Heatmap: Cluster_14 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
Archegoniophore (female)
Antheridiophore (male)
Antheridium (male)
Sperm
Sporeling
Thallus
Thallus (vegetative)
Thallus (MpPAP1OX-1)
Thallus (Tak1-2)
Thallus (MpPAP1OX-3)
Thallus (MpPAP1OX-2)
Thallus (Tak1-3)
mid rib (male)
Gametophyte
Gemmaling (female, hpt2040)
Gemmaling (male, hpt2040)
Gemmaling (BC3-38)
Gemmaling (Tak1)
Gemmaling
Gemma cup
gemma cup (male)
Aseptically grown rhizoids, thalloid, gemmae
0.76 0.54 2.0 2.47 0.2 0.44 0.55 0.21 0.5 0.3 0.41 0.35 0.18 0.15 0.25 0.26 0.18 0.18 0.13 0.19 0.15 0.2
2.93 5.67 44.08 9.51 1.93 2.91 2.48 1.46 1.67 1.79 1.86 2.31 2.61 2.38 2.77 3.18 2.25 1.63 1.08 1.52 1.43 0.51
5.38 4.52 23.96 1.63 1.73 3.72 3.76 2.53 4.14 1.48 2.25 3.81 2.11 2.95 2.39 3.38 2.21 2.37 3.17 2.78 2.94 2.13
0.36 5.87 41.88 0.46 0.68 0.31 0.21 0.15 0.3 0.13 0.23 0.28 0.11 0.16 0.08 0.12 0.2 0.08 0.29 0.18 0.26 0.26
4.86 12.26 24.37 1.26 0.81 3.41 2.21 1.86 0.0 2.2 1.77 1.37 0.64 1.42 3.42 3.19 3.26 2.68 2.63 3.33 1.26 1.48
1.62 2.66 7.32 1.19 0.82 1.1 1.31 1.17 0.96 0.99 1.12 1.15 0.19 0.6 1.07 0.84 1.06 0.94 0.64 0.44 0.44 1.24
10.79 20.43 60.31 1.16 5.72 7.76 9.7 5.31 7.19 2.81 3.67 8.91 5.51 5.01 3.48 4.64 4.57 4.8 5.38 6.26 7.71 7.53
1.78 3.28 27.56 4.69 2.27 2.14 1.21 0.48 2.29 0.57 1.19 3.24 0.92 1.39 0.63 1.05 0.74 1.03 1.9 1.5 1.14 2.35
1.38 4.92 27.54 3.26 1.48 1.29 0.2 1.06 1.47 0.62 0.59 1.42 0.84 0.66 0.77 1.12 0.45 0.62 0.33 0.18 0.5 0.29
0.51 1.25 2.48 1.03 0.28 0.22 0.35 0.2 0.21 0.16 0.21 0.18 0.15 0.31 0.21 0.23 0.17 0.2 0.61 0.33 0.26 0.59
Mp2g09280.1 (NRPA2)
0.0 0.25 1.03 0.19 0.0 0.02 0.02 0.0 0.0 0.0 0.07 0.33 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.24 3.42 12.29 0.55 0.19 0.73 0.27 0.1 0.3 0.04 0.18 0.35 0.41 0.24 0.74 0.65 0.5 0.73 0.5 0.34 0.54 0.23
1.69 3.05 35.36 0.55 0.97 0.9 1.24 0.42 1.0 0.3 0.74 0.65 0.51 0.54 0.35 0.56 0.33 0.42 0.4 0.65 0.62 1.19
3.48 3.37 23.98 0.77 1.66 2.43 3.85 1.59 1.93 1.3 1.69 1.75 1.37 1.58 1.02 1.27 1.3 1.33 0.82 1.43 1.69 2.72
2.32 3.66 8.75 0.43 0.98 1.06 1.58 0.58 1.03 0.97 1.63 1.16 0.72 1.09 0.77 0.68 1.01 0.62 1.14 0.94 0.76 1.34
0.0 0.9 24.79 0.46 0.21 0.02 0.26 0.0 0.0 1.11 0.0 0.0 0.0 0.21 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 1.08 20.79 3.11 0.91 0.26 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.72 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.25 0.9 4.79 0.49 0.19 0.23 0.25 0.08 0.16 0.14 0.1 0.0 0.02 0.95 0.09 0.1 0.19 0.08 0.12 0.16 0.5 0.25
