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Heatmap: Cluster_73 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
Archegoniophore (female)
Antheridiophore (male)
Antheridium (male)
Sperm
Sporeling
Thallus
Thallus (vegetative)
Thallus (MpPAP1OX-1)
Thallus (Tak1-2)
Thallus (MpPAP1OX-3)
Thallus (MpPAP1OX-2)
Thallus (Tak1-3)
mid rib (male)
Gametophyte
Gemmaling (female, hpt2040)
Gemmaling (male, hpt2040)
Gemmaling (BC3-38)
Gemmaling (Tak1)
Gemmaling
Gemma cup
gemma cup (male)
Aseptically grown rhizoids, thalloid, gemmae
0.45 0.08 -1.84 -5.58 0.04 -0.15 0.34 0.07 0.0 0.05 0.1 0.01 -0.63 0.16 0.21 0.08 0.19 0.17 0.01 0.12 -0.03 0.68
0.04 0.21 -0.06 -4.47 0.04 -0.2 -0.16 0.04 -0.0 -0.1 -0.15 0.1 -0.03 0.31 0.14 0.04 0.14 0.05 0.37 0.14 0.22 0.04
1.29 0.7 -1.56 -5.85 -0.41 -0.81 -2.32 0.51 0.06 0.51 0.53 0.28 -0.57 -2.77 0.34 0.24 0.43 0.33 0.77 -0.07 -0.19 -3.37
0.27 0.49 0.64 -4.41 0.18 -0.32 -0.48 0.39 -0.17 0.15 0.19 0.17 -0.58 -0.12 -0.06 -0.36 -0.08 -0.19 0.33 0.06 0.19 -0.04
0.63 0.77 0.49 -5.09 0.01 -0.51 -1.37 0.29 -0.1 0.2 0.18 -0.2 -0.61 -1.07 0.51 0.4 0.49 0.42 0.21 -0.23 -0.19 -1.29
Mp1g14800.1 (B5 #4)
 0.46 0.64 -0.15 -4.8 -0.52 -0.3 0.14 0.13 0.39 -0.01 0.04 0.45 -1.03 0.75 -0.36 -0.46 -0.26 -0.33 0.25 -0.12 -0.19 0.53
-0.0 0.52 0.9 -4.69 -0.4 -0.26 -0.41 0.38 -0.38 0.3 0.24 -0.25 -0.72 0.76 -0.11 -0.52 -0.13 -0.17 0.54 0.04 0.02 -0.38
0.17 -0.16 -0.82 -5.15 0.55 -0.02 -0.28 0.35 0.6 -0.13 -0.03 0.45 -1.17 -0.09 -0.34 -0.6 -0.33 -0.41 0.58 0.52 0.47 0.45
0.18 -0.02 -3.8 -6.14 0.79 0.2 -0.39 -0.44 -0.75 -0.49 -0.71 -0.61 -0.34 -0.15 0.67 0.67 0.69 0.59 1.04 -0.1 0.17 -0.41
0.65 0.2 -0.24 -4.49 -0.12 0.04 0.12 0.0 -0.2 -0.14 -0.07 0.08 -0.22 -0.12 0.08 0.01 0.07 0.09 0.37 0.07 0.2 0.15
1.25 0.77 1.31 -2.99 -0.44 -0.35 -0.02 0.04 -0.15 -0.15 -0.12 -0.08 -0.81 -0.22 -0.32 -0.45 -0.42 -0.44 0.01 -0.08 -0.02 -0.49
0.16 0.4 0.66 -4.05 0.14 -0.16 -0.0 0.07 0.23 0.06 -0.14 0.23 -0.74 -0.65 -0.05 -0.2 -0.2 -0.24 0.52 0.04 0.11 0.32
0.72 0.18 0.92 -2.1 -0.33 0.03 -0.15 -0.08 -0.26 -0.1 0.05 -0.16 -0.67 0.49 0.24 0.18 0.21 0.03 0.13 -0.23 -0.23 -1.31
-0.05 0.27 0.45 -2.66 0.33 -0.16 0.15 0.05 -0.05 0.0 -0.18 -0.03 -0.71 -0.15 -0.09 -0.35 -0.01 -0.05 0.52 0.12 0.06 0.5
Mp3g16470.1 (MTACP1)
 -0.34 0.03 0.27 -5.34 -0.12 0.13 -0.1 -0.24 -0.07 -0.22 -0.36 0.08 0.39 0.49 0.17 -0.03 0.1 0.08 0.38 0.08 0.29 -0.01
1.39 0.67 0.82 -4.82 -0.1 -0.04 -1.95 -0.25 -0.49 -0.66 -0.54 -0.6 -1.01 -0.37 0.4 0.38 0.45 0.39 0.82 -0.12 -0.29 -2.15
0.59 0.32 -0.11 -4.91 0.34 -0.52 - 0.48 -0.24 0.15 -0.09 0.04 -0.42 -0.73 0.63 0.62 0.86 0.61 0.18 0.14 0.0 -
0.32 0.13 0.06 -3.01 0.67 0.13 0.39 -0.49 -0.54 -0.58 -0.87 -0.42 -1.14 0.72 0.22 0.21 0.07 0.07 0.61 -0.42 -0.2 0.57
0.16 0.28 0.7 -1.57 -0.07 -1.23 - -0.26 -0.3 0.04 -0.29 -0.51 -2.29 -4.11 1.24 1.28 1.21 1.08 0.59 -0.73 -0.85 -
