Heatmap: Cluster_35 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	Archegoniophore (female)	Antheridiophore (male)	Antheridium (male)	Sperm	Sporeling	Thallus	Thallus (vegetative)	Thallus (MpPAP1OX-1)	Thallus (Tak1-2)	Thallus (MpPAP1OX-3)	Thallus (MpPAP1OX-2)	Thallus (Tak1-3)	mid rib (male)	Gametophyte	Gemmaling (female, hpt2040)	Gemmaling (male, hpt2040)	Gemmaling (BC3-38)	Gemmaling (Tak1)	Gemmaling	Gemma cup	gemma cup (male)	Aseptically grown rhizoids, thalloid, gemmae
Mp1g00310.1	0.03	0.03	0.05	0.01	0.01	0.39	0.15	0.14	0.35	0.22	0.13	0.39	0.15	1.0	0.3	0.16	0.32	0.31	0.16	0.31	0.3	0.35
Mp1g08630.1	0.19	0.22	0.07	0.02	0.27	0.56	0.42	0.38	0.82	0.36	0.31	0.84	0.13	1.0	0.47	0.38	0.54	0.44	0.7	0.67	0.5	0.72
Mp1g09600.1 (GMD2)	0.07	0.05	0.0	0.0	0.0	0.3	0.22	0.25	0.43	0.3	0.25	0.51	0.06	1.0	0.13	0.11	0.15	0.12	0.4	0.5	0.38	0.43
Mp1g11340.1 (PPC2)	0.29	0.14	0.08	0.01	0.1	0.42	0.48	0.41	0.43	0.34	0.35	0.43	0.21	0.73	0.47	0.38	0.52	0.48	0.58	0.28	0.28	1.0
Mp1g17390.1	0.66	0.32	0.05	0.03	0.06	0.91	0.67	0.91	0.83	0.84	0.86	0.78	0.39	0.54	0.62	0.5	0.76	0.62	0.22	0.35	0.39	1.0
Mp1g17600.1 (COBL11)	0.06	0.08	0.02	0.01	0.02	0.26	0.25	0.12	0.22	0.12	0.1	0.29	0.06	1.0	0.18	0.12	0.21	0.18	0.45	0.18	0.17	0.33
Mp1g26030.1	0.48	0.35	0.21	0.05	0.26	0.67	0.55	0.51	0.51	0.46	0.41	0.48	0.33	0.56	0.48	0.39	0.53	0.52	0.63	0.38	0.41	1.0
Mp1g26390.1	0.05	0.07	0.0	0.0	0.25	0.63	0.33	0.35	0.83	0.36	0.31	1.0	0.18	0.87	0.55	0.41	0.6	0.51	0.62	0.91	0.73	0.47
Mp1g28410.1	0.18	0.05	0.0	0.08	0.0	0.71	0.9	0.52	0.71	0.36	0.34	1.0	0.4	1.0	0.33	0.17	0.56	0.39	0.45	0.8	0.78	0.81
Mp2g01450.1	0.39	0.31	0.07	0.01	0.19	0.5	0.78	0.54	0.54	0.46	0.41	0.61	0.43	0.84	0.41	0.35	0.45	0.38	0.46	0.42	0.48	1.0
Mp2g02440.1 (KJK)	0.08	0.05	0.0	0.03	0.21	0.37	0.3	0.25	0.42	0.23	0.2	0.51	0.08	0.95	0.31	0.24	0.35	0.27	0.61	0.35	0.35	1.0
Mp2g03160.1	0.17	0.41	0.44	0.02	0.15	0.56	0.45	0.42	0.94	0.57	0.53	1.0	0.24	0.32	0.3	0.24	0.31	0.29	0.29	0.83	0.59	0.4
Mp2g04880.1	0.35	0.19	0.1	0.03	0.04	0.41	0.63	0.39	0.32	0.52	0.61	0.36	0.19	0.61	0.16	0.15	0.19	0.17	0.24	0.19	0.26	1.0
