.45	0.31	0.14	0.18	0.16
Nbi_g38323	1.0	0.47	0.91	0.48	0.48	0.14	0.33	0.18
Nbi_g39469 (EMB2758)	1.0	0.46	0.86	0.42	0.42	0.18	0.16	0.24
Nbi_g39984	1.0	0.16	0.45	0.07	0.3	0.01	0.12	0.03
Nbi_g40328	1.0	0.4	0.54	0.39	0.49	0.06	0.27	0.11
Nbi_g40466	1.0	0.64	0.8	0.59	0.37	0.28	0.31	0.33
Nbi_g41488	1.0	0.3	0.47	0.21	0.35	0.07	0.13	0.05
Nbi_g42121	1.0	0.7	0.92	0.66	0.49	0.45	0.32	0.41
Nbi_g42461 (AAE14)	1.0	0.65	0.85	0.75	0.48	0.16	0.24	0.18
Nbi_g42594 (PFC1)	1.0	0.69	0.93	0.54	0.55	0.26	0.32	0.26

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)