Mp4g12300.1 (TRP2)
 0.72 -0.06 -4.35 -4.57 0.21 0.05 0.53 -0.02 -0.7 -0.55 -0.46 -0.62 -2.13 -0.06 0.0 0.06 0.17 0.06 1.37 -1.42 -1.51 1.72
0.73 0.66 0.39 -3.36 0.17 -0.11 0.13 0.03 0.01 -0.02 -0.02 0.11 -0.71 -0.75 -0.03 -0.11 -0.15 -0.16 0.25 -0.21 0.03 0.21
0.29 0.56 0.17 -5.45 -0.03 -0.23 -0.82 0.0 -0.11 -0.1 0.09 0.29 -0.38 -0.91 0.24 0.31 0.3 0.34 0.6 -0.11 0.2 -0.32
Mp4g17940.1 (ENH1)
 0.68 0.03 -2.39 -5.38 0.29 0.09 0.51 -0.21 0.36 -0.13 -0.36 0.66 -0.06 -0.4 0.15 0.18 0.28 0.11 -0.62 0.07 -0.12 0.18
0.39 0.7 0.42 -4.38 -0.09 0.15 -0.45 0.05 -0.38 -0.36 -0.1 -0.41 -0.84 -1.04 0.49 0.44 0.27 0.34 0.81 0.06 -0.05 -0.77
0.04 0.02 -0.37 -5.09 0.24 -0.28 -0.77 0.45 0.08 0.37 0.47 0.28 -0.68 -0.34 0.06 -0.08 0.11 -0.03 0.24 0.01 0.23 0.52
0.16 0.05 0.15 -2.91 0.1 -0.24 0.09 0.24 0.13 0.16 0.25 0.14 -0.53 -0.14 -0.11 -0.2 -0.1 -0.15 0.35 -0.2 -0.15 0.73
0.41 0.77 0.8 -4.37 0.55 -0.41 -0.3 -0.13 -0.28 -0.37 -0.13 -0.12 -1.21 0.44 -0.14 -0.13 -0.06 -0.1 0.71 -0.19 -0.08 -0.26
0.46 0.33 -0.13 -4.9 0.54 -0.08 -0.13 0.07 -0.02 -0.12 -0.04 0.22 -0.98 -0.25 0.08 0.01 0.05 0.04 0.43 -0.01 0.02 0.25
-3.22 -4.33 - -5.88 -0.09 0.39 0.88 -0.96 -1.71 -2.17 -1.34 -1.44 -1.42 -0.09 0.75 0.91 0.94 0.63 2.03 -0.49 0.02 0.82
0.5 0.44 0.5 -3.15 0.22 -0.06 -0.24 0.28 0.07 0.07 0.08 0.36 -0.52 -1.18 -0.16 -0.22 -0.12 -0.2 0.35 0.22 0.1 -0.19
0.87 1.07 -3.13 -7.58 0.11 -0.53 -0.65 -0.32 -0.76 -0.07 -0.33 -0.26 -2.13 -0.11 -0.17 0.15 -0.13 0.07 1.73 -0.14 -0.13 0.37
Mp5g12720.1 (CYP703)
 -0.8 -0.65 -8.23 -4.75 0.34 -0.32 1.0 -0.17 -2.01 -0.18 -0.43 -1.17 -1.01 -1.02 0.29 0.24 0.54 0.61 1.48 -0.53 -0.38 1.51
0.4 0.36 0.21 -3.94 -0.04 -0.03 -0.54 -0.16 0.04 -0.46 -0.42 -0.14 -0.75 0.35 0.21 0.03 0.16 0.07 0.41 0.02 0.15 0.65
0.27 0.89 1.0 -4.88 0.44 -0.49 -0.19 -0.15 -0.23 -0.38 -0.47 -0.23 -1.04 0.67 -0.03 0.02 0.01 0.05 0.38 -0.33 -0.2 -0.35
0.81 0.35 0.14 -4.9 0.16 0.14 -0.27 0.15 -0.05 0.08 -0.05 0.02 -0.83 -0.19 0.06 -0.2 -0.0 -0.07 0.25 -0.11 0.0 0.33
0.34 0.6 0.47 -4.35 -0.38 -0.3 -0.23 0.12 -0.15 0.08 -0.08 -0.04 -0.84 0.35 -0.0 -0.1 0.0 -0.02 0.45 0.04 0.06 0.26
1.71 0.26 0.57 -1.52 -0.09 -0.12 - -0.11 0.64 0.02 0.21 0.59 -0.43 -7.77 0.24 0.37 0.47 0.13 -0.55 -0.14 -1.29 -
-0.14 0.12 0.19 -5.75 0.46 -0.37 -0.17 -0.05 0.12 -0.28 -0.23 0.26 -0.87 -0.18 -0.02 -0.05 0.1 0.08 1.03 -0.14 -0.04 0.53
0.07 0.22 0.34 -3.65 -0.22 0.01 -0.21 0.22 -0.09 0.16 -0.1 0.02 0.01 0.28 -0.07 -0.09 0.08 0.01 0.5 -0.03 0.13 -0.18
0.43 0.35 0.15 -5.17 0.11 -0.03 0.1 -0.08 -0.26 -0.18 -0.17 -0.23 -1.07 1.09 0.04 0.1 0.02 0.02 0.53 -0.2 -0.37 -0.19
0.45 0.33 -0.36 -5.84 0.08 -0.24 -0.17 0.24 0.04 0.04 -0.06 0.16 -0.55 0.04 0.04 0.04 0.05 0.02 0.42 -0.05 0.22 0.27

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.