1.3 2.02 41.81 5.34 0.4 0.83 1.2 0.35 0.45 0.24 0.6 0.3 0.59 0.44 0.37 0.45 0.22 0.33 0.0 0.44 0.2 0.96
4.25 3.44 31.98 3.1 0.71 4.18 4.9 1.84 3.66 1.4 1.82 2.95 1.85 2.66 3.3 3.35 3.32 2.96 2.19 1.71 2.87 6.65
0.53 1.42 5.54 2.32 0.57 0.68 0.48 0.4 0.26 0.49 0.6 0.33 0.3 0.51 0.33 0.36 0.33 0.22 0.19 0.27 0.38 1.33
Mp3g13090.1 (SLP2)
1.78 5.8 19.26 0.79 0.73 1.32 1.91 0.78 0.88 0.69 1.03 0.75 0.98 1.19 1.05 1.19 1.09 1.04 0.9 0.76 0.92 0.78
0.06 0.64 3.72 0.61 0.05 0.03 0.02 0.0 0.45 0.0 0.0 0.0 0.0 0.18 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.03 2.92 8.71 0.7 0.42 0.43 0.25 0.0 0.0 0.24 0.0 0.55 0.64 0.63 0.36 0.22 0.0 0.16 0.0 0.44 0.0 0.59
0.13 11.66 22.52 10.05 0.78 0.49 0.14 0.0 2.54 0.72 1.06 0.82 0.0 0.13 0.27 0.0 0.87 0.28 0.63 0.0 0.0 0.0
1.42 3.2 45.0 0.91 1.27 0.76 1.08 0.26 0.72 0.56 0.58 0.62 0.21 0.44 0.66 1.57 0.68 0.32 0.69 0.2 0.19 0.93
0.24 0.94 11.71 1.32 0.57 0.49 0.58 0.17 0.17 0.22 0.2 0.14 0.11 0.49 0.36 0.94 0.26 0.26 0.22 0.16 0.16 0.5
6.68 23.34 118.99 6.42 5.07 8.17 4.77 3.81 9.78 2.76 3.79 5.3 2.08 9.42 3.22 3.45 4.25 5.52 9.47 4.78 5.41 6.99
8.54 12.29 63.71 2.37 3.92 1.94 4.73 1.17 3.1 1.45 2.46 2.35 5.75 3.09 1.46 2.46 1.22 1.3 0.94 2.8 2.12 2.49
0.46 0.0 1.81 0.43 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.38 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Mp5g00330.1 (GSTF9)
1.82 2.55 13.35 3.54 0.42 0.47 0.42 0.41 0.39 0.35 0.49 0.88 0.11 0.8 0.31 0.41 0.47 0.42 0.39 0.41 0.35 0.2
0.11 0.7 3.13 0.91 0.26 0.17 0.22 0.0 0.15 0.27 0.09 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.23
0.23 0.0 17.96 0.22 0.47 0.27 0.18 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.67 0.26 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.24 1.11 9.19 1.33 0.1 0.07 0.1 0.0 0.0 0.28 0.0 0.0 0.0 0.16 0.0 0.19 0.0 0.19 0.0 0.0 0.0 0.0
0.76 9.86 41.2 0.57 0.53 0.87 1.08 0.48 0.92 0.81 0.0 1.76 0.46 1.31 0.29 1.7 0.27 0.92 0.0 1.46 0.81 0.48
0.24 0.29 0.94 0.56 0.01 0.02 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.06
1.85 2.41 8.56 0.65 0.19 0.52 1.3 0.7 0.99 0.34 0.61 0.87 0.36 0.78 0.39 0.21 0.24 0.39 0.22 0.42 0.34 0.83
0.62 1.2 8.05 1.19 0.29 0.36 0.33 0.27 0.32 0.13 0.25 0.19 0.18 0.71 0.28 0.26 0.24 0.35 0.39 0.25 0.26 0.44