Mp2g05640.1 (KJK)	0.07	0.06	0.04	0.03	0.0	0.35	0.38	0.11	0.44	0.16	0.11	0.59	0.08	1.0	0.19	0.09	0.2	0.14	0.63	0.08	0.11	0.63
Mp2g10790.1 (RGP)	0.31	0.28	0.07	0.01	0.13	0.45	0.53	0.57	0.83	0.55	0.5	1.0	0.12	0.78	0.31	0.27	0.34	0.31	0.47	0.68	0.58	0.78
Mp2g14700.1 (VHA-A)	0.07	0.05	0.0	0.01	0.02	0.5	0.3	0.21	0.43	0.29	0.21	0.51	0.09	1.0	0.51	0.31	0.49	0.39	0.39	0.3	0.28	0.45
Mp2g14840.1	0.75	0.57	0.13	0.01	0.16	0.63	0.43	0.66	0.94	0.52	0.54	1.0	0.45	0.65	0.33	0.26	0.38	0.3	0.59	0.82	0.77	0.46
Mp2g24410.1 (PR3)	0.15	0.14	0.01	0.02	0.0	0.29	0.67	0.25	0.21	0.18	0.23	0.17	0.18	0.36	0.12	0.1	0.12	0.11	0.4	0.08	0.1	1.0
Mp3g00690.1 (XYLT)	0.29	0.26	0.25	0.01	0.14	0.47	0.59	0.59	0.9	0.49	0.52	1.0	0.19	0.76	0.27	0.24	0.31	0.27	0.45	0.68	0.58	0.85
Mp3g03130.1	0.01	0.0	0.0	0.01	0.0	0.21	0.18	0.05	0.55	0.11	0.15	0.41	0.05	0.5	0.06	0.08	0.07	0.09	0.05	0.03	0.05	1.0
Mp3g03140.1	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.33	0.28	0.15	0.78	0.23	0.27	0.8	0.07	0.74	0.08	0.12	0.14	0.13	0.12	0.23	0.18	1.0
Mp3g03530.1 (GLTP1)	0.19	0.13	0.01	0.01	0.02	0.58	0.3	0.31	0.32	0.34	0.29	0.39	0.9	0.62	0.33	0.27	0.31	0.26	0.67	0.39	0.55	1.0
Mp3g03890.1 (EXP1)	0.05	0.04	0.09	0.01	0.01	0.28	0.13	0.42	0.48	0.08	0.18	0.55	0.1	0.63	0.11	0.09	0.19	0.19	0.39	0.51	0.4	1.0
Mp3g07040.1	0.2	0.15	0.01	0.01	0.14	0.56	0.46	0.41	0.45	0.39	0.36	0.5	0.14	1.0	0.55	0.46	0.55	0.53	0.6	0.32	0.32	0.85
Mp3g12000.1	0.01	0.04	0.05	0.03	0.0	0.24	0.36	0.03	0.3	0.02	0.09	1.0	0.06	0.37	0.04	0.03	0.06	0.03	0.17	0.1	0.05	0.25
Mp3g13480.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.39	0.39	0.12	0.22	0.18	0.19	0.22	0.11	0.23	0.19	0.14	0.16	0.24	0.31	0.07	0.06	1.0
Mp3g13490.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.61	0.68	0.39	0.56	0.48	0.48	0.57	0.16	0.54	0.33	0.31	0.3	0.45	0.6	0.24	0.25	1.0
Mp3g13500.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.3	0.45	0.1	0.24	0.15	0.18	0.25	0.06	0.13	0.1	0.09	0.09	0.15	0.17	0.06	0.06	1.0
