Heatmap: Cluster_58 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
Archegoniophore (female)
Antheridiophore (male)
Antheridium (male)
Sperm
Sporeling
Thallus
Thallus (vegetative)
Thallus (MpPAP1OX-1)
Thallus (Tak1-2)
Thallus (MpPAP1OX-3)
Thallus (MpPAP1OX-2)
Thallus (Tak1-3)
mid rib (male)
Gametophyte
Gemmaling (female, hpt2040)
Gemmaling (male, hpt2040)
Gemmaling (BC3-38)
Gemmaling (Tak1)
Gemmaling
Gemma cup
gemma cup (male)
Aseptically grown rhizoids, thalloid, gemmae
0.4 3.13 4.91 1.9 0.06 0.02 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.02 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.05 0.0
Mp1g06410.1 (DMS1)
0.13 4.36 3.81 0.34 0.13 0.14 0.07 0.14 0.09 0.03 0.09 0.13 0.12 0.08 0.09 0.06 0.07 0.08 0.16 0.04 0.08 0.05
29.47 88.31 56.4 0.46 0.25 2.39 17.27 10.58 2.57 7.63 7.34 1.32 1.66 3.0 0.9 0.89 1.14 1.12 2.02 6.1 4.89 7.55
Mp1g14610.1 (BAT1)
4.95 20.95 4.44 0.52 1.83 2.84 4.03 1.04 4.31 0.7 0.38 5.82 1.15 7.62 2.09 1.44 2.11 2.53 2.51 2.74 3.39 1.2
1.12 13.75 1.62 0.26 0.2 0.62 0.94 0.61 2.74 4.8 4.71 2.26 0.19 0.75 0.25 0.0 0.0 0.13 0.0 1.06 0.0 0.41
30.7 117.82 21.82 1.53 0.3 19.9 12.0 5.11 3.08 6.23 3.17 2.61 0.92 5.87 12.38 14.1 8.36 8.87 3.38 0.92 1.6 1.19
0.35 10.65 6.19 0.95 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Mp2g03650.1 (CHIA)
16.18 154.63 0.81 0.17 0.0 2.55 5.95 27.12 11.6 23.75 17.06 11.43 0.69 2.13 0.76 0.97 0.79 1.3 0.41 5.61 6.29 7.27
72.9 384.77 3.87 0.57 0.04 0.25 8.15 1.78 0.34 0.93 0.14 0.0 0.31 0.88 0.11 0.0 0.0 0.12 0.0 2.69 0.91 0.0
5.59 90.58 0.33 0.36 0.0 0.8 0.86 1.49 1.07 1.35 1.24 1.34 0.38 4.4 0.4 0.39 0.94 0.3 0.04 0.54 0.33 0.17
0.02 0.79 2.16 0.9 0.07 0.05 0.01 0.14 0.0 0.12 0.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0
3.98 28.74 0.1 0.65 0.0 0.88 1.56 11.95 0.99 6.01 5.95 0.73 0.04 2.56 0.08 0.05 0.08 0.06 0.0 0.63 0.67 0.86
1.52 3.99 1.18 0.82 0.25 0.29 0.15 0.2 0.0 0.18 0.0 0.38 0.0 0.44 0.13 0.23 0.14 0.11 0.0 0.0 0.0 0.2
0.84 7.32 17.66 7.5 0.04 0.39 0.48 0.42 0.4 0.22 0.46 0.09 0.33 0.34 0.1 0.34 0.16 0.33 0.03 0.22 0.72 0.28
Mp2g23000.1 (BEH4)
2.12 16.68 14.63 1.01 0.01 0.02 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.01 0.04 0.0 0.06 0.0 0.01 0.06 0.0 0.0 0.02
1.74 8.79 1.25 1.14 0.15 0.5 0.47 0.48 0.0 0.0 0.38 0.0 0.21 0.47 0.0 0.35 0.15 0.13 0.0 0.18 0.81 0.24
0.12 3.58 0.22 0.28 0.0 0.1 0.05 0.3 0.58 0.16 0.25 0.0 0.01 0.24 0.0 0.02 0.04 0.02 0.0 0.0 0.0 0.16
32.65 208.31 17.15 0.81 0.01 18.98 29.99 7.99 25.02 8.62 13.28 20.85 6.06 17.68 2.75 2.38 2.23 2.69 11.73 6.62 7.17 30.39
0.11 0.77 2.13 0.48 0.0 0.07 0.02 0.01 0.1 0.0 0.03 0.0 0.08 0.04 0.03 0.03 0.02 0.02 0.08 0.03 0.02 0.02
7.83 24.31 0.0 0.69 0.0 0.16 1.02 0.2 0.0 0.03 0.12 0.0 0.02 1.15 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03
