Heatmap: Cluster_67 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
Archegoniophore (female)
Antheridiophore (male)
Antheridium (male)
Sperm
Sporeling
Thallus
Thallus (vegetative)
Thallus (MpPAP1OX-1)
Thallus (Tak1-2)
Thallus (MpPAP1OX-3)
Thallus (MpPAP1OX-2)
Thallus (Tak1-3)
mid rib (male)
Gametophyte
Gemmaling (female, hpt2040)
Gemmaling (male, hpt2040)
Gemmaling (BC3-38)
Gemmaling (Tak1)
Gemmaling
Gemma cup
gemma cup (male)
Aseptically grown rhizoids, thalloid, gemmae
2.09 5.64 5.14 0.19 1.54 5.52 4.54 4.36 10.56 1.87 4.8 0.0 3.65 1.68 0.0 2.07 1.4 1.39 1.56 5.87 1.87 3.29
0.0 1.86 8.44 0.16 0.0 1.35 0.14 2.87 0.0 0.0 0.0 0.0 0.58 0.22 0.0 0.0 1.66 0.81 0.0 0.0 0.0 0.0
0.61 0.48 0.76 0.47 0.1 0.76 0.17 0.0 0.0 0.0 0.18 0.0 0.56 0.02 0.09 0.09 0.29 0.1 0.0 0.23 0.0 0.0
Mp1g18140.1 (RLP54)
3.18 1.89 3.55 0.55 3.96 12.62 4.54 2.43 4.7 3.93 2.59 6.26 3.7 4.28 6.54 6.34 5.5 6.25 4.86 5.13 5.6 16.1
0.52 0.0 0.0 0.09 0.02 1.49 0.29 0.96 1.23 0.26 0.26 0.59 0.0 0.44 0.0 0.19 0.0 0.18 0.0 0.48 0.0 2.27
0.23 0.73 0.33 0.56 0.24 2.21 0.28 0.0 1.43 0.33 0.3 0.69 0.77 0.51 0.68 1.51 0.24 0.48 0.0 0.57 0.0 0.0
5.34 7.75 4.8 0.9 0.01 21.79 20.21 8.03 20.71 8.33 7.29 17.27 5.38 21.42 12.72 14.19 17.58 19.8 10.35 2.21 3.65 5.66
1.81 0.0 0.0 1.41 1.16 5.48 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.22 1.95 1.98 0.49 0.0 0.48 0.19 0.26 0.21 0.3 0.16 0.07 0.13 0.1 0.12 0.05 0.0 0.07 0.63 0.26 0.82 0.3
0.0 0.0 0.0 1.05 0.0 0.21 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.22 0.55 0.01 0.28 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.38 0.19 0.12 0.0 0.0 0.0 0.23 0.29 0.0 0.0 0.0
0.06 0.0 0.0 1.33 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.84 1.35 3.1 0.45 0.31 2.6 1.49 1.23 0.79 0.33 0.49 0.76 1.29 0.31 2.19 0.0 2.32 0.27 0.58 1.85 0.7 0.0
0.0 0.0 0.0 0.31 0.0 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
3.3 2.41 0.0 3.2 0.15 82.82 46.36 29.86 113.5 35.82 38.13 88.05 21.03 30.99 44.11 35.44 40.9 50.4 146.78 33.72 27.01 41.12
0.84 0.0 0.0 0.44 0.0 2.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 5.88 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 3.17
0.09 0.0 0.0 0.09 0.1 2.49 0.75 0.0 0.0 0.27 0.0 0.61 0.13 1.97 0.4 2.02 0.61 0.57 1.4 0.0 0.0 0.66
0.03 0.0 0.0 0.3 0.0 0.6 0.08 0.0 0.0 0.16 0.0 0.0 0.09 0.08 0.11 0.87 0.44 0.0 0.0 0.0 0.3 0.0
0.0 0.0 0.0 0.61 0.0 0.51 0.1 0.0 0.0 0.0 0.21 0.0 0.0 0.04 0.19 0.0 0.0 0.17 0.37 0.0 0.0 1.29
0.06 0.0 0.0 0.47 0.04 0.66 0.0 0.26 0.0 0.24 0.0 0.0 0.44 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.21 0.46 0.27
0.0 0.3 0.0 0.41 0.0 0.79 0.55 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.18 0.0 0.87 0.0 0.31 0.28 0.63 0.0 0.0 0.0
0.01 0.0 0.0 0.25 0.28 4.62 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.1 1.6 0.0 0.36 2.05 0.68 4.33 0.0 0.0 0.0
Mp5g13080.1 (VPS54)
0.24 0.0 0.0 0.16 0.0 0.04 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.43 0.0 0.0 0.32 0.0 0.46 0.76 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.62 0.24 0.0 0.0 1.0 0.99 0.0 1.21 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.23 0.29 0.22 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.51 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.39 0.12 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Mp6g08320.1 (CYP706A2)
0.24 0.32 0.0 0.17 0.22 0.09 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.71 0.0 0.0 1.91 0.0 0.21 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 1.04 0.35 0.54 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.23 0.16 0.0 0.59 0.03 0.18 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.65 0.0 1.7 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 3.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.63 0.17 0.0 0.3 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.28 0.11 0.0 0.4 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.09 0.07 0.12 0.41 0.35 0.82 0.45 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.11 0.26 0.08 0.25 0.0 0.0 0.0 0.0 0.21
0.0 0.0 0.0 0.16 0.13 0.2 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Mp8g06040.1 (UGT85A4)
0.0 0.09 0.03 0.1 0.01 0.03 0.0 0.0 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0
0.33 0.0 0.0 0.23 0.06 0.22 0.28 1.23 0.0 0.0 0.0 1.16 0.0 0.29 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Mp8g09050.1 (LOX1)
3.65 1.09 0.06 0.73 0.36 75.39 59.32 10.96 35.74 20.5 34.94 22.95 12.35 22.48 27.47 39.23 23.92 29.63 46.5 16.24 19.16 16.22
Mp8g10320.1 (CYP71A22)
0.2 0.4 0.12 0.62 0.06 0.34 0.01 0.0 0.0 0.0 0.33 0.0 0.33 0.47 0.0 0.0 0.03 0.08 0.0 0.14 0.0 0.45
0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.35 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.29 0.64 0.28 0.34 0.6 0.0 0.0 0.0 0.0

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)