Mp3g14420.1	0.42	0.37	0.35	0.04	0.13	0.87	1.0	0.64	0.59	0.59	0.6	0.59	0.47	0.76	0.38	0.36	0.41	0.31	0.33	0.45	0.49	0.69
Mp3g20190.1	0.63	0.22	0.11	0.24	0.08	0.78	0.71	0.63	0.82	0.43	0.52	0.84	0.32	0.99	0.58	0.35	0.69	0.45	0.9	0.78	0.57	1.0
Mp3g21400.1 (PFU2)	0.48	0.29	0.3	0.12	0.29	0.54	0.62	0.22	0.25	0.18	0.15	0.26	0.17	0.85	0.4	0.41	0.43	0.47	0.56	0.22	0.27	1.0
Mp4g01660.1	0.47	0.13	0.01	0.2	0.02	0.35	0.43	0.43	0.48	0.29	0.31	0.42	0.12	1.0	0.22	0.21	0.21	0.17	0.28	0.28	0.24	0.69
Mp4g04910.1 (ICE1)	0.57	0.58	0.4	0.02	0.0	1.0	0.71	0.29	0.83	0.42	0.38	0.91	0.2	0.87	0.52	0.42	0.77	0.77	0.76	0.33	0.32	0.44
Mp4g05500.1	0.63	0.39	0.05	0.02	0.06	0.65	0.7	0.99	1.0	0.82	0.95	0.95	0.37	0.81	0.31	0.31	0.41	0.37	0.32	0.82	0.69	0.87
Mp4g09580.1	0.07	0.02	0.0	0.01	0.01	0.28	0.29	0.23	0.18	0.2	0.14	0.3	0.28	1.0	0.32	0.25	0.3	0.21	0.53	0.23	0.28	0.4
Mp4g16720.1	0.01	0.01	0.0	0.0	0.02	0.33	0.21	0.12	0.27	0.18	0.13	0.32	0.09	1.0	0.28	0.2	0.28	0.25	0.43	0.22	0.23	0.34
Mp4g21660.1	0.1	0.05	0.01	0.03	0.05	0.28	0.25	0.28	0.32	0.22	0.2	0.41	0.13	1.0	0.2	0.14	0.22	0.21	0.31	0.17	0.26	0.48
Mp5g00620.1	0.06	0.04	0.0	0.01	0.0	0.76	0.75	0.5	0.68	0.73	0.59	0.51	0.88	0.65	0.39	0.42	0.36	0.34	0.41	0.36	0.51	1.0
Mp5g03510.1	0.44	0.37	0.24	0.01	0.08	0.53	0.75	0.5	0.76	0.46	0.44	1.0	0.15	0.64	0.3	0.26	0.34	0.28	0.46	0.63	0.6	0.85
Mp5g04700.1	0.31	0.23	0.01	0.04	0.13	0.49	0.67	0.46	0.43	0.49	0.38	0.55	0.22	0.71	0.36	0.36	0.41	0.36	0.46	0.23	0.25	1.0
Mp5g12310.1	0.04	0.06	0.01	0.02	0.11	0.45	0.37	0.25	0.63	0.3	0.27	0.63	0.16	1.0	0.33	0.25	0.33	0.33	0.44	0.5	0.41	0.63
Mp5g13220.1 (EST3)	0.26	0.4	0.02	0.04	0.15	0.57	0.64	0.51	0.46	0.32	0.46	0.39	0.18	0.89	0.69	0.53	0.62	0.68	0.71	0.24	0.19	1.0
Mp5g24530.1 (CSLD2)	0.12	0.08	0.0	0.01	0.17	0.49	0.45	0.27	0.53	0.22	0.22	0.59	0.18	0.62	0.43	0.35	0.44	0.41	1.0	0.33	0.38	0.64
Mp6g03700.1	0.35	0.23	0.02	0.17	0.04	0.46	0.53	0.22	0.24	0.24	0.23	0.35	0.11	1.0	0.17	0.13	0.26	0.2	0.38	0.16	0.2	0.42
Mp6g05430.1 (GES)	0.27	0.18	0.17	0.04	0.1	0.41	0.4	0.51	0.6	0.39	0.39	0.61	0.25	1.0	0.41	0.29	0.38	0.36	0.62	0.51	0.52	0.77