0.12 0.49 4.66 0.87 0.08 0.08 0.08 0.11 0.0 0.09 0.09 0.0 0.1 0.13 0.15 0.0 0.14 0.14 0.0 0.0 0.0 0.22
2.96 3.16 31.24 6.69 0.8 1.65 3.66 0.84 0.96 0.87 0.76 1.39 1.78 0.68 0.4 0.56 0.5 0.41 0.12 1.01 0.28 1.5
Mp6g09800.1 (FRA1)
1.54 3.26 20.61 1.03 2.02 1.58 1.86 0.98 1.76 0.77 1.6 1.46 0.69 1.25 1.03 1.25 0.84 0.94 1.44 1.71 1.97 4.18
1.35 1.48 17.08 1.34 0.57 0.28 0.42 0.64 0.0 0.0 0.0 0.59 0.56 0.54 0.39 0.83 0.79 0.8 0.0 0.0 0.0 0.32
1.19 3.59 19.8 0.76 1.11 0.73 1.32 0.77 1.1 0.52 0.79 0.82 1.09 0.67 0.38 0.38 0.55 0.38 0.47 0.55 0.86 0.81
2.69 5.66 33.82 1.55 1.99 2.48 3.49 1.52 2.41 1.22 1.77 2.75 3.07 2.12 1.96 1.5 1.7 1.26 0.79 2.11 1.34 5.88
0.99 1.9 33.03 3.03 0.7 0.19 0.33 0.6 0.0 0.49 0.0 0.0 0.0 0.36 0.36 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.02 0.0
0.22 0.96 6.52 1.66 0.14 0.48 0.41 0.08 0.32 0.22 0.17 0.15 0.25 1.19 0.1 0.19 0.05 0.31 0.0 0.19 0.28 0.08
3.07 11.2 55.78 2.94 1.44 1.32 1.05 1.88 6.21 4.47 3.97 3.49 0.97 2.35 2.39 0.8 1.01 0.32 1.53 5.95 4.58 1.88
5.02 14.31 218.04 30.86 6.83 6.55 7.46 2.29 5.17 1.83 3.21 4.27 6.41 2.02 2.99 2.45 4.66 4.22 2.91 5.19 5.56 3.65
Mp7g13030.1 (UBP11)
0.62 3.16 36.96 1.02 1.29 0.38 0.68 0.34 0.07 0.1 0.08 0.34 0.19 0.24 0.15 0.15 0.23 0.21 0.17 0.05 0.23 0.46
0.6 4.2 44.42 4.29 1.37 0.62 0.81 0.39 0.59 0.28 0.17 0.85 0.58 0.69 0.25 0.33 0.46 0.42 0.61 0.49 0.52 0.64
0.41 0.91 2.28 0.48 0.09 0.12 0.14 0.26 0.15 0.15 0.2 0.08 0.05 0.3 0.1 0.11 0.11 0.07 0.19 0.17 0.19 0.12
0.31 0.24 0.98 0.41 0.07 0.03 0.1 0.05 0.08 0.06 0.01 0.12 0.04 0.11 0.02 0.02 0.03 0.02 0.04 0.06 0.0 0.04
3.1 2.66 6.8 5.87 0.75 2.55 3.7 2.37 2.17 1.6 1.28 2.34 1.77 2.21 1.73 1.57 1.94 1.25 2.17 2.19 1.98 3.49
1.74 4.35 81.44 6.52 0.2 0.53 1.26 0.48 0.92 0.85 1.52 0.0 0.87 0.8 0.29 0.26 0.0 0.0 0.0 0.37 1.62 1.91
Mp8g08430.1 (SAM2)
17.47 29.0 87.56 0.44 4.78 6.57 13.25 16.1 17.87 11.0 17.17 16.89 6.87 38.0 1.39 1.48 2.26 1.47 1.93 14.23 11.6 41.77
0.33 3.0 78.11 8.52 1.12 1.34 1.81 0.0 4.54 1.92 2.82 0.0 1.88 1.44 1.46 1.72 0.0 0.0 3.35 5.48 0.0 2.36
0.16 0.37 3.26 0.62 0.21 0.09 0.14 0.12 0.07 0.04 0.11 0.03 0.07 0.46 0.07 0.07 0.06 0.09 0.12 0.15 0.0 0.09
0.62 0.97 3.37 0.11 0.16 0.22 0.11 0.0 0.21 0.18 0.26 0.0 0.19 0.18 0.14 0.12 0.27 0.12 0.0 0.0 0.0 0.21
2.14 1.48 4.3 3.67 0.4 0.86 0.67 0.98 0.56 0.48 0.62 0.56 0.55 1.29 0.58 0.44 0.6 0.44 0.77 0.71 0.58 1.33

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)