Heatmap: Cluster_52 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	Archegoniophore (female)	Antheridiophore (male)	Antheridium (male)	Sperm	Sporeling	Thallus	Thallus (vegetative)	Thallus (MpPAP1OX-1)	Thallus (Tak1-2)	Thallus (MpPAP1OX-3)	Thallus (MpPAP1OX-2)	Thallus (Tak1-3)	mid rib (male)	Gametophyte	Gemmaling (female, hpt2040)	Gemmaling (male, hpt2040)	Gemmaling (BC3-38)	Gemmaling (Tak1)	Gemmaling	Gemma cup	gemma cup (male)	Aseptically grown rhizoids, thalloid, gemmae
Mp1g03740.1	0.2	0.14	0.0	0.04	0.0	0.24	0.32	0.08	0.22	0.13	0.19	0.11	0.05	1.0	0.1	0.03	0.22	0.08	0.0	0.02	0.11	0.06
Mp1g08060.1	0.33	0.36	0.56	0.41	0.0	0.27	0.65	0.09	0.07	0.12	0.11	0.15	0.07	1.0	0.08	0.04	0.18	0.1	0.13	0.01	0.02	0.57
Mp1g22730.1 (EXP9)	0.19	0.14	0.0	0.0	0.0	0.13	0.32	0.09	0.05	0.09	0.07	0.08	0.01	1.0	0.03	0.01	0.09	0.04	0.0	0.0	0.02	0.26
Mp1g22970.1 (RCI3)	0.01	0.0	0.0	0.07	0.0	0.06	0.13	0.01	0.0	0.04	0.02	0.04	0.03	1.0	0.03	0.01	0.06	0.02	0.0	0.03	0.02	0.25
Mp1g28210.1	0.24	0.2	0.0	0.03	0.02	0.12	0.37	0.1	0.09	0.09	0.1	0.06	0.04	1.0	0.04	0.01	0.1	0.07	0.09	0.05	0.06	0.33
Mp1g29040.1 (PIP3)	0.04	0.04	0.01	0.02	0.0	0.08	0.15	0.03	0.01	0.02	0.0	0.06	0.05	1.0	0.02	0.0	0.07	0.04	0.0	0.02	0.03	0.02
Mp2g00490.1	0.12	0.19	0.0	0.04	0.0	0.13	0.32	0.06	0.05	0.1	0.07	0.06	0.01	1.0	0.04	0.01	0.1	0.07	0.01	0.03	0.03	0.43
Mp2g04490.1	0.26	0.45	0.0	0.07	0.0	0.16	0.38	0.09	0.08	0.11	0.1	0.09	0.03	1.0	0.11	0.09	0.16	0.12	0.09	0.03	0.03	0.22
Mp2g09030.1	0.2	0.12	0.0	0.02	0.0	0.1	0.16	0.03	0.06	0.04	0.06	0.04	0.01	1.0	0.01	0.01	0.06	0.0	0.0	0.01	0.02	0.07
Mp2g13570.1	0.11	0.18	0.0	0.02	0.0	0.17	0.36	0.09	0.07	0.07	0.09	0.08	0.03	1.0	0.05	0.01	0.12	0.07	0.0	0.01	0.02	0.17
Mp2g13580.1	0.05	0.03	0.0	0.04	0.0	0.1	0.22	0.03	0.03	0.02	0.03	0.03	0.01	1.0	0.01	0.01	0.05	0.02	0.0	0.01	0.01	0.12
Mp3g06900.1 (EXPA4)	0.02	0.16	0.0	0.06	0.0	0.16	0.22	0.05	0.19	0.06	0.06	0.1	0.06	1.0	0.02	0.0	0.06	0.03	0.0	0.02	0.02	0.02
Mp3g10280.1	0.01	0.01	0.01	0.17	0.0	0.05	0.07	0.0	0.02	0.0	0.01	0.06	0.03	1.0	0.0	0.01	0.1	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0
Mp3g11220.1	0.27	0.19	0.0	0.02	0.0	0.09	0.25	0.03	0.04	0.07	0.05	0.01	0.02	1.0	0.03	0.0	0.06	0.03	0.0	0.01	0.01	0.07