Mp6g07890.1 (TMT2)	0.17	0.11	0.05	0.01	0.06	0.34	0.29	0.37	0.46	0.37	0.28	0.67	0.11	0.31	0.28	0.23	0.33	0.27	0.4	0.31	0.29	1.0
Mp6g13160.2	0.39	0.06	0.02	0.09	0.07	0.45	0.81	0.3	0.63	0.31	0.37	0.58	0.45	0.76	0.22	0.12	0.24	0.25	0.8	0.35	0.29	1.0
Mp6g18120.1 (RFO1)	0.82	0.88	0.15	0.04	0.01	1.0	0.74	0.93	0.78	0.62	0.73	0.71	0.48	0.64	0.67	0.72	0.73	0.63	0.7	0.49	0.64	0.83
Mp7g00640.1	0.3	0.16	0.01	0.01	0.08	0.42	0.65	0.31	0.41	0.31	0.28	0.6	0.18	1.0	0.28	0.25	0.29	0.22	0.39	0.18	0.21	0.77
Mp7g02160.1 (FXG1)	0.25	0.11	0.0	0.0	0.05	0.36	0.59	0.44	0.58	0.29	0.33	0.63	0.17	0.69	0.22	0.2	0.24	0.24	0.32	0.46	0.41	1.0
Mp7g02180.1	0.31	0.21	0.0	0.01	0.06	0.63	0.77	0.57	0.93	0.38	0.42	0.97	0.22	1.0	0.33	0.29	0.42	0.38	0.57	0.6	0.55	0.87
Mp7g12530.1	0.56	0.52	0.3	0.19	0.45	0.79	1.0	0.47	0.49	0.57	0.47	0.41	0.32	0.61	0.44	0.59	0.54	0.61	0.7	0.58	0.52	0.58
Mp7g14850.1	0.48	0.47	0.2	0.01	0.23	0.54	0.74	0.7	0.81	0.68	0.6	0.91	0.18	0.7	0.35	0.31	0.4	0.34	0.47	0.66	0.55	1.0
Mp7g15310.1	0.05	0.05	0.0	0.02	0.06	0.46	0.28	0.51	0.88	0.56	0.49	0.96	0.64	0.77	0.3	0.2	0.25	0.21	0.53	1.0	0.59	0.49
Mp8g00850.1	0.34	0.16	0.03	0.19	0.05	0.29	0.37	0.38	0.27	0.31	0.29	0.72	0.27	0.37	0.3	0.24	0.27	0.22	0.47	0.24	0.35	1.0
Mp8g01720.1	0.05	0.02	0.0	0.0	0.06	0.49	0.24	0.31	0.6	0.33	0.26	0.73	0.12	1.0	0.34	0.26	0.37	0.34	0.37	0.48	0.39	0.91
Mp8g03610.1	0.12	0.17	0.0	0.01	0.0	0.38	0.35	0.55	0.82	0.35	0.41	1.0	0.25	0.64	0.24	0.23	0.25	0.21	0.17	0.67	0.67	0.2
Mp8g04280.1	0.01	0.02	0.0	0.05	0.05	0.25	0.33	0.14	0.15	0.22	0.13	0.28	0.31	1.0	0.2	0.19	0.22	0.2	0.53	0.29	0.2	0.6
Mp8g04770.1 (PK3)	0.59	0.56	0.49	0.03	0.19	0.62	0.7	0.65	0.89	0.48	0.57	0.94	0.38	1.0	0.37	0.3	0.4	0.33	0.46	0.67	0.58	0.76
Mp8g15680.1	0.21	0.21	0.01	0.02	0.11	0.79	0.74	0.45	0.45	0.37	0.44	0.42	0.48	0.54	0.41	0.23	0.44	0.41	0.72	0.23	0.27	1.0
Mp8g15780.1	0.34	0.22	0.37	0.01	0.02	0.97	1.0	0.51	0.85	0.63	0.65	0.98	0.54	0.2	0.4	0.28	0.52	0.34	0.1	0.62	0.62	0.76

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)