0.09 15.64 0.19 0.24 0.0 0.17 0.01 0.0 0.0 0.02 0.0 0.05 0.05 0.03 0.0 0.0 0.02 0.03 0.0 0.97 0.17 0.1
Mp4g14620.1 (ERL2)
3.65 12.12 1.79 0.41 0.39 2.25 1.74 2.22 2.2 2.44 2.39 2.97 0.28 2.24 2.14 3.13 2.43 2.49 2.46 2.22 1.9 0.68
0.36 3.62 4.72 2.71 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.31 0.24 0.07 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0
0.3 0.99 1.45 0.17 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.05 1.63 3.81 0.43 0.01 0.03 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06
13.94 73.69 60.38 1.12 0.0 0.25 1.1 0.0 0.28 0.13 0.7 0.55 0.07 0.61 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 5.75
4.37 34.84 0.17 0.29 0.17 1.03 4.44 2.2 0.85 3.1 5.03 1.07 0.68 6.96 0.51 0.8 0.53 0.37 0.87 1.04 1.33 1.56
1.04 6.52 0.0 0.33 0.0 0.75 1.72 0.14 0.46 0.15 0.1 0.22 0.17 2.33 0.16 1.09 0.19 0.29 0.03 0.06 0.03 0.51
2.59 235.15 0.51 0.92 0.0 0.01 0.35 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.06 0.5 0.14 0.11 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.03 0.0 0.0 0.0 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0
Mp5g16040.1 (PAP29)
11.2 27.78 40.03 0.41 0.78 2.83 7.03 2.99 3.24 2.94 2.33 2.78 2.37 2.81 2.39 2.26 2.22 1.78 1.17 3.55 2.49 5.85
0.66 3.73 4.49 0.17 0.01 0.11 0.14 0.43 0.38 0.68 0.84 0.44 0.02 0.1 0.1 0.03 0.02 0.07 0.0 0.45 0.34 0.12
Mp6g13410.1 (CYCJ18)
0.01 1.6 2.69 0.27 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.03 0.0 0.03 0.0 0.04 0.0 0.0
Mp7g01390.1 (MES14)
7.88 32.78 0.0 0.35 0.0 6.68 5.55 1.97 1.02 0.94 0.53 1.96 1.7 10.76 4.43 4.42 5.24 10.0 0.3 1.0 1.35 1.38
21.59 80.79 0.0 0.22 0.0 18.57 7.67 4.59 4.18 3.06 6.82 5.37 0.21 8.53 8.91 11.56 6.84 10.64 5.14 0.55 0.0 4.83
16.19 99.49 0.49 0.47 0.01 1.66 5.74 8.26 0.52 5.55 4.55 0.17 0.15 3.32 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.41 0.91 3.4
0.84 17.2 12.47 4.12 0.09 1.58 0.49 0.58 0.84 0.12 0.23 0.27 0.24 1.72 0.0 0.08 0.45 0.74 1.45 1.11 1.49 0.0
0.38 1.18 1.41 0.97 0.09 0.01 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.18
3.77 95.88 54.44 1.83 0.01 0.06 0.37 0.06 0.64 0.02 0.06 2.24 0.02 33.33 0.01 0.04 0.0 0.0 0.11 0.4 0.22 0.02
28.36 62.67 106.64 1.29 3.99 6.39 11.12 15.75 9.21 16.73 16.45 17.73 4.83 6.62 2.47 2.18 2.89 1.83 3.93 18.01 15.43 17.88
2.47 19.53 27.83 0.97 0.01 1.42 0.87 0.59 1.35 0.51 0.62 2.53 0.59 0.62 0.27 0.19 0.23 0.14 0.1 0.87 0.75 0.22
0.0 1.69 4.23 0.65 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.34 13.39 15.32 0.85 0.34 0.32 0.0 1.58 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.48 2.83 0.0 0.0 0.87 0.0 0.0 0.0 0.0
MpVg00320.1 (CRK8)
4.09 39.59 95.43 31.98 2.65 2.77 4.83 2.61 2.46 2.07 2.03 2.43 2.66 2.16 2.28 3.21 2.12 3.13 2.03 2.94 3.17 5.21

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)