Mp3g14100.1 (PR1)	0.0	0.0	0.0	0.13	0.0	0.15	0.1	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	1.0	0.0	0.0	0.02	0.05	0.0	0.06	0.0	0.42
Mp3g16530.1	0.89	1.0	0.43	0.03	0.0	0.26	0.5	0.12	0.12	0.16	0.14	0.1	0.05	0.87	0.07	0.03	0.15	0.07	0.0	0.02	0.03	0.05
Mp3g24420.1 (AFH14)	0.29	0.23	0.0	0.1	0.01	0.37	0.42	0.15	0.1	0.33	0.27	0.23	0.06	1.0	0.14	0.07	0.17	0.18	0.24	0.14	0.21	0.23
Mp4g00680.1 (XTH21)	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.05	0.08	0.0	0.01	0.0	0.0	0.01	0.04	1.0	0.0	0.0	0.04	0.0	0.0	0.02	0.04	0.0
Mp4g00700.1 (XTR6)	0.01	0.03	0.0	0.01	0.0	0.06	0.11	0.01	0.0	0.0	0.01	0.02	0.01	1.0	0.0	0.0	0.04	0.02	0.0	0.01	0.01	0.02
Mp4g05190.1	1.0	0.97	0.05	0.48	0.0	0.38	0.59	0.24	0.23	0.0	0.19	0.22	0.07	0.53	0.08	0.0	0.12	0.04	0.0	0.09	0.1	0.0
Mp4g14270.1	0.37	0.2	0.01	0.01	0.0	0.25	0.61	0.06	0.08	0.06	0.06	0.07	0.06	1.0	0.06	0.01	0.12	0.07	0.0	0.03	0.03	0.08
Mp4g17620.1 (DMP1)	0.2	0.29	0.0	0.02	0.0	0.1	0.28	0.09	0.51	0.12	0.1	0.45	0.08	1.0	0.04	0.01	0.09	0.06	0.0	0.05	0.04	0.04
Mp4g17800.1	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.15	0.14	0.01	0.06	0.04	0.02	0.03	0.03	1.0	0.02	0.01	0.08	0.01	0.0	0.02	0.0	0.0
Mp5g00250.1	0.08	0.02	0.01	0.07	0.0	0.07	0.13	0.0	0.03	0.03	0.05	0.03	0.04	1.0	0.06	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.32
Mp5g01630.1	0.05	0.04	0.0	0.0	0.0	0.12	0.14	0.03	0.05	0.05	0.06	0.09	0.05	1.0	0.02	0.01	0.04	0.02	0.0	0.02	0.03	0.08
Mp5g01650.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.13	0.24	0.02	0.06	0.07	0.05	0.21	0.06	1.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.02	0.05	0.05
Mp5g01660.1 (RCI3)	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.09	0.12	0.03	0.02	0.05	0.06	0.11	0.04	1.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.01	0.03	0.05
Mp5g01670.1	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.14	0.25	0.04	0.08	0.08	0.06	0.28	0.07	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.08	0.05
Mp5g01680.1	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.1	0.16	0.02	0.04	0.04	0.04	0.18	0.05	1.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.02	0.02	0.03
Mp5g01700.1	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.12	0.24	0.03	0.12	0.08	0.14	0.29	0.06	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.05	0.06
Mp5g01710.1	0.03	0.02	0.0	0.01	0.0	0.11	0.14	0.04	0.06	0.08	0.09	0.22	0.06	1.0	0.01	0.0	0.02	0.0	0.0	0.03	0.05	0.05
Mp5g02600.1	0.24	0.15	0.0	0.03	0.0	0.07	0.16	0.05	0.14	0.04	0.06	0.19	0.04	1.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.02	0.04	0.02
Mp5g04290.1 (RCI3)	0.03	0.01	0.0	0.01	0.0	0.08	0.21	0.02	0.02	0.03	0.04	0.12	0.05	1.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.01	0.02	0.02
Mp5g04320.1	0.04	0.03	0.0	0.0	0.0	0.15	0.27	0.04	0.09	0.07	0.07	0.16	0.08	1.0	0.01	0.0	0.02	0.0	0.0	0.04	0.05	0.06
Mp5g08890.1	0.1	0.15	0.0	0.15	0.0	0.22	0.34	0.08	0.03	0.07	0.07	0.06	0.02	1.0	0.06	0.0	0.09	0.06	0.01	0.02	0.04	0.06
Mp5g09230.1	1.0	0.66	0.0	0.07	0.0	0.32	0.67	0.16	0.1	0.12	0.11	0.23	0.07	0.96	0.11	0.06	0.3	0.13	0.0	0.03	0.02	0.25
Mp5g10750.1	0.06	0.05	0.0	0.01	0.0	0.04	0.0	0.02	0.03	0.03	0.02	0.05	0.03	1.0	0.01	0.0	0.02	0.0	0.0	0.02	0.02	0.0
Mp5g12140.1	0.13	0.09	0.0	0.0	0.0	0.16	0.25	0.02	0.05	0.03	0.03	0.08	0.03	1.0	0.01	0.01	0.04	0.03	0.0	0.01	0.02	0.04
Mp5g12170.1	0.07	0.16	0.0	0.05	0.0	0.14	0.38	0.07	0.1	0.08	0.1	0.08	0.04	1.0	0.05	0.02	0.08	0.06	0.01	0.01	0.03	0.14
Mp5g12180.1	0.15	0.21	0.0	0.01	0.0	0.13	0.33	0.07	0.05	0.07	0.06	0.06	0.03	1.0	0.03	0.0	0.09	0.04	0.0	0.01	0.02	0.12
Mp5g16350.1	0.14	0.16	0.0	0.02	0.0	0.15	0.53	0.06	0.06	0.06	0.05	0.06	0.04	1.0	0.03	0.01	0.1	0.05	0.0	0.02	0.03	0.08
Mp5g16410.1	0.06	0.01	0.0	0.07	0.01	0.12	0.23	0.02	0.01	0.05	0.01	0.04	0.08	1.0	0.0	0.0	0.04	0.01	0.0	0.05	0.06	0.0
Mp5g16420.1	0.04	0.02	0.0	0.01	0.0	0.06	0.18	0.02	0.02	0.03	0.03	0.02	0.02	1.0	0.01	0.0	0.05	0.01	0.0	0.01	0.02	0.06
Mp5g16430.1	0.06	0.02	0.0	0.01	0.0	0.06	0.15	0.01	0.03	0.03	0.02	0.03	0.02	1.0	0.01	0.01	0.05	0.01	0.0	0.01	0.02	0.05
Mp5g17030.1 (RCI3)	0.66	0.22	0.0	0.03	0.0	0.31	0.34	0.23	0.3	0.26	0.19	0.35	0.08	1.0	0.13	0.02	0.29	0.15	0.0	0.02	0.01	0.25
Mp5g17070.1	0.19	0.03	0.0	0.07	0.0	0.2	0.29	0.0	0.0	0.11	0.0	0.0	0.14	1.0	0.06	0.0	0.19	0.03	0.06	0.16	0.11	0.13
Mp5g17100.1	0.29	0.28	0.01	0.0	0.0	0.15	0.29	0.08	0.06	0.08	0.07	0.04	0.05	1.0	0.06	0.01	0.13	0.08	0.0	0.02	0.02	0.1
Mp5g17110.1	0.34	0.38	0.0	0.01	0.0	0.14	0.34	0.1	0.07	0.08	0.08	0.07	0.04	1.0	0.03	0.01	0.08	0.05	0.01	0.01	0.03	0.12
Mp5g17120.1	0.33	0.2	0.0	0.04	0.0	0.1	0.28	0.02	0.03	0.02	0.02	0.06	0.01	1.0	0.02	0.01	0.06	0.01	0.0	0.0	0.02	0.05
Mp5g17130.1	0.14	0.08	0.0	0.0	0.0	0.03	0.15	0.01	0.03	0.02	0.01	0.01	0.01	1.0	0.0	0.0	0.02	0.01	0.0	0.01	0.01	0.02
Mp5g17250.1	0.16	0.23	0.0	0.01	0.0	0.22	0.5	0.08	0.08	0.1	0.07	0.16	0.08	1.0	0.04	0.0	0.09	0.04	0.0	0.04	0.07	0.03
Mp5g17260.1	0.14	0.29	0.0	0.01	0.0	0.25	0.57	0.07	0.09	0.09	0.07	0.11	0.06	1.0	0.05	0.01	0.14	0.09	0.0	0.03	0.05	0.09
Mp5g19410.1	0.08	0.02	0.0	0.02	0.0	0.11	0.15	0.01	0.08	0.03	0.02	0.05	0.04	1.0	0.01	0.01	0.08	0.01	0.0	0.03	0.04	0.0
Mp5g21950.1 (TT7)	0.04	0.04	0.0	0.0	0.0	0.12	0.3	0.08	0.15	0.14	0.25	0.21	0.05	1.0	0.08	0.04	0.13	0.04	0.01	0.02	0.03	0.05
Mp6g03750.1	0.09	0.03	0.01	0.05	0.01	0.23	0.18	0.0	0.08	0.09	0.05	0.07	0.08	1.0	0.04	0.05	0.17	0.04	0.02	0.07	0.12	0.02
Mp6g03780.1	0.42	0.15	0.0	0.06	0.03	0.19	0.39	0.08	0.14	0.15	0.08	0.1	0.12	1.0	0.05	0.04	0.13	0.03	0.0	0.06	0.14	0.04
Mp6g03820.1	0.08	0.07	0.0	0.11	0.0	0.11	0.2	0.09	0.03	0.03	0.06	0.1	0.04	1.0	0.08	0.01	0.1	0.05	0.0	0.02	0.08	0.05
Mp6g12240.1	0.06	0.07	0.0	0.01	0.0	0.13	0.31	0.03	0.02	0.05	0.04	0.03	0.05	1.0	0.03	0.01	0.08	0.04	0.0	0.02	0.03	0.05
Mp6g18300.1 (RCI3)	0.28	0.28	0.0	0.0	0.0	0.14	0.33	0.1	0.05	0.14	0.12	0.07	0.04	1.0	0.03	0.01	0.07	0.06	0.02	0.01	0.03	0.35
Mp8g01650.1 (LOX1)	0.12	0.15	0.01	0.03	0.0	0.14	0.34	0.07	0.04	0.05	0.05	0.05	0.03	1.0	0.04	0.01	0.1	0.07	0.0	0.01	0.03	0.15
Mp8g02350.1	0.01	0.01	0.0	0.05	0.0	0.05	0.12	0.01	0.04	0.02	0.01	0.02	0.01	1.0	0.01	0.0	0.03	0.02	0.0	0.0	0.01	0.02
Mp8g03270.1	0.32	0.11	0.0	0.03	0.0	0.08	0.23	0.03	0.04	0.04	0.03	0.04	0.02	1.0	0.01	0.0	0.07	0.02	0.0	0.01	0.02	0.04
Mp8g07700.1 (MC7)	0.03	0.04	0.0	0.1	0.0	0.09	0.23	0.04	0.03	0.05	0.05	0.05	0.02	1.0	0.02	0.01	0.05	0.03	0.0	0.01	0.01	0.12
Mp8g15570.1 (LOX1)	0.15	0.14	0.0	0.07	0.0	0.12	0.18	0.03	0.04	0.03	0.03	0.05	0.02	1.0	0.02	0.01	0.08	0.04	0.01	0.02	0.02	0.03
Mpzg00270.1	1.0	0.21	0.0	0.03	0.0	0.38	0.9	0.21	0.27	0.18	0.24	0.35	0.33	0.31	0.02	0.02	0.09	0.01	0.0	0.22	0.35	0